Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2373
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2373, 1143 aa
1>>>pF1KE2373 1143 - 1143 aa - 1143 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3545+/-0.000928; mu= 8.1300+/- 0.055
mean_var=190.0702+/-48.106, 0's: 0 Z-trim(110.9): 22 B-trim: 639 in 1/50
Lambda= 0.093029
statistics sampled from 11921 (11943) to 11921 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.367), width: 16
Scan time: 4.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 7621 1036.4 0
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 1222 177.6 1.5e-43
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220) 1222 177.6 1.5e-43
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 1169 170.3 1.4e-41
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 1155 168.6 7.8e-41
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 1131 165.4 6.4e-40
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 1127 164.8 7.5e-40
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 982 145.2 4.8e-34
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 982 145.3 4.9e-34
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 766 116.4 3.5e-25
CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 748 114.1 2.4e-24
CCDS1949.2 DQX1 gene_id:165545|Hs108|chr2 ( 717) 735 112.1 4.8e-24
CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10 ( 743) 720 110.1 2e-23
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 685 105.5 6.4e-22
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 684 105.5 9.4e-22
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 643 99.8 2.4e-20
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 643 99.8 2.7e-20
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 629 98.1 1.4e-19
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 625 97.6 2.2e-19
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 612 95.8 6.6e-19
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157) 472 77.0 2.9e-13
CCDS9987.2 TDRD9 gene_id:122402|Hs108|chr14 (1382) 449 73.9 2.9e-12
>>CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143 aa)
initn: 7621 init1: 7621 opt: 7621 Z-score: 5537.1 bits: 1036.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7621; 100.0% identity (100.0% similar) in 1143 aa overlap (1-1143:1-1143)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPPPRTREGRDRRDHHRAPSEEEALEKWDWNCPETRRLLEDAFFREEDYIRQGSEECQKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MPPPRTREGRDRRDHHRAPSEEEALEKWDWNCPETRRLLEDAFFREEDYIRQGSEECQKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 WTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKHSIPALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKHSIPALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEHQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEHQV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSHVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSHVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 QLQAAASSAQDLSREQLALLKLVLGRGLYPQLAVPDAFNSSRKDSDQIFHTQAKQGAVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QLQAAASSAQDLSREQLALLKLVLGRGLYPQLAVPDAFNSSRKDSDQIFHTQAKQGAVLH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 PTCVFAGSPEVLHAQELEASNCDGSRDDKDKMSSKHQLLSFVSLLETNKPYLVNCVRIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PTCVFAGSPEVLHAQELEASNCDGSRDDKDKMSSKHQLLSFVSLLETNKPYLVNCVRIPA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 LQSLLLFSRSLDTNGDCSRLVADGWLELQLADSESAIRLLAASLRLRARWESALDRQLAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQSLLLFSRSLDTNGDCSRLVADGWLELQLADSESAIRLLAASLRLRARWESALDRQLAH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 QAQQQLEEEEEDTPVSPKEVATLSKELLQFTASKIPYSLRRLTGLEVQNMYVGPQTIPAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QAQQQLEEEEEDTPVSPKEVATLSKELLQFTASKIPYSLRRLTGLEVQNMYVGPQTIPAT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PHLPGLFGSSTLSPHPTKGGYAVTDFLTYNCLTNDTDLYSDCLRTFWTCPHCGLHAPLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PHLPGLFGSSTLSPHPTKGGYAVTDFLTYNCLTNDTDLYSDCLRTFWTCPHCGLHAPLTP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 LERIAHENTCPQAPQDGPPGAEEAALETLQKTSVLQRPYHCEACGKDFLFTPTEVLRHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LERIAHENTCPQAPQDGPPGAEEAALETLQKTSVLQRPYHCEACGKDFLFTPTEVLRHRK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 QHV
:::
CCDS12 QHV
>>CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181 aa)
initn: 1249 init1: 434 opt: 1222 Z-score: 895.4 bits: 177.6 E(32554): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 1324; 37.5% identity (67.2% similar) in 606 aa overlap (119-714:526-1105)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 SIPALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQA
.:.: .: . . :... : . :.: .
