Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2329
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2329, 1313 aa
1>>>pF1KE2329 1313 - 1313 aa - 1313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.6251+/-0.00112; mu= -11.0729+/- 0.068
mean_var=578.4764+/-118.836, 0's: 0 Z-trim(117.1): 39 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.053325
statistics sampled from 17726 (17760) to 17726 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.546), width: 16
Scan time: 6.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31902.1 ATXN2 gene_id:6311|Hs108|chr12 (1313) 9035 710.8 5.9e-204
CCDS81739.1 ATXN2 gene_id:6311|Hs108|chr12 (1073) 6735 533.8 9.3e-151
CCDS81738.1 ATXN2 gene_id:6311|Hs108|chr12 (1006) 5570 444.2 8.5e-124
CCDS76850.1 ATXN2L gene_id:11273|Hs108|chr16 (1068) 1475 129.1 6.1e-29
CCDS10640.1 ATXN2L gene_id:11273|Hs108|chr16 (1097) 1420 124.9 1.2e-27
CCDS10639.1 ATXN2L gene_id:11273|Hs108|chr16 (1044) 1415 124.5 1.5e-27
CCDS58443.1 ATXN2L gene_id:11273|Hs108|chr16 (1062) 1413 124.4 1.7e-27
CCDS32423.1 ATXN2L gene_id:11273|Hs108|chr16 (1062) 1413 124.4 1.7e-27
CCDS10641.1 ATXN2L gene_id:11273|Hs108|chr16 (1075) 1413 124.4 1.7e-27
CCDS45451.1 ATXN2L gene_id:11273|Hs108|chr16 (1044) 1407 123.9 2.2e-27
>>CCDS31902.1 ATXN2 gene_id:6311|Hs108|chr12 (1313 aa)
initn: 9035 init1: 9035 opt: 9035 Z-score: 3775.2 bits: 710.8 E(32554): 5.9e-204
Smith-Waterman score: 9035; 100.0% identity (100.0% similar) in 1313 aa overlap (1-1313:1-1313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRSAAAAPRSPAVATESRRFAAARWPGWRSLQRPARRSGRGGGGAAPGPYPSAAPPPPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRSAAAAPRSPAVATESRRFAAARWPGWRSLQRPARRSGRGGGGAAPGPYPSAAPPPPGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GPPPSRQSSPPSASDCFGSNGNGGGAFRPGSRRLLGLGGPPRPFVVLLLPLASPGAPPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GPPPSRQSSPPSASDCFGSNGNGGGAFRPGSRRLLGLGGPPRPFVVLLLPLASPGAPPAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PTRASPLGARASPPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTRASPLGARASPPRSGVSLARPAPGCPRPACEPVYGPLTMSLKPQQQQQQQQQQQQQQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QQQQQQQQPPPAAANVRKPGGSGLLASPAAAPSPSSSSVSSSSATAPSSVVAATSGGGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QQQQQQQQPPPAAANVRKPGGSGLLASPAAAPSPSSSSVSSSSATAPSSVVAATSGGGRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GLGRGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFKTYSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLGRGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFKTYSPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTDSAISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTDSAISA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTYDSSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTYDSSLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQRNSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQRNSSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 REGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDFNPNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 REGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDFNPNSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRPPSHPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRPPSHPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 AHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPPSEAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPPSEAAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 PPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGIIPTEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGIIPTEAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 AMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSFSKAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSFSKAEN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 KGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDKIEPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDKIEPSA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 KDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQEKDDKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQEKDDKE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 EKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPTPVYTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPTPVYTQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 PVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSAMMHPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSAMMHPA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 SAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 THAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 THAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 HPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYHAGLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYHAGLAP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 TPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMVPSHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMVPSHP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE2 TAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
1270 1280 1290 1300 1310
>>CCDS81739.1 ATXN2 gene_id:6311|Hs108|chr12 (1073 aa)
initn: 7169 init1: 6730 opt: 6735 Z-score: 2820.0 bits: 533.8 E(32554): 9.3e-151
Smith-Waterman score: 7123; 97.7% identity (97.7% similar) in 1073 aa overlap (266-1313:1-1073)
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GGGRPGLGRGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFK
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 TYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTD
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SAISAKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SAISAKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTY
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQ
160 170 180 190 200 210
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 RNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDF
220 230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 NPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRP
280 290 300 310 320 330
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 PSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPP
340 350 360 370 380 390
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGII
400 410 420 430 440 450
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 PTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSF
460 470 480 490 500 510
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 SKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDK
520 530 540 550 560 570
