Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2418
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2418, 839 aa
1>>>pF1KE2418 839 - 839 aa - 839 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5822+/-0.000989; mu= 14.6315+/- 0.059
mean_var=101.1849+/-19.867, 0's: 0 Z-trim(107.1): 39 B-trim: 72 in 1/50
Lambda= 0.127502
statistics sampled from 9444 (9470) to 9444 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 1.970
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS45576.1 TRPV1 gene_id:7442|Hs109|chr17 ( 839) 5554 1032.9 0
CCDS53829.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs109|chr12 ( 837) 2306 435.4 2e-121
CCDS9134.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs109|chr12 ( 871) 2306 435.4 2.1e-121
CCDS32576.1 TRPV2 gene_id:51393|Hs109|chr17 ( 764) 2121 401.4 3.2e-111
CCDS53828.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs109|chr12 ( 824) 1856 352.6 1.6e-96
CCDS11029.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs109|chr17 ( 790) 1380 265.1 3.6e-70
CCDS58500.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs109|chr17 ( 791) 1380 265.1 3.6e-70
CCDS53827.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs109|chr12 ( 764) 1274 245.6 2.6e-64
CCDS9135.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs109|chr12 ( 811) 840 165.7 2.9e-40
CCDS5875.1 TRPV5 gene_id:56302|Hs109|chr7 ( 729) 517 106.3 2e-22
CCDS5874.2 TRPV6 gene_id:55503|Hs109|chr7 ( 765) 499 103.0 2.1e-21
>>CCDS45576.1 TRPV1 gene_id:7442|Hs109|chr17 (839 aa)
initn: 5554 init1: 5554 opt: 5554 Z-score: 5522.6 bits: 1032.9 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5554; 99.8% identity (99.9% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
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CCDS45 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS45 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE2 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
790 800 810 820 830
>>CCDS53829.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs109|chr12 (837 aa)
initn: 1935 init1: 1324 opt: 2306 Z-score: 2293.7 bits: 435.4 E(33420): 2e-121
Smith-Waterman score: 2306; 49.1% identity (77.3% similar) in 721 aa overlap (98-813:100-807)
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFEAVAQNNC
: . : . :....: .:. :....
CCDS53 MDSLFDYGTYRHHSSDNKRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEIARQTDSL
::..:: :: ::.:::.::..: :::::: ::.::: .:.: :::.::.::..: ..
CCDS53 ADLDGLLPFLLTHKKRLTDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 KELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPG-F
.:..:. . : ::.:::::::::::: : ::: .::::.: :.: ::. : . : :
CCDS53 REFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQP-KDEGGYF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFV
::::::::::::::: ::..: .: . ::. .:: ::::::::: .:::: .:::::
CCDS53 YFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHL
:.::. .:. :.: : .:: . :. :..:: .:: :::::.. .:..::. . . :::
CCDS53 TKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQD
:::: .::::::.::::::: .::: :. ::::...:.: . :::.:: :::.:.::.:
CCDS53 SRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNS-KIENRHEMLAVEPINELLRD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEILSVLGG
:: .: ::.: . : :.:::..:::.:..: ::. .. ::.:..::..... :
CCDS53 KWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFS
: ::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :.: :::.
CCDS53 VLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKN
:.::: : ::.:::.. : :..::.:....:: ::..::..:..:...:.:.:.. :
CCDS53 LVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCAN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFII
.. .:. .. :.:: :: ... . :.:::.::::::::. . . .::::
CCDS53 MKVCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFII
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFR
::..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.:: .:::::
CCDS53 LLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 SGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSR
::... :: . :: : :::::::::::. :: :.::::::::. : . .:: .:
CCDS53 SGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE2 VSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
. .:.. .:: . : . ....:.::
CCDS53 LRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAP
790 800 810 820 830
CCDS53 L
>>CCDS9134.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs109|chr12 (871 aa)
initn: 1935 init1: 1324 opt: 2306 Z-score: 2293.4 bits: 435.4 E(33420): 2.1e-121
Smith-Waterman score: 2306; 49.1% identity (77.3% similar) in 721 aa overlap (98-813:134-841)
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFEAVAQNNC
: . : . :....: .:. :....
CCDS91 MDSLFDYGTYRHHSSDNKRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGST
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEIARQTDSL
::..:: :: ::.:::.::..: :::::: ::.::: .:.: :::.::.::..: ..
CCDS91 ADLDGLLPFLLTHKKRLTDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNM
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 KELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPG-F
.:..:. . : ::.:::::::::::: : ::: .::::.: :.: ::. : . : :
CCDS91 REFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQP-KDEGGYF
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFV
::::::::::::::: ::..: .: . ::. .:: ::::::::: .:::: .:::::
CCDS91 YFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFV
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHL
:.::. .:. :.: : .:: . :. :..:: .:: :::::.. .:..::. . . :::
CCDS91 TKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHL
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQD
:::: .::::::.::::::: .::: :. ::::...:.: . :::.:: :::.:.::.:
CCDS91 SRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNS-KIENRHEMLAVEPINELLRD
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEILSVLGG
:: .: ::.: . : :.:::..:::.:..: ::. .. ::.:..::..... :
CCDS91 KWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTG
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFS
: ::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :.: :::.
CCDS91 VLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFA
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKN
:.::: : ::.:::.. : :..::.:....:: ::..::..:..:...:.:.:.. :
CCDS91 LVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCAN
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFII
.. .:. .. :.:: :: ... . :.:::.::::::::. . . .::::
CCDS91 MKVCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFII
650 660 670 680 690
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFR
::..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.:: .:::::
CCDS91 LLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFR
700 710 720 730 740 750
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 SGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSR
::... :: . :: : :::::::::::. :: :.::::::::. : . .:: .:
CCDS91 SGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGR
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830
pF1KE2 VSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
. .:.. .:: . : . ....:.::
CCDS91 LRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAP
820 830 840 850 860 870
CCDS91 L
>>CCDS32576.1 TRPV2 gene_id:51393|Hs109|chr17 (764 aa)
initn: 1392 init1: 590 opt: 2121 Z-score: 2110.4 bits: 401.4 E(33420): 3.2e-111
Smith-Waterman score: 2121; 50.4% identity (76.8% similar) in 669 aa overlap (113-774:74-734)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 TIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFEAVAQNNCQDLESLLLFLQKSKK
.:: .:.::... .:: .: .:.:..:
CCDS32 QGEDRKFAPQIRVNLNYRKGTGASQPDPNRFDRDRLFNAVSRGVPEDLAGLPEYLSKTSK
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 HLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEIARQTDSLKELVNASYTDSYYKG
.:::.:. . ::::::.::.:::.:: :. : ::.: :.. . . ::::. ::.::.:
CCDS32 YLTDSEYTEGSTGKTCLMKAVLNLKDGVNACILPLLQIDRDSGNPQPLVNAQCTDDYYRG
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 QTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPGFYFGELPLSLAACTNQL
..:::::::.:.. : :::::::.:.: : : ::.: .: ::::::::::::::.:
CCDS32 HSALHIAIEKRSLQCVKLLVENGANVHARACGRFFQKGQGT-CFYFGELPLSLAACTKQW
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 GIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFVTSMYNEILILGAKLHP
.:..::.: : :...: :: ::::::::: ..::.:.: .:::::. .: ::.: :
CCDS32 DVVSYLLENPHQPASLQATDSQGNTVLHALVMISDNSAENIALVTSMYDGLLQAGARLCP
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 TLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHLSRKFTEWAYGPVHSSL
:..::.. : . .::: ::: ::: .. .:::::.. ::::::::: ::::. ::
CCDS32 TVQLEDIRNLQDLTPLKLAAKEGKIEIFRHILQREFSG--LSHLSRKFTEWCYGPVRVSL
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 YDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVY
:::. .:.::.:::::.::. ..:.:: :...::::.::: ::: .. . :..:::
CCDS32 YDLASVDSCEENSVLEIIAFHC-KSPHRHRMVVLEPLNKLLQAKWDLLIPK-FFLNFLCN
350 360 370 380 390
450 460 470 480 490
pF1KE2 CLYMIIFTMAAYYRPV---DGLPPFKMEKIGDYFRVTGEILSVLGGVYFFFRGIQYFLQR
.::.::: .::..:. .. : .: : .:. . .::.:: .:::.:.. . :: .:
CCDS32 LIYMFIFTAVAYHQPTLKKQAAPHLKAE-VGNSMLLTGHILILLGGIYLLVGQLWYFWRR
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 RPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFSLALGWTNMLYYTRGF
. . :.::: :.::..:.:. ... :: : .. :. .: .:.::: :.:::::::
CCDS32 HVFIWISFIDSYFEILFLFQALLTVVSQVLCFLAIEWYLPLLVSALVLGWLNLLYYTRGF
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 QQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKNDSLPSESTSHRWRGP
:. :::.:::.:.::::: ::...:.::::::..:.:.: ... :. .. . :
CCDS32 QHTGIYSVMIQKVILRDLLRFLLIYLVFLFGFAVALVSLSQEAWRPEAPTGPNATESVQP
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 ACRPPD----SSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFIILLLAYVILTYILL
: ..: .. . :::::::::::.: : :. :... ..::::::.::::::
CCDS32 MEGQEDEGNGAQYRGILEASLELFKFTIGMGELAFQEQLHFRGMVLLLLLAYVLLTYILL
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 LNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFRSGKLLQVGYTPDG
::::::::.::::..: .: .:::::.::..:. :... : :: :.: .: :: :::
CCDS32 LNMLIALMSETVNSVATDSWSIWKLQKAISVLEMENGYWWC-RKKQRAGVMLTVGTKPDG
640 650 660 670 680 690
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pF1KE2 KDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSRVSGRHWKNFALVP
. : ::::::.::::..:. .. . :::.. :: :::
CCDS32 SPDERWCFRVEEVNWASWEQTLPTLCEDPSGA-GVPRTLENPVLASPPKEDEDGASEENY
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830
pF1KE2 LLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
CCDS32 VPVQLLQSN
760
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130 140 150 160 170 180
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::..:: :: ::.:::.::..: :::::: ::.::: .:.: :::.::.::..: ..
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190 200 210 220 230 240
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CCDS53 REFINSPFRDIYYRG---------------------------------------------
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250 260 270 280 290 300
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.::. .:. :.: : .:: . :. :..:: .:: :::::.. .:..::. . . ::::
CCDS53 KMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLS
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::: .::::::.::::::: .::: :. ::::...:.: . :::.:: :::.:.::.::
CCDS53 RKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNS-KIENRHEMLAVEPINELLRDK
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: .: ::.: . : :.:::..:::.:..: ::. .. ::.:..::..... ::
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::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :.: :::.:
CCDS53 LFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFAL
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pF1KE2 ALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKND
.::: : ::.:::.. : :..::.:....:: ::..::..:..:...:.:.:.. :
CCDS53 VLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANM
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.. .:. .. :.:: :: ... . :.:::.::::::::. . . .:::::
CCDS53 KVCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIIL
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:..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.:: .::::::
CCDS53 LVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRS
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pF1KE2 GKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSRV
:... :: . :: : :::::::::::. :: :.::::::::. : . .:: .:.
CCDS53 GEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGRL
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pF1KE2 SGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
.:.. .:: . : . ....:.::
CCDS53 RRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
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. . : .:: : . . . . . : : : : . .. : ... :
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:: :: ::... ..: ::. ::. .. :.. : .::::::.:
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..: :. . .:.: .... :... .. .. . . :: :: : ...... :.. ...:
CCDS11 AIPHPLALTHKMG-WLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVF
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:.:..... .: ::. :::.: .:...::::.::::::::::.::.:.:::.:.::.:
CCDS11 FIQAVLVILSVFLYLFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHD
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. .:.:::::::.::..:...::: .:. : :::.:. .. :
CCDS11 VLKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKCPKDN------------KDC----SSYGSFSDAVL
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CCDS11 ELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLITYVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESER
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::.:::: :::. :: . . .:. :: :.: .:. .::.: :.:..::.:: :.:.