CCDS77 AEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIG-MMPND-IPEWKK---HAFG-GNKAS
500 510 520 530 540
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 FGRLAKLQ--RERAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFS-
.:. .... ..: .::: . ....:.....:...: :.:: ::.::. ::: ::..
CCDS77 YGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTS
550 560 570 580 590 600
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 --HVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQ
...::::::.: .:.::::. : :..::: ::::. : : : ..: :.:::.
CCDS77 RGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRE
610 620 630 640 650 660
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 IQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYF
.:.: :: ....::.::: .:.: :.:.:.. . : :.:.:. :::.. ::.::
CCDS77 CLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYF
670 680 690 700 710 720
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLV
.::. .::: .:. ..: :: : . :: .. :.. : :: ::.::
CCDS77 YEAPIFTIPGRTYPVEILY---TKEPET---DYLDAS-LITVMQ-IHLTEPP---GDILV
730 740 750 760 770
390 400 410 420 430
pF1KE2 FLSGMAEISA----VLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILS
::.:. ::.. . : .. . . . ..::..::: : ..:: :::: :: ...
CCDS77 FLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIA
780 790 800 810 820 830
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 TNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGV
:::::::.::::: .::: : ::. :. .. ...: ::::.:.:: :::::::::
CCDS77 TNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGK
840 850 860 870 880 890
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 CFRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAI
:.:::.: : : . ::::.:. : : ::..:.:...: .: :.. :: .: ::.
CCDS77 CYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAM
900 910 920 930 940 950
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 LYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPF
: ::::. :: .: .:..:.. .. ::::.. .. : .:::.. ::::. :
CCDS77 EQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVF
960 970 980 990 1000 1010
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 TRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLY
: ... . ... .:: .::. :.:.: . .. : :: . :. . :
CCDS77 YRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSW-----KNNKFSNPWCYENFIQARSLR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 EMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKV
. ..:.:. ... : : .... : : :.:.
CCDS77 RAQDIRKQMLGIMDRHKL----DVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLID
1080 1090 1100 1110 1120
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 LRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLAQLQAAASSAQDLSREQLA
CCDS77 QQVVYIHPSSALFNRQPECPKHFLPVVAVAVSLEQCLSKFEDLNKELGLVTC
1130 1140 1150 1160 1170 1180
>>CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220 aa)
initn: 1249 init1: 434 opt: 1222 Z-score: 895.2 bits: 177.6 E(32554): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 1324; 37.5% identity (67.2% similar) in 606 aa overlap (119-714:526-1105)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 SIPALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQA
.:.: .: . . :... : . :.: .
CCDS11 AEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIG-MMPND-IPEWKK---HAFG-GNKAS
500 510 520 530 540
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 FGRLAKLQ--RERAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFS-
.:. .... ..: .::: . ....:.....:...: :.:: ::.::. ::: ::..
CCDS11 YGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTS
550 560 570 580 590 600
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 --HVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQ
...::::::.: .:.::::. : :..::: ::::. : : : ..: :.:::.
CCDS11 RGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRE
610 620 630 640 650 660
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 IQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYF
.:.: :: ....::.::: .:.: :.:.:.. . : :.:.:. :::.. ::.::
CCDS11 CLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYF
670 680 690 700 710 720
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLV
.::. .::: .:. ..: :: : . :: .. :.. : :: ::.::
CCDS11 YEAPIFTIPGRTYPVEILY---TKEPET---DYLDAS-LITVMQ-IHLTEPP---GDILV
730 740 750 760 770
390 400 410 420 430
pF1KE2 FLSGMAEISA----VLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILS
::.:. ::.. . : .. . . . ..::..::: : ..:: :::: :: ...
CCDS11 FLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIA
780 790 800 810 820 830
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 TNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGV
:::::::.::::: .::: : ::. :. .. ...: ::::.:.:: :::::::::
CCDS11 TNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGK
840 850 860 870 880 890
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 CFRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAI
:.:::.: : : . ::::.:. : : ::..:.:...: .: :.. :: .: ::.
