FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2390, 501 aa
1>>>pF1KE2390 501 - 501 aa - 501 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0686+/-0.000311; mu= 20.2463+/- 0.019
mean_var=77.7371+/-15.497, 0's: 0 Z-trim(117.6): 169 B-trim: 119 in 1/53
Lambda= 0.145466
statistics sampled from 29615 (29793) to 29615 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16
Scan time: 10.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000738 (OMIM: 100710,616313,616314) acetylcholi ( 501) 3400 723.0 5e-208
NP_005190 (OMIM: 100730,253290,265000) acetylcholi ( 517) 1290 280.2 1e-74
NP_000742 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61632 ( 517) 1268 275.5 2.5e-73
NP_001243586 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 502) 1148 250.3 9.3e-66
NP_000071 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) acet ( 493) 1103 240.9 6.4e-63
XP_016879604 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) P ( 481) 1079 235.9 2.1e-61
NP_001298125 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 416) 1010 221.3 4.2e-57
XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 777 172.4 2.3e-42
XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 777 172.4 2.3e-42
XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 777 172.5 2.4e-42
XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 777 172.5 2.4e-42
XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 777 172.5 2.5e-42
XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 777 172.5 2.5e-42
NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 777 172.5 2.5e-42
XP_011519494 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 316) 771 171.1 4.3e-42
XP_011508826 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 390) 763 169.5 1.6e-41
XP_016855669 (OMIM: 118507,605375) PREDICTED: neur ( 332) 732 162.9 1.3e-39
NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 732 163.0 1.8e-39
NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 676 151.3 6.2e-36
NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479) 663 148.5 3.9e-35
XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 649 145.6 3.2e-34
NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 649 145.6 3.2e-34
XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 649 145.6 3.2e-34
XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 639 143.5 1.2e-33
XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 636 142.9 1.9e-33
XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 635 142.7 2.2e-33
NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 580 131.2 8.4e-30
NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 565 128.0 5.9e-29
NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 547 124.2 8.5e-28
XP_016868492 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 534 121.4 4.6e-27
XP_005273454 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 534 121.4 4.6e-27
NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 534 121.5 5.8e-27
NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 532 121.1 7.4e-27
XP_016858745 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 489) 532 121.1 7.5e-27
XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 530 120.7 1.1e-26
XP_011526826 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 556) 530 120.7 1.1e-26
NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 526 119.8 1.8e-26
XP_016868493 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 523 119.0 2.1e-26
XP_011542691 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 523 119.0 2.1e-26
XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 243) 521 118.5 2.2e-26
XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 245) 521 118.5 2.2e-26
NP_001243502 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ( 451) 518 118.1 5.4e-26
XP_016883114 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 451) 518 118.1 5.4e-26
XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 517 117.9 6.1e-26
NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 513 117.1 1.1e-25
XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 494 113.1 1.8e-24
NP_001298124 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 323) 485 111.0 5.2e-24
XP_011542692 (OMIM: 118508) PREDICTED: neuronal ac ( 329) 482 110.4 8.1e-24
XP_011519479 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 401) 469 107.8 6.2e-23
XP_011520455 (OMIM: 609756) PREDICTED: CHRNA7-FAM7 ( 412) 469 107.8 6.3e-23
>>NP_000738 (OMIM: 100710,616313,616314) acetylcholine r (501 aa)
initn: 3400 init1: 3400 opt: 3400 Z-score: 3855.7 bits: 723.0 E(85289): 5e-208
Smith-Waterman score: 3400; 100.0% identity (100.0% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGLIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNND
