FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2431, 309 aa
1>>>pF1KE2431 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4585+/-0.00119; mu= 14.7174+/- 0.070
mean_var=78.0612+/-17.316, 0's: 0 Z-trim(100.8): 65 B-trim: 421 in 1/48
Lambda= 0.145163
statistics sampled from 6305 (6345) to 6305 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 1.020
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs109|chr12 ( 309) 1996 428.2 4.1e-120
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs109|chr12 ( 309) 1808 388.8 2.9e-108
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs109|chr12 ( 309) 1803 387.7 6.1e-108
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs109|chr12 ( 319) 1631 351.7 4.4e-97
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs109|chr12 ( 309) 1356 294.1 9.2e-80
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs109|chr12 ( 299) 1309 284.3 8.3e-77
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs109|chr12 ( 299) 1281 278.4 4.8e-75
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs109|chr12 ( 303) 814 180.6 1.3e-45
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs109|chr12 ( 317) 778 173.1 2.6e-43
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs109|chr12 ( 318) 667 149.8 2.6e-36
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs109|chr12 ( 312) 617 139.4 3.6e-33
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs109|chr12 ( 314) 610 137.9 1e-32
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs109|chr12 ( 307) 608 137.5 1.3e-32
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs109|chr12 ( 309) 574 130.3 1.8e-30
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs109|chr7 ( 316) 564 128.3 8e-30
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs109|chr7 ( 307) 505 115.9 4.1e-26
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs109|chr5 ( 299) 425 99.1 4.4e-21
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs109|chr7 ( 299) 398 93.5 2.2e-19
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs109|chr7 ( 338) 398 93.5 2.5e-19
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs109|chr7 ( 323) 378 89.3 4.3e-18
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs109|chr7 ( 318) 356 84.7 1e-16
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs109|chr7 ( 299) 341 81.5 8.8e-16
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs109|chr7 ( 291) 328 78.8 5.7e-15
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs109|chr7 ( 333) 320 77.2 2e-14
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs109|chr12 (309 aa)
initn: 1996 init1: 1996 opt: 1996 Z-score: 2270.0 bits: 428.2 E(33420): 4.1e-120
Smith-Waterman score: 1996; 99.4% identity (99.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKTSSP
:::::::::
CCDS53 VKGEKTSSP
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs109|chr12 (309 aa)
initn: 1808 init1: 1808 opt: 1808 Z-score: 2057.2 bits: 388.8 E(33420): 2.9e-108
Smith-Waterman score: 1808; 89.0% identity (96.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::::.::: :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
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CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
..:::::::::: :.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS53 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:::
CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKTSSP
::::: :::
CCDS53 VKGEKPSSP
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs109|chr12 (309 aa)
initn: 1803 init1: 1803 opt: 1803 Z-score: 2051.6 bits: 387.7 E(33420): 6.1e-108
Smith-Waterman score: 1803; 87.7% identity (96.1% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
:::::::::: :.::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
::.::::.: :::::::.::: ::::.:::::::::::::.::::::::::::::.::::
CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
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CCDS53 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
..::::::::::.::.:::::::::::::::.:::::::: :::::::::: ::::::::
CCDS53 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
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CCDS53 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKTSSP
::::: ::
CCDS53 VKGEKPSSS
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs109|chr12 (319 aa)
initn: 1631 init1: 1631 opt: 1631 Z-score: 1856.7 bits: 351.7 E(33420): 4.4e-97
Smith-Waterman score: 1631; 82.1% identity (93.7% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
:::::::::: :.:: :::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
::::.::.: ::::: ::::: ::::.::: ::::.::::.::.::::.::::::.:::.
CCDS53 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
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CCDS53 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
:.::.::.::::.::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS53 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
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CCDS53 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKTSSP
::
CCDS53 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs109|chr12 (309 aa)
initn: 1371 init1: 1345 opt: 1356 Z-score: 1545.6 bits: 294.1 E(33420): 9.2e-80
Smith-Waterman score: 1356; 66.3% identity (85.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
:..:: :.:: ::::.:..::::::::::.: : :::::: ::::..:::::::::::
CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
:.::.::::::::. ....: : ::: :::: ::::.:::::::::.::: .:: :
CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
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CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
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CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
::: ..:: :.: .. :.:.:.:. . :::.: :::::::: ::::::::.::. :
CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKTSSP
.::.. :.:
CCDS86 AKGQNQSTP
>>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs109|chr12 (299 aa)
initn: 1298 init1: 1298 opt: 1309 Z-score: 1492.6 bits: 284.3 E(33420): 8.3e-77
Smith-Waterman score: 1309; 67.8% identity (86.9% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
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CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
:::::.:::::.::: :.::.:::.: ::.: . ..:.::::: :.::......: .:::
CCDS86 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
. ...::::.:.::..::::::::::::::.:.:::: :::::::::::.:::::::::
CCDS86 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
.:: ...:::: :.: :: : ::. : .. ::::: .::::.::: .. :.:
CCDS86 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
pF1KE2 VKGEKTSSP
>>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs109|chr12 (299 aa)
initn: 1281 init1: 1281 opt: 1281 Z-score: 1461.0 bits: 278.4 E(33420): 4.8e-75
Smith-Waterman score: 1281; 65.7% identity (87.2% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
:. :: :: : ::: .::.:: ::::::::: :. . .::: :.::::::.:::.::::
CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
:.:. ::.::.: :. ..::: .: : ::: :::: :::..:::: :::::::::.: ::
CCDS86 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
::.:.:::.::.:::::.:: :.: ::.:.: : :::.:::.::::::..:...:..:::
CCDS86 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
.:::.::::.:. :.:::::::::::::.:..:::::::::::::::::: :::.: ::
CCDS86 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
::: :. :.:.. . ..: :...:... . :::.: :::: :..:::::::::.:::
CCDS86 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
250 260 270 280 290
pF1KE2 VKGEKTSSP
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs109|chr12 (303 aa)
initn: 776 init1: 263 opt: 814 Z-score: 932.3 bits: 180.6 E(33420): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 814; 45.0% identity (72.6% similar) in 307 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]