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 IEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQE
580 590 600 610 620 630
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 KDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPT
640 650 660 670 680 690
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE2 PVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSA
700 710 720 730 740 750
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNAR
760 770 780 790 800 810
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 MMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAH
820 830 840 850 860 870
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 PNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYH
880 890 900 910 920 930
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE2 AGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQ-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQCASEALA
940 950 960 970 980 990
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE2 ------------------AHVQSGMVPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RCGLEMRLSWIYLSEGYLAHVQSGMVPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1300 1310
pF1KE2 VSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
:::::::::::::::::::::::
CCDS81 VSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
1060 1070
>>CCDS81738.1 ATXN2 gene_id:6311|Hs108|chr12 (1006 aa)
initn: 6860 init1: 5483 opt: 5570 Z-score: 2336.0 bits: 444.2 E(32554): 8.5e-124
Smith-Waterman score: 6784; 95.9% identity (96.0% similar) in 1048 aa overlap (266-1313:1-1006)
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GGGRPGLGRGRNSNKGLPQSTISFDGIYANMRMVHILTSVVGSKCEVQVKNGGIYEGVFK
:::::::::::
CCDS81 MRMVHILTSVV-------------------
10
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 TYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 -----CDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAFTD
20 30 40 50 60
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SAISAKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SAISAKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTY
70 80 90 100 110 120
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQ
130 140 150 160 170 180
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 RNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSMPSRSTSHTSDF
190 200 210 220 230 240
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 NPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRP
250 260 270 280 290 300
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 PSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPP
310 320 330 340 350 360
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SEAATPPVARTSPSGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGNTPSGPVLASPQAGII
370 380 390 400 410 420
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 PTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PTEAVAMPIPAASPTPASPASNRAVTPSSEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPNETSPSF
430 440 450 460 470 480
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 SKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SKAENKGISPVVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSESMDQLLNKNREGEKSRDLIKDK
490 500 510 520 530 540
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 IEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IEPSAKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNTEHKRGPEVTSQGVQTSSPACKQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPT
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CCDS81 PVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MMHPASAAGPPIAATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNAR
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CCDS81 MMAPPTHAQPGLVSSSATQYGAHEQTHAMY------------------VSTGSLAQQYAH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPAAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGM
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CCDS81 VPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL
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:. :. . : ..:... .: ..:.:: : .:: :.. .: .:.: :
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:: :: : :..:..:.: ::.. .: : ..::::. :: . :: :
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CCDS10 HLDNSSPGPGSEARGINGG---PSRM-SPKAQRPLR---GAKTL-------SSPSNRPSG
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CCDS10 FKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHFRNVDFNYATKDKF
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1290 1300 1310
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. .:: . .::. ::
CCDS32 ALSASTPSPYPYIGHPQGEQPGQAPGFPGGADDRIPPLPPPGELKIVLAAT
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... . : : ::. :: :.: ..: . :.: :.. .. :
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.. : . : . . ::. : :.: ..: ..:: .. .. : :: :.
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:: : . ... .::::.::::::::::::: . .: : ..::::: :... .:
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:. :. . : ..:... .: ..:.:: : .:: :.. .: .:.: :
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CCDS10 HYPSQ-P-VFAPMLQSNPRMLTSGSHPQ-AIVSSSTPQYPSAEQ-------P--------
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CCDS10 ALSASTPSPYPYIGHPQGEQPGQAPGFPGGADDRIREFSLAGGIWHGRAEGLQVGQDARV
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CCDS45 RPGAAAIGSARGQSTGKGPPQSPV-FEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNGTTYEGI
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pF1KE2 FKTYSPKCDLVLDAAHEKSTESSSGPKREEIMESILFKCSDFVVVQFKDMDSSYAKRDAF
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CCDS45 FKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHFRNVDFNYATKDKF
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pF1KE2 TDSAIS--AKVNGEHKEKDLEPWDAGELTANEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGV
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CCDS45 TDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGD--SNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGV
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CCDS45 HSAVQRQGSGRESPSLASREGKYIPLPQRVREG-PRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPH
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CCDS45 HLDNSSPGPGSEARGINGG---PSRM-SPKAQRPLR---GAKTL-------SSPSNRPSG
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CCDS45 -QAGQAPHLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPA-AVYAIHHQQLP
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CCDS45 ALSASTPSPYPYIGHPQAPLPPPGELKIVLAAT
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1313 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]