Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2383
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2383, 490 aa
1>>>pF1KE2383 490 - 490 aa - 490 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8303+/-0.00118; mu= 6.3732+/- 0.070
mean_var=171.3876+/-35.790, 0's: 0 Z-trim(107.7): 136 B-trim: 20 in 1/50
Lambda= 0.097968
statistics sampled from 9568 (9718) to 9568 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41488.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 490) 3181 462.3 5.4e-130
CCDS44355.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 521) 3181 462.3 5.6e-130
CCDS44356.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 488) 3125 454.4 1.3e-127
CCDS44354.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 508) 3125 454.4 1.3e-127
CCDS81565.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 514) 2565 375.2 9e-104
CCDS31482.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 486) 2560 374.5 1.4e-103
CCDS53622.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 485) 2543 372.1 7.4e-103
CCDS53623.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 512) 2543 372.1 7.8e-103
CCDS7939.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 483) 2337 343.0 4.3e-94
CCDS7938.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 482) 2327 341.6 1.1e-93
CCDS45858.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 448) 857 133.8 3.8e-31
CCDS45856.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 485) 836 130.8 3.2e-30
CCDS32818.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 486) 835 130.7 3.5e-30
CCDS45857.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 826 129.4 8.4e-30
CCDS82250.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 819 128.4 1.7e-29
CCDS54197.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 409) 751 118.8 1.1e-26
CCDS10242.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 481) 638 102.9 8.3e-22
CCDS1002.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 465) 617 99.9 6.4e-21
CCDS12106.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 485) 586 95.5 1.4e-19
CCDS53955.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 344) 579 94.4 2.1e-19
CCDS53367.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 415) 559 91.6 1.7e-18
CCDS53956.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 454) 540 89.0 1.2e-17
>>CCDS41488.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 (490 aa)
initn: 3181 init1: 3181 opt: 3181 Z-score: 2447.3 bits: 462.3 E(32554): 5.4e-130
Smith-Waterman score: 3181; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 IVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQL
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE2 KRSKNDSKPY
::::::::::
CCDS41 KRSKNDSKPY
490
>>CCDS44355.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 (521 aa)
initn: 3181 init1: 3181 opt: 3181 Z-score: 2447.0 bits: 462.3 E(32554): 5.6e-130
Smith-Waterman score: 3181; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:32-521)
10 20 30
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSAFKLDFLPDMMVEGRLLVPDRINGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 ELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 PIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGC
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 AFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 ATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQ
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 TSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNI
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 NALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQ
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 QQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGF
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490
pF1KE2 VSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
490 500 510 520
>>CCDS44356.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 (488 aa)
initn: 2170 init1: 2170 opt: 3125 Z-score: 2404.6 bits: 454.4 E(32554): 1.3e-127
Smith-Waterman score: 3125; 98.6% identity (99.2% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 IVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAG
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ...:::::::::::::::::::
CCDS44 NSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALA--GTINSMAALNGGLGATGLTNGTAG
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQD
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQL
420 430 440 450 460 470
490
pF1KE2 KRSKNDSKPY
::::::::::
CCDS44 KRSKNDSKPY
480
>>CCDS44354.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 (508 aa)
initn: 2181 init1: 2181 opt: 3125 Z-score: 2404.3 bits: 454.4 E(32554): 1.3e-127
Smith-Waterman score: 3125; 98.8% identity (98.8% similar) in 490 aa overlap (1-490:25-508)
10 20 30
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MRCPKSAVTMRNEELLLSNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 EPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKP
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 TRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 TGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATST
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 NANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALA--
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 QMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ----GMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 SQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KE2 VSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
480 490 500
>>CCDS81565.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (514 aa)
initn: 2147 init1: 1302 opt: 2565 Z-score: 1976.5 bits: 375.2 E(32554): 9e-104
Smith-Waterman score: 2565; 79.1% identity (93.4% similar) in 497 aa overlap (1-490:28-514)
10 20 30
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELK
:::.::: :::: :::::::::.::.::::.:.
