Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2387
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2387, 1756 aa
1>>>pF1KE2387 1756 - 1756 aa - 1756 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2581+/-0.00155; mu= -16.8551+/- 0.091
mean_var=585.4074+/-127.741, 0's: 0 Z-trim(107.6): 219 B-trim: 480 in 1/54
Lambda= 0.053008
statistics sampled from 9476 (9649) to 9476 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16
Scan time: 6.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10526.1 PPL gene_id:5493|Hs108|chr16 (1756) 11184 872.6 0
CCDS11737.1 EVPL gene_id:2125|Hs108|chr17 (2033) 2212 186.5 8.4e-46
CCDS82207.1 EVPL gene_id:2125|Hs108|chr17 (2055) 1879 161.0 3.9e-38
CCDS4959.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (2649) 948 89.9 1.3e-16
CCDS4501.1 DSP gene_id:1832|Hs108|chr6 (2871) 940 89.3 2.1e-16
CCDS47936.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4515) 918 87.8 9.4e-16
CCDS43771.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4525) 918 87.8 9.4e-16
CCDS43770.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4533) 918 87.8 9.5e-16
CCDS43775.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 918 87.8 9.5e-16
CCDS43773.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 918 87.8 9.5e-16
CCDS43774.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4551) 918 87.8 9.5e-16
CCDS43769.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4574) 918 87.8 9.5e-16
CCDS43772.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4684) 918 87.8 9.7e-16
CCDS47368.1 DSP gene_id:1832|Hs108|chr6 (2272) 804 78.9 2.4e-13
CCDS47443.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (5171) 741 74.3 1.2e-11
CCDS75474.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (5537) 741 74.4 1.3e-11
>>CCDS10526.1 PPL gene_id:5493|Hs108|chr16 (1756 aa)
initn: 11184 init1: 11184 opt: 11184 Z-score: 4644.8 bits: 872.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11184; 99.8% identity (99.9% similar) in 1756 aa overlap (1-1756:1-1756)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNSLFRKRNKGKYSPTVQTRSISNKELSELIEQLQKNADQVEKNIVDTEAKMQSDLARLQ
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CCDS10 MNSLFRKRNKGKYSPTVQTRSISNKELSELIEQLQKNADQVEKNIVDTEAKMQSDLARLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EGRQPEHRDVTLQKVLDSEKLLYVLEADAAIAKHMKHPQGDMIAEDIRQLKERVTNLRGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EGRQPEHRDVTLQKVLDSEKLLYVLEADAAIAKHMKHPQGDMIAEDIRQLKERVTNLRGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HKQIYRLAVKEVDPQVNWAALVEEKLDKLNNQSFGTDLPLVDHQVEEHNIFHNEVKAIGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HKQIYRLAVKEVDPQVNWAALVEEKLDKLNNQSFGTDLPLVDHQVEEHNIFHNEVKAIGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HLAKDGDKEQNSELRAKYQKLLAASQARQQHLSSLQDYMQRCTNELYWLDQQAKGRMQYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HLAKDGDKEQNSELRAKYQKLLAASQARQQHLSSLQDYMQRCTNELYWLDQQAKGRMQYD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 WSDRNLDYPSRRRQYENFINRNLEAKEERINKLHSEGDQLLAAEHPGRNSIEAHMEAVHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WSDRNLDYPSRRRQYENFINRNLEAKEERINKLHSEGDQLLAAEHPGRNSIEAHMEAVHA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DWKEYLNLLICEESHLKYMEDYHQFHEDVKDAQELLRKVDSDLNQKYGPDFKDRYQIELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DWKEYLNLLICEESHLKYMEDYHQFHEDVKDAQELLRKVDSDLNQKYGPDFKDRYQIELL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LRELDDQEKVLDKYEDVVQGLQKRGQQVVPLKYRRETPLKPIPVEALCDFEGEQGLISRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRELDDQEKVLDKYEDVVQGLQKRGQQVVPLKYRRETPLKPIPVEALCDFEGEQGLISRG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 