Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1072
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1072, 771 aa
1>>>pF1KE1072 771 - 771 aa - 771 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9509+/-0.00116; mu= 17.0544+/- 0.069
mean_var=72.8659+/-14.835, 0's: 0 Z-trim(101.7): 38 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.150249
statistics sampled from 6585 (6616) to 6585 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 3.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33892.1 SLC7A14 gene_id:57709|Hs108|chr3 ( 771) 5029 1100.1 0
CCDS33608.1 SLC7A4 gene_id:6545|Hs108|chr22 ( 635) 1204 271.0 4.2e-72
CCDS14404.1 SLC7A3 gene_id:84889|Hs108|chrX ( 619) 820 187.8 4.7e-47
CCDS9333.1 SLC7A1 gene_id:6541|Hs108|chr13 ( 629) 812 186.0 1.6e-46
CCDS34852.1 SLC7A2 gene_id:6542|Hs108|chr8 ( 658) 779 178.9 2.3e-44
CCDS55203.1 SLC7A2 gene_id:6542|Hs108|chr8 ( 698) 779 178.9 2.5e-44
CCDS6002.2 SLC7A2 gene_id:6542|Hs108|chr8 ( 697) 757 174.1 6.7e-43
CCDS9590.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 ( 535) 287 72.2 2.5e-12
>>CCDS33892.1 SLC7A14 gene_id:57709|Hs108|chr3 (771 aa)
initn: 5029 init1: 5029 opt: 5029 Z-score: 5887.5 bits: 1100.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5029; 100.0% identity (100.0% similar) in 771 aa overlap (1-771:1-771)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSGFFTSLDPRRVQWGAAWYAMHSRILRTKPVESMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLIS
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CCDS33 MSGFFTSLDPRRVQWGAAWYAMHSRILRTKPVESMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LGVGSCVGTGMYVVSGLVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGVGSCVGTGMYVVSGLVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TYSYVTVGEFVAFFIGWNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TYSYVTVGEFVAFFIGWNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GKGEESYPDLLALLIAVIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGKY
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CCDS33 GKGEESYPDLLALLIAVIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WAEGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAITASLVICLTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WAEGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAITASLVICLTAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVSLLGSLFPMPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVSLLGSLFPMPRV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 IYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMMSIGTLLAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMMSIGTLLAYT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGDEFSGPATNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGDEFSGPATNT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 CGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLIKLKKLIGPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLIKLKKLIGPH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 YYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFIIFGSDYISEQSWWAILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFIIFGSDYISEQSWWAILL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 VVLMVLLISTLVFVILQQPENPKKLPYMAPCLPFVPAFAMLVNIYLMLKLSTITWIRFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVLMVLLISTLVFVILQQPENPKKLPYMAPCLPFVPAFAMLVNIYLMLKLSTITWIRFAV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 WCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSYATEGESQEDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSYATEGESQEDW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE1 GGPTEDKGFYYQQMSDAKANGRTSSKAKSKSKHKQNSEALIANDELDYSPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GGPTEDKGFYYQQMSDAKANGRTSSKAKSKSKHKQNSEALIANDELDYSPE
730 740 750 760 770
>>CCDS33608.1 SLC7A4 gene_id:6545|Hs108|chr22 (635 aa)
initn: 1055 init1: 815 opt: 1204 Z-score: 1407.9 bits: 271.0 E(32554): 4.2e-72
Smith-Waterman score: 1387; 37.8% identity (65.4% similar) in 709 aa overlap (25-728:17-632)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSGFFTSLDPRRVQWGAAWYAMHSRILRTKPVE-SMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLI
.. : ::.: : .: :.: . :.:.::
CCDS33 MARGLPTIASLARLCQKLNRLKPLEDSTME---------TSLRRCLSTLDLT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SLGVGSCVGTGMYVVSGLVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSA
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CCDS33 LLGVGGMVGSGLYVLTGAVAKEVAGPAVLLSFGVAAVASLLAALCYAEFGARVPRT-GSA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 YTYSYVTVGEFVAFFIGWNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNG
: ..::..::. ::.::::..:::.:: :: : : :...::. .:.: . ::. .
CCDS33 YLFTYVSMGELWAFLIGWNVLLEYIIGGAAVARAWSGYLDSMFSHSIRNFTETHVGSWQV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LGKGEESYPDLLALLIAVIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGK
:. :::.:: : .... .:. :.. : .:.......: : .::.: :... . .