CCDS81 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 ELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQ
:::: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::
CCDS81 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 MKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
::::::::.::::::::::::.::::.::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS81 MKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 TFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTAT-
::.::::::.:::::::.:::::::::.:::::::::::::.:. ::: :::::...:.
CCDS81 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KE2 WGNLTGLGGLTPQYLAL----LQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAA
::::.::. : :::::: :::..::.::...:... :.:.::.::::::.:::::.:
CCDS81 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 AQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLN
::.. ..::: :.:.:: :..::: :.:.:.:... ..: ..:::.:: :::::.:::
CCDS81 AQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTSS-AGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLN
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 NINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSL
...:: ::::::::::..::.:::..::.:::::::::::::::::::::.:.:
CCDS81 -VGSLA------GMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 LQQQS--AAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSK
: ::: :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::
CCDS81 LTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSK
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KE2 CFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
480 490 500 510
>>CCDS31482.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (486 aa)
initn: 2122 init1: 1302 opt: 2560 Z-score: 1973.0 bits: 374.5 E(32554): 1.4e-103
Smith-Waterman score: 2560; 78.9% identity (93.4% similar) in 497 aa overlap (1-490:1-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKG
:::.::: :::: :::::::::.::.::::.:.:::: :::::.::::::::::::::::
CCDS31 MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLRELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCN
:::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::.::::.
CCDS31 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQMKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSP
::::::::: :::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::.:::::::::
CCDS31 ENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE2 IVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTAT-WGNLTGLGGLTPQYLAL----LQQATS
.:::::::::::::.:. ::: :::::...:. ::::.::. : :::::: :::..:
CCDS31 MVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVWGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTAS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPV
:.::...:... :.:.::.::::::.:::::.:::.. ..::: :.:.:: :..:::
CCDS31 SGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAAQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTS--
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 AASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLT
..:.:.:... ..: ..:::.:: :::::.::: ...:: ::::::::::..::.
CCDS31 SGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLN-VGSLA------GMAALNGGLGSSGLS
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 NGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQS--AAGSQKEGPEGANLFIYHLP
:::..::.:::::::::::::::::::::.:.:: ::: ::::::::::::::::::::
CCDS31 NGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLP
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 QEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGM
:::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS31 QEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGM
410 420 430 440 450 460
480 490
pF1KE2 KRLKVQLKRSKNDSKPY
:::::::::::::::::
CCDS31 KRLKVQLKRSKNDSKPY
470 480
>>CCDS53622.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (485 aa)
initn: 1395 init1: 764 opt: 2543 Z-score: 1960.0 bits: 372.1 E(32554): 7.4e-103
Smith-Waterman score: 2543; 78.7% identity (93.2% similar) in 497 aa overlap (1-490:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKG
:::.::: :::: :::::::::.::.::::.:.:::: :::::.::::::::::::::::
CCDS53 MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLRELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCN
:::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::.: ::::::::::.::::.
CCDS53 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQMKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCT
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSP
::::::::: :::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::.:::::::::
CCDS53 ENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE2 IVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTAT-WGNLTGLGGLTPQYLAL----LQQATS
.:::::::::::::.:. ::: :::::...:. ::::.::. : :::::: :::..:
CCDS53 MVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVWGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTAS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPV
:.::...:... :.:.::.::::::.:::::.:::.. ..::: :.:.:: :..:::
CCDS53 SGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAAQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTS--
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 AASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLT
..:.:.:... ..: ..:::.:: :::::.::: ...:: ::::::::::..::.
CCDS53 SGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLN-VGSLA------GMAALNGGLGSSGLS
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 NGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQS--AAGSQKEGPEGANLFIYHLP
:::..::.:::::::::::::::::::::.:.:: ::: ::::::::::::::::::::
CCDS53 NGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLP
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 QEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGM
:::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS53 QEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGM
410 420 430 440 450 460
480 490
pF1KE2 KRLKVQLKRSKNDSKPY
:::::::::::::::::
CCDS53 KRLKVQLKRSKNDSKPY
470 480
>>CCDS53623.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (512 aa)
initn: 1395 init1: 764 opt: 2543 Z-score: 1959.7 bits: 372.1 E(32554): 7.8e-103
Smith-Waterman score: 2543; 78.7% identity (93.2% similar) in 497 aa overlap (1-490:28-512)
10 20 30
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELK
:::.::: :::: :::::::::.::.::::.:.
