Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2434
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2434, 291 aa
1>>>pF1KE2434 291 - 291 aa - 291 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2677+/-0.00116; mu= 15.9848+/- 0.069
mean_var=74.3849+/-16.248, 0's: 0 Z-trim(101.5): 49 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.148707
statistics sampled from 6500 (6534) to 6500 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 1.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 1927 423.1 1.2e-118
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 605 139.5 3e-33
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 569 131.8 6.4e-31
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 437 103.5 2.1e-22
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 431 102.2 5e-22
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 411 97.9 1e-20
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 408 97.2 1.5e-20
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 402 96.0 4e-20
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 393 94.0 1.5e-19
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 388 93.0 3.3e-19
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 385 92.3 4.8e-19
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 374 89.9 2.4e-18
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 367 88.4 7e-18
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 367 88.4 7e-18
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 358 86.5 2.7e-17
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 343 83.3 2.5e-16
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 339 82.4 4.5e-16
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 338 82.2 5.1e-16
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 333 81.1 1.1e-15
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 330 80.5 1.7e-15
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 310 76.2 3.3e-14
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 305 75.1 7e-14
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 295 73.0 3e-13
>>CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 (291 aa)
initn: 1927 init1: 1927 opt: 1927 Z-score: 2243.6 bits: 423.1 E(32554): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 1927; 99.7% identity (100.0% similar) in 291 aa overlap (1-291:1-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILISLGISRFCLQ
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CCDS57 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILISLGISRFCLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 WASMLNNFCSYFNLNYVLCNLTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCIKVSSFTHHIFLWLRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 WASMLNNFCSYFNLNYVLCNLTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCIKVSSFTHHIFLWLRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHLPRNSTVTDKLENFHQYQFQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHLPRNSTVTDKLENFHQYQFQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HTVALVIPFILFLASTIFLMASLTKQIQHHSTGHCNPSMKAHFTALRSLAVLFIVFTSYF
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CCDS57 HTVALVIPFILFLASTIFLMASLTKQIQHHSTGHCNPSMKARFTALRSLAVLFIVFTSYF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE2 LTILITIIGTLFDKRCWLWVWEAFVYAFILMHSTSLMLSSPTLKRILKGKC
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CCDS57 LTILITIIGTLFDKRCWLWVWEAFVYAFILMHSTSLMLSSPTLKRILKGKC
250 260 270 280 290
>>CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 (307 aa)
initn: 586 init1: 257 opt: 605 Z-score: 710.5 bits: 139.5 E(32554): 3e-33
Smith-Waterman score: 605; 35.7% identity (65.0% similar) in 294 aa overlap (6-287:5-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILISLGISRFCLQ
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CCDS43 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 WASMLNNFCSYFNLNYVLCN-------LTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCIKVSSFTHH
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CCDS43 LVGTVHNF--YYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 IFLWLRWRILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHLPRNSTV--TDKLE
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CCDS43 TFLWLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE2 NFHQYQFQAHTVALVIPFILFLASTIFLMASL---TKQIQHHSTGHCNPSMKAHFTALRS
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CCDS43 TY--YFPSLKLVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LAVLFIVFTSYFLTILITIIGTLFDKRCWLWVWEAFVYAFILMHSTSLMLSSPTLKRILK
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CCDS43 LISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFS
240 250 260 270 280 290
290
pF1KE2 GKC
CCDS43 QLLLLARGFWVA
300
>>CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 (318 aa)
initn: 547 init1: 231 opt: 569 Z-score: 668.5 bits: 131.8 E(32554): 6.4e-31
Smith-Waterman score: 569; 33.0% identity (64.3% similar) in 294 aa overlap (8-290:18-310)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILI
.... : .: :. :. ...:.:.:: ::. : :.: : .:.
CCDS58 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 SLGISRFCLQWASMLNNFCSY-----FNLNYVLCNLTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCI
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CCDS58 SLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFYCV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KVSSFTHHIFLWLRWRILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHL-PRNS
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CCDS58 KIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYLRNHLQPWNV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE2 TVTDKLENFHQ--YQFQAHTVALVIPFILFLASTIFLMASL---TKQIQHHSTGHCNPSM
: :..... . : : . .. ..: .:. :.:..:: :. ..: .::.
CCDS58 T-GDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSGFREPSV
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 KAHFTALRSLAVLFIVFTSYFLTILITIIGTLFDKRCWLWVWEAFVYAFILMHSTSLMLS
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CCDS58 QAHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAVHPIILLFS
240 250 260 270 280 290
280 290
pF1KE2 SPTLKRILKGKC
. :. .::..
CCDS58 NCRLRAVLKSRRSSRCGTP
300 310
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 351 init1: 249 opt: 437 Z-score: 515.5 bits: 103.5 E(32554): 2.1e-22
Smith-Waterman score: 437; 28.5% identity (62.6% similar) in 305 aa overlap (1-291:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILISLGISRFCLQ
:. . ::... . .: :.: . .: : : :....:. :.:. .:.. :. :
CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILV-NCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 WASMLNNFCSYFNLN-----YVLCNLTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCIKVSSFTHHIF
. ..: :. : .. . ..: : : :..:: . : :.::.:..::.: :
CCDS58 CIILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LWLRWRILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHLPRNSTVTDKLENFHQ
:::.::. :.. :.:::.:...: . : :... ... . :: ::..... ..
CCDS58 LWLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTA-SLINEFKLYSVFRGIEATRN--VTEHFRKKRS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE2 YQFQAH---TVALVIPFILFLASTIFLMASL---TKQIQHHSTGHCNPSMKAHFTALRSL
. : :. . :.:. ::: .:. :: :.:. ...:. .:. .:: :.: .
