FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2329, 1313 aa
1>>>pF1KE2329 1313 - 1313 aa - 1313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.0162+/-0.00047; mu= -31.1869+/- 0.029
mean_var=682.6198+/-140.254, 0's: 0 Z-trim(125.1): 80 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.049089
statistics sampled from 48031 (48159) to 48031 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.796), E-opt: 0.2 (0.565), width: 16
Scan time: 20.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002964 (OMIM: 168600,183090,601517) ataxin-2 is (1313) 9035 655.8 5.7e-187
NP_001297050 (OMIM: 168600,183090,601517) ataxin-2 (1073) 6735 492.9 5.2e-138
NP_001297052 (OMIM: 168600,183090,601517) ataxin-2 (1006) 5570 410.3 3.4e-113
XP_005255124 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1086) 1492 121.5 3.1e-26
XP_005255125 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1086) 1492 121.5 3.1e-26
XP_005255131 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1051) 1487 121.2 3.9e-26
XP_005255120 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1104) 1486 121.1 4.3e-26
XP_005255119 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1104) 1486 121.1 4.3e-26
XP_005255118 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1104) 1486 121.1 4.3e-26
XP_011544021 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1104) 1486 121.1 4.3e-26
XP_006721072 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1063) 1482 120.8 5e-26
XP_006721073 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1063) 1482 120.8 5e-26
XP_005255127 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1069) 1482 120.8 5e-26
XP_005255128 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1069) 1482 120.8 5e-26
XP_005255126 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1082) 1482 120.8 5.1e-26
XP_005255133 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1050) 1480 120.7 5.5e-26
XP_005255121 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1103) 1479 120.6 6e-26
XP_011544023 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1045) 1476 120.4 6.6e-26
XP_006721074 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1045) 1476 120.4 6.6e-26
XP_006721075 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1045) 1476 120.4 6.6e-26
XP_005255132 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1051) 1476 120.4 6.7e-26
NP_001295159 (OMIM: 607931) ataxin-2-like protein (1068) 1475 120.3 7.1e-26
XP_005255122 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1098) 1435 117.5 5.2e-25
XP_005255134 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1044) 1433 117.4 5.5e-25
XP_005255123 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1097) 1420 116.5 1.1e-24
NP_680780 (OMIM: 607931) ataxin-2-like protein iso (1097) 1420 116.5 1.1e-24
NP_680781 (OMIM: 607931) ataxin-2-like protein iso (1044) 1415 116.1 1.3e-24
NP_059867 (OMIM: 607931) ataxin-2-like protein iso (1062) 1413 115.9 1.5e-24
NP_663760 (OMIM: 607931) ataxin-2-like protein iso (1062) 1413 115.9 1.5e-24
NP_009176 (OMIM: 607931) ataxin-2-like protein iso (1075) 1413 116.0 1.5e-24
NP_680782 (OMIM: 607931) ataxin-2-like protein iso (1044) 1407 115.5 2e-24
XP_006721070 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1080) 1401 115.1 2.7e-24
XP_016878380 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1038) 1382 113.7 6.7e-24
XP_006721071 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1074) 1382 113.8 6.9e-24
XP_011544024 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li ( 982) 1357 112.0 2.2e-23
XP_016878381 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li ( 976) 1306 108.4 2.6e-22
>>NP_002964 (OMIM: 168600,183090,601517) ataxin-2 isofor (1313 aa)
initn: 9035 init1: 9035 opt: 9035 Z-score: 3477.7 bits: 655.8 E(85289): 5.7e-187
Smith-Waterman score: 9035; 100.0% identity (100.0% similar) in 1313 aa overlap (1-1313:1-1313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRSAAAAPRSPAVATESRRFAAARWPGWRSLQRPARRSGRGGGGAAPGPYPSAAPPPPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MRSAAAAPRSPAVATESRRFAAARWPGWRSLQRPARRSGRGGGGAAPGPYPSAAPPPPGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GPPPSRQSSPPSASDCFGSNGNGGGAFRPGSRRLLGLGGPPRPFVVLLLPLASPGAPPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GPPPSRQSSPPSASDCFGSNGNGGGAFRPGSRRLLGLGGPPRPFVVLLLPLASPGAPPAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PTRASPLGARASPPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PTRASPLGARASPPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QQQQQQQQPPPAAANVRKPGGSGLLASPAAAPSPSSSSVSSSSATAPSSVVAATSGGGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QQQQQQQQPPPAAANVRKPGGSGLLASPAAAPSPSSSSVSSSSATAPSSVVAATSGGGRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GLGRGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFKTYSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GLGRGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFKTYSPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTDSAISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTDSAISA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTYDSSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTYDSSLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQRNSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQRNSSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 REGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDFNPNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 REGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDFNPNSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRPPSHPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRPPSHPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 AHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPPSEAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPPSEAAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 PPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGIIPTEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGIIPTEAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 AMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSFSKAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSFSKAEN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 KGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDKIEPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDKIEPSA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 KDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQEKDDKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQEKDDKE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 EKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPTPVYTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPTPVYTQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 PVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSAMMHPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSAMMHPA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 SAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 THAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 THAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 HPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYHAGLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYHAGLAP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 TPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMVPSHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMVPSHP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE2 TAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
1270 1280 1290 1300 1310
>>NP_001297050 (OMIM: 168600,183090,601517) ataxin-2 iso (1073 aa)
initn: 7169 init1: 6730 opt: 6735 Z-score: 2598.7 bits: 492.9 E(85289): 5.2e-138
Smith-Waterman score: 7123; 97.7% identity (97.7% similar) in 1073 aa overlap (266-1313:1-1073)
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GGGRPGLGRGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFK
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 TYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTD
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SAISAKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAISAKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTY
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQ
160 170 180 190 200 210
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 RNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDF
220 230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 NPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRP
280 290 300 310 320 330
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 PSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPP
340 350 360 370 380 390
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGII
