FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2389, 691 aa
1>>>pF1KE2389 691 - 691 aa - 691 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4190+/-0.00134; mu= 19.4318+/- 0.080
mean_var=77.8454+/-15.549, 0's: 0 Z-trim(100.4): 44 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.145364
statistics sampled from 6055 (6087) to 6055 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8685.1 SLCO1B1 gene_id:10599|Hs108|chr12 ( 691) 4561 967.1 0
CCDS8684.1 SLCO1B3 gene_id:28234|Hs108|chr12 ( 702) 3735 793.9 0
CCDS44843.1 SLCO1B7 gene_id:338821|Hs108|chr12 ( 640) 3209 683.6 2.4e-196
CCDS8683.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 ( 712) 2124 456.1 8.3e-128
CCDS53757.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 ( 730) 2043 439.1 1.1e-122
CCDS53759.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 ( 612) 1674 361.6 1.9e-99
CCDS8686.1 SLCO1A2 gene_id:6579|Hs108|chr12 ( 670) 1458 316.4 8.7e-86
CCDS53758.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 ( 663) 1430 310.5 5.1e-84
CCDS10371.1 SLCO3A1 gene_id:28232|Hs108|chr15 ( 710) 1366 297.1 5.9e-80
CCDS45354.1 SLCO3A1 gene_id:28232|Hs108|chr15 ( 692) 1365 296.9 6.7e-80
CCDS55243.1 SLCO5A1 gene_id:81796|Hs108|chr8 ( 687) 933 206.3 1.2e-52
CCDS6205.1 SLCO5A1 gene_id:81796|Hs108|chr8 ( 848) 933 206.3 1.5e-52
CCDS34205.1 SLCO4C1 gene_id:353189|Hs108|chr5 ( 724) 744 166.7 1.1e-40
CCDS44683.1 SLCO2B1 gene_id:11309|Hs108|chr11 ( 687) 665 150.1 1e-35
CCDS8235.1 SLCO2B1 gene_id:11309|Hs108|chr11 ( 709) 665 150.1 1.1e-35
CCDS3084.1 SLCO2A1 gene_id:6578|Hs108|chr3 ( 643) 650 146.9 8.7e-35
CCDS75282.1 SLCO6A1 gene_id:133482|Hs108|chr5 ( 657) 591 134.5 4.7e-31
CCDS34206.1 SLCO6A1 gene_id:133482|Hs108|chr5 ( 719) 591 134.6 5e-31
CCDS78042.1 SLCO6A1 gene_id:133482|Hs108|chr5 ( 466) 417 97.9 3.4e-20
CCDS53679.1 SLCO2B1 gene_id:11309|Hs108|chr11 ( 565) 402 94.9 3.5e-19
CCDS55242.1 SLCO5A1 gene_id:81796|Hs108|chr8 ( 793) 332 80.3 1.2e-14
>>CCDS8685.1 SLCO1B1 gene_id:10599|Hs108|chr12 (691 aa)
initn: 4561 init1: 4561 opt: 4561 Z-score: 5170.3 bits: 967.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4561; 100.0% identity (100.0% similar) in 691 aa overlap (1-691:1-691)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGAIIMKSSIIHIERRFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGAIIMKSSIIHIERRFE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMGIGGVLTALPHFFMGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMGIGGVLTALPHFFMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YRYSKETNINSSENSTSTLSTCLINQILSLNRASPEIVGKGCLKESGSYMWIYVFMGNML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YRYSKETNINSSENSTSTLSTCLINQILSLNRASPEIVGKGCLKESGSYMWIYVFMGNML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPIIGFTLGSLFSKMYVDIGYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPIIGFTLGSLFSKMYVDIGYV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQTPNKPQKERKASLSLHVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQTPNKPQKERKASLSLHVLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TNDEKDQTANLTNQGKNITKNVTGFFQSFKSILTNPLYVMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 TNDEKDQTANLTNQGKNITKNVTGFFQSFKSILTNPLYVMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIKKFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIKKFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSYCNSDCNCDESQWEPVCGNNGIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSYCNSDCNCDESQWEPVCGNNGIT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 YISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYSAHLGECPRDDACTRKFYFFVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYSAHLGECPRDDACTRKFYFFVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 QVLNLFFSALGGTSHVMLIVKIVQPELKSLALGFHSMVIRALGGILAPIYFGALIDTTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 QVLNLFFSALGGTSHVMLIVKIVQPELKSLALGFHSMVIRALGGILAPIYFGALIDTTCI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KWSTNNCGTRGSCRTYNSTSFSRVYLGLSSMLRVSSLVLYIILIYAMKKKYQEKDINASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KWSTNNCGTRGSCRTYNSTSFSRVYLGLSSMLRVSSLVLYIILIYAMKKKYQEKDINASE
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 NGSVMDEANLESLNKNKHFVPSAGADSETHC
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 NGSVMDEANLESLNKNKHFVPSAGADSETHC
670 680 690
>>CCDS8684.1 SLCO1B3 gene_id:28234|Hs108|chr12 (702 aa)
initn: 3768 init1: 3620 opt: 3735 Z-score: 4234.0 bits: 793.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3735; 79.8% identity (93.6% similar) in 692 aa overlap (1-691:1-691)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGAIIMKSSIIHIERRFE
:::.::::::::. ::.:::: :::.::::::::.:.:::.::.:::: :: .:::::.