YSYTLQKNNGESWELMDSAGNKLIAPAVCFVIPPTDPEALALADSLGSQYRSVRQKAAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YSYTLQKNNGESWELMDSAGNKLIAPAVCFVIPPTDPEALALADSLGSQYRSVRQKAAGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KRTLQQRYEVLKTENPGDASDLQGRQLLAGLDKVASDLDRQEKAITGILRPPLEQGRAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KRTLQQRYEVLKTENPGDASDLQGRQLLAGLDKVASDLDRQEKAITGILRPPLEQGRAVQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 DSAERAKDLKNITNELLRIEPEKTRSTAEGEAFIQALPGSGTTPLLRTQVEDTNRKYEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS10 DSAERAKDLKNITNELLRIEPEKTRSTAEGEAFIQALPGSGTTPLLRTRVEDTNRKYEHL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LQLLDLAQEKVDVANRLEKSLQQSWELLATHENHLNQDDTVPESSRVLDSKGQELAAMAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LQLLDLAQEKVDVANRLEKSLQQSWELLATHENHLNQDDTVPESSRVLDSKGQELAAMAC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ELQAQKSLLGEVEQNLQAAKQCSSTLASRFQEHCPDLERQEAEVHKLGQRFNNLRQQVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ELQAQKSLLGEVEQNLQAAKQCSSTLASRFQEHCPDLERQEAEVHKLGQRFNNLRQQVER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 RAQSLQSAKAAYEHFHRGHDHVLQFLVSIPSYEPQETDSLSQMETKLKNQKNLLDEIASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RAQSLQSAKAAYEHFHRGHDHVLQFLVSIPSYEPQETDSLSQMETKLKNQKNLLDEIASR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 EQEVQKICANSQQYQQAVKDYELEAEKLRSLLDLENGRSSHVSKRARLQSPATKVKEEEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS10 EQEVQKICANSQQYQQAVKDYELEAEKLRSLLDLENGRRSHVSKRARLQSPATKVKEEEA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 ALAAKFTEVYAINRQRLQNLEFALNLLRQQPEVEVTHETLQRNRPDSGVEEAWKIRKELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALAAKFTEVYAINRQRLQNLEFALNLLRQQPEVEVTHETLQRNRPDSGVEEAWKIRKELD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 EETERRRQLENEVKSTQEEIWTLRNQGPQESVVRKEVLKKVPDPVLEESFQQLQRTLAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EETERRRQLENEVKSTQEEIWTLRNQGPQESVVRKEVLKKVPDPVLEESFQQLQRTLAEE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 QHKNQLLQEELEALQLQLRALEQETRDGGQEYVVKEVLRIEPDRAQADEVLQLREELEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QHKNQLLQEELEALQLQLRALEQETRDGGQEYVVKEVLRIEPDRAQADEVLQLREELEAL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 RRQKGAREAEVLLLQQRVAALAEEKSRAQEKVTEKEVVKLQNDPQLEAEYQQLQEDHQRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RRQKGAREAEVLLLQQRVAALAEEKSRAQEKVTEKEVVKLQNDPQLEAEYQQLQEDHQRQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 DQLREKQEEELSFLQDKLKRLEKERAMAEGKITVKEVLKVEKDAATEREVSDLTRQYEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DQLREKQEEELSFLQDKLKRLEKERAMAEGKITVKEVLKVEKDAATEREVSDLTRQYEDE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 AAKARASQREKTELLRKIWALEEENAKVVVQEKVREIVRPDPKAESEVANLRLELVEQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AAKARASQREKTELLRKIWALEEENAKVVVQEKVREIVRPDPKAESEVANLRLELVEQER
