Result of FASTA (omim) for
pF1KE2114
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2114, 882 aa
1>>>pF1KE2114 882 - 882 aa - 882 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
63214209 residues in 88908 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7393+/-0.000409; mu= 19.4412+/- 0.025
mean_var=91.2817+/-18.860, 0's: 0 Z-trim(114.4): 419 B-trim: 1101 in 2/53
Lambda= 0.134240
statistics sampled from 24304 (24737) to 24304 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 9.350
The best scores are: opt bits E(88908)
NP_004351 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19209 ( 882) 5857 1145.3 0
XP_011521790 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 637) 4160 816.5 0
XP_011521791 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 637) 4160 816.5 0
NP_001304125 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 774) 3045 600.6 9.5e-171
NP_001784 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 ( 829) 3045 600.6 1e-170
NP_001304113 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 821) 2945 581.3 6.7e-165
XP_011521102 (OMIM: 114021,225280,601553) PREDICTE ( 808) 2622 518.7 4.5e-146
NP_001304124 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 784) 2617 517.7 8.6e-146
NP_001304114 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 366) 2441 483.4 8.7e-136
XP_016881003 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 ( 848) 1804 360.3 2.3e-98
NP_001783 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 1 prep ( 906) 1804 360.3 2.4e-98
NP_001295105 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 2 [ ( 875) 1758 351.4 1.1e-95
XP_011524090 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 ( 821) 1686 337.4 1.7e-91
NP_001239268 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 3 [ ( 842) 1600 320.8 1.8e-86
NP_001239267 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 2 [ ( 879) 1600 320.8 1.8e-86
NP_001785 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 1 prep ( 916) 1600 320.8 1.9e-86
NP_001304115 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 227) 1514 303.7 6.7e-82
NP_004924 (OMIM: 114019,612580) cadherin-15 prepro ( 814) 1283 259.4 5.2e-68
NP_001304153 (OMIM: 604555) cadherin-10 isoform 3 ( 786) 1273 257.4 2e-67
XP_016864404 (OMIM: 604555) PREDICTED: cadherin-10 ( 786) 1273 257.4 2e-67
NP_004939 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 840) 1266 256.1 5.3e-67
NP_077739 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 894) 1266 256.1 5.5e-67
XP_011521106 (OMIM: 601364) PREDICTED: cadherin-13 ( 612) 1229 248.8 5.9e-65
NP_001248 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 1 pre ( 713) 1229 248.9 6.7e-65
NP_001207417 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 2 ( 760) 1229 248.9 7e-65
NP_004940 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 847) 1213 245.8 6.5e-64
NP_077740 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 901) 1213 245.9 6.8e-64
XP_005258263 (OMIM: 125645,610476) PREDICTED: desm ( 758) 1168 237.1 2.5e-61
NP_077741 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 839) 1132 230.2 3.4e-59
NP_001932 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 896) 1132 230.2 3.6e-59
NP_001207418 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 3 ( 674) 1120 227.8 1.4e-58
XP_011512225 (OMIM: 604555) PREDICTED: cadherin-10 ( 788) 1060 216.2 5.1e-55
NP_006718 (OMIM: 604555) cadherin-10 isoform 1 pre ( 788) 1060 216.2 5.1e-55
NP_001934 (OMIM: 125671,610193,612877) desmoglein- (1118) 1021 208.8 1.3e-52
NP_066976 (OMIM: 603016) cadherin-19 isoform 1 pre ( 772) 985 201.7 1.2e-50
XP_011524152 (OMIM: 169615) PREDICTED: desmoglein- ( 998) 981 201.0 2.5e-50
NP_001935 (OMIM: 169615) desmoglein-3 preproprotei ( 999) 981 201.0 2.5e-50
NP_001304143 (OMIM: 605806) cadherin-7 isoform 2 p ( 630) 911 187.3 2.1e-46
XP_011512223 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6 ( 790) 911 187.3 2.5e-46
NP_004923 (OMIM: 603007) cadherin-6 preproprotein ( 790) 911 187.3 2.5e-46
XP_016864399 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6 ( 790) 911 187.3 2.5e-46
NP_001207419 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 4 ( 459) 903 185.6 4.8e-46
NP_817123 (OMIM: 607892,607903) desmoglein-4 isofo (1040) 894 184.1 3e-45
NP_001127925 (OMIM: 607892,607903) desmoglein-4 is (1059) 894 184.1 3.1e-45
NP_057363 (OMIM: 609974) cadherin-9 preproprotein ( 789) 889 183.1 4.8e-45
XP_016864400 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6 ( 663) 876 180.5 2.4e-44
NP_004052 (OMIM: 600562) cadherin-12 isoform 1 pre ( 794) 846 174.8 1.5e-42
XP_011512229 (OMIM: 600562) PREDICTED: cadherin-12 ( 794) 846 174.8 1.5e-42
NP_001304156 (OMIM: 600562) cadherin-12 isoform 1 ( 794) 846 174.8 1.5e-42
XP_016864409 (OMIM: 600562) PREDICTED: cadherin-12 ( 794) 846 174.8 1.5e-42
>>NP_004351 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090,60 (882 aa)
initn: 5857 init1: 5857 opt: 5857 Z-score: 6129.2 bits: 1145.3 E(88908): 0
Smith-Waterman score: 5857; 100.0% identity (100.0% similar) in 882 aa overlap (1-882:1-882)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFEDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFEDC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNTVG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILNDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILNDDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 AISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILAL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 EVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KE2 EAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
850 860 870 880
>>XP_011521790 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090 (637 aa)
initn: 4160 init1: 4160 opt: 4160 Z-score: 4355.0 bits: 816.5 E(88908): 0