400 410 420 430 440 450
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 PTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSF
460 470 480 490 500 510
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 SKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDK
520 530 540 550 560 570
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 IEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQE
580 590 600 610 620 630
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 KDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPT
640 650 660 670 680 690
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE2 PVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSA
700 710 720 730 740 750
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNAR
760 770 780 790 800 810
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 MMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAH
820 830 840 850 860 870
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 PNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYH
880 890 900 910 920 930
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE2 AGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQ-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQCASEALA
940 950 960 970 980 990
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE2 ------------------AHVQSGMVPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCGLEMRLSWIYLSEGYLAHVQSGMVPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1300 1310
pF1KE2 VSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
:::::::::::::::::::::::
NP_001 VSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
1060 1070
>>NP_001297052 (OMIM: 168600,183090,601517) ataxin-2 iso (1006 aa)
initn: 6860 init1: 5483 opt: 5570 Z-score: 2153.3 bits: 410.3 E(85289): 3.4e-113
Smith-Waterman score: 6784; 95.9% identity (96.0% similar) in 1048 aa overlap (266-1313:1-1006)
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GGGRPGLGRGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFK
:::::::::::
NP_001 MRMVHILTSVV-------------------
10
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 TYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----CDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTD
20 30 40 50 60
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SAISAKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAISAKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTY
70 80 90 100 110 120
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQ
130 140 150 160 170 180
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 RNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDF
190 200 210 220 230 240
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 NPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRP
250 260 270 280 290 300
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 PSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPP
310 320 330 340 350 360
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGII
370 380 390 400 410 420
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 PTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSF
430 440 450 460 470 480
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 SKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDK
490 500 510 520 530 540
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 IEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQE
550 560 570 580 590 600
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 KDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPT
610 620 630 640 650 660
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE2 PVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSA
670 680 690 700 710 720
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNAR
730 740 750 760 770 780
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 MMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAH
:::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::
NP_001 MMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMY------------------VSTGSLAQQYAH
790 800 810 820
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 PNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYH
830 840 850 860 870 880
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE2 AGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGM
890 900 910 920 930 940
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE2 VPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
950 960 970 980 990 1000
>>XP_005255124 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-like p (1086 aa)
initn: 1254 init1: 888 opt: 1492 Z-score: 591.9 bits: 121.5 E(85289): 3.1e-26
Smith-Waterman score: 2276; 39.6% identity (62.8% similar) in 1188 aa overlap (163-1305:2-1036)
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 PPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPPPA
:::: :: .: :: :: .. ::.
XP_005 MLKPQPLQQPSQPQQPPPTQQAVARR--PPG
10 20
200 210 220 230
pF1KE2 AANVRKPGGSGLLASPAAAPSP--SSSSVSSSSATAPSSVVAATSG------------GG
... . : : ::. :: :.: ..: . :.: :.. .. :
XP_005 GTSPPNGGLPGPLATSAAPPGPPAAASPCLGPVAAAGSGLRRGAEGILAPQPPPPQQHQE
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RPG---LG--RGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGV
::: .: ::....:: ::: . :.:.: : ::.:.::.:::: :.:.:::: :::.
XP_005 RPGAAAIGSARGQSTGKGPPQSPV-FEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNGTTYEGI
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FKTYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAF
::: : : .:..::.:.:..: ..::.::.:.....:: :: ..:.:...: .:: .: :
XP_005 FKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHFRNVDFNYATKDKF
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TDSAIS--AKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGV
:::::. .::::::::: :. :..:. .: . ::.:.:::::::.::..:::::::
XP_005 TDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGD--SNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGV
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VSTYDSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDD-RSEEEK
.::::::::::::::.:::::: .:: :: :::.::::: ::. :.:.:::: :.::::
XP_005 KTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEK
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 YTAVQRNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTS
..::::..: ::. :. .::.:::: :: :: :. : .: : :.:: .:.: :.
XP_005 HSAVQRQGSGRESPSLASREGKYIPLPQRVREG-PRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPH
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 HTSDFNPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPS
: .. .:. ::. : .::: :: ::... : : : ..: . : .:: .
XP_005 HLDNSSPGPGSEARGINGG---PSRM-SPKAQRPLR---GAKTL-------SSPSNRPSG
390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RPSRPPSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFV
. : :: : : ::. : ::: ::: ::. . ::..
XP_005 ETSVPP--PPAAPPFLPVGRMY-------PPR-SPK----------SAAPAPISAS----
440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SHNPPSEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASP
.:: .:.: . . : .. :. :: .:: :::
XP_005 CPEPPIGSAVPTSSASIPVTSSVSD--PGVGSISP----------------------ASP
470 480 490 500
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 QAGIIPTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNE
. .. ::.. . .. :. :.. :. :. ::. ... ::
XP_005 KISLAPTDVKEL----STKEPG-----RTLEPQELAR-----------IAGKVPGLQ-NE
510 520 530 540
780 790 800 810 820
pF1KE2 TSPSFSKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSE-SMDQLLNKN-REGEKS
..: :...:.:: .:.:::::. : :.: . . .: :.
XP_005 ------------------QKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPENSLDPFPPRILKEEPKG
550 560 570 580
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 RDLIKDKIEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTS
.. : . : . . ::. : :.: ..: ..:: .. .. : :: :.
XP_005 KEKEVDGLLTS--EPMGSPVSSKTESVSDKEDKPPLAPSGGTEGPEQPPPPCPSQ---TG
590 600 610 620 630
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 SPACKQEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRS--FSQPKPSTTPTSPRPQAQPSP
:: : . ... .::::.::::::::::::: . .: : ..::::: :... .:
XP_005 SPPVGLIKGEDKDEGPVAEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTP
640 650 660 670 680 690
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 SMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVP---VSPGVQ-P-LYPIPMT-PMPVNQAKTYRAV
:. :. . : ..:... .: ..:.:: : .:: :.. .: .:.: :
XP_005 SI-----PVLTAGQSGLYSPQYISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAK
700 710 720 730 740 750
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 PNMPQQRQDQHHQSA---MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQP-LVQHVP
..: ::.:::. .. ::. :.:::::..:. : ::. :. :.:::::.:: ..: .