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFYLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFYLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLYLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLYLRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KRPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KRPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRFI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTS
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE2 VGTLVIFLDATYHLPPPDPFP
:::::::::::::::::::::
NP_000 VGTLVIFLDATYHLPPPDPFP
490 500
>>NP_005190 (OMIM: 100730,253290,265000) acetylcholine r (517 aa)
initn: 1046 init1: 607 opt: 1290 Z-score: 1462.4 bits: 280.2 E(85289): 1e-74
Smith-Waterman score: 1290; 42.0% identity (69.7% similar) in 509 aa overlap (4-501:6-506)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGL
: ::.:: :.. : :..: . : :: :...:: ..:::.. .: : ::. :
NP_005 MHGGQGPLLLLL-LLAVCL--GAQGRNQEERLLADLMQNYDPNLRPAERDSDVVNVSLKL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNN
:..::::::..: ..:.:.....: :::: ::: ...:. ::. . :: ::.:: ::
NP_005 TLTNLISLNEREEALTTNVWIEMQWCDYRLRWDPRDYEGLWVLRVPSTMVWRPDIVLENN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 NDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSE
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NP_005 VDGVFEVALYCNVLVSPDGCIYWLPPAIFRSACSISVTYFPFDWQNCSLIFQSQTYSTNE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 VSLQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFY
..:: . ::: . : : .: :::.: : :.:.... :. : ..:. .:.:.::
NP_005 IDLQLSQ-EDGQTIEWIFIDPEAFTENGEWAIQHRPAKMLLDPAAP--AQEAGHQKVVFY
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pF1KE2 LIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAG-EKMGLSIFALLTLTVFLLLLADK
:.:.::::::..:.::::.::. .::.. .:: :: .: ..: .::. ::::.:.: :
NP_005 LLIQRKPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHFLPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFLVAKK
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pF1KE2 VPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLY
::::: .::.: ::: : .:.. . :. .:::::. ::::::.: ::..:.. ::
NP_005 VPETSQAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAVVVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRLLPQL
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pF1KE2 LRLK-RPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGT-DEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPD
::.. :: .. . .. .:::. : .: . : :..:: . .: : :
NP_005 LRMHVRPLAPAAVQDTQSRLQNGSSGWSITTGEEVALCLPRSELLFQQWQR--QGLVAAA
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pF1KE2 LRRFIDGPNRAVALL--------PELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVV
:... ::. ... . : .. : . . :: ..: : .:.: .:. :.
NP_005 LEKLEKGPELGLSQFCGSLKQAAPAIQACVEACNLIACARHQQSHFDNGNEEWFLVGRVL
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pF1KE2 DRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP
::. . ... . :: ::: : :. : :::
NP_005 DRVCFLAMLSLFICGTAGIFLMAHYNRVPALPFPGDPRPYLPSPD
480 490 500 510
>>NP_000742 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,616323) a (517 aa)
initn: 1214 init1: 491 opt: 1268 Z-score: 1437.5 bits: 275.5 E(85289): 2.5e-73
Smith-Waterman score: 1268; 40.6% identity (70.5% similar) in 508 aa overlap (7-501:5-503)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFS--GYDSSVRPAREVGDRVRVSVGL
.. :: :.: . : : . : :: ..::. ::.. .::. . . : :...:
NP_000 MEGPVLTLGLLAALAVCGSWGLNEEERLIRHLFQEKGYNKELRPVAHKEESVDVALAL
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pF1KE2 ILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNN
:..::::.: .: ..:.:... ::: ::.:. : .:. ::. . ::::..:: ::
NP_000 TLSNLISLKEVEETLTTNVWIEHGWTDNRLKWNAEEFGNISVLRLPPDMVWLPEIVLENN
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pF1KE2 NDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSE
:::.:... . .:.: : : : ::.:.:::: :.:::::::::::.. ::: .: ..:
NP_000 NDGSFQISYSCNVLVYHYGFVYWLPPAIFRSSCPISVTYFPFDWQNCSLKFSSLKYTAKE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 VSLQTGLGPDGQGHQEIHIH------EGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREG-Q
..: .: :.. .. .. :: : :::.:::.:.:.:. :::. .. .
NP_000 ITL--SLKQDAKENRTYPVEWIIIDPEG-FTENGEWEIVHRPARVNV---DPRAPLDSPS
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 RQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFL
::.. ::::::::::::..:...::.::.... .::::: :.::: ...: .::. .:::
NP_000 RQDITFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISFMVNLVFYLPADSGEKTSVAISVLLAQSVFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFI
::.. ..: ::...:.: :.:.: :::::. :.. :.:::.: :.: :: . :...:.