Smith-Waterman score: 4160; 100.0% identity (100.0% similar) in 637 aa overlap (246-882:1-637)
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 VTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGA
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 LPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDR
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 ESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITT
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 LKVTDADAPNTPAWEAVYTILNDDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKVTDADAPNTPAWEAVYTILNDDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVA
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 VTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDT
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 FMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVA
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 TGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGAS
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 ANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVC
400 410 420 430 440 450
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 RKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYY
460 470 480 490 500 510
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 DEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENL
520 530 540 550 560 570
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 KAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADM
580 590 600 610 620 630
880
pF1KE2 YGGGEDD
:::::::
XP_011 YGGGEDD
>>XP_011521791 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090 (637 aa)
initn: 4160 init1: 4160 opt: 4160 Z-score: 4355.0 bits: 816.5 E(88908): 0
Smith-Waterman score: 4160; 100.0% identity (100.0% similar) in 637 aa overlap (246-882:1-637)
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 VTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGA
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 LPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDR
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 ESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITT
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 LKVTDADAPNTPAWEAVYTILNDDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKVTDADAPNTPAWEAVYTILNDDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVA
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 VTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDT
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 FMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVA
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 TGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGAS
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 ANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVC
400 410 420 430 440 450
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 RKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYY
460 470 480 490 500 510
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 DEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENL
520 530 540 550 560 570
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 KAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADM
580 590 600 610 620 630
880
pF1KE2 YGGGEDD
:::::::
XP_011 YGGGEDD
>>NP_001304125 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 i (774 aa)
initn: 2310 init1: 1602 opt: 3045 Z-score: 3186.8 bits: 600.6 E(88908): 9.5e-171
Smith-Waterman score: 3045; 60.2% identity (82.7% similar) in 746 aa overlap (139-882:38-774)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KFSTKVTLNTVGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEK
: :: :. :::.:::::. ::: ::: :
NP_001 PALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFP-SKRILRRHKRDWVVAPISVPENGK
10 20 30 40 50 60
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 GPFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATY
::::. : :.:::::.. :.:::::: :::.:: ::: .:.::::: ...:::::.:: :
NP_001 GPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKY
70 80 90 100 110 120
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 TLFSHAVSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATD
::.:::: :: .:::::.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.:::::::.:::::
NP_001 ELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATD
130 140 150 160 170 180
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 ADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAA
:: . :::...::.: ::.:. : ::::.:.::.:::...:::::. : :::..::.
NP_001 EDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQAT
190 200 210 220 230 240
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 DLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPA
:..:.: .:::.::. . :.::: :.:.: :...:::: .. . : ::: ::::.::
NP_001 DMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPA
250 260 270 280 290 300
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 WEAVYTILN-DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLT
:.:.: :.. ::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.: ::: .:: ..:
NP_001 WRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLP
310 320 330 340 350 360
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 TSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWR
:::::..: : ::::::.:::: : :::.: . .:. . :::..:: .:::.::: :
NP_001 TSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILR
370 380 390 400 410 420
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 DTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSD
: :.:: ..::.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: .:::::::: : :
NP_001 DPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLID
430 440 450 460 470 480
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 VNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQ
:::..:.:::: : .:...: ::.:: : :: :.:::: :.:: .. :: . :.