CCDS86 MDQHQHLNKTAESASSEKKKTRRCNGFKMFLAALSFSYIAKALGGIIMKISITQIERRFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMGIGGVLTALPHFFMGY
:::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::..:: :..::.::::::::
CCDS86 ISSSLAGLIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCLLMGTGSILTSLPHFFMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YRYSKETNINSSENSTSTLSTCLINQILSLNRASPEIVGKGCLKESGSYMWIYVFMGNML
:::::::.:: ::::::.:::::::: ::.: .::::: : :.:::::.:::::::::::
CCDS86 YRYSKETHINPSENSTSSLSTCLINQTLSFNGTSPEIVEKDCVKESGSHMWIYVFMGNML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPIIGFTLGSLFSKMYVDIGYV
::::::::::::.::::::::::::::::: ::::.::::.:::.:::::.:::::::::
CCDS86 RGIGETPIVPLGISYIDDFAKEGHSSLYLGSLNAIGMIGPVIGFALGSLFAKMYVDIGYV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQTPNKPQKERKASLSLHVLE
::::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::..::::::::: :::::::.
CCDS86 DLSTIRITPKDSRWVGAWWLGFLVSGLFSIISSIPFFFLPKNPNKPQKERKISLSLHVLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TNDEKDQTANLTNQGKNITKNVTGFFQSFKSILTNPLYVMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVF
:::...:::::::::::.::::::::::.::::::::::.:.:::::::::.::.:::::
CCDS86 TNDDRNQTANLTNQGKNVTKNVTGFFQSLKSILTNPLYVIFLLLTLLQVSSFIGSFTYVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIKKFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLS
::.:::::: .:.::.:::.:::: :.::::::.:::::::. ::::::: .:...:.
CCDS86 KYMEQQYGQSASHANFLLGIITIPTVATGMFLGGFIIKKFKLSLVGIAKFSFLTSMISFL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSYCNSDCNCDESQWEPVCGNNGIT
: :::: ..::.:::::::.:::::: :.:: :::::::::.::::::::::::::::::
CCDS86 FQLLYFPLICESKSVAGLTLTYDGNNSVASHVDVPLSYCNSECNCDESQWEPVCGNNGIT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 YISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYSAHLGECPRDDACTRKFYFFVAI
:.:::::::::::: :: :::::::.::::::::::::::::::::..:::::...:::
CCDS86 YLSPCLAGCKSSSGIKKHTVFYNCSCVEVTGLQNRNYSAHLGECPRDNTCTRKFFIYVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 QVLNLFFSALGGTSHVMLIVKIVQPELKSLALGFHSMVIRALGGILAPIYFGALIDTTCI
::.: .::: :::. ..: :::::::::.::.::.:::::.::::::::::::::: ::.
CCDS86 QVINSLFSATGGTTFILLTVKIVQPELKALAMGFQSMVIRTLGGILAPIYFGALIDKTCM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KWSTNNCGTRGSCRTYNSTSFSRVYLGLSSMLRVSSLVLYIILIYAMKKKYQEKDINASE
:::::.::..:.:: :::. :.::::::: :: .:::::..:.:::::.: :: .::.