NP_000 LLISKRLPATSMAIPLIGKFLLFGMVLVTMVVVICVIVLNIHFRTPSTHVLSEGVKKLFL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE2 HKLPLYLRLKRPKPERDLMPEPPHC--SSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPN-RFQ
. :: :...:: . : : : . :. ..:::. : ::..: : . :
NP_000 ETLPELLHMSRPAED---GPSPGALVRRSSSLGYISKAEEYFLLKSRSDLMFEKQSERHG
360 370 380 390 400
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pF1KE2 PELSAPDLRRFIDGPNRAVA-LLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVV
:: . ..: :. ::. .:.. ..:. ....:.... :..:. :: .:
NP_000 LARRLTTARRPPASSEQAQQELFNELKPAVDGANFIVNHMRDQNNYNEEKDSWNRVARTV
410 420 430 440 450 460
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pF1KE2 DRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP
::: :.. ::: :::...:. :::.:::
NP_000 DRLCLFVVTPVMVVGTAWIFLQGVYNQPPPQPFPGDPYSYNVQDKRFI
470 480 490 500 510
>>NP_001243586 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,616323 (502 aa)
initn: 1125 init1: 491 opt: 1148 Z-score: 1301.5 bits: 250.3 E(85289): 9.3e-66
Smith-Waterman score: 1203; 39.8% identity (68.3% similar) in 508 aa overlap (7-501:5-488)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFS--GYDSSVRPAREVGDRVRVSVGL
.. :: :.: . : : . : :: ..::. ::.. .::. . . : :...:
NP_001 MEGPVLTLGLLAALAVCGSWGLNEEERLIRHLFQEKGYNKELRPVAHKEESVDVALAL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNN
:..::::. ::: ::.:. : .:. ::. . ::::..:: ::
NP_001 TLSNLISLG---------------WTDNRLKWNAEEFGNISVLRLPPDMVWLPEIVLENN
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 NDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSE
:::.:... . .:.: : : : ::.:.:::: :.:::::::::::.. ::: .: ..:
NP_001 NDGSFQISYSCNVLVYHYGFVYWLPPAIFRSSCPISVTYFPFDWQNCSLKFSSLKYTAKE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VSLQTGLGPDGQGHQEIHIH------EGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREG-Q
..: .: :.. .. .. :: : :::.:::.:.:.:. :::. .. .
NP_001 ITL--SLKQDAKENRTYPVEWIIIDPEG-FTENGEWEIVHRPARVNV---DPRAPLDSPS
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFL
::.. ::::::::::::..:...::.::.... .::::: :.::: ...: .::. .:::
NP_001 RQDITFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISFMVNLVFYLPADSGEKTSVAISVLLAQSVFL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFI
::.. ..: ::...:.: :.:.: :::::. :.. :.:::.: :.: :: . :...:.
NP_001 LLISKRLPATSMAIPLIGKFLLFGMVLVTMVVVICVIVLNIHFRTPSTHVLSEGVKKLFL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KE2 HKLPLYLRLKRPKPERDLMPEPPHC--SSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPN-RFQ
. :: :...:: . : : : . :. ..:::. : ::..: : . :
NP_001 ETLPELLHMSRPAED---GPSPGALVRRSSSLGYISKAEEYFLLKSRSDLMFEKQSERHG
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 PELSAPDLRRFIDGPNRAVA-LLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVV
:: . ..: :. ::. .:.. ..:. ....:.... :..:. :: .:
NP_001 LARRLTTARRPPASSEQAQQELFNELKPAVDGANFIVNHMRDQNNYNEEKDSWNRVARTV
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500
pF1KE2 DRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP
::: :.. ::: :::...:. :::.:::
NP_001 DRLCLFVVTPVMVVGTAWIFLQGVYNQPPPQPFPGDPYSYNVQDKRFI
460 470 480 490 500
>>NP_000071 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) acetylch (493 aa)
initn: 986 init1: 625 opt: 1103 Z-score: 1250.6 bits: 240.9 E(85289): 6.4e-63
Smith-Waterman score: 1217; 39.9% identity (69.3% similar) in 499 aa overlap (3-500:5-487)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGL
: ..:.::: :: :: :.. : :: ..::..:: . ::.:: : : .:. .
NP_000 MARAPLGVLLLLGLLGR----GV-GKNEELRLYHHLFNNYDPGSRPVREPEDTVTISLKV
10 20 30 40 50
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pF1KE2 ILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNN
:..:::::::.: ..:.:.. ..: ::::... . ::..::. .: ::::..:: ::
NP_000 TLTNLISLNEKEETLTTSVWIGIDWQDYRLNYSKDDFGGIETLRVPSELVWLPEIVLENN
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 NDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSE
::.: :: : .:.: ::: : ::.:::: :...:::::::::::...: : .:.. :
NP_000 IDGQFGVAYDANVLVYEGGSVTWLPPAIYRSVCAVEVTYFPFDWQNCSLIFRSQTYNAEE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 VSLQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFY
: . .. ::. ..: : .. :::.: : :. . . : : :. .::.