NP_001 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEG-
490 500 510 520 530 540
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 ESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQI
....:. : :. : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .: : ..:. .
NP_001 DTVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETC--PGPWKGGFIL
550 560 570 580 590 600
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 PAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDF
: .::..::::.:.:.:::..:.. .::::: :::::::::.:: ::::::::::.
NP_001 P----VLGAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDY
610 620 630 640 650
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 DLSQLHRGLDARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPP
:..::::::.:::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: ::::::.:::::::
NP_001 DITQLHRGLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPP
660 670 680 690 700 710
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 YDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
::.:::::::::::.:::::::.:: ::.:::::::::::.:::::::::::::::
NP_001 YDTLLVFDYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
720 730 740 750 760 770
>>NP_001784 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 isof (829 aa)
initn: 2384 init1: 1602 opt: 3045 Z-score: 3186.4 bits: 600.6 E(88908): 1e-170
Smith-Waterman score: 3094; 55.1% identity (75.9% similar) in 877 aa overlap (10-882:9-829)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWL-CQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFED
: :::::: :: : :::. : :. . . : :..::.: :
NP_001 MGLPRGPLASLLLLQVC-WLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKV-FMG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 CTGRQRTAYFSLDTR-FKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNT
: : :. : :: :. : : . .. .: :. .::
NP_001 CPG-QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNP------------------------
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQI
: :: :. :::.:::::. ::: ::: :::::. : :.
NP_001 --------------------LKIFP-SKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQL
100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 KSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSN
:::::.. :.:::::: :::.:: ::: .:.::::: ...:::::.:: : ::.:::: :
NP_001 KSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSEN
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNA
: .:::::.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.:::::::.::::: :: . :::.
NP_001 GASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNG
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 AIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTT
..::.: ::.:. : ::::.:.::.:::...:::::. : :::..::.:..:.: .::
NP_001 VVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTT
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILN-
:.::. . :.::: :.:.: :...:::: .. . : ::: ::::.:::.:.: :..
NP_001 AVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGG
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDV
::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.: ::: .:: ..: :::::..: :
NP_001 DDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHV
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINP
::::::.:::: : :::.: . .:. . :::..:: .:::.::: :: :.:: ..:
NP_001 EDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILRDPAGWLAMDP
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 DTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEP
:.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: .:::::::: : ::::..:.:::
NP_001 DSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEP
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMA
: : .:...: ::.:: : :: :.:::: :.:: .. :: . :. ....:. :
NP_001 RQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKF
560 570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 LEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGI
:. : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .: : ..:. .: .::..
NP_001 LKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETC--PGPWKGGFILP----VLGAV
610 620 630 640 650 660
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 LALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLD
::::.:.:.:::..:.. .::::: :::::::::.:: ::::::::::.:..::::::.
NP_001 LALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLE
670 680 690 700 710 720
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 ARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYE
:::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: ::::::.:::::::::.:::::::
NP_001 ARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYE
730 740 750 760 770 780
840 850 860 870 880
pF1KE2 GSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
::::.:::::::.:: ::.:::::::::::.:::::::::::::::
NP_001 GSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
790 800 810 820
>>NP_001304113 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090 (821 aa)
initn: 2937 init1: 2937 opt: 2945 Z-score: 3081.7 bits: 581.3 E(88908): 6.7e-165
Smith-Waterman score: 5329; 93.1% identity (93.1% similar) in 882 aa overlap (1-882:1-821)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFEDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFEDC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNTVG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILNDDG
:::::::::::::::::::
NP_001 AVITVTDTNDNPPIFNPTT-----------------------------------------
370
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 --------------------GLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDV
380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTG
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 AISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEV
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILAL
600 610 620 630 640 650
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARP
660 670 680 690 700 710
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 EVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGS
720 730 740 750 760 770
850 860 870 880
pF1KE2 EAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
780 790 800 810 820
>>XP_011521102 (OMIM: 114021,225280,601553) PREDICTED: c (808 aa)
initn: 2294 init1: 1602 opt: 2622 Z-score: 2743.8 bits: 518.7 E(88908): 4.5e-146
Smith-Waterman score: 2673; 51.3% identity (73.1% similar) in 830 aa overlap (10-835:9-778)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWL-CQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFED
: :::::: :: : :::. : :. . . : :..::.: :
XP_011 MGLPRGPLASLLLLQVC-WLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKV-FMG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 CTGRQRTAYFSLDTR-FKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNT
: : :. : :: :. : : . .. .: :. .::
XP_011 CPG-QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNP------------------------
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQI
: :: :. :::.:::::. ::: ::: :::::. : :.