XP_005 GSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAAAGPPLVAATP-YSS-YIPYNPQQFPGQPAMMQPMA
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 HYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKET
:: :: : :..:..:.: ::.. .: : ..::::. :: . :: :
XP_005 HYPSQ-P-VFAPMLQSNPRMLTSGSHPQ-AIVSSSTPQYPSAEQ-------P--------
820 830 840 850
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 SPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQ-QSQHGGSHPAPSPVQHHQ
.:. .: .. :.: : . :: : .:::..::::.: ::::. :::::: :
XP_005 TPQALYA----TVHQSYPHHATQLHAH--QPQPATTPTGSQPQSQHA----APSPVQ--Q
860 870 880 890 900
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 HQAAQALHLASPQQQSAIYHAG-LAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQ
:::.:: ::.: : :. .:: : :. ::::. :. ..::::.::: .:..:: ...
XP_005 HQAGQAPHLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPA-AVYAIHHQQLP
910 920 930 940 950 960
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 PAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMV---PSHPTAHAPMMLMTTQPP---GGP-QAALAQSALQ
..:: :::: :::::.:.. : :: : : ..: .:: ::: :.:. ::..
XP_005 HGFTN---MAHVTQAHVQTGITAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQSHGGPPQGAVPQSGVP
970 980 990 1000 1010
1290 1300 1310
pF1KE2 PIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
. .:: . .::. ::.:
XP_005 ALSASTPSPYPYIGHPQVCRVGRSHSRRRQGLAPGSVLCFPPSSLSCDPAAPLPTASPAL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>XP_005255125 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-like p (1086 aa)
initn: 1254 init1: 888 opt: 1492 Z-score: 591.9 bits: 121.5 E(85289): 3.1e-26
Smith-Waterman score: 2276; 39.6% identity (62.8% similar) in 1188 aa overlap (163-1305:2-1036)
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 PPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPPPA
:::: :: .: :: :: .. ::.
XP_005 MLKPQPLQQPSQPQQPPPTQQAVARR--PPG
10 20
200 210 220 230
pF1KE2 AANVRKPGGSGLLASPAAAPSP--SSSSVSSSSATAPSSVVAATSG------------GG
... . : : ::. :: :.: ..: . :.: :.. .. :
XP_005 GTSPPNGGLPGPLATSAAPPGPPAAASPCLGPVAAAGSGLRRGAEGILAPQPPPPQQHQE
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RPG---LG--RGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGV
::: .: ::....:: ::: . :.:.: : ::.:.::.:::: :.:.:::: :::.
XP_005 RPGAAAIGSARGQSTGKGPPQSPV-FEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNGTTYEGI
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FKTYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAF
::: : : .:..::.:.:..: ..::.::.:.....:: :: ..:.:...: .:: .: :
XP_005 FKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHFRNVDFNYATKDKF
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TDSAIS--AKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGV
:::::. .::::::::: :. :..:. .: . ::.:.:::::::.::..:::::::
XP_005 TDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGD--SNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGV
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VSTYDSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDD-RSEEEK
.::::::::::::::.:::::: .:: :: :::.::::: ::. :.:.:::: :.::::
XP_005 KTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEK
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 YTAVQRNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTS
..::::..: ::. :. .::.:::: :: :: :. : .: : :.:: .:.: :.
XP_005 HSAVQRQGSGRESPSLASREGKYIPLPQRVREG-PRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPH
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 HTSDFNPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPS
: .. .:. ::. : .::: :: ::... : : : ..: . : .:: .
XP_005 HLDNSSPGPGSEARGINGG---PSRM-SPKAQRPLR---GAKTL-------SSPSNRPSG
390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RPSRPPSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFV
. : :: : : ::. : ::: ::: ::. . ::..
XP_005 ETSVPP--PPAAPPFLPVGRMY-------PPR-SPK----------SAAPAPISAS----
440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SHNPPSEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASP
.:: .:.: . . : .. :. :: .:: :::
XP_005 CPEPPIGSAVPTSSASIPVTSSVSD--PGVGSISP----------------------ASP
470 480 490 500
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 QAGIIPTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNE
. .. ::.. . .. :. :.. :. :. ::. ... ::
XP_005 KISLAPTDVKEL----STKEPG-----RTLEPQELAR-----------IAGKVPGLQ-NE
510 520 530 540
780 790 800 810 820
pF1KE2 TSPSFSKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSE-SMDQLLNKN-REGEKS
..: :...:.:: .:.:::::. : :.: . . .: :.
XP_005 ------------------QKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPENSLDPFPPRILKEEPKG
550 560 570 580
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 RDLIKDKIEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTS
.. : . : . . ::. : :.: ..: ..:: .. .. : :: :.
XP_005 KEKEVDGLLTS--EPMGSPVSSKTESVSDKEDKPPLAPSGGTEGPEQPPPPCPSQ---TG
590 600 610 620 630
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 SPACKQEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRS--FSQPKPSTTPTSPRPQAQPSP
:: : . ... .::::.::::::::::::: . .: : ..::::: :... .:
XP_005 SPPVGLIKGEDKDEGPVAEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTP
640 650 660 670 680 690
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 SMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVP---VSPGVQ-P-LYPIPMT-PMPVNQAKTYRAV
:. :. . : ..:... .: ..:.:: : .:: :.. .: .:.: :
XP_005 SI-----PVLTAGQSGLYSPQYISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAK
700 710 720 730 740 750
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 PNMPQQRQDQHHQSA---MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQP-LVQHVP
..: ::.:::. .. ::. :.:::::..:. : ::. :. :.:::::.:: ..: .