NP_000 VEFTFAVDNDGKTINKIDIDTEAYTENGEWAIDFCPGVIRRHHGGATDG-PGET-DVIYS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAG-EKMGLSIFALLTLTVFLLLLADK
::::::::::..:.:.::.::. :......:: .:: .: .:: .::. ::::.:.:.:
NP_000 LIIRRKPLFYVINIIVPCVLISGLVLLAYFLPAQAGGQKCTVSINVLLAQTVFLFLIAQK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLY
.::::::::.. ..:.:.::..:. :. :.:::. .:.: :: : .:..... ::
NP_000 IPETSLSVPLLGRFLIFVMVVATLIVMNCVIVLNVSQRTPTTHAMSPRLRHVLLELLPRL
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 LRLKRPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLR
: . : :: ::. .: . : ..: ...:: :...: . : .:
NP_000 LG-SPPPPEAPRAASPPRRAS-SVGLLLRAEELILKKPRSELVFEGQRHRQGTWTAA---
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 RFIDGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFII
: .. . :. ::.: :......:.. ..:: :: .. ..: . .:. ..
NP_000 -FCQSLGAAA---PEVRCCVDAVNFVAESTRDQEATGEEVSDWVRMGNALDNICFWAALV
410 420 430 440 450 460
480 490 500
pF1KE2 FTSVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP
. :::. .::: : .. : :.
NP_000 LFSVGSSLIFLGAYFNRVPDLPYAPCIQP
470 480 490
>>XP_016879604 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) PREDI (481 aa)
initn: 986 init1: 625 opt: 1079 Z-score: 1223.5 bits: 235.9 E(85289): 2.1e-61
Smith-Waterman score: 1193; 39.8% identity (69.7% similar) in 482 aa overlap (20-500:6-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGLIL
:: :.. : :: ..::..:: . ::.:: : : .:. . :
XP_016 MQRGRGV-GKNEELRLYHHLFNNYDPGSRPVREPEDTVTISLKVTL
10 20 30 40
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pF1KE2 AQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNND
..:::::::.: ..:.:.. ..: ::::... . ::..::. .: ::::..:: :: :
XP_016 TNLISLNEKEETLTTSVWIGIDWQDYRLNYSKDDFGGIETLRVPSELVWLPEIVLENNID
50 60 70 80 90 100
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pF1KE2 GNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVS
:.: :: : .:.: ::: : ::.:::: :...:::::::::::...: : .:.. ::
XP_016 GQFGVAYDANVLVYEGGSVTWLPPAIYRSVCAVEVTYFPFDWQNCSLIFRSQTYNAEEVE
110 120 130 140 150 160
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pF1KE2 LQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFYLI
. .. ::. ..: : .. :::.: : :. . . : : :. .::. ::
XP_016 FTFAVDNDGKTINKIDIDTEAYTENGEWAIDFCPGVIRRHHGGATDG-PGET-DVIYSLI
170 180 190 200 210 220
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pF1KE2 IRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAG-EKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVP
::::::::..:.:.::.::. :......:: .:: .: .:: .::. ::::.:.:.:.:
XP_016 IRRKPLFYVINIIVPCVLISGLVLLAYFLPAQAGGQKCTVSINVLLAQTVFLFLIAQKIP
230 240 250 260 270 280
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pF1KE2 ETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLYLR
:::::::.. ..:.:.::..:. :. :.:::. .:.: :: : .:..... :: :
XP_016 ETSLSVPLLGRFLIFVMVVATLIVMNCVIVLNVSQRTPTTHAMSPRLRHVLLELLPRLLG
290 300 310 320 330 340
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pF1KE2 LKRPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRF
. : :: ::. .: . : ..: ...:: :...: . : .: :
XP_016 -SPPPPEAPRAASPPRRAS-SVGLLLRAEELILKKPRSELVFEGQRHRQGTWTAA----F
350 360 370 380 390
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pF1KE2 IDGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFT
.. . :. ::.: :......:.. ..:: :: .. ..: . .:. ...
XP_016 CQSLGAAA---PEVRCCVDAVNFVAESTRDQEATGEEVSDWVRMGNALDNICFWAALVLF
400 410 420 430 440 450
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pF1KE2 SVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP
:::. .::: : .. : :.