XP_011 --------------------LKIFP-SKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQL
100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 KSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSN
:::::.. :.:::::: :::.:: ::: .:.::::: ...:::::.:: : ::.:::: :
XP_011 KSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSEN
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNA
: .:::::.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.:::::::.::::: :: . :::.
XP_011 GASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNG
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 AIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTT
..::.: ::.:. : ::::.:.::.:::...:::::. : :::..::.:..:.: .::
XP_011 VVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTT
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILN-
:.::. . :.::: :.:.: :...:::: .. . : ::: ::::.:::.:.: :..
XP_011 AVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGG
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDV
::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.: ::: .:: ..: :::::..: :
XP_011 DDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHV
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINP
::::::.:::: : :::.: . .:. . :::..:: .:::.::: :: :.:: ..:
XP_011 EDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILRDPAGWLAMDP
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 DTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEP
:.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: .:::::::: : ::::..:.:::
XP_011 DSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEP
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMA
: : .:...: ::.:: : :: :.:::: :.:: .. :: . :. ....:. :
XP_011 RQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKF
560 570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 LEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGI
:. : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .: : ..:. .: .::..
XP_011 LKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETC--PGPWKGGFILP----VLGAV
610 620 630 640 650 660
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 LALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLD
::::.:.:.:::..:.. .::::: :::::::::.:: ::::::::::.:..::::::.
XP_011 LALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLE
670 680 690 700 710 720
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 ARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYE
:::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: : : .::.. :. :
XP_011 ARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIEVLLLC----RSPPWQEALATGYS
730 740 750 760 770
840 850 860 870 880
pF1KE2 GSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
XP_011 LDPAWPVPPFPPTTPGKTKTQPFHKYMST
780 790 800
>>NP_001304124 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 i (784 aa)
initn: 2292 init1: 1602 opt: 2617 Z-score: 2738.7 bits: 517.7 E(88908): 8.6e-146
Smith-Waterman score: 2666; 52.1% identity (74.0% similar) in 808 aa overlap (10-813:9-760)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWL-CQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFED
: :::::: :: : :::. : :. . . : :..::.: :
NP_001 MGLPRGPLASLLLLQVC-WLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKV-FMG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 CTGRQRTAYFSLDTR-FKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNT
: : :. : :: :. : : . .. .: :. .::
NP_001 CPG-QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNP------------------------
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQI
: :: :. :::.:::::. ::: ::: :::::. : :.
NP_001 --------------------LKIFP-SKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQL
100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 KSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSN
:::::.. :.:::::: :::.:: ::: .:.::::: ...:::::.:: : ::.:::: :
NP_001 KSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSEN
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNA
: .:::::.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.:::::::.::::: :: . :::.
NP_001 GASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNG
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 AIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTT
..::.: ::.:. : ::::.:.::.:::...:::::. : :::..::.:..:.: .::
NP_001 VVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTT
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILN-
:.::. . :.::: :.:.: :...:::: .. . : ::: ::::.:::.:.: :..
NP_001 AVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGG
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDV
::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.: ::: .:: ..: :::::..: :
NP_001 DDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHV
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINP
::::::.:::: : :::.: . .:. . :::..:: .:::.::: :: :.:: ..:
NP_001 EDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILRDPAGWLAMDP
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 DTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEP
:.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: .:::::::: : ::::..:.:::
NP_001 DSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEP
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMA
: : .:...: ::.:: : :: :.:::: :.:: .. :: . :. ....:. :
NP_001 RQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKF
560 570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 LEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGI
:. : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .: : ..:. .: .::..