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 KYRGAEEQLRSYQSELEALRRRGPQVEVKEVTKEVIKYKTDPEMEKELQRLREEIVDKTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KYRGAEEQLRSYQSELEALRRRGPQVEVKEVTKEVIKYKTDPEMEKELQRLREEIVDKTR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 LIERCDLEIYQLKKEIQALKDTKPQVQTKEVVQEILQFQEDPQTKEEVASLRAKLSEEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LIERCDLEIYQLKKEIQALKDTKPQVQTKEVVQEILQFQEDPQTKEEVASLRAKLSEEQK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 KQVDLERERASQEEQIARKEEELSRVKERVVQQEVVRYEEEPGLRAEASAFAESIDVELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KQVDLERERASQEEQIARKEEELSRVKERVVQQEVVRYEEEPGLRAEASAFAESIDVELR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 QIDKLRAELRRLQRRRTELERQLEELERERQARREAEREVQRLQQRLAALEQEEAEAREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QIDKLRAELRRLQRRRTELERQLEELERERQARREAEREVQRLQQRLAALEQEEAEAREK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 VTHTQKVVLQQDPQQAREHALLRLQLEEEQHRRQLLEGELETLRRKLAALEKAEVKEKVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VTHTQKVVLQQDPQQAREHALLRLQLEEEQHRRQLLEGELETLRRKLAALEKAEVKEKVV
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 LSESVQVEKGDTEQEIQRLKSSLEEESRSKRELDVEVSRLEARLSELEFHNSKSSKELDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSESVQVEKGDTEQEIQRLKSSLEEESRSKRELDVEVSRLEARLSELEFHNSKSSKELDF
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 LREENHKLQLERENLQLETRRLQSEINMAATETRDLRNMTVADSGTNHDSRLWSLERELD
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LREENHKLQLERQNLQLETRRLQSEINMAATETRDLRNMTVADSGTNHDSRLWSLERELD
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 DLKRLSKDKDLEIDELQKRLGSVAVKREQRENHLRRSIVVIHPDTGRELSPEEAHRAGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLKRLSKDKDLEIDELQKRLGSVAVKREQRENHLRRSIVVIHPDTGRELSPEEAHRAGLI
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 DWNMFVKLRSQECDWEEISVKGPNGESSVIHDRKSGKKFSIEEALQSGRLTPAQYDRYVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DWNMFVKLRSQECDWEEISVKGPNGESSVIHDRKSGKKFSIEEALQSGRLTPAQYDRYVN
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750
pF1KE2 KDMSIQELAVLVSGQK
::::::::::::::::
CCDS10 KDMSIQELAVLVSGQK
1750
>>CCDS11737.1 EVPL gene_id:2125|Hs108|chr17 (2033 aa)
initn: 2190 init1: 702 opt: 2212 Z-score: 935.8 bits: 186.5 E(32554): 8.4e-46
Smith-Waterman score: 2867; 30.9% identity (65.6% similar) in 1778 aa overlap (8-1755:21-1783)
10 20 30 40
pF1KE2 MNSLFRKRNKGKYSPTVQTRSISNKELSELIEQLQKNADQVEKNIVD
... : ::. ..:. . .::. :: ..: ::::::..:..
CCDS11 MFKGLSKGSQGKGSPKGSPAKGSPKGSPSRHSRAAT-QELALLISRMQANADQVERDILE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 TEAKMQSDLARLQEGRQPEHRDVTLQKVLDSEKLLYVLEADAAIAKHMKHPQGDMIAEDI
:. ..:.: .... .:.. : ... ..: :: : :. :...::::.. : .::
CCDS11 TQKRLQQDRLNSEQSQALQHQQETGRSLKEAEVLLKDLFLDVDKARRLKHPQAEEIEKDI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 RQLKERVTNLRGKHKQIYRLAV--KEVDPQVNWAALVEEKLDKLNNQSFGTDLPLVDHQV
.::.::::. .... .:. : .: :.:.:: ..:.: .. ..: . ...:.
CCDS11 KQLHERVTQECAEYRALYEKMVLPPDVGPRVDWARVLEQKQKQVCAGQYGPGMAELEQQI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 EEHNIFHNEVKAIGPHLAKDGDKEQNSELRAKYQKLLAASQARQQHLSSLQDYMQRCTNE
::::...:. : : .: .. . . .:..:. :: :.. : : :.:: ..: :: .
CCDS11 AEHNILQKEIDAYGQQL-RSLVGPDAATIRSQYRDLLKAASWRGQSLGSLYTHLQGCTRQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LYWLDQQAKGRMQYDWSDRNLDYPSRRRQYENFINRNLEAKEERINKLHSEGDQLLAAEH
: : .: . .: :::: : . ::.::.: ...: ..:. .:.:...:.... .:
CCDS11 LSALAEQQRRILQQDWSDLMADPAGVRREYEHFKQHELLSQEQSVNQLEDDGERMVELRH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 PGRNSIEAHMEAVHADWKEYLNLLICEESHLKYMEDYHQFHEDVKDAQELLRKVDSDLNQ
:. . :.::.::.. .:...::: ::.:..:...:::..:.:.. .... : :..:.:.