XP_016 SVGSSLIFLGAYFNRVPDLPYAPCIQP
460 470 480
>>NP_001298125 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,616323 (416 aa)
initn: 987 init1: 491 opt: 1010 Z-score: 1146.1 bits: 221.3 E(85289): 4.2e-57
Smith-Waterman score: 1010; 40.9% identity (70.6% similar) in 394 aa overlap (119-501:18-402)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 SWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNNDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYR
:::.:... . .:.: : : : ::.:.:
NP_001 MLKNLETSVSCASPRTCNDGSFQISYSCNVLVYHYGFVYWLPPAIFR
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 SSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVSLQTGLGPDGQGHQEIHIH------EGTF
::: :.:::::::::::.. ::: .: ..:..: .: :.. .. .. :: :
NP_001 SSCPISVTYFPFDWQNCSLKFSSLKYTAKEITL--SLKQDAKENRTYPVEWIIIDPEG-F
50 60 70 80 90 100
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pF1KE2 IENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREG-QRQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITL
:::.:::.:.:.:. :::. .. .::.. ::::::::::::..:...::.::..
NP_001 TENGEWEIVHRPARVNV---DPRAPLDSPSRQDITFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISF
110 120 130 140 150 160
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pF1KE2 LAIFVFYLPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTF
.. .::::: :.::: ...: .::. .:::::.. ..: ::...:.: :.:.: :::::.
NP_001 MVNLVFYLPADSGEKTSVAISVLLAQSVFLLLISKRLPATSMAIPLIGKFLLFGMVLVTM
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370
pF1KE2 SVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLYLRLKRPKPERDLMPEPPHC--SSP
:.. :.:::.: :.: :: . :...:.. :: :...:: . : : :
NP_001 VVVICVIVLNIHFRTPSTHVLSEGVKKLFLETLPELLHMSRPAED---GPSPGALVRRSS
230 240 250 260 270
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pF1KE2 GSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKPN-RFQPELSAPDLRRFIDGPNRAVA-LLPELREVV
. :. ..:::. : ::..: : . : :: . ..: :. ::. .:
NP_001 SLGYISKAEEYFLLKSRSDLMFEKQSERHGLARRLTTARRPPASSEQAQQELFNELKPAV
280 290 300 310 320 330
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pF1KE2 SSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHLPPP
.. ..:. ....:.... :..:. :: .:::: :.. ::: :::...:. :::
NP_001 DGANFIVNHMRDQNNYNEEKDSWNRVARTVDRLCLFVVTPVMVVGTAWIFLQGVYNQPPP
340 350 360 370 380 390
500
pF1KE2 DPFP
.:::
NP_001 QPFPGDPYSYNVQDKRFI
400 410
>>XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal acetyl (424 aa)
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Smith-Waterman score: 1196; 42.8% identity (68.9% similar) in 444 aa overlap (73-500:1-419)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 RPAREVGDRVRVSVGLILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLR
:.:.:.: :::::::.:. ....:.. ::
XP_011 MTTNVWLKQEWTDYRLTWNSSRYEGVNILR
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110 120 130 140 150 160
pF1KE2 ITAESVWLPDVVLLNNNDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDW
: :. .::::.:: :: ::...:.. ...: :.::: : ::.::.:.:.:.: :::::
XP_011 IPAKRIWLPDIVLYNNADGTYEVSVYTNLIVRSNGSVLWLPPAIYKSACKIEVKYFPFDQ
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 QNCTMVFSSYSYDSSEVSLQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPG
::::. : :..:: .:... . . : .. . : .:.:.:. :.: :
XP_011 QNCTLKFRSWTYDHTEIDM-VLMTPTASMDD--------FTPSGEWDIVALPGRRTVNPQ
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 DPRGGREGQRQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIF
:: . .: . .::.:::::: .:.: ::.: :::::.::::: : :::: : :
XP_011 DP------SYVDVTYDFIIKRKPLFYTINLIIPCVLTTLLAILVFYLPSDCGEKMTLCIS
150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 ALLTLTVFLLLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQM
.::.:: ::::.. :: :::.::.: :::::::::::::.. :: :::.::::: :: :
XP_011 VLLALTFFLLLISKIVPPTSLDVPLIGKYLMFTMVLVTFSIVTSVCVLNVHHRSPSTHTM
200 210 220 230 240 250
350 360 370 380
pF1KE2 PLWVRQIFIHKLPLYLRLKRPKPERD---LMPEPPHC----------SSPGSGWGRGTDE
::.. :.:::: .: .::: :. . .: : .::.. .: ..
XP_011 APWVKRCFLHKLPTFLFMKRPGPDSSPARAFPPSKSCVTKPEATATSTSPSNFYG--NSM
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 YFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRF-IDGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQ
::. :.. .: : .. : : : . . .: . ...:.. ..:.::....
