Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2155
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2155, 378 aa
1>>>pF1KE2155 378 - 378 aa - 378 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6382+/-0.00135; mu= 14.8245+/- 0.080
mean_var=131.3685+/-40.524, 0's: 0 Z-trim(101.2): 282 B-trim: 925 in 2/44
Lambda= 0.111900
statistics sampled from 5957 (6407) to 5957 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 2460 409.6 2.3e-114
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 2416 402.5 3.1e-112
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 1007 175.0 8.9e-44
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 1007 175.1 9.1e-44
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 955 166.7 3.1e-41
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 841 148.2 1e-35
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 836 147.4 1.8e-35
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 788 139.7 4e-33
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 786 139.4 5e-33
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 786 139.4 5.4e-33
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 779 138.3 1.1e-32
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 772 137.1 2.4e-32
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 762 135.5 7.1e-32
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 760 135.2 8.9e-32
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 758 134.9 1.1e-31
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 749 133.4 3.1e-31
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 745 132.7 4.8e-31
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 734 131.0 1.7e-30
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 715 127.9 1.4e-29
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 711 127.3 2.2e-29
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 711 127.3 2.2e-29
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 689 123.7 2.5e-28
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 668 120.4 2.8e-27
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 661 119.2 5.8e-27
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 661 119.2 6.1e-27
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 645 116.6 3.4e-26
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 611 111.1 1.6e-24
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 611 111.2 1.6e-24
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 611 111.2 1.7e-24
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 573 105.0 1.1e-22
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 567 104.1 2.3e-22
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 522 96.8 3.3e-20
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 516 95.8 6.5e-20
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 503 93.7 2.9e-19
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 490 91.6 1.2e-18
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 482 90.3 2.9e-18
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 482 90.3 2.9e-18
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 481 90.1 3.2e-18
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 478 89.7 4.6e-18
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 477 89.4 4.8e-18
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 477 89.5 5e-18
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 473 88.8 7.6e-18
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 466 87.8 1.8e-17
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 465 87.5 1.9e-17
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 465 87.6 2.1e-17
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 464 87.4 2.3e-17
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 464 87.4 2.3e-17
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 464 87.4 2.3e-17
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 464 87.4 2.3e-17
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 464 87.4 2.3e-17
>>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (378 aa)
initn: 2460 init1: 2460 opt: 2460 Z-score: 2166.8 bits: 409.6 E(32554): 2.3e-114
Smith-Waterman score: 2460; 100.0% identity (100.0% similar) in 378 aa overlap (1-378:1-378)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRH
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE2 IRRSSMSVEAETTTTFSP
::::::::::::::::::
CCDS11 IRRSSMSVEAETTTTFSP
370
>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (372 aa)
initn: 2416 init1: 2416 opt: 2416 Z-score: 2128.5 bits: 402.5 E(32554): 3.1e-112
Smith-Waterman score: 2416; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (7-378:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCEL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRH
300 310 320 330 340 350
370
pF1KE2 IRRSSMSVEAETTTTFSP
::::::::::::::::::
CCDS77 IRRSSMSVEAETTTTFSP
360 370
>>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (357 aa)
initn: 1007 init1: 603 opt: 1007 Z-score: 899.4 bits: 175.0 E(32554): 8.9e-44
Smith-Waterman score: 1007; 41.9% identity (74.6% similar) in 358 aa overlap (28-377:1-352)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT-----VDYTLFESLCSKKDVRN
..::: ...:. :.... . : :..::.
CCDS27 MADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQ
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FKAWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWA
: . ::: .: .. .:: :::.::.:.: : :.::::: .:::::.::.:::.::::::
CCDS27 FASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWA
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 YSAAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLIS
.:: .: : . .::.. ..:::.:.: .::..:::.:::.::.::. :: : . :: :
CCDS27 IAAADQWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYS
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 KLSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLI---TEHVEAFITIQVAQMVIGF
:. : ::.::..: :::.:::.... :. :... : .. .. . ....::
CCDS27 KMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAI--CTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGF
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN
..:...:. :: .::.::.::.. ..::.:: :.:..::.. :.::: ..:.::. .
CCDS27 FLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL
. :.: .: ...: ..:: ..: . :.:: ::.:.: .:: :: : .:.:::.:: :
CCDS27 MFISNCAVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQ-
280 290 300 310 320 330
360 370
pF1KE2 RQWSSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
: : . :..:... . : :
CCDS27 --WVSFTR-REGSLKLSSMLLETTSGALSL
340 350
>>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (369 aa)
initn: 1007 init1: 603 opt: 1007 Z-score: 899.2 bits: 175.1 E(32554): 9.1e-44
Smith-Waterman score: 1007; 41.9% identity (74.6% similar) in 358 aa overlap (28-377:13-364)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT-----VDYTLFESLCSKKDVRN
..::: ...:. :.... . : :..::.
CCDS27 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQ
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FKAWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWA
: . ::: .: .. .:: :::.::.:.: : :.::::: .:::::.::.:::.::::::
CCDS27 FASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 YSAAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLIS
.:: .: : . .::.. ..:::.:.: .::..:::.:::.::.::. :: : . :: :
CCDS27 IAAADQWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 KLSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLI---TEHVEAFITIQVAQMVIGF
:. : ::.::..: :::.:::.... :. :... : .. .. . ....::
CCDS27 KMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAI--CTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN
..:...:. :: .::.::.::.. ..::.:: :.:..::.. :.::: ..:.::. .