XP_005 GSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAAAGPPLVAATP-YSS-YIPYNPQQFPGQPAMMQPMA
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 HYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKET
:: :: : :..:..:.: ::.. .: : ..::::. :: . :: :
XP_005 HYPSQ-P-VFAPMLQSNPRMLTSGSHPQ-AIVSSSTPQYPSAEQ-------P--------
820 830 840 850
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 SPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQ-QSQHGGSHPAPSPVQHHQ
.:. .: .. :.: : . :: : .:::..::::.: ::::. :::::: :
XP_005 TPQALYA----TVHQSYPHHATQLHAH--QPQPATTPTGSQPQSQHA----APSPVQ--Q
860 870 880 890 900
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 HQAAQALHLASPQQQSAIYHAG-LAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQ
:::.:: ::.: : :. .:: : :. ::::. :. ..::::.::: .:..:: ...
XP_005 HQAGQAPHLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPA-AVYAIHHQQLP
910 920 930 940 950 960
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 PAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMV---PSHPTAHAPMMLMTTQPP---GGP-QAALAQSALQ
..:: :::: :::::.:.. : :: : : ..: .:: ::: :.:. ::..
XP_005 HGFTN---MAHVTQAHVQTGITAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQSHGGPPQGAVPQSGVP
970 980 990 1000 1010
1290 1300 1310
pF1KE2 PIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
. .:: . .::. ::.:
XP_005 ALSASTPSPYPYIGHPQVCRVGRSHSRRRQGLAPGSVLCFPPSSLSCDPAAPLPTASPAL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>XP_005255131 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-like p (1051 aa)
initn: 1298 init1: 888 opt: 1487 Z-score: 590.2 bits: 121.2 E(85289): 3.9e-26
Smith-Waterman score: 2311; 39.8% identity (63.0% similar) in 1196 aa overlap (163-1313:2-1044)
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 PPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPPPA
:::: :: .: :: :: .. ::.
XP_005 MLKPQPLQQPSQPQQPPPTQQAVARR--PPG
10 20
200 210 220 230
pF1KE2 AANVRKPGGSGLLASPAAAPSP--SSSSVSSSSATAPSSVVAATSG------------GG
... . : : ::. :: :.: ..: . :.: :.. .. :
XP_005 GTSPPNGGLPGPLATSAAPPGPPAAASPCLGPVAAAGSGLRRGAEGILAPQPPPPQQHQE
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RPG---LG--RGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGV
::: .: ::....:: ::: . :.:.: : ::.:.::.:::: :.:.:::: :::.
XP_005 RPGAAAIGSARGQSTGKGPPQSPV-FEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNGTTYEGI
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FKTYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAF
::: : : .:..::.:.:..: ..::.::.:.....:: :: ..:.:...: .:: .: :
XP_005 FKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHFRNVDFNYATKDKF
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TDSAIS--AKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGV
:::::. .::::::::: :. :..:. .: . ::.:.:::::::.::..:::::::
XP_005 TDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGD--SNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGV
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VSTYDSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDD-RSEEEK
.::::::::::::::.:::::: .:: :: :::.::::: ::. :.:.:::: :.::::
XP_005 KTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEK
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 YTAVQRNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTS
..::::..: ::. :. .::.:::: :: :: :. : .: : :.:: .:.: :.
XP_005 HSAVQRQGSGRESPSLASREGKYIPLPQRVREGPR-GGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPH
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 HTSDFNPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPS
: .. .:. ::. : .::: :: ::... : : : ..: . : .:: .
XP_005 HLDNSSPGPGSEARGINGG---PSRM-SPKAQRPLR---GAKTL-------SSPSNRPSG
390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RPSRPPSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFV
. : :: : : ::. : ::: ::: ::. . ::..
XP_005 ETSVPP--PPAAPPFLPVGRMY-------PPR-SPK----------SAAPAPISASCP--
440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SHNPPSEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASP
.:: .:.: . . : .. :. :: .:: :::
XP_005 --EPPIGSAVPTSSASIPVTSSVSD--PGVGSISP----------------------ASP
470 480 490 500
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 QAGIIPTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNE
. .. ::.. . .. :. :.. :. :. ::. ... ::
XP_005 KISLAPTDVKEL----STKEPG-----RTLEPQELAR-----------IAGKVPGLQ-NE
510 520 530 540
780 790 800 810 820
pF1KE2 TSPSFSKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSE-SMDQLLNKN-REGEKS
..: :...:.:: .:.:::::. : :.: . . .: :.
XP_005 ------------------QKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPENSLDPFPPRILKEEPKG
550 560 570 580
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 RDLIKDKIEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTS
.. : . : . . ::. : :.: ..: ..:: .. .. : : ::.
XP_005 KEKEVDGLLTS--EPMGSPVSSKTESVSDKEDKPPLAPSGGTEGPEQPPPPCPS---QTG
590 600 610 620 630
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 SPACKQEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRS--FSQPKPSTTPTSPRPQAQPSP
:: : . ... .::::.::::::::::::: . .: : ..::::: :... .:
XP_005 SPPVGLIKGEDKDEGPVAEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTP
640 650 660 670 680 690
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 SMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVP---VSPGVQ-P-LYPIPMT-PMPVNQAKTYRAV
:. :. . : ..:... .: ..:.:: : .:: :.. .: .:.: :
XP_005 SI-----PVLTAGQSGLYSPQYISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAK
700 710 720 730 740 750
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 PNMPQQRQDQHHQSA---MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQP-LVQHVP
..: ::.:::. .. ::. :.:::::..:. : ::. :. :.:::::.:: ..: .