CCDS33 PLLGH--YPDFLAAGIILLASAFVSCGARVSSWLNHTFSAISLLVILFIVILGFILAQPH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 YWA--EGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAITASLVICL
:. :: : : :.:::. :.:.:::::.:::.::...:::.:: :.: ::. ::.:
CCDS33 NWSADEGGFAPFGFSGVMAGTASCFYAFVGFDVIAASSEEAQNPRRSVPLAIAISLAIAA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 TAYVSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVSLLGSLFPM
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CCDS33 GAYILVSTVLTLMVPWHSLDPDSALADAFYQRGYRWAGFIVAAGSICAMNTVLLSLLFSL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PRVIYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMMSIGTLL
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CCDS33 PRIVYAMAADGLFFQVFAHVHPRTQVPVAGTLAFGLLTAFLALLLDLESLVQFLSLGTLL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 AYTLVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGDEFSGPA
:::.:.. ...::.: : : : : ::
CCDS33 AYTFVATSIIVLRFQKSSP-----------------------------PSSPGPASPGPL
410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 TNTCGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLIKLKKLI
: :. :..:. .:.: : ... :. : .:: .
CCDS33 T-----KQQSSFSDHLQLVG-----TVHASVPEPG-------------------ELKPAL
440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 GPHYYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFIIFGSDYISEQSWWA
:. ::. .: . : .:: . ... . . ..::.. . :
CCDS33 RPY-------LGF---LD--GYSPGAVVTWALGVMLASAITIGCVLVFGNSTLHLPHWGY
470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 ILLVVL--MVLLISTLVFVILQQPENPKKLPYMAPCLPFVPAFAMLVNIYLMLKLSTITW
:::..: ...:.: ::. :: .. .. : .:..::.....:: :::::: .::
CCDS33 ILLLLLTSVMFLLSLLVLGAHQQQY--REDLFQIPMVPLIPALSIVLNICLMLKLSYLTW
520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 IRFAVWCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSYATEGE
.::..: ..:: .:::::: .: . . :: .::. : : :.:: . : .
CCDS33 VRFSIWLLMGLAVYFGYGIRHS--KENQRELPGLNSTH--YVVFPRGSLEETVQ-AMQPP
570 580 590 600 610 620
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 SQEDWGGPTEDKGFYYQQMSDAKANGRTSSKAKSKSKHKQNSEALIANDELDYSPE
:: .:..: :
CCDS33 SQ----APAQDPGHME
630
>>CCDS14404.1 SLC7A3 gene_id:84889|Hs108|chrX (619 aa)
initn: 1684 init1: 813 opt: 820 Z-score: 958.3 bits: 187.8 E(32554): 4.7e-47
Smith-Waterman score: 1502; 40.8% identity (64.9% similar) in 679 aa overlap (47-699:26-610)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 AAWYAMHSRILRTKPVESMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLISLGVGSCVGTGMYVVSG
:.::. :.:.::..::::: .:.:.::..:
CCDS14 MPWQAFRRFGQKLVRRRTLESGMAETRLARCLSTLDLVALGVGSTLGAGVYVLAG
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSAYTYSYVTVGEFVAFFIG
:::. :::.... :..::..:.:.:.::::::.:::.. :::: ::::::::. :: :
CCDS14 EVAKDKAGPSIVICFLVAALSSVLAGLCYAEFGARVPRS-GSAYLYSYVTVGELWAFTTG
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 WNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNGLGKGEESYPDLLALLIA
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CCDS14 WNLILSYVIGTASVARAWSSAFDNLIGNHISKTLQGSIAL--HVPHVLAEYPDFFALGLV
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KE1 VIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGKY--W-----------AE
...: ..:::...: ..:.. .:: : :.::.: :..: : ::
CCDS14 LLLTGLLALGASESALVTKVFTGVNLLVLGFVMISG--FVKGDVHNWKLTEEDYELAMAE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE1 ------------GQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAITA
: :.: :. :.:.:::::::::.::: ::::::::.::. :::..:.
CCDS14 LNDTYSLGPLGSGGFVPFGFEGILRGAATCFYAFVGFDCIATTGEEAQNPQRSIPMGIVI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SLVICLTAYVSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVSLL
:: .:. :: .:: ::::.::: .. :::: : :. :. :..:::.::. .:..:::
CCDS14 SLSVCFLAYFAVSSALTLMMPYYQLQPESPLPEAFLYIGWAPARYVVAVGSLCALSTSLL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 GSLFPMPRVIYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMM
::.::::::::::: :::::: ::.. . :.::..: .:::..::..:.: .: ::...:
CCDS14 GSMFPMPRVIYAMAEDGLLFRVLARIHTGTRTPIIATVVSGIIAAFMAFLFKLTDLVDLM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 SIGTLLAYTLVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGD
::::::::.:::.:::.:::::... : : .. ..::
CCDS14 SIGTLLAYSLVSICVLILRYQPDQET--------------KTGEEVELQEEA--------
420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 EFSGPATNTCGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLI
.:: :::.. :
CCDS14 --------------------------------------------ITT-----ESEKLTLW
450
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 KLKKLIGPHYYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFII-FGSDYI
: .. . . :: .:. : .: :: .:. .: . .. .
