Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1063
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1063, 581 aa
1>>>pF1KE1063 581 - 581 aa - 581 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5622+/- 0.002; mu= 14.9092+/- 0.118
mean_var=286.3968+/-54.279, 0's: 0 Z-trim(104.9): 979 B-trim: 38 in 1/49
Lambda= 0.075786
statistics sampled from 7083 (8153) to 7083 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 3.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS48099.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 581) 4104 463.7 2.8e-130
CCDS55406.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 575) 4037 456.4 4.5e-128
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1668 197.4 4.4e-50
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1669 197.7 4.4e-50
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1668 197.4 4.4e-50
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1617 191.8 2.1e-48
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1617 191.9 2.1e-48
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1617 191.9 2.2e-48
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1617 191.9 2.2e-48
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1603 190.3 5.8e-48
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1603 190.3 6.1e-48
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1604 190.6 6.3e-48
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1602 190.4 7.7e-48
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1595 189.5 1.2e-47
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 1588 188.7 1.9e-47
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1582 188.1 3.2e-47
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1561 185.8 1.6e-46
CCDS7194.1 ZNF248 gene_id:57209|Hs108|chr10 ( 579) 1559 185.5 1.6e-46
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1554 185.3 3.2e-46
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1553 185.2 3.3e-46
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1551 184.8 3.4e-46
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 1544 183.9 5.5e-46
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 1544 184.0 5.7e-46
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1541 183.5 6.6e-46
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1541 183.6 6.8e-46
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1541 183.7 7.6e-46
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1541 183.7 7.6e-46
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1532 182.5 1.3e-45
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1532 182.6 1.3e-45
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1533 182.8 1.3e-45
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1532 182.7 1.5e-45
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1526 182.1 2.3e-45
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1525 181.8 2.3e-45
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1523 181.8 3e-45
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1523 181.8 3e-45
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 1522 181.7 3.3e-45
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1505 179.5 9.3e-45
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1505 179.7 1.1e-44
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1501 179.1 1.3e-44
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1502 179.3 1.3e-44
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1501 179.4 1.6e-44
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1499 179.0 1.7e-44
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1497 178.7 1.9e-44
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 1498 179.0 2e-44
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 1498 179.0 2e-44
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1495 178.6 2.3e-44
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1493 178.3 2.6e-44
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1496 179.1 2.7e-44
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1496 179.1 2.8e-44
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1494 178.7 2.9e-44
>>CCDS48099.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX (581 aa)
initn: 4104 init1: 4104 opt: 4104 Z-score: 2452.4 bits: 463.7 E(32554): 2.8e-130
Smith-Waterman score: 4104; 100.0% identity (100.0% similar) in 581 aa overlap (1-581:1-581)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAMSQESLTFKDVFVDFTLEEWQQLDSAQKNLYRDVMLENYSHLVSVGHLVGKPDVIFRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MAMSQESLTFKDVFVDFTLEEWQQLDSAQKNLYRDVMLENYSHLVSVGHLVGKPDVIFRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GPGDESWMADGGTPVRTCAGEDRPEVWEVDEQIDHYKESQDKFLWQAAFIGKETLKDESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GPGDESWMADGGTPVRTCAGEDRPEVWEVDEQIDHYKESQDKFLWQAAFIGKETLKDESG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QECKICRKIIYLNTDFVSVKQRLPKYYSWERCSKHHLNFLGQNRSYVRKKDDGCKAYWKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QECKICRKIIYLNTDFVSVKQRLPKYYSWERCSKHHLNFLGQNRSYVRKKDDGCKAYWKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CLHYNLHKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQTGEKLYKCTECGKVFIQKANLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CLHYNLHKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQTGEKLYKCTECGKVFIQKANLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 THTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAFYKGIKCTTSSLIYQRIHTSEKPQCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 THTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAFYKGIKCTTSSLIYQRIHTSEKPQCS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 EHGKASDEKPSPTKHWