Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2394, 821 aa
1>>>pF1KE2394 821 - 821 aa - 821 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1372+/-0.00112; mu= 15.4360+/- 0.067
mean_var=70.7882+/-13.736, 0's: 0 Z-trim(102.6): 40 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.152438
statistics sampled from 7026 (7042) to 7026 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 ( 821) 5347 1185.9 0
CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 543) 894 206.5 9.8e-53
CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 719) 894 206.5 1.3e-52
CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22 ( 734) 882 203.9 8.1e-52
CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8 ( 863) 845 195.8 2.7e-49
CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 (1143) 783 182.2 4.4e-45
CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3 ( 904) 772 179.7 1.9e-44
CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 818) 750 174.9 4.9e-43
CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 853) 750 174.9 5.1e-43
CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 840) 663 155.8 2.9e-37
CCDS13095.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 824) 659 154.9 5.2e-37
CCDS63227.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 880) 590 139.7 2.1e-32
CCDS63226.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 793) 478 115.1 4.9e-25
>>CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 (821 aa)
initn: 5347 init1: 5347 opt: 5347 Z-score: 6349.9 bits: 1185.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5347; 100.0% identity (100.0% similar) in 821 aa overlap (1-821:1-821)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNT
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CCDS21 MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 HKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNIC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RNPVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RNPVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 CCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 TISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDEC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NEVTDYAIARRIVDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NEVTDYAIARRIVDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 TPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 CRISNLIVLHLRKVEEEEDESALKRSELVNWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIHRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 CRISNLIVLHLRKVEEEEDESALKRSELVNWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIHRL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KE2 THYDHVLIELTQAGLKGSTEGSESYEEDPYLVVNPNYLLED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 THYDHVLIELTQAGLKGSTEGSESYEEDPYLVVNPNYLLED
790 800 810 820
>>CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (543 aa)
initn: 941 init1: 725 opt: 894 Z-score: 1060.2 bits: 206.5 E(32554): 9.8e-53
Smith-Waterman score: 1009; 37.6% identity (68.2% similar) in 510 aa overlap (151-655:1-464)
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNIC
.: .:. : .: . . :. . .:
CCDS56 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMC
10 20 30
190 200 210 220 230
pF1KE2 RNPVCANRR---RFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQ
. : . : :. :.: :::. ::....:: . ..: :.::::. :....: .. ::
CCDS56 PSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 AGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLV
::. . :: : .: . : : .: :.: .: :.: .:.:
CCDS56 PGDHVSVTG--IFLP----ILRTGFR-----QV--VQGLLSETY--LEA-------HRIV
100 110 120
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPT
: ..:.. :: ...: .: ... : ...:..: .:. :
CCDS56 ---------------KMNKSEDD--ESGAGELTREELRQIAE----EDFYEKLAASIAPE
130 140 150 160
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 IHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAV
:.:...::...::.: ::: .. .: ..::.::.:..:::..::::.:.......::.
CCDS56 IYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSP-RGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQ
170 180 190 200 210 220
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 YTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAM
::.:..::..::::::.:: : :...:.:::.:::.::::::::::: :..::::.:
CCDS56 YTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVM
230 240 250 260 270 280
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 EQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILV
:::::::.:::. .::::: :::::::: :.:. .::.:::.: : ..:::::....
CCDS56 EQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQ
290 300 310 320 330 340
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 DECNEVTDYAIARRI--VDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIV
:. .. .: .:..: : ::: : . .. .:::. . :. .: . . :.:.
CCDS56 DRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMRRYIAMCREKQPMVPESLADYIT
350 360 370 380 390 400
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 EQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKS
: ..:.. . ..:.. ..: : ...::: :.::.. : :. . :.::.::.. :
CCDS56 AAYVEMRRE--AWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMS
410 420 430 440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 IIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRL
CCDS56 KDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDE
470 480 490 500 510 520
>>CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (719 aa)
initn: 941 init1: 725 opt: 894 Z-score: 1058.2 bits: 206.5 E(32554): 1.3e-52
Smith-Waterman score: 1088; 37.1% identity (67.6% similar) in 558 aa overlap (106-655:130-640)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 STTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTRHK---IRELTSSRIG
: . : . :: :. .: :::. .. .:
CCDS56 DVYIEHRLMMEQRSRDPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQG-PSSNKPRVIREVRADSVG
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180
pF1KE2 LLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRR---
:. . : :.:. :.:..: .:. : .: . . :. . .: . : . :
CCDS56 KLVTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGG
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLI
:. :.: :::. ::....:: . ..: :.::::. :....: .. :: ::. . :: ..
CCDS56 RLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIFL
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPR
. : : : : :.: .: :.: .:.:
CCDS56 PI-----LRT-GFRQV-------VQGLLSETY--LEA-------HRIV------------
280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVL
: ..:.. :: ...: .: ... : ...:..: .:. : :.:...::...:
CCDS56 ---KMNKSEDD--ESGAGELTREELRQIAE----EDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALL
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGL
:.: ::: .. .: ..::.::.:..:::..::::.:.......::. ::.:..::..::
CCDS56 LLLVGGVDQSP-RGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGV
::::.:: : :...:.:::.:::.::::::::::: :..::::.::::::::.:::.
CCDS56 TAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIA
.::::: :::::::: :.:. .::.:::.: : ..:::::.... :. .. .: .:
CCDS56 LTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLA
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RRI--VDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGS
..: : ::: : . .. .:::. . :. .: . . :.:. : ..:.. .