CCDS14 GL-------FFPLN---------SIPTPLSGQIVYVCSSLLAVLLTALCLVLAQWSVPLL
460 470 480 490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 SEQSWWAILLVVLMVLLISTLVFVILQQPENPKKLPYMAPCLPFVPAFAMLVNIYLMLKL
: . :. . :::..::: .. :: .::.. : . .: ::..: ....::::::...
CCDS14 SGDLLWTAV-VVLLLLLIIGIIVVIWRQPQSSTPLHFKVPALPLLPLMSIFVNIYLMMQM
510 520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 STITWIRFAVWCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSY
.. :: ::.:: ..:. ::::::: .: ::.. . . ..: . :.:
CCDS14 TAGTWARFGVWMLIGFAIYFGYGIQHSLEEIKSNQPS-RKSRAKTVDLDPGTLYVHSV
570 580 590 600 610
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 ATEGESQEDWGGPTEDKGFYYQQMSDAKANGRTSSKAKSKSKHKQNSEALIANDELDYSP
>>CCDS9333.1 SLC7A1 gene_id:6541|Hs108|chr13 (629 aa)
initn: 1705 init1: 812 opt: 812 Z-score: 948.8 bits: 186.0 E(32554): 1.6e-46
Smith-Waterman score: 1597; 42.9% identity (69.8% similar) in 658 aa overlap (47-677:26-608)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 AAWYAMHSRILRTKPVESMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLISLGVGSCVGTGMYVVSG
:.:.. :.: ::..::::: .:.:.::..:
CCDS93 MGCKVLLNIGQQMLRRKVVDCSREETRLSRCLNTFDLVALGVGSTLGAGVYVLAG
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSAYTYSYVTVGEFVAFFIG
::.: :::....::.:::.::.:.:.::.:::.::::: :::: ::::::::. ::. :
CCDS93 AVARENAGPAIVISFLIAALASVLAGLCYGEFGARVPKT-GSAYLYSYVTVGELWAFITG
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 WNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNGLGKGEESYPDLLALLIA
::::: :.:::.. : : :. :: : .. :... . :::. : :. ::..:..:
CCDS93 WNLILSYIIGTSSVARAWSATFDELIGRPIGEFSRTHM-TLNAPGVLAEN-PDIFAVIII
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KE1 VIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFING--KYWA------------
.:.: ...::::.: :.... .:. : :::..: :..: : :
CCDS93 LILTGLLTLGVKESAMVNKIFTCINVLVLGFIMVSG--FVKGSVKNWQLTEEDFGNTSGR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280
pF1KE1 --------EGQ-----FLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAI
::. :.: :.::::.:::::::::.::: :::::::.:::. .:: .:
CCDS93 LCLNNDTKEGKPGVGGFMPFGFSGVLSGAATCFYAFVGFDCIATTGEEVKNPQKAIPVGI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 TASLVICLTAYVSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVS
.:::.::. :: .::. ::::.::. .:..::: . : :. .::..::.::. .:..:
CCDS93 VASLLICFIAYFGVSAALTLMMPYFCLDNNSPLPDAFKHVGWEGAKYAVAVGSLCALSAS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 LLGSLFPMPRVIYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIE
::::.::::::::::: :::::.:::.:.. :.::..: ..:: .::..:.: .:.::..
CCDS93 LLGSMFPMPRVIYAMAEDGLLFKFLANVNDRTKTPIIATLASGAVAAVMAFLFDLKDLVD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 MMSIGTLLAYTLVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSE
.:::::::::.::..:::.::::::. ..: .. :
CCDS93 LMSIGTLLAYSLVAACVLVLRYQPEQP--NLVYQMA----------------------ST
420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GDEFSGPATNTCGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIY
.::.. :: .. .: : .:... : . :.:
CCDS93 SDELD-PADQN----ELASTNDSQL-----------------GFLP--------EAE---
450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 LIKLKKLIGPHYYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFIIFGSDY
...:: ...: : .:. .: :.: . :. .:.. :: ..: .