CCDS53 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 ELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQ
:::: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::
CCDS53 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 MKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
::::::::.: ::::::::::.::::.::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS53 MKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 TFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTAT-
::.::::::.:::::::.:::::::::.:::::::::::::.:. ::: :::::...:.
CCDS53 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE2 WGNLTGLGGLTPQYLAL----LQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAA
::::.::. : :::::: :::..::.::...:... :.:.::.::::::.:::::.:
CCDS53 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 AQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLN
::.. ..::: :.:.:: :..::: ..:.:.:... ..: ..:::.:: :::::.:::
CCDS53 AQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTS--SGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLN
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 NINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSL
...:: ::::::::::..::.:::..::.:::::::::::::::::::::.:.:
CCDS53 -VGSLA------GMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNL
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 LQQQS--AAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSK
: ::: :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::
CCDS53 LTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSK
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KE2 CFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
470 480 490 500 510
>>CCDS7939.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (483 aa)
initn: 1935 init1: 1304 opt: 2337 Z-score: 1802.7 bits: 343.0 E(32554): 4.3e-94
Smith-Waterman score: 2583; 79.7% identity (94.1% similar) in 493 aa overlap (1-490:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKG
:::.::: :::: :::::::::.::.::::.:.:::: :::::.::::::::::::::::
CCDS79 MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLRELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCN
:::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::.::::.
CCDS79 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQMKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSP
::::::::: :::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::.:::::::::
CCDS79 ENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE2 IVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTAT-WGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNL
.:::::::::::::.:. ::: :::::...:. ::::.::. : :::::::::..::.::
CCDS79 MVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVWGNLAGLNTLGPQYLALLQQTASSGNL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAAST
...:... :.:.::.::::::.:::::.:::.. ..::: :.:.:: :..::: :.:.
CCDS79 NTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAAQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTSS-AGSS
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 PNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTA
:.:... ..: ..:::.:: :::::.::: ...:: ::::::::::..::.:::.
CCDS79 PSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLN-VGSLA------GMAALNGGLGSSGLSNGTG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 GTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQS--AAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFG
.::.:::::::::::::::::::::.:.:: ::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS79 STMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLK
:::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS79 DQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLK
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE2 VQLKRSKNDSKPY
:::::::::::::
CCDS79 VQLKRSKNDSKPY
480
>>CCDS7938.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (482 aa)
initn: 1948 init1: 1317 opt: 2327 Z-score: 1795.1 bits: 341.6 E(32554): 1.1e-93
Smith-Waterman score: 2578; 79.5% identity (94.1% similar) in 493 aa overlap (1-490:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKG
:::.::: :::: :::::::::.::.::::.:.:::: :::::.::::::::::::::::
CCDS79 MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLRELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCN
:::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::.::::.
CCDS79 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQMKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSP
::::::::: :::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::.:::::::::
CCDS79 ENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE2 IVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTAT-WGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNL
.:::::::::::::.:. ::: :::::...:. ::::.::. : :::::::::..::.::
CCDS79 MVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVWGNLAGLNTLGPQYLALLQQTASSGNL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAAST
...:... :.:.::.::::::.:::::.:::.. ..::: :.:.:: :..::: ..:.
CCDS79 NTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAAQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTS--SGSS
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 PNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTA
:.:... ..: ..:::.:: :::::.::: ...:: ::::::::::..::.:::.
CCDS79 PSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLN-VGSLA------GMAALNGGLGSSGLSNGTG
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 GTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQS--AAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFG
.::.:::::::::::::::::::::.:.:: ::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS79 STMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLK
:::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS79 DQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLK
410 420 430 440 450 460
480 490
pF1KE2 VQLKRSKNDSKPY
:::::::::::::
CCDS79 VQLKRSKNDSKPY
470 480
490 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 11:08:36 2016 done: Sun Nov 6 11:08:36 2016
Total Scan time: 2.400 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]