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CCDS11 VSFLNEDPGP---VRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV
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CCDS58 IAAGADVNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEH--EQTDITSR
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.:..... .: ::. :::.: .:...::::.::::::::::.::.:.:::.:.::.:.
CCDS58 IQAVLVILSVFLYLFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDV
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:::.:::.:::.. .: . .:..::..:::::..::::::::::::::.....::. :
CCDS58 LFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLITYVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERI
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pF1KE2 WKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNV
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CCDS58 WRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGELCKVA-----EDDFRLCLRINEVKWTEWKTHV
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CCDS58 SFLNEDPGP---VRRTADFNKIQDSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV
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CCDS53 MDSLFDYGTYRHHSSDNKRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGST
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CCDS53 ADLDGLLPFLLTHKKRLTDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNM
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pF1KE2 KELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPGFY
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CCDS53 REFINSPFRDIYYRG---------------------------------------------
230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFVT
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CCDS53 --ELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVT
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 SMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHLS
.::. .:. :.: : .:: . :. :..:: .:: :::::
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:::.:: :::.:.::.:::
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.: ::.: . : :.:::..:::.:..: ::. .. ::.:..::..... ::
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::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :.: :::.:.
CCDS53 FFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALV
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::: : ::.:::.. : :..::.:....:: ::..::..:..:...:.:.:.. : .
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. .:. .. :.:: :: ... . :.:::.::::::::. . . .::::::
CCDS53 VCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILL
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..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.:: .:::::::
CCDS53 VTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSG
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pF1KE2 KLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSRVS
... :: . :: : :::::::::::. :: :.::::::::. : . .:: .:.
CCDS53 EMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGRLR
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pF1KE2 GRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
.:.. .:: . : . ....:.::
CCDS53 RDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
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310 320 330 340 350 360
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:.::. .:. :.: : .:: . :. :..:: .:: :::::
CCDS91 TKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIG------------------
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::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :.: :::.:
CCDS91 LFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFAL
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.::: : ::.:::.. : :..::.:....:: ::..::..:..:...:.:.:.. :
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CCDS91 KVCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIIL
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pF1KE2 GKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSRV
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CCDS91 RRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
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>>CCDS5875.1 TRPV5 gene_id:56302|Hs109|chr7 (729 aa)
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CCDS58 ---PELVFEPTTCEAFAGQTALHIAVVNQNVNLVRALLTRRASVSARATGTAFRHSP-RN
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pF1KE2 GFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTADNTK
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CCDS58 LIYFGEHPLSFAACVNSEEIVRLLIEHG---ADIRAQDSLGNTVLHILI-----LQPNKT
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CCDS58 FACQMYNLLLSYDGHGDHLQP---LDLVPNHQGLTPFKLAGVEGNTVMFQHLMQKR----
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CCDS58 --RHI-----QWTYGPLTSILYDLTEIDSWGEELSFLELVV--SSDKREARQILEQTPVK
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CCDS58 ELVSFKWNKYGRPYFCILAALYLLYMICFTTCCVYRPLKFRGGNRTHSRDITILQQKLLQ
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CCDS58 EAYETREDIIRLVGELVSIVGAVIILLLEIPDIFRVGASRYFGKTILGGPFHVIIITYAS
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CCDS58 L-VLVTMVMRLTNTNGEVVPMSFALVLGWCSVMYFTRGFQMLGPFTIMIQKMIFGDLMRF
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CCDS58 FLTVI---DAPANYDVDLPFMFSIVNFAFTIIATLLMLNLFIAMMGDTHWRVAQERDELW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]