XP_005 GSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAAAGPPLVAATP-YSS-YIPYNPQQFPGQPAMMQPMA
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 HYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKET
:: :: : :..:..:.: ::.. .: : ..::::. :: . :: :
XP_005 HYPSQ-P-VFAPMLQSNPRMLTSGSHPQ-AIVSSSTPQYPSAEQ----------P-----
820 830 840 850
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 SPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQ-QSQHGGSHPAPSPVQHHQ
.:. .: .. :.: : . :: : .:::..::::.: ::::. :::::: :
XP_005 TPQALYA----TVHQSYPHHATQLHAH--QPQPATTPTGSQPQSQHA----APSPVQ--Q
860 870 880 890 900
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 HQAAQALHLASPQQQSAIYHAG-LAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQ
:::.:: ::.: : :. .:: : :. ::::. :. ..::::.::: .:..:: ...
XP_005 HQAGQAPHLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPA-AVYAIHHQQLP
910 920 930 940 950 960
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 PAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMV---PSHPTAHAPMMLMTTQPP---GGP-QAALAQSALQ
..:: :::: :::::.:.. : :: : : ..: .:: ::: :.:. ::..
XP_005 HGFTN---MAHVTQAHVQTGITAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQSHGGPPQGAVPQSGVP
970 980 990 1000 1010
1290 1300 1310
pF1KE2 PIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
. .:: . .::. ::.::.: .:::
XP_005 ALSASTPSPYPYIGHPQVQSHPSQQLPFHPPGN
1020 1030 1040 1050
>>XP_005255120 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-like p (1104 aa)
initn: 1254 init1: 888 opt: 1486 Z-score: 589.5 bits: 121.1 E(85289): 4.3e-26
Smith-Waterman score: 2271; 39.6% identity (62.7% similar) in 1186 aa overlap (163-1303:2-1034)
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 PPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPPPA
:::: :: .: :: :: .. ::.
XP_005 MLKPQPLQQPSQPQQPPPTQQAVARR--PPG
10 20
200 210 220 230
pF1KE2 AANVRKPGGSGLLASPAAAPSP--SSSSVSSSSATAPSSVVAATSG------------GG
... . : : ::. :: :.: ..: . :.: :.. .. :
XP_005 GTSPPNGGLPGPLATSAAPPGPPAAASPCLGPVAAAGSGLRRGAEGILAPQPPPPQQHQE
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RPG---LG--RGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGV
::: .: ::....:: ::: . :.:.: : ::.:.::.:::: :.:.:::: :::.
XP_005 RPGAAAIGSARGQSTGKGPPQSPV-FEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNGTTYEGI
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FKTYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAF
::: : : .:..::.:.:..: ..::.::.:.....:: :: ..:.:...: .:: .: :
XP_005 FKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHFRNVDFNYATKDKF
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TDSAIS--AKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGV
:::::. .::::::::: :. :..:. .: . ::.:.:::::::.::..:::::::
XP_005 TDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGD--SNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGV
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VSTYDSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDD-RSEEEK
.::::::::::::::.:::::: .:: :: :::.::::: ::. :.:.:::: :.::::
XP_005 KTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEK
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 YTAVQRNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTS
..::::..: ::. :. .::.:::: :: :: :. : .: : :.:: .:.: :.
XP_005 HSAVQRQGSGRESPSLASREGKYIPLPQRVREG-PRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPH
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 HTSDFNPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPS
: .. .:. ::. : .::: :: ::... : : : ..: . : .:: .
XP_005 HLDNSSPGPGSEARGINGG---PSRM-SPKAQRPLR---GAKTL-------SSPSNRPSG
390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RPSRPPSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFV
. : :: : : ::. : ::: ::: ::. . ::..
XP_005 ETSVPP--PPAAPPFLPVGRMY-------PPR-SPK----------SAAPAPISAS----
440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SHNPPSEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASP
.:: .:.: . . : .. :. :: .:: :::
XP_005 CPEPPIGSAVPTSSASIPVTSSVSD--PGVGSISP----------------------ASP
470 480 490 500
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 QAGIIPTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNE
. .. ::.. . .. :. :.. :. :. ::. ... ::
XP_005 KISLAPTDVKEL----STKEPG-----RTLEPQELAR-----------IAGKVPGLQ-NE
510 520 530 540
780 790 800 810 820
pF1KE2 TSPSFSKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSE-SMDQLLNKN-REGEKS
..: :...:.:: .:.:::::. : :.: . . .: :.
XP_005 ------------------QKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPENSLDPFPPRILKEEPKG
550 560 570 580
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 RDLIKDKIEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTS
.. : . : . . ::. : :.: ..: ..:: .. .. : :: :.
XP_005 KEKEVDGLLTS--EPMGSPVSSKTESVSDKEDKPPLAPSGGTEGPEQPPPPCPSQ---TG
590 600 610 620 630
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 SPACKQEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRS--FSQPKPSTTPTSPRPQAQPSP
:: : . ... .::::.::::::::::::: . .: : ..::::: :... .:
XP_005 SPPVGLIKGEDKDEGPVAEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTP
640 650 660 670 680 690
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 SMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVP---VSPGVQ-P-LYPIPMT-PMPVNQAKTYRAV
:. :. . : ..:... .: ..:.:: : .:: :.. .: .:.: :
XP_005 SI-----PVLTAGQSGLYSPQYISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAK
700 710 720 730 740 750
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 PNMPQQRQDQHHQSA---MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQP-LVQHVP
..: ::.:::. .. ::. :.:::::..:. : ::. :. :.:::::.:: ..: .
XP_005 GSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAAAGPPLVAATP-YSS-YIPYNPQQFPGQPAMMQPMA
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 HYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKET
:: :: : :..:..:.: ::.. .: : ..::::. :: . :: :
XP_005 HYPSQ-P-VFAPMLQSNPRMLTSGSHPQ-AIVSSSTPQYPSAEQ-------P--------
820 830 840 850
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 SPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQ-QSQHGGSHPAPSPVQHHQ
.:. .: .. :.: : . :: : .:::..::::.: ::::. :::::: :
XP_005 TPQALYA----TVHQSYPHHATQLHAH--QPQPATTPTGSQPQSQHA----APSPVQ--Q
860 870 880 890 900
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 HQAAQALHLASPQQQSAIYHAG-LAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQ
:::.:: ::.: : :. .:: : :. ::::. :. ..::::.::: .:..:: ...