XP_011 YFVN--PASAASKSPAGSTP-VAIP--RDFWLRSSGR---FRQDVQEALEGVSFIAQHMK
320 330 340 350 360
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 EQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATY--HLPPPDPFP
.... ... :::..:::::::::::.:.. .::. .:: . : :.
XP_011 NDDEDQSVVEDWKYVAMVVDRLFLWVFMFVCVLGTVGLFLPPLFQTHAASEGPYAAQRD
370 380 390 400 410 420
>>XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal acetyl (424 aa)
initn: 1131 init1: 564 opt: 777 Z-score: 881.7 bits: 172.4 E(85289): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 1196; 42.8% identity (68.9% similar) in 444 aa overlap (73-500:1-419)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 RPAREVGDRVRVSVGLILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLR
:.:.:.: :::::::.:. ....:.. ::
XP_011 MTTNVWLKQEWTDYRLTWNSSRYEGVNILR
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 ITAESVWLPDVVLLNNNDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDW
: :. .::::.:: :: ::...:.. ...: :.::: : ::.::.:.:.:.: :::::
XP_011 IPAKRIWLPDIVLYNNADGTYEVSVYTNLIVRSNGSVLWLPPAIYKSACKIEVKYFPFDQ
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 QNCTMVFSSYSYDSSEVSLQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPG
::::. : :..:: .:... . . : .. . : .:.:.:. :.: :
XP_011 QNCTLKFRSWTYDHTEIDM-VLMTPTASMDD--------FTPSGEWDIVALPGRRTVNPQ
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 DPRGGREGQRQEVIFYLIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAGEKMGLSIF
:: . .: . .::.:::::: .:.: ::.: :::::.::::: : :::: : :
XP_011 DP------SYVDVTYDFIIKRKPLFYTINLIIPCVLTTLLAILVFYLPSDCGEKMTLCIS
150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 ALLTLTVFLLLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQM
.::.:: ::::.. :: :::.::.: :::::::::::::.. :: :::.::::: :: :
XP_011 VLLALTFFLLLISKIVPPTSLDVPLIGKYLMFTMVLVTFSIVTSVCVLNVHHRSPSTHTM
200 210 220 230 240 250
350 360 370 380
pF1KE2 PLWVRQIFIHKLPLYLRLKRPKPERD---LMPEPPHC----------SSPGSGWGRGTDE
::.. :.:::: .: .::: :. . .: : .::.. .: ..
XP_011 APWVKRCFLHKLPTFLFMKRPGPDSSPARAFPPSKSCVTKPEATATSTSPSNFYG--NSM
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 YFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPDLRRF-IDGPNRAVALLPELREVVSSISYIARQLQ
::. :.. .: : .. : : : . . .: . ...:.. ..:.::....
XP_011 YFVN--PASAASKSPAGSTP-VAIP--RDFWLRSSGR---FRQDVQEALEGVSFIAQHMK
320 330 340 350 360
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 EQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATY--HLPPPDPFP
.... ... :::..:::::::::::.:.. .::. .:: . : :.
XP_011 NDDEDQSVVEDWKYVAMVVDRLFLWVFMFVCVLGTVGLFLPPLFQTHAASEGPYAAQRD
370 380 390 400 410 420
>>XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal acetyl (468 aa)
initn: 1226 init1: 564 opt: 777 Z-score: 881.2 bits: 172.5 E(85289): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 1280; 42.4% identity (69.1% similar) in 479 aa overlap (38-500:10-463)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGLILAQLISLN
:.. .::: .. . ... : ::::::.:
XP_016 MDDLLNKTRYNNLIRPATSSSQLISIKLQLSLAQLISVN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNNNDGNFDVAL
:... :.:.:.: :::::::.:. ....:.. ::: :. .::::.:: :: ::...:..
XP_016 EREQIMTTNVWLKQEWTDYRLTWNSSRYEGVNILRIPAKRIWLPDIVLYNNADGTYEVSV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVSLQTGLGP
...: :.::: : ::.::.:.:.:.: ::::: ::::. : :..:: .:... . . :
XP_016 YTNLIVRSNGSVLWLPPAIYKSACKIEVKYFPFDQQNCTLKFRSWTYDHTEIDM-VLMTP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFYLIIRRKPLF
.. . : .:.:.:. :.: : :: . .: . .::.:::::
XP_016 TASMDD--------FTPSGEWDIVALPGRRTVNPQDP------SYVDVTYDFIIKRKPLF
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