CCDS93 MFSLKTILSP-------------KNMEPSKISGLIVNISTSLIAVLIITFCIVTVLGREA
480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 ISEQSWWAILLVVLMVLLISTLVFVILQQPENPKKLPYMAPCLPFVPAFAMLVNIYLMLK
... . ::..:.. .:: .... :: .:::. :: . .: :: .: ....::.:::..
CCDS93 LTKGALWAVFLLAGSALLCAVVTGVIWRQPESKTKLSFKVPFLPVLPILSIFVNVYLMMQ
530 540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 LSTITWIRFAVWCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFS
:. ::.::::: ..:..::::::.:.:
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.... ....:::.: :.:....:. : .:.:.::. : :
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. . ..:: : :. . :: .. :.. : .: .:.. . . .: :
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.. :.. :..:...:. ..:..: .::.: .:. .:.: :::.:::..:::::::..:
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pF1KE1 STITWIRFAVWCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSY
:. ::.::..: .:.::::.::: .: :: :.: ....:
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20 30 40 50 60 70
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140 150 160 170 180 190
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200 210 220 230 240
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250 260 270 280 290
pF1KE1 -----------AEGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAIT
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300 310 320 330 340 350
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.::..:. :: .::. ::::.::: .: .::: : :. ::.::: ::. .:..::
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360 370 380 390 400 410
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420 430 440 450 460 470
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. . ..:: : :. . :: .. :.. : .: .:.. . . .: :
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CCDS55 DHHPRNLSSPFIFHEKTSEF
680 690
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20 30 40 50 60 70
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CCDS60 DVRMIPCRAALTFARCLIRRKIVTLDSLEDTKLCRCLSTMDLIALGVGSTLGAGVYVLAG
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CCDS60 EVAKADSGPSIVVSFLIAALASVMAGLCYAEFGARVPKT-GSAYLYTYVTVGELWAFITG
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 WNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNGLGKGEESYPDLLALLIA
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CCDS60 WNLILSYVIGTSSVARAWSGTFDELLSKQIGQFLR-TYFRMNYTGLAE--YPDFFAVCLI
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CCDS60 LLLAGLLSFGVKESAWVNKVFTAVNILVLLFVMVAGFVKGNVANWKISEEFLKNISASAR
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250 260 270 280 290
pF1KE1 -----------AEGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAIT
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CCDS60 EPPSENGTSIYGAGGFMPYGFTGTLAGAATCFYAFVGFDCIATTGEEVRNPQKAIPIGIV
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300 310 320 330 340 350
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CCDS60 TSLLVCFMAYFGVSAALTLMMPYYLLDEKSPLPVAFEYVGWGPAKYVVAAGSLCALSTSL
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LGSLFPMPRVIYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEM
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420 430 440 450 460 470
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CCDS60 MSIGTLMAYSLVAACVLILRYQP--------------------GLSYDQPK--CSPEKDG
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pF1KE1 IKLKKLIGPHYYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFIIFGSDYI
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CCDS60 QR-------QGFSMRT-LFCPSLL--PTQQSASLVSFLVGFLAFLVLGLSVLTTYGVHAI
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CCDS95 KGVLENAGSVGLALIVWIVTGFITVVGALCYAELGVTIPKS-GGDYSYVKDIFGGLAGFL
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CCDS95 RLWIAVL-VIYPTNQAVIALT-----FSNYVLQPLFPTCFPPESGL--------RLLAAI
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CCDS95 CLLLLTWVNCSSVRWATRVQDIFTAGKLLALALIIIMGIVQICKGEYFWLEPKNAFENFQ
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CCDS95 EPDIGLVALAFLQGSFAYGGWNFLNYVTEELVDPYKNLPRAIFISIPLVTFVYVFANVAY
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CCDS95 VTAMSPQELLASNAVAVTFGEKLLGVMAWIMPISVALSTFGGVN----GSLFTSSRLFFA
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pF1KE1 MAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMMSIGTLLAYTLVS
: .: : :: . ::. : . . ...:: :..: :. ... .. : . .
CCDS95 GAREGHLPSVLAMIHVKRCTPIPALLFT-CISTLLMLVTS--DMYTLINYVGFINYLFYG
350 360 370 380 390 400
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: : ..::.. . :: .:
CCDS95 VTVAGQIVLRWK-KPDIPRPIKINLLFPIIYLLFWAFLLVFSLWSEPVVCGIGLAIMLTG
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771 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 19:29:36 2016 done: Sat Nov 5 19:29:37 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]