CCDS11 CYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAM
900 910 920 930 940 950
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 LYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPF
: ::::. :: .: .:..:.. .. ::::.. .. : .:::.. ::::. :
CCDS11 EQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVF
960 970 980 990 1000 1010
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 TRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLY
: ... . ... .:: .::. :.:.: . .. : :: . :. . :
CCDS11 YRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSW-----KNNKFSNPWCYENFIQARSLR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 EMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKV
. ..:.:. ... : : .... : : :.:.
CCDS11 RAQDIRKQMLGIMDRHKL----DVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLID
1080 1090 1100 1110 1120
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 LRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLAQLQAAASSAQDLSREQLA
CCDS11 QQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKL
1130 1140 1150 1160 1170 1180
>>CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 (707 aa)
initn: 1099 init1: 469 opt: 1169 Z-score: 860.1 bits: 170.3 E(32554): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 1172; 35.9% identity (63.8% similar) in 622 aa overlap (85-690:14-602)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 EECQKFWTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKHSIPALADLPRTYDP-RYRINLSVLGP
.: . :. : .. : : . : . :
CCDS11 MPEEAGFPPAKRFRPGSGPPSRAG---SFPPGRQVVMLLTAGS
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQ
. ::. : :. : ..: .: .. .: .::: : ...:
CCDS11 GGRGGGGGRRQQPP---------------LAQPSASPYPEAVELQRRSLPIFQARGQLLA
50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 TLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH---VACTQPRRIACISLAKRVGFESLS
:.. . .:. :.:: ::.::.:::: .:.:. .: :::::.: :::: ::. :. .
CCDS11 QLRNLDNAVLIGETGSGKTTQIPQYLYEGGISRQGIIAVTQPRRVAAISLATRVSDEKRT
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 QYGSQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDF
. :. ::: .::... : :.: ::: :.:::. . : .: .:.::.::: .:.:
CCDS11 ELGKLVGYTVRFDDVTSEDTRIKFLTDGMLLREAISDSLLRKYSCVILDEAHERTIHTDV
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340
pF1KE2 LLGVLQRLLPTRPDL-----KVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQ
:.::.. : .: :::.::::....:::.::..:::. . :: :: : : :
CCDS11 LFGVVKAAQKRRKELGKLPLKVIVMSATMDVDLFSQYFNGAPVLYLEGRQHPIQVFYTKQ
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 EAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHT
: ... : .. :.. :. : . :.::::.:. :: :. .. . :.:
CCDS11 ---P---QNDYLHA-ALVSVFQI--HQEAPSSQ-DILVFLTGQEEIEAMSKTCRDIAKHL
270 280 290 300 310
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 QR----WVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKV
.::::...: :.: .::. :: : :: :.::::::::.:: ::..:::.: :
CCDS11 PDGCPAMLVLPLYASLPYAQQLRVFQGAPKGYRKVIISTNIAETSITITGIKYVVDTGMV
320 330 340 350 360 370
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 KEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIR
: .:.:.. :. : .:...: :: ::::: :.:.:::.:.... : . ::::.
CCDS11 KAKKYNPDSGLEVLAVQRVSKTQAWQRTGRAGREDSGICYRLYTEDEFEKFDKMTVPEIQ
380 390 400 410 420 430
530 540 550 560 570
pF1KE2 RVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGAL---DSSEALTPIGS
: : :..::. .:.: . :: :. : : ...:: : ::: :.. .:::.:
CCDS11 RCNLASVMLQLLAMKVPNVLTFDFMSKPSPDHIQAAIAQLDLLGALEHKDDQLTLTPMGR
440 450 460 470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 LLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESD
.: .:.. ..: .... : .: .:::.. :::.: . . : ..:. . :.
CCDS11 KMAAFPLEPKFAKTILMSPKFHCTEEILTIVSLLSVDSVLHNPPSRREEVQGVRKKFISS
500 510 520 530 540 550
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 QGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLA
.:: .::.:.. .. .. ... ::.. .. . . .:..: :....