CCDS56 QHITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRRE--A
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 GVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLD
..:.. ..: : ...::: :.::.. : :. . :.::.::.. :
CCDS56 WASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTA
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 QEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEYCRISNLI
CCDS56 RTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNAS
660 670 680 690 700 710
>>CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22 (734 aa)
initn: 917 init1: 638 opt: 882 Z-score: 1043.8 bits: 203.9 E(32554): 8.1e-52
Smith-Waterman score: 1011; 31.3% identity (62.0% similar) in 658 aa overlap (27-657:32-649)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKY-LQLAEELIR
:. : .::.... . . . .. .:: :
CCDS13 SGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELKR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 PERNT----LVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIP------
. : . : . :: .:...:. . .. . : .: : : :. :
CCDS13 -HYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKE-VADEVTRPRPSGEE
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 LAKDFYVAFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVI
. .:. : ... . .:: : :. .. :..: : .. . :. . . .. : .:....
CCDS13 VLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE2 RDVEQQ---FKYTQPNICRN-----PVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPR
.. .. :. : : . : : :.. .: . :::: ...:: .:.
CCDS13 TNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMP-DKCKCVDFQTLKLQELPDAVPH
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 GSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYE
: .:: ... ... :.. . : . ...:.. :.:: : .
CCDS13 GEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMG----IYSIKKFGL------TTSR-----GRD
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 TEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKV
:. :.:. .: :. .. : . ...:. . .. .: :.
CCDS13 RVGV-GIRSSYIRVLGIQV--------------------DTDGSGRSFAGAVSPQEEEEF
290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 FEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGD
... :.:. . :. :.: :. ..:... .:::: : .: . :::::. ..::
CCDS13 RRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGD
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 PSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVC
:.:::::.:: ::. :: .::::::.::::::::.:.:: :..:..:.::..:::.::
CCDS13 PGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVV
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 CIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLK
:::::::: :.::::::::::::::.:::. .:::.: :.::::: . :..:..:. .
CCDS13 CIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKG-E
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 QNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRI---EESIDRVYSLDDIRR
.::.. :.::::..::. :: :: : .:.... :: .... .: ...
CCDS13 DNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLKK
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620
pF1KE2 YLLFAR-QFKPKISKESEDFIVEQYKHLR----QRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSE
.. . : . :..: :. . . ..: .: :.. .. .:: :::::::...:..:
CCDS13 FIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAE
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 AMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADS
:...:. . :.::.::.. : .
CCDS13 ALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKR
630 640 650 660 670 680
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CCDS61 SVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLLLDPQDEAYDRRLAHHLVALYY
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CCDS61 QSEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRK---IGSSRGMVS
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:::::.:::.:: :... ..:. :.:: ::
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CCDS61 GMSATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALA
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CCDS56 NLHARISGLPVCPELVREHIPKTKDVGHFLSVTGTVIRTSLVKVLEFERDYMCNKCKHVF
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CCDS56 SIPRSMKVILEDDLVDSCKSGDDLTIYG---IVMQRWKPFQQDVRCEV------------
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CCDS56 ----------------EIVLKANYIQVNN-----------EQSSGIIMDEEVQKEFEDFW
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CCDS56 SVNIALGSPLLSRFDLILVLLDTKNEDWDRIISSFILENKGYPSKS-EKLWSMEKMKTYF
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CCDS56 CLIRNLQPTLSDVGNQVLLRYYQMQRQSD----CRNAARTTIRLLESLIRLAEAHARLMF
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: :
CCDS56 RDTVTLEDAITVVSVMESSMQGGALLGGVNALHTSFPENPGEQYQRQCELILEKLELQSL
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10 20 30 40 50
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CCDS30 SLVVNYEDLAAREHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDR----ITNHIHVR
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CCDS30 ISHLPLVEELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQN
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CCDS30 QEVKPGSC--PECQSAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADL
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CCDS30 VDSCKPGDEIELTGIY--------------HNNYDGSLNTANGFPV--------------
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: ::..:.:...::.:::: : : :.:...:::::.::: ::: :::::::. .:...
CCDS30 SSRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTS
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CCDS30 IHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDI
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CCDS30 LCVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEV
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CCDS30 LKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKE---SMATGSIPITVRHIESMIRMAEA
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CCDS30 HARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFIL
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CCDS75 WSCGRLREITWTSWTTRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFG
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CCDS75 SKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVA
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CCDS75 FPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVD
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CCDS75 RAIPTTGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIH
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CCDS75 EVMEQGRVTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLF
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CCDS75 IMLDQMDPEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQ
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pF1KE2 VYSLDD------------------IRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDG-
.: : ...:. :. .:: ...:: .:.:.:..::..:.
CCDS75 IYEKHDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKIIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSM
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pF1KE2 SGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNL
:. : . .:.: ::..:::. : :. . :. . ..:: .:.. . ..
CCDS75 SSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKK
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CCDS49 SPPLPRGNLWWREEFGSFRAGVESSWEPPRDFGGGSSLAAGMAGTVVLDDVELREAQRDY
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CCDS49 LDFLDDEE--DQGI-YQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAF
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:::: :: : ..:::... .. ..: . : ::: .. .. . : :..
CCDS49 QRALKDFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSL
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