CCDS86 KWSTNSCGAQGACRIYNSVFFGRVYLGLSIALRFPALVLYIVFIFAMKKKFQGKDTKASD
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 NG-SVMDEANLESLNKNKHFVPSAGADSETHC
: .:::::::: ::...:::::::.::.: :
CCDS86 NERKVMDEANLEFLNNGEHFVPSAGTDSKT-CNLDMQDNAAAN
670 680 690 700
>>CCDS44843.1 SLCO1B7 gene_id:338821|Hs108|chr12 (640 aa)
initn: 3210 init1: 3122 opt: 3209 Z-score: 3638.4 bits: 683.6 E(32554): 2.4e-196
Smith-Waterman score: 3209; 73.5% identity (90.3% similar) in 637 aa overlap (48-683:1-637)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 NKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGAIIMKSSIIHIERRFEISSSLVGFIDGSFEIGN
:: : .:::::::::::::.:::::::::
CCDS44 MKISTTQIERRFEISSSLVGLIDGSFEIGN
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 LLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMGIGGVLTALPHFFMGYYRYSKETNINSSENSTS
:.:::::::::::::::::::::::.:: :..: ::::::::::::::::::. ::::::
CCDS44 LFVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFLMGTGSILMALPHFFMGYYRYSKETNIDPSENSTS
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 TLSTCLINQILSLNRASPEIVGKGCLKESGSYMWIYVFMGNMLRGIGETPIVPLGLSYID
.: .:::::.:::::. ::. .::.:::::.:::::::::::::::::::::::.::::
CCDS44 NLPNCLINQMLSLNRTPSEIIERGCVKESGSHMWIYVFMGNMLRGIGETPIVPLGISYID
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 DFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPIIGFTLGSLFSKMYVDIGYVDLSTIRITPTDSRWVGA
::::::::::::: .:...: : ...: :::::.:::::::::::::::::: :::::::
CCDS44 DFAKEGHSSLYLGTVNVMGMTGLVFAFMLGSLFAKMYVDIGYVDLSTIRITPKDSRWVGA
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 WWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQTPNKPQKERKASLSLHVLETNDEKDQTANLTNQGKN
:::.:::::. :::::::::::: .:::::::::.:: ::::.:::...: :::::. :
CCDS44 WWLGFLVSGIVSIISSIPFFFLPLNPNKPQKERKVSLFLHVLKTNDKRNQIANLTNRRKY
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 ITKNVTGFFQSFKSILTNPLYVMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVFKYVEQQYGQPSSKANIL
:::::::::::.::::::::::.::..:::..::::...::..:.:::::: .::.:.:
CCDS44 ITKNVTGFFQSLKSILTNPLYVIFVIFTLLHMSSYIASLTYIIKMVEQQYGWSASKTNFL
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 LGVITIPIFASGMFLGGYIIKKFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLSFYLLYFFILCENKSVAG
:::...: : ::: ::::::::::. ::.::.. .:.. : .::::..::.:::::
CCDS44 LGVLALPAVAIGMFSGGYIIKKFKLSLVGLAKLAFCSATVHLLSQVLYFFLICESKSVAG
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 LTMTYDGNNPVTSHRDVPLSYCNSDCNCDESQWEPVCGNNGITYISPCLAGCKSSSGNKK
::.:::::.:: :: :::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::.
CCDS44 LTLTYDGNSPVRSHVDVPLSYCNSECNCDESQWEPVCGNNGITYLSPCLAGCKSSSGNKE
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 PIVFYNCSCLEVTGLQNRNYSAHLGECPRDDACTRKFYFFVAIQVLNLFFSALGGTSHVM
:::::::::.:: ::::.:::::::::::::::::: : . .::::. :. :.: ::. .
CCDS44 PIVFYNCSCVEVIGLQNKNYSAHLGECPRDDACTRKSYVYFVIQVLDAFLCAVGLTSYSV
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 LIVKIVQPELKSLALGFHSMVIRALGGILAPIYFGALIDTTCIKWSTNNCGTRGSCRTYN
:...:::::::.::.:::::..:.:::::.::::::::::::.:::::.::.::.:: ::
CCDS44 LVIRIVQPELKALAIGFHSMIMRSLGGILVPIYFGALIDTTCMKWSTNSCGARGACRIYN
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 STSFSRVYLGLSSMLRVSSLVLYIILIYAMKKKYQEKDINASENG-SVMDEANLESLNKN
:: ..:...::. : ::: ..:....:: . :: .. :: .:::::::: :: .