XP_005 HQAGQAPHLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPA-AVYAIHHQQLP
910 920 930 940 950 960
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 PAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMV---PSHPTAHAPMMLMTTQPP---GGP-QAALAQSALQ
..:: :::: :::::.:.. : :: : : ..: .:: ::: :.:. ::..
XP_005 HGFTN---MAHVTQAHVQTGITAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQSHGGPPQGAVPQSGVP
970 980 990 1000 1010
1290 1300 1310
pF1KE2 PIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
. .:: . .::. ::
XP_005 ALSASTPSPYPYIGHPQGEQPGQAPGFPGGADDRILCRVGRSHSRRRQGLAPGSVLCFPP
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>XP_005255119 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-like p (1104 aa)
initn: 1254 init1: 888 opt: 1486 Z-score: 589.5 bits: 121.1 E(85289): 4.3e-26
Smith-Waterman score: 2271; 39.6% identity (62.7% similar) in 1186 aa overlap (163-1303:2-1034)
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 PPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPPPA
:::: :: .: :: :: .. ::.
XP_005 MLKPQPLQQPSQPQQPPPTQQAVARR--PPG
10 20
200 210 220 230
pF1KE2 AANVRKPGGSGLLASPAAAPSP--SSSSVSSSSATAPSSVVAATSG------------GG
... . : : ::. :: :.: ..: . :.: :.. .. :
XP_005 GTSPPNGGLPGPLATSAAPPGPPAAASPCLGPVAAAGSGLRRGAEGILAPQPPPPQQHQE
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RPG---LG--RGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGV
::: .: ::....:: ::: . :.:.: : ::.:.::.:::: :.:.:::: :::.
XP_005 RPGAAAIGSARGQSTGKGPPQSPV-FEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNGTTYEGI
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FKTYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAF
::: : : .:..::.:.:..: ..::.::.:.....:: :: ..:.:...: .:: .: :
XP_005 FKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHFRNVDFNYATKDKF
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TDSAIS--AKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGV
:::::. .::::::::: :. :..:. .: . ::.:.:::::::.::..:::::::
XP_005 TDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGD--SNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGV
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VSTYDSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDD-RSEEEK
.::::::::::::::.:::::: .:: :: :::.::::: ::. :.:.:::: :.::::
XP_005 KTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEK
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 YTAVQRNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTS
..::::..: ::. :. .::.:::: :: :: :. : .: : :.:: .:.: :.
XP_005 HSAVQRQGSGRESPSLASREGKYIPLPQRVREG-PRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPH
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 HTSDFNPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPS
: .. .:. ::. : .::: :: ::... : : : ..: . : .:: .
XP_005 HLDNSSPGPGSEARGINGG---PSRM-SPKAQRPLR---GAKTL-------SSPSNRPSG
390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RPSRPPSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFV
. : :: : : ::. : ::: ::: ::. . ::..
XP_005 ETSVPP--PPAAPPFLPVGRMY-------PPR-SPK----------SAAPAPISAS----
440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SHNPPSEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASP
.:: .:.: . . : .. :. :: .:: :::
XP_005 CPEPPIGSAVPTSSASIPVTSSVSD--PGVGSISP----------------------ASP
470 480 490 500
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 QAGIIPTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNE
. .. ::.. . .. :. :.. :. :. ::. ... ::
XP_005 KISLAPTDVKEL----STKEPG-----RTLEPQELAR-----------IAGKVPGLQ-NE
510 520 530 540
780 790 800 810 820
pF1KE2 TSPSFSKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSE-SMDQLLNKN-REGEKS
..: :...:.:: .:.:::::. : :.: . . .: :.
XP_005 ------------------QKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPENSLDPFPPRILKEEPKG
550 560 570 580
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 RDLIKDKIEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTS
.. : . : . . ::. : :.: ..: ..:: .. .. : :: :.
XP_005 KEKEVDGLLTS--EPMGSPVSSKTESVSDKEDKPPLAPSGGTEGPEQPPPPCPSQ---TG
590 600 610 620 630
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 SPACKQEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRS--FSQPKPSTTPTSPRPQAQPSP
:: : . ... .::::.::::::::::::: . .: : ..::::: :... .:
XP_005 SPPVGLIKGEDKDEGPVAEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTP
640 650 660 670 680 690
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 SMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVP---VSPGVQ-P-LYPIPMT-PMPVNQAKTYRAV
:. :. . : ..:... .: ..:.:: : .:: :.. .: .:.: :
XP_005 SI-----PVLTAGQSGLYSPQYISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAK
700 710 720 730 740 750
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 PNMPQQRQDQHHQSA---MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQP-LVQHVP
..: ::.:::. .. ::. :.:::::..:. : ::. :. :.:::::.:: ..: .
XP_005 GSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAAAGPPLVAATP-YSS-YIPYNPQQFPGQPAMMQPMA
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 HYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKET
:: :: : :..:..:.: ::.. .: : ..::::. :: . :: :
XP_005 HYPSQ-P-VFAPMLQSNPRMLTSGSHPQ-AIVSSSTPQYPSAEQ-------P--------
820 830 840 850
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 SPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQ-QSQHGGSHPAPSPVQHHQ
.:. .: .. :.: : . :: : .:::..::::.: ::::. :::::: :
XP_005 TPQALYA----TVHQSYPHHATQLHAH--QPQPATTPTGSQPQSQHA----APSPVQ--Q
860 870 880 890 900
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 HQAAQALHLASPQQQSAIYHAG-LAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQ
:::.:: ::.: : :. .:: : :. ::::. :. ..::::.::: .:..:: ...
XP_005 HQAGQAPHLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPA-AVYAIHHQQLP
910 920 930 940 950 960
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 PAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMV---PSHPTAHAPMMLMTTQPP---GGP-QAALAQSALQ
..:: :::: :::::.:.. : :: : : ..: .:: ::: :.:. ::..