NP_001 LKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETC--PGPWKGGFILP----VLGAV
610 620 630 640 650 660
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 LALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLD
::::.:.:.:::..:.. .::::: :::::::::.:: ::::::::::.:..::::::.
NP_001 LALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLE
670 680 690 700 710 720
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 ARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYE
:::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: :
NP_001 ARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIEGRGERGSQRGNGGLQLARGRTRR
730 740 750 760 770 780
840 850 860 870 880
pF1KE2 GSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
NP_001 S
>>NP_001304114 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090 (366 aa)
initn: 2441 init1: 2441 opt: 2441 Z-score: 2559.1 bits: 483.4 E(88908): 8.7e-136
Smith-Waterman score: 2441; 100.0% identity (100.0% similar) in 366 aa overlap (517-882:1-366)
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRA
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRA
10 20 30
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERN
40 50 60 70 80 90
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKIN
100 110 120 130 140 150
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILL
160 170 180 190 200 210
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRND
220 230 240 250 260 270
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLS
280 290 300 310 320 330
850 860 870 880
pF1KE2 SLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
340 350 360
>>XP_016881003 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 isof (848 aa)
initn: 1449 init1: 609 opt: 1804 Z-score: 1887.3 bits: 360.3 E(88908): 2.3e-98
Smith-Waterman score: 2151; 44.3% identity (70.7% similar) in 842 aa overlap (6-813:9-838)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGPWSRSLSALLL-LLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVN
:.: :: :::.: : :. :: . :. .: . ...:. : :.
XP_016 MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYS-AVLSKDVHEGQPLLNVK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FEDCTGRQRTAYFSLD-TRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDS-TYRKFSTKV
: .:.:.... : : . . ::: ::.. . : . . . . .::.:: :. : .:... :
XP_016 FSNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE2 TLNTVGHHHRPPPHQASVS-GIQAELLTFPNS----SPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKG
:. .: . ::. . ..: ..:: . : :.:::::::::::. ::: .:
XP_016 KLSL-----KPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 PFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYT
:::..::.:.:..::. .. ::.:: ::: ::.:.:::. .: :.::.:::::.:: .
XP_016 PFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LFSHAVSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDA
: .:::. ::: ::.:..:.:.: :.:::.::: ..:..:.: ::. ::: :: ::: ::
XP_016 LRAHAVDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 DDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAAD
:: :. :. . : :.:: : :. :::::: .:: : .:..:::::. :::..::.:
XP_016 DDP-NALNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 LQGE---GLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNT
..:. :::.::::::::::.::::: :. :. :.::::........: ::: : :.:
XP_016 MEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 PAWEAVYTILNDDG-GQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVS
:::.::: : . : :.:.. :.: .:::.. ..: .:::......: ::. : ::. .
XP_016 PAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKG
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LT---TSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKIT
. :::::.: :.:::: : :.: : .. : . .: .:..:::.:: .:.:.:
XP_016 IQHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIR
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 YRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLL
: : ::::.:.: .: :.: : ::::. .:::. :.: ..:.::: : .:::::
XP_016 YTKLSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRES-PNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQ
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630
pF1KE2 LILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINI--IDADLPPNTSPFTAELTHGASA---N
. : :.::::: :. :: .: :. ::: .: :. ::..::. .: . . :
XP_016 IYLLDINDNAPQVLPQEAETCE-TPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRN
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 WTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQN--KDQVTTLEVSVCDCEGAAGVC
::: . .. :: :. ::.: :.. . . :. : :.... :.:.::.:. . : :
XP_016 WTITRLNGDFAQLNLKIKF-LEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCD-SNGDC
660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 RKA-QPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAV---VKEPLLPPEDDTRDN
. . : ::: ::..:: :. ::::.:.......:: .:. :. ::::.:::
XP_016 TDVDRIVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDN
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800
pF1KE2 VYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPE------VTRNDVAPTLMSVPRYLPRPA--N
. ::::::::::::.:::::.. ..:. . : : : . . :.: : : .
XP_016 ILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERP-IHAEPQYPVRSAAPH
770 780 790 800 810 820
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 PDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLN
: .::.::.:
XP_016 PGDIGDFINEKTWPIESLHL
830 840
882 residues in 1 query sequences
63214209 residues in 88908 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Sep 11 12:00:43 2017 done: Mon Sep 11 12:00:45 2017
Total Scan time: 9.350 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]