CCDS11 PAVGPIQAHQEALKMEWQNFLNLCICQETQLQHVEDYRRFQEEADSVSQTLAKLNSNLDA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 KYGPDFKDRYQIEL-LLRELDDQEKVLDKYEDVVQGLQKRGQQVVPLKYRRETPLKPIPV
::.: ::..:. .:: : : .. ::.:...:.:: ::. : .:. :
CCDS11 KYSPAPGGPPGAPTELLQQLEAEEKRLAVTERATGDLQRRSRDVAPLPQRRNPPQQPLHV
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 EALCDFEGEQGLISRGYSYTLQKN-NGESWELMDSAGNKLIAPAVCFVIPPTDPEALALA
...::... . . .: : : : . ..: .. .:. :::.:: :: ::.:.: :
CCDS11 DSICDWDSGEVQLLQGERYKLVDNTDPHAWVVQGPGGETKRAPAACFCIPAPDPDAVARA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE2 DSLGSQYRSVRQKAAGSKRTLQQR-YEVLK-TENPGDASDL---QGRQLLAGLDKVASDL
. :.:. ....:: : . :. : :. ... ..::: :...::. . .. .::
CCDS11 SRLASELQALKQKLATVQSRLKASAVESLRPSQQAPSGSDLANPQAQKLLTQMTRLDGDL
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 DRQEKAITGILRPPLEQGRAVQDSAERAKDLKNITNELLRIEPEKTRSTAEGEAFIQALP
. :. . . : :: . ..: : .. .. ...: . :: . : :::... :
CCDS11 GQIERQVLAWARAPLSRPTPLEDLEGRIHSHEGTAQRLQSLGTEKETAQKECEAFLSTRP
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 GSGTTPLLRTQVEDTNRKYEHLLQLLDLAQEKVDVANRLEKSLQQSWELLATHENHLNQD
. .. : . ..... :. . : .: ::. .: ::...:.. ... : : :.
CCDS11 VGPAALQLPVALNSVKNKFSDVQVLCSLYGEKAKAALDLERQIQDADRVIRGFEATLVQE
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 DTVPESSRVLDSKGQELAAMACELQAQKSLLGEVEQNLQAAKQCSSTLASRFQEHCPDLE
.: .:. . .:: . :: :.. . .... :.:... ..: . ::: : ::
CCDS11 APIPAEPGALQERVSELQRQRRELLEQQTCVLRLHRALKASEHACAALQNNFQEFCQDLP
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 RQEAEVHKLGQRFNNLRQQVERRAQSLQSAKAAYEHFHRGHDHVLQFLVSIPSYEPQETD
::. .:. : .:.. . .:.. : . .:.: .:..:. .:.. ..: .: . . .:
CCDS11 RQQRQVRALTDRYHAVGDQLDLREKVVQDAALTYQQFKNCKDNLSSWLEHLPRSQVRPSD
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 SLSQMETKLKNQKNLLDEIASREQEVQKICANSQQYQQAVKDYELEAEKLRSLLDLENGR
. ::. ::. :: : .:: :::.. :: : :..::::.:. : .::
CCDS11 GPSQIAYKLQAQKRLTQEIQSRERDRATASHLSQALQAALQDYELQADTYRC--SLEPTL
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 SSHVSKRARLQSPATKVKEEEAALAAKFTEVYAINRQRLQNLEFALNLLRQQP---EVEV
. . :: :. ... .: :: .::: : ..: ::.:::: ..:... ...
CCDS11 AVSAPKRPRVAPLQESIQAQEKNLAKAYTEVAAAQQQLLQQLEFARKMLEKKELSEDIRR
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 THETLQRNR-PDSGVEEAWKIRKELDEETERRRQLENEVKSTQEEIWTLRNQGPQESVVR
::.. : .. : .. .:. .. .:.:: .: ....:... . .. ::.: : : . .
CCDS11 THDAKQGSESPAQAGRESEALKAQLEEERKRVARVQHELEAQRSQLLQLRTQRPLERLEE
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 KEVLKKVPDPVLEESFQQLQRTLAEEQHKNQLLQEELEALQLQLRALEQETRDGGQEYVV
:::.. :: :: :..... . :: .. :: .::. .. ::.. . . ..
CCDS11 KEVVEFYRDPQLEGSLSRVKAQVEEEGKRRAGLQADLEVAAQKVVQLESKRKTMQPHLLT
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1000 1010 1020 1030 1040 1050
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.:::...: :. ::.. ..::. . : :..::. . :: .:..:. .
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.:: : .. . .:.. :. .:. : .. ::: . . :: :.. .:. . .:. .
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.: ... :.: .. :. . . ::.: ::: :.:: :.: : :.:
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: :. .:.: .... . .. :.. :.: :: :: :: . : :
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: : : :. .::::: .: . ::..:.:. :. . : :: :
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.. : .. : . : . . ::.. .: :::..:: :.: : ....::: :.:
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..:..: : :. :. .: : .::. :.:: . .: :.. ::.:. . : .
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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