CCDS44 STYLGRAFFGLKVALIFPVLVLLTVFIFVVRKKSHGKDTKVLENERQVMDEANLEFLNDS
580 590 600 610 620 630
680 690
pF1KE2 KHFVPSAGADSETHC
.::::::
CCDS44 EHFVPSAEEQ
640
>>CCDS8683.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 (712 aa)
initn: 2088 init1: 1072 opt: 2124 Z-score: 2408.1 bits: 456.1 E(32554): 8.3e-128
Smith-Waterman score: 2124; 45.4% identity (76.1% similar) in 687 aa overlap (15-690:30-711)
10 20 30 40
pF1KE2 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGA
:: ..: :. ::.:: :::. ..::.:.
CCDS86 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 IIMKSSIIHIERRFEISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMG
.::.: .:::::.: ::::: :::::::::::::.::::::.::::::.:: :: :::
CCDS86 GYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 IGGVLTALPHFFMGYYRYSKETNINSSENSTSTLSTCLI---NQI-LSLNRASPEIVGKG
.: .: :.:.::: :.: . . : ::: ..: ::. .:. .:. . : ...
CCDS86 VGTLLIAMPQFFMEQYKYER---YSPSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNE
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 CLKESGSYMWIYVFMGNMLRGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPI
: ...: ::::::.::.::::::::: :::..:.::::.: ....:.: ....:.::::
CCDS86 CEVDTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 IGFTLGSLFSKMYVDIGYVDLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQ
.:: :::: .:.:::::.:.:. : ::: : .:::::::..:..:..:.....::..::.
CCDS86 FGFLLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE2 T-PNKPQKERKASLSLHVLETNDEKDQTANLTNQGKN--ITKNVTGFFQSFKSILTNPLY
. : . ..: . : : . : :.: : ::.: : . . :. :.:... ::.:
CCDS86 SLPRSQSREDSNSSSEKSKFIID--DHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 VMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVFKYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIK
... . .: .: .: :: ::.:::::: ::.::...:.:.:: : :.: :: ..:
CCDS86 FLYLCTSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 KFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLSFYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSY
::.... : ::. ..:.. ..: : . :::..:::::..:.:..::. :. . .:
CCDS86 KFRISVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSD
420 430 440 450 460 470
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CCDS53 GIVGRCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLA
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CCDS53 NSPKHCSTFHFKEKLCFKTQKFYNQERKNNGVYKIPKGKLHYK
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CCDS86 IVRGMGETPILPLGISYIEDFAKFENSPLYIGLVETGAIIGPLIGLLLASFCANVYVDTG
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CCDS86 GLSYLSACLAGCETSIGTGINMVFQNCSCIQTSG----NSSAVLGLCDKGPDCSLMLQYF
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CCDS86 LILSAMSSFIYSLAAIPGYMVLLRCMKSEEKSLGVGLHTFCTRVFAGIPAPIYFGALMDS
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CCDS86 TCLHWGTLKCGESGACRIYDSTTFRYIYLGLPAALRGSSFVPALIILILLRKCHLPGE-N
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CCDS86 AS-SGTELIETKVKGKENECKDIYQKSTVLKDDELKTKL
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CCDS53 VGTLLIAMPQFFMEQYKYERY-----SPSSNSTLSI------------SP------CLLE
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CCDS53 CTSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRI
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pF1KE2 NTVGIAKFSCFTAVMSLSFYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSYCNSD
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CCDS53 SVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSR
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CCDS53 CKCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVG
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CCDS53 RCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVL
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pF1KE2 GGILAPIYFGALIDTTCIKWSTNNCGTRGSCRTYNSTSFSRVYLGLSSMLRVSSLVLYII
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CCDS53 AGIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRGSCRLYDSNVFRHIYLGLTVILGTVSILLSIA
560 570 580 590 600 610
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pF1KE2 LIYAMKKKYQEKD---INASENGSVMDEANLESLNKNKHFV-PSAGADSETHC
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CCDS53 VLFILKKNYVSKHRSFITKRERTMVSTRFQKENYTTSDHLLQPNYWPGKETQL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]