XP_005 HGFTN---MAHVTQAHVQTGITAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQSHGGPPQGAVPQSGVP
970 980 990 1000 1010
1290 1300 1310
pF1KE2 PIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
. .:: . .::. ::
XP_005 ALSASTPSPYPYIGHPQGEQPGQAPGFPGGADDRILCRVGRSHSRRRQGLAPGSVLCFPP
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>XP_005255118 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-like p (1104 aa)
initn: 1254 init1: 888 opt: 1486 Z-score: 589.5 bits: 121.1 E(85289): 4.3e-26
Smith-Waterman score: 2271; 39.6% identity (62.7% similar) in 1186 aa overlap (163-1303:2-1034)
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 PPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPPPA
:::: :: .: :: :: .. ::.
XP_005 MLKPQPLQQPSQPQQPPPTQQAVARR--PPG
10 20
200 210 220 230
pF1KE2 AANVRKPGGSGLLASPAAAPSP--SSSSVSSSSATAPSSVVAATSG------------GG
... . : : ::. :: :.: ..: . :.: :.. .. :
XP_005 GTSPPNGGLPGPLATSAAPPGPPAAASPCLGPVAAAGSGLRRGAEGILAPQPPPPQQHQE
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RPG---LG--RGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGV
::: .: ::....:: ::: . :.:.: : ::.:.::.:::: :.:.:::: :::.
XP_005 RPGAAAIGSARGQSTGKGPPQSPV-FEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNGTTYEGI
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FKTYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAF
::: : : .:..::.:.:..: ..::.::.:.....:: :: ..:.:...: .:: .: :
XP_005 FKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHFRNVDFNYATKDKF
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TDSAIS--AKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGV
:::::. .::::::::: :. :..:. .: . ::.:.:::::::.::..:::::::
XP_005 TDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGD--SNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGV
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VSTYDSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDD-RSEEEK
.::::::::::::::.:::::: .:: :: :::.::::: ::. :.:.:::: :.::::
XP_005 KTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEK
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 YTAVQRNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTS
..::::..: ::. :. .::.:::: :: :: :. : .: : :.:: .:.: :.
XP_005 HSAVQRQGSGRESPSLASREGKYIPLPQRVREG-PRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPH
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 HTSDFNPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPS
: .. .:. ::. : .::: :: ::... : : : ..: . : .:: .
XP_005 HLDNSSPGPGSEARGINGG---PSRM-SPKAQRPLR---GAKTL-------SSPSNRPSG
390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RPSRPPSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFV
. : :: : : ::. : ::: ::: ::. . ::..
XP_005 ETSVPP--PPAAPPFLPVGRMY-------PPR-SPK----------SAAPAPISAS----
440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SHNPPSEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASP
.:: .:.: . . : .. :. :: .:: :::
XP_005 CPEPPIGSAVPTSSASIPVTSSVSD--PGVGSISP----------------------ASP
470 480 490 500
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 QAGIIPTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNE
. .. ::.. . .. :. :.. :. :. ::. ... ::
XP_005 KISLAPTDVKEL----STKEPG-----RTLEPQELAR-----------IAGKVPGLQ-NE
510 520 530 540
780 790 800 810 820
pF1KE2 TSPSFSKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSE-SMDQLLNKN-REGEKS
..: :...:.:: .:.:::::. : :.: . . .: :.
XP_005 ------------------QKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPENSLDPFPPRILKEEPKG
550 560 570 580
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 RDLIKDKIEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTS
.. : . : . . ::. : :.: ..: ..:: .. .. : :: :.
XP_005 KEKEVDGLLTS--EPMGSPVSSKTESVSDKEDKPPLAPSGGTEGPEQPPPPCPSQ---TG
590 600 610 620 630
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 SPACKQEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRS--FSQPKPSTTPTSPRPQAQPSP
:: : . ... .::::.::::::::::::: . .: : ..::::: :... .:
XP_005 SPPVGLIKGEDKDEGPVAEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTP
640 650 660 670 680 690
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 SMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVP---VSPGVQ-P-LYPIPMT-PMPVNQAKTYRAV
:. :. . : ..:... .: ..:.:: : .:: :.. .: .:.: :
XP_005 SI-----PVLTAGQSGLYSPQYISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAK
700 710 720 730 740 750
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 PNMPQQRQDQHHQSA---MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQP-LVQHVP
..: ::.:::. .. ::. :.:::::..:. : ::. :. :.:::::.:: ..: .
XP_005 GSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAAAGPPLVAATP-YSS-YIPYNPQQFPGQPAMMQPMA
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 HYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKET
:: :: : :..:..:.: ::.. .: : ..::::. :: . :: :
XP_005 HYPSQ-P-VFAPMLQSNPRMLTSGSHPQ-AIVSSSTPQYPSAEQ-------P--------
820 830 840 850
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 SPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQ-QSQHGGSHPAPSPVQHHQ
.:. .: .. :.: : . :: : .:::..::::.: ::::. :::::: :
XP_005 TPQALYA----TVHQSYPHHATQLHAH--QPQPATTPTGSQPQSQHA----APSPVQ--Q
860 870 880 890 900
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 HQAAQALHLASPQQQSAIYHAG-LAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQ
:::.:: ::.: : :. .:: : :. ::::. :. ..::::.::: .:..:: ...
XP_005 HQAGQAPHLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPA-AVYAIHHQQLP
910 920 930 940 950 960
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 PAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMV---PSHPTAHAPMMLMTTQPP---GGP-QAALAQSALQ
..:: :::: :::::.:.. : :: : : ..: .:: ::: :.:. ::..