CCDS58 EYYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRII
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 AVLFIVFTSYFLTILITIIGTLFDK-RCWLWVWEAFVYAFILMHSTSLMLSSPTLKR--I
.:..: :::..::. .:... : . . :.... . :: :.:.. ::. .
CCDS58 LSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFV
240 250 260 270 280 290
290
pF1KE2 LKGKC
. .:
CCDS58 VMLRCESGHLKPGSKGPIFS
300 310
>>CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 (299 aa)
initn: 203 init1: 203 opt: 431 Z-score: 508.9 bits: 102.2 E(32554): 5e-22
Smith-Waterman score: 431; 28.1% identity (63.0% similar) in 303 aa overlap (1-291:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILISLGISRFCLQ
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CCDS38 MLESHLIIYFLLA-VIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 WASMLNNFCSYFNLNYVLC--NLTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCIKVSSFTHHIFLWL
. : : .....: : .: :.: : .:: . : :::: ::.: : .:.::
CCDS38 LFIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILL-FINELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLFIWL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 RWRILRLFPWILLGSLM-ITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHLPRNSTVTDKLENFHQYQ
. :: .: ::..::::. .. . .. : .... . . . . .:.:. . :. :
CCDS38 KMRISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAGFM-VPYFLRKFFSQNATI--QKEDTLAIQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 FQAHTVALVIPFILFLASTIFLMASL---TKQIQHHSTGHCNPSMKAHFTALRSLAVLFI
. . .. . .:...:: ....:. :: :.:... .: :. : ..:: :. ..:
CCDS38 IFSFVAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTRQMRNTVAGSRVPGRGAPISALLSILSFLI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 VFTSYFLTILITIIGTLFDKRCWLWVWEAFVYA-FILMHSTSLMLSSPTLKR-----ILK
.. :. . : . . . : : ..... .: . . :: :.:..: ::. .:.
CCDS38 LYFSHCM-IKVFLSSLKFHIRRFIFLFFILVIGIYPSGHSLILILGNPKLKQNAKKFLLH
240 250 260 270 280 290
290
pF1KE2 GKC
.::
CCDS38 SKCCQ
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 342 init1: 120 opt: 411 Z-score: 485.5 bits: 97.9 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 411; 30.2% identity (64.4% similar) in 295 aa overlap (2-284:1-290)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTI-IVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILISLGISRFCL
.: . ....:. . : ::: : ...:: : .::. : . .:.:::::.:::.::
CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGE-LTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QWASMLNNFCSY-FNLNY---VLCNLT-ITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCIKVSSFTHHI
. :..: : .: :: ... ..: : : ..:..: :..:: .:.....: .
CCDS86 LCVISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 FLWLRWRILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHLPRNSTVTDKLENFH
:.::. .: ... :::::..:. . .:. .. . .:. . : .: : :. ..
CCDS86 FFWLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPK--NDDMWYHLFKVSH-EENITWKFKVSKI-
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE2 QYQFQAHTVAL--VIPFILFLASTIFLMASL---TKQIQHHSTGHCNPSMKAHFTALRSL
:. :. : ..:::: : : ..:. :: ::::. :.:: .:: .::. :....
CCDS86 PGTFKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 AVLFIVFTSYFLTILITIIGTLFDK-RCWLWVWEAFVYAFILMHSTSLMLSSPTLKRILK
...... :. ..:. ..:. . . : . . . : :: :.... :.
CCDS86 IIFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFL
240 250 260 270 280 290
290
pF1KE2 GKC
CCDS86 KMLRFVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 (299 aa)
initn: 294 init1: 148 opt: 408 Z-score: 482.2 bits: 97.2 E(32554): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 419; 28.2% identity (62.7% similar) in 284 aa overlap (9-285:8-281)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILISLGISRFCLQ
..:.. :.: : .. .. .:. :::.. ..:...:. :: ::
CCDS58 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 WASMLN-NFCSYFNLNYVLCNLTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCIKVSSFTHHIFLWLR
: .:. .. :. . : :.: : . . ..:. ..:.:::: :...: . .:::.
CCDS58 WLIILDLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLWLK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 WRILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHLPR-NSTVTDKLENFHQ-YQ
: : : ::: ..:. . . :: ::. : :. ::.. .:... :
CCDS58 QRAYNLSLWCLLGYFIINLLLTVQ--IG-------LTFYHPPQGNSSIRYPFESWQYLYA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FQAHTVALVIPFILFLASTIFLMASLT---KQIQHHSTGHCNPSMKAHFTALRSLAVLFI
:: .. . .:...::.:. .:..:: :... ::.:. . :::.:::.::. ...
CCDS58 FQLNSGSY-LPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLL
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VFTSYFLTILITIIGTLFDKRCW-LWVWEAFVYAFILMHSTSLMLSSPTLKRILKGKC
. :... ..: . . ...::... :. .:: :... : .:.
CCDS58 LHLVYIMASPFSITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWK
230 240 250 260 270 280
CCDS58 TVCARRCWGP
290
>>CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 (323 aa)
initn: 344 init1: 145 opt: 402 Z-score: 474.8 bits: 96.0 E(32554): 4e-20
Smith-Waterman score: 402; 25.7% identity (62.7% similar) in 292 aa overlap (9-288:20-308)
10 20 30 40
pF1KE2 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMIL
: ... .: .: :. :..:.:. : :: . . : : :.
CCDS43 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
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