CCDS27 FLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL
. :.: .: ...: ..:: ..: . :.:: ::.:.: .:: :: : .:.:::.:: :
CCDS27 MFISNCAVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQ-
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KE2 RQWSSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
: : . :..:... . : :
CCDS27 --WVSFTR-REGSLKLSSMLLETTSGALSL
350 360
>>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 (374 aa)
initn: 539 init1: 317 opt: 955 Z-score: 853.8 bits: 166.7 E(32554): 3.1e-41
Smith-Waterman score: 955; 42.1% identity (73.0% similar) in 366 aa overlap (26-377:13-373)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT---VDYTLFESLCSKKDVRNFK
: : ... ::. :: .. ::: ..::.:.
CCDS52 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEML--LCSLQEVRQFS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS
:.:: ::.:: ::::: :::.:. ..:. ..:::.::::.:.:::::.::::::: :
CCDS52 RLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 -AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISK
:. .:::. :::. .:: ..: ::::: :::.:::.:::::... : :.:.: ::
CCDS52 HATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRC----SLITEHVEAFITIQVAQMVIGF
. :. .: :....: .... :. ... . : . ..: .. . . ....::
CCDS52 IICLVVWGLSVIISSSTFVFN--QKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN
..::. : ::: :..::.::.: .:.:::.::::::.::.. :.:.: :.:. :.::..
CCDS52 FIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL
. .:. : .. . :: :: ..::.:: :::::: :::: ..:..::: :. ..
CCDS52 KMNRSCQSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYK
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KE2 RQWSSC--RHI----RRSSMSVEAETTTTFSP
. :: :. :..: ... .....:.
CCDS52 SSGFSCAGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM
350 360 370
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10 20 30 40 50
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: :.. :: : .: : ::. .: .: :.:::.:
CCDS30 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFA
10 20 30 40
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CCDS30 KVFLPVFLTIVFVIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVN
50 60 70 80 90 100
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:...::.: .::. :.: ..: ::: .: :::::::::.... : .. : .
CCDS30 AVHGWVLGKIMCKITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPS----QSGVGKPCWI
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180 190 200 210 220 230
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: .:. : .::::.:.. .. .. . . ..:.: :. .. :::.::.:
CCDS30 ICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALI--QMLEICIGFVVPFL
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:. ::.. :::.. :.. .. .::...::.:::: ::::: : . ... . ..
CCDS30 IMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 CELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSS
:..::...:: .:: :.: . :.::.::.:.:..:.: ..:. : : : .. :: :
CCDS30 CNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYG--SWRRQRQ--S
280 290 300 310 320 330
360 370
pF1KE2 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
... .: . .: :.:::
CCDS30 VEEFPFDSEG-PTEPTSTFSI
340 350
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESL---CSKKDVRNFK
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pF1KE2 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS
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CCDS26 ELFLPPLYSLVFVFGLLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE2 AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKL
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CCDS26 AADQWVFGLGLCKMISWMYLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSL--RARTLTYGVI
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pF1KE2 SCVGIWILATVLSIPELLYSD--LQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVP
. .. : .:. :.: .:.: .:. . . :: . ... .... ..:...:
CCDS26 TSLATWSVAVFASLPGFLFSTCYTERNHTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEIN--ILGLVIP
160 170 180 190 200 210
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pF1KE2 LLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITS
: : ::: .::::: . .: ..:::.:.:.::::.:. : ::: :.. .:...... .
CCDS26 LGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQ
220 230 240 250 260 270
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pF1KE2 STCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQW
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CCDS26 D-CTFERYLDYAIQATETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKT--CRGLFVLCQY
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360 370
pF1KE2 SSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
. .: .. . : .:
CCDS26 CGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDLHDAL
340 350 360
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 KPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFES-LCSKKD---VRNFKAWF
:: . : .: :. :: . . .::: :
CCDS84 MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYN-DTSLVENHLCPATEGPLMASFKAVF
10 20 30 40 50
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pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
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CCDS84 VPVAYSLIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSV
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pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
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CCDS84 GWVLGTFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHR-RLLSI-HITCG
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pF1KE2 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAM-RCSLITEH---VEAFITIQVAQMVIGFLVPL
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CCDS84 TIWLVGFLLALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAWFTSRFLYHVAGFLLPM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LAMSFCYLVIIRTLLQA-RNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITS
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CCDS84 LVMGWCYVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVD
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 STCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQW
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CCDS84 NTCKLNGSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQL
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pF1KE2 SSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
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CCDS84 FPS--WRRSSLS-ESENATSLTTF
360 370
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
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pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
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CCDS14 MVLEVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDY-GENES-DSCCTSPPCPQDFSLNFDRAF
10 20 30 40 50
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pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
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CCDS14 LPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHR--ARVLLISKLS
.:::: .::. :.....:..: ::: :::.:::. ::.:.. .:. ::: : .
CCDS14 QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTL----T
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 CVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA
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CCDS14 CLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQV-GRTALRVLQLVAGFLLPLLV
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:..:: :. .:: .:. .: .:......:::.: . ::. :::.. . ... . .:
CCDS14 MAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNC
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pF1KE2 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL-RQWSS
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CCDS14 GRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS
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360 370
pF1KE2 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
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CCDS14 SR--RDSSWSETSEASYSGL
360
>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS48 SPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDY-GENES-DSCCTSPPCPQDFSLNFDRAF
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CCDS48 CLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQV-GRTALRVLQLVAGFLLPLLV
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CCDS48 MAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNC
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pF1KE2 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL-RQWSS
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CCDS48 GRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS
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360 370
pF1KE2 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
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CCDS48 SR--RDSSWSETSEASYSGL
400 410
378 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 15:46:16 2016 done: Sun Nov 6 15:46:16 2016
Total Scan time: 2.200 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]