XP_005 HGFTN---MAHVTQAHVQTGITAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQSHGGPPQGAVPQSGVP
970 980 990 1000 1010
1290 1300 1310
pF1KE2 PIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
. .:: . .::. ::
XP_005 ALSASTPSPYPYIGHPQGEQPGQAPGFPGGADDRILCRVGRSHSRRRQGLAPGSVLCFPP
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>XP_011544021 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-like p (1104 aa)
initn: 1254 init1: 888 opt: 1486 Z-score: 589.5 bits: 121.1 E(85289): 4.3e-26
Smith-Waterman score: 2271; 39.6% identity (62.7% similar) in 1186 aa overlap (163-1303:2-1034)
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 PPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPPPA
:::: :: .: :: :: .. ::.
XP_011 MLKPQPLQQPSQPQQPPPTQQAVARR--PPG
10 20
200 210 220 230
pF1KE2 AANVRKPGGSGLLASPAAAPSP--SSSSVSSSSATAPSSVVAATSG------------GG
... . : : ::. :: :.: ..: . :.: :.. .. :
XP_011 GTSPPNGGLPGPLATSAAPPGPPAAASPCLGPVAAAGSGLRRGAEGILAPQPPPPQQHQE
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RPG---LG--RGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGV
::: .: ::....:: ::: . :.:.: : ::.:.::.:::: :.:.:::: :::.
XP_011 RPGAAAIGSARGQSTGKGPPQSPV-FEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNGTTYEGI
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FKTYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAF
::: : : .:..::.:.:..: ..::.::.:.....:: :: ..:.:...: .:: .: :
XP_011 FKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHFRNVDFNYATKDKF
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TDSAIS--AKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGV
:::::. .::::::::: :. :..:. .: . ::.:.:::::::.::..:::::::
XP_011 TDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGD--SNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGV
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VSTYDSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDD-RSEEEK
.::::::::::::::.:::::: .:: :: :::.::::: ::. :.:.:::: :.::::
XP_011 KTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEK
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 YTAVQRNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTS
..::::..: ::. :. .::.:::: :: :: :. : .: : :.:: .:.: :.
XP_011 HSAVQRQGSGRESPSLASREGKYIPLPQRVREG-PRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPH
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 HTSDFNPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPS
: .. .:. ::. : .::: :: ::... : : : ..: . : .:: .
XP_011 HLDNSSPGPGSEARGINGG---PSRM-SPKAQRPLR---GAKTL-------SSPSNRPSG
390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RPSRPPSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFV
. : :: : : ::. : ::: ::: ::. . ::..
XP_011 ETSVPP--PPAAPPFLPVGRMY-------PPR-SPK----------SAAPAPISAS----
440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SHNPPSEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASP
.:: .:.: . . : .. :. :: .:: :::
XP_011 CPEPPIGSAVPTSSASIPVTSSVSD--PGVGSISP----------------------ASP
470 480 490 500
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 QAGIIPTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNE
. .. ::.. . .. :. :.. :. :. ::. ... ::
XP_011 KISLAPTDVKEL----STKEPG-----RTLEPQELAR-----------IAGKVPGLQ-NE
510 520 530 540
780 790 800 810 820
pF1KE2 TSPSFSKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSE-SMDQLLNKN-REGEKS
..: :...:.:: .:.:::::. : :.: . . .: :.
XP_011 ------------------QKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPENSLDPFPPRILKEEPKG
550 560 570 580
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 RDLIKDKIEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTS
.. : . : . . ::. : :.: ..: ..:: .. .. : :: :.
XP_011 KEKEVDGLLTS--EPMGSPVSSKTESVSDKEDKPPLAPSGGTEGPEQPPPPCPSQ---TG
590 600 610 620 630
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 SPACKQEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRS--FSQPKPSTTPTSPRPQAQPSP
:: : . ... .::::.::::::::::::: . .: : ..::::: :... .:
XP_011 SPPVGLIKGEDKDEGPVAEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTP
640 650 660 670 680 690
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 SMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVP---VSPGVQ-P-LYPIPMT-PMPVNQAKTYRAV
:. :. . : ..:... .: ..:.:: : .:: :.. .: .:.: :
XP_011 SI-----PVLTAGQSGLYSPQYISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAK
700 710 720 730 740 750
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 PNMPQQRQDQHHQSA---MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQP-LVQHVP
..: ::.:::. .. ::. :.:::::..:. : ::. :. :.:::::.:: ..: .
XP_011 GSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAAAGPPLVAATP-YSS-YIPYNPQQFPGQPAMMQPMA
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 HYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKET
:: :: : :..:..:.: ::.. .: : ..::::. :: . :: :
XP_011 HYPSQ-P-VFAPMLQSNPRMLTSGSHPQ-AIVSSSTPQYPSAEQ-------P--------
820 830 840 850
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 SPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQ-QSQHGGSHPAPSPVQHHQ
.:. .: .. :.: : . :: : .:::..::::.: ::::. :::::: :
XP_011 TPQALYA----TVHQSYPHHATQLHAH--QPQPATTPTGSQPQSQHA----APSPVQ--Q
860 870 880 890 900
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 HQAAQALHLASPQQQSAIYHAG-LAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQ
:::.:: ::.: : :. .:: : :. ::::. :. ..::::.::: .:..:: ...
XP_011 HQAGQAPHLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPA-AVYAIHHQQLP
910 920 930 940 950 960
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 PAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMV---PSHPTAHAPMMLMTTQPP---GGP-QAALAQSALQ
..:: :::: :::::.:.. : :: : : ..: .:: ::: :.:. ::..
XP_011 HGFTN---MAHVTQAHVQTGITAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQSHGGPPQGAVPQSGVP
970 980 990 1000 1010
1290 1300 1310
pF1KE2 PIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
. .:: . .::. ::
XP_011 ALSASTPSPYPYIGHPQGEQPGQAPGFPGGADDRILCRVGRSHSRRRQGLAPGSVLCFPP
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1313 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 12:26:39 2016 done: Sun Nov 6 12:26:42 2016
Total Scan time: 20.680 Total Display time: 0.600
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]