CCDS11 EGDHMTLLNIYRTFKNLG-----GNKDWCKENFVNSKNMTLVAEVRAQLRDICLKMSMPI
560 570 580 590 600 610
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 GAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPA
CCDS11 ASSRGDVESVRRCLAHSLFMSTAELQPDGTYATTDTHQPVAIHPSSVLFHCKPACVVYTE
620 630 640 650 660 670
>>CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227 aa)
initn: 1209 init1: 433 opt: 1155 Z-score: 846.6 bits: 168.6 E(32554): 7.8e-41
Smith-Waterman score: 1205; 36.8% identity (66.3% similar) in 552 aa overlap (149-691:519-1052)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 QGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEH
:.. .. ..: ::: ...: ....
CCDS10 KAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDN
490 500 510 520 530 540
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 QVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH---VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQ
..:.:.:.:: ::.::. ::: :.. ..::::::.: .:.::::. : .. : .
CCDS10 SIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEE
550 560 570 580 590 600
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVL
::: ::::. : : : ..: :.:::. :: .: .: ..:.::.::: :..: :.:.:
CCDS10 VGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLL
610 620 630 640 650 660
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQ--PQEAEPTTSK
.... : :::.:. :::.. :...:.:.:. ..::: ::. .... ::: ..
CCDS10 REVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAV
670 680 690 700 710 720
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQR---WVV
...:. . . : ::.:.:. :. .: .. . . . . .:
CCDS10 KQSLQ----------VHLSGAP---GDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAV
730 740 750 760 770
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQA
::..: : : :.:. :: ::::::..:::::::.:.::: ::.::: : ..:.
CCDS10 LPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRI
780 790 800 810 820 830
480 490 500 510 520
pF1KE2 KLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDSLV
.. :: . ::::.:.::.::::::::: :::::..: : . . ::::.:. : ..:
CCDS10 GMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVV
840 850 860 870 880 890
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 LQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVI
: .::..: : : :..::: .. ... : ::::.. .:: : :....:.: ..
CCDS10 LLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPAL
900 910 920 930 940 950
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 GKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVF
.::::.. .. .: :.. ::: . : : : :. . ..: .: .::.
CCDS10 SKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVY
960 970 980 990 1000 1010
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 NAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSY
: . . : :: . :. . . .. ..: :.:...
CCDS10 LQW-----KNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 SRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQ
CCDS10 KCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYM
1080 1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041 aa)
initn: 1177 init1: 449 opt: 1131 Z-score: 830.2 bits: 165.4 E(32554): 6.4e-40
Smith-Waterman score: 1248; 33.9% identity (61.8% similar) in 741 aa overlap (4-714:224-941)
10 20 30
pF1KE2 MPPPRTREGRDRRDHHRAPSEEEALEKWDWNCP
:. :. ..::.. : :.: :: . .
CCDS46 RNVLERSDKKAYEEAQKRLKMAEEDRKAMVPELRK-KSRREYL-AKREREKLEDLEAELA
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80
pF1KE2 ETRRLLEDAFF----REE-DYIRQGSEECQKFWTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKH
. . :. :. . :.: : :. . ... . :. .... . . .. ::: .
CCDS46 DEEFLFGDVELSRHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQ-EKLEATNRYHMPKETRGQPAR
260 270 280 290 300 310
90 100 110 120 130
pF1KE2 SIPALADLPRTY-DPRYRINLSVLGPATR--GSQGLGRHLPA-------ERVAEFRRALL
.. . . . . . : . . :: :. :.. . . : :.. :: ::
CCDS46 AVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQ
320 330 340 350 360 370
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 HYLDFGQKQAFGRLAKLQRE-----RAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKST
: . :.: : .::. . ...: .. .:::... :.:: ::.:
CCDS46 LQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTT
380 390 400 410 420 430
200 210 220 230 240
pF1KE2 QVPQYLLAAGFSH----VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAA
:.::::. :... .:::::::.: .:.: ::. : . :..:::.::::. :
CCDS46 QIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSER
440 450 460 470 480 490
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVIL
: . ..: :.:::.. ::.: .: :..:::.::: ::.:.:.:... . ::.:::..
CCDS46 TVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLV
500 510 520 530 540 550
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 MSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESI
:::.. . ::..:..::: ..::: ::. . : : .. : . ::. :
CCDS46 ASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKA---PEADYLEAC----VVSVLQ-I
560 570 580 590 600
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 DHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTY----ASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKV
:: ::.::::.:. :: :. : : .:. .. .:::... : : ..
CCDS46 HVTQPP---GDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARI
610 620 630 640 650
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASA
:. .:::.:: ...:::::::.::.:: .:.: : :. ::.:.. .. : :.:::
CCDS46 FQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASA
660 670 680 690 700 710
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 EQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYD-AFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFP
.:: :::::.. : :::::. :. . ::::.:..: ..:: .::... : :
CCDS46 NQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFD
720 730 740 750 760 770
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEP
:..::: .: :. : :::. :: : .:.:::: ...::.. . .: :
CCDS46 FLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEE
780 790 800 810 820 830
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VLTIAAALSVQ-SPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNS
.::.:: :::. : : : .. . :: . :: ..:.::.. :.. : :
CCDS46 ILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAE-----SGYS
840 850 860 870 880 890
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQ
.:: . .. . . . ..:.:.. ::: . .: .. : :: : :...
CCDS46 SQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLER--VEVGLSSCQ-GD-YIRVRKAITAGYFYH
900 910 920 930 940 950
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLAQLQ
CCDS46 TARLTRSGYRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLE
960 970 980 990 1000 1010
>>CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 (795 aa)
initn: 1052 init1: 643 opt: 1127 Z-score: 828.9 bits: 164.8 E(32554): 7.5e-40
Smith-Waterman score: 1201; 38.5% identity (66.6% similar) in 563 aa overlap (151-696:126-673)
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEHQV
: . ..: ::. .: .:. . : .::
CCDS33 HSAHSTHAGHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE2 VVVAGDTGCGKSTQVPQ----YL--LAAGFSHVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGS
:..:.:: ::.::.:: :. : . ::::::::.: .:.:.::. : . :.
CCDS33 FVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQ
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 QVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGV
.:::.::::. :: : . ..: :.:::. . .: : .: :.:.::.::: : .:.:.::
CCDS33 EVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKS
:.... : :::::.::::.. . :. ::.: :.. .::: :. . : : :: .
CCDS33 LKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTP---EPERDYL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 EKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQRWV----V
: .:.. .: : . ::.::::.::.:. ::. . . . .. : .
CCDS33 EAA-----IRTVIQI-H-MCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKI
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460
pF1KE2 LPLHSALSVADQDKVFDVAPP----GV--RKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEM
.::.:.: .:...:. :: :. :: ..::::::::.::::. ::.: : .:.
CCDS33 IPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQK
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 SYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDA-FAPYPVPEIRRV
:.:. ... : ::.:::.:: :::::: :: :::::.:. : . . ::: :
CCDS33 VYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRS
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 ALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQL
: :.:::.:.... : : :..:: : .: :. : .::... :: .::..:..
CCDS33 NLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEF
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 PVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPF
:.: ..::.: . .. . ::.:.: ::: . :.: .... :. . .:: .
CCDS33 PLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHL
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 TLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAA
::.::..:. : ...: .:: :. . :. :.:.:...... .:
CCDS33 TLLNVYHAFKQ-----NHESVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDF
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 QVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGAS
CCDS33 TSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKDNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFV
690 700 710 720 730 740
>>CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 (672 aa)
initn: 820 init1: 432 opt: 982 Z-score: 724.8 bits: 145.2 E(32554): 4.8e-34
Smith-Waterman score: 991; 34.7% identity (66.7% similar) in 519 aa overlap (195-691:56-558)
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 AQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH----VACTQPRRIACISL
: .:: ::.. :. :::::.: ...
CCDS54 RQSLAENSGTTVVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTV
30 40 50 60 70 80
230 240 250 260 270
pF1KE2 AKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFES-TRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVD
: ::. : . : .::: :::.. : . ::.: ::: :.:.:... .: : .: :...:
CCDS54 AGRVAEERGAVLGHEVGYCIRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLD
90 100 110 120 130 140
280 290 300 310 320
pF1KE2 EVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYF----SNAP------VV
:.::: :..:. .:.:... : ::..:. :::.. . : ..: .. : ..
CCDS54 EAHERTLYTDIAIGLLKKIQKKRGDLRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVIL
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 QVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMA
: :: ::. . : : : :: ..:.. . . : ::.:.::.:.
CCDS54 TVEGRTFPVDIFYL-QSPVPDYIKS----------TVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQE
210 220 230 240 250
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 EI----SAVLEAAQTYA-SHTQRWV-VLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIA
:. : ..: :.. : . .: . :::....: .: :::. . .::: :..::.:
CCDS54 EVETVVSMLIEQARALARTGMKRHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVA
260 270 280 290 300 310
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 ETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRL
:::.::.:: .:.: : :: .:.:.. .. : .:::::.:: ::.::. : :.::
CCDS54 ETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIECLVVVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRL
320 330 340 350 360 370
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 YAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRD
:.: .: . :::..: : ..::.:.... . : :. ::: :. :. :
CCDS54 YTEEAFDKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQLKALGIDNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYA
380 390 400 410 420 430
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 QGALDSSEALT-PIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSA
:.::.. :: :.: .:..:.. ...:::. .. :. . .:.::: ...:. :.
CCDS54 LGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAKMLLESGNFGCSQEILSIAAMMQIQNIFVVPP
440 450 460 470 480 490
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 QSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMAN
... . ..: . ..:: .:..:...:... ....: :::... .. . : . :.
CCDS54 NQKSHAIRVHRKFAVEEGDHLTMLNIYEAFIK----HNKDS-KWCQEHFLNYKGLVRAAT
500 510 520 530 540
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 LRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQ
.:.:.:.::
CCDS54 VREQLKKLLVKFQVPRKSSEGDPDLVLRCIVSGFFANAARFHSTGAYRTIRDDHELHIHP
550 560 570 580 590 600
>>CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 (703 aa)
initn: 943 init1: 432 opt: 982 Z-score: 724.5 bits: 145.3 E(32554): 4.9e-34
Smith-Waterman score: 1153; 34.8% identity (67.0% similar) in 594 aa overlap (122-691:14-589)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGR
: . :. ..: :..: . . : ...
CCDS13 MAAPVGPVKFWRPGTEGPGVSISEERQSLAE--NSGTTVVYNP
10 20 30 40
160 170 180 190 200
pF1KE2 LAKL--QRERAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH---
: : ...: ::. . :.:: ....:.::..:.::::::::.:::: ::..
CCDS13 YAALSIEQQRQKLPVFKLRNHILYLIENYQTVVIVGETGCGKSTQIPQYLAEAGWTAEGR
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 -VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFES-TRSAATKIVFLTVGLLLRQI
:. :::::.: ...: ::. : . : .::: :::.. : . ::.: ::: :.:.:..
CCDS13 VVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYCIRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREM
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 QREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYF-
. .: : .: :...::.::: :..:. .:.:... : ::..:. :::.. . : ..:
CCDS13 MVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDIAIGLLKKIQKKRGDLRLIVASATLDADKFRDFFN
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370
pF1KE2 ---SNAP------VVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYP
.. : .. : :: ::. . : : : :: ..:.. . .
CCDS13 QNETSDPARDTCVILTVEGRTFPVDIFYL-QSPVPDYIKS----------TVETVVKIHQ
230 240 250 260 270
380 390 400 410 420
pF1KE2 PEERGDLLVFLSGMAEI----SAVLEAAQTYA-SHTQRWV-VLPLHSALSVADQDKVFDV
: ::.:.::.:. :. : ..: :.. : . .: . :::....: .: :::.
CCDS13 TEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQARALARTGMKRHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFER
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 APPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQR
. .::: :..::.::::.::.:: .:.: : :: .:.:.. .. : .:::::.::
CCDS13 VSRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIECLVVVPVSQASANQR
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEP
::.::. : :.:::.: .: . :::..: : ..::.:.... . : :. :
CCDS13 AGRGGRSRSGKCYRLYTEEAFDKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQLKALGIDNVLRFHFMSP
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 PPPASLETAILYLRDQGALDSSEALT-PIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLT
:: :. :. : :.::.. :: :.: .:..:.. ...:::. .. :. . .:.
CCDS13 PPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAKMLLESGNFGCSQEILS
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 IAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWC
::: ...:. :. ... . ..: . ..:: .:..:...:... ....: :::
CCDS13 IAAMMQIQNIFVVPPNQKSHAIRVHRKFAVEEGDHLTMLNIYEAFIK----HNKDS-KWC
520 530 540 550 560
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQ
... .. . : . :..:.:.:.::
CCDS13 QEHFLNYKGLVRAATVREQLKKLLVKFQVPRKSSEGDPDLVLRCIVSGFFANAARFHSTG
570 580 590 600 610 620
>>CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008 aa)
initn: 911 init1: 433 opt: 766 Z-score: 565.6 bits: 116.4 E(32554): 3.5e-25
Smith-Waterman score: 1181; 33.4% identity (62.4% similar) in 683 aa overlap (142-747:187-865)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRI
:. .:. : ..:. : :: . ...
CCDS31 IRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKEL
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220
pF1KE2 LQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLL------AAGFS-HVACTQPRRIACISLAKRV
.. . .:::.:..:.:::::.::: :..: . : . ...:::::::. ::.:.::
CCDS31 VNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERV
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 GFESLSQYGS--QVGYQIRFEST--RSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDE
. : . :: ..:::::..: :. .. :.. :.:..:. .: .: : . ...::
CCDS31 AAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGS-ILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDE
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330
pF1KE2 VHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPIT-
.:::.:..: :. :.. :: : ::::::::::.: :: ::.: :....:: ::..
CCDS31 IHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVE
340 350 360 370 380 390
340 350 360
pF1KE2 ---------VVYQPQEAEPTT-----------SKSEKLDPR-------P-FLR-------
. : :.. : . ...:: . . : ..:
CCDS31 YLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYS
400 410 420 430 440 450
370 380 390 400
pF1KE2 -----VLESI-DHKYP-------------PEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYAS-H
:.: . : : :: : .:::: : .::.. . .. . .
CCDS31 ASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFK
460 470 480 490 500 510
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 TQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEM
.......:::: . ...: .:: .:::::: ...:::::::.::: . .:.:.::.::
CCDS31 SDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKET
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 SYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVA
.: : ... .. :.:.:.:.::::::::. :: :..:: . . : .::: :.
CCDS31 HFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTP
580 590 600 610 620 630
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 LDSLVLQMKSMSVGDPRTF--PFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQ
:. : ::.: . .: : ...:: .. .: .: . .:::..: :::.: ::.
CCDS31 LEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLGVHLAR
640 650 660 670 680 690
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 LPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESD-QGD
:::. ::::...:..: ..:::::::.:: ..::. . : :. : .: ..:
CCDS31 LPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSD
700 710 720 730 740 750
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 PFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQ
.:. :.:..: ... . : . .: . . . : . :.. :: : : :.... .
CCDS31 HLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRN
760 770 780 790 800 810
710 720 730 740 750
pF1KE2 AAQVGDSYSRLQQRRER--RA-----LHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDR
: : ... :. .: :. . . . :..::.... . ::
CCDS31 PK---DPESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLNLGKKRKMVKVYTKTDGLVAVHPK
820 830 840 850 860 870
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 AGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLAQLQAAASSAQDLSREQLALLKLVLGRGLYPQLAV
CCDS31 SVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDE
880 890 900 910 920 930
1143 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 19:41:46 2016 done: Sun Nov 6 19:41:47 2016
Total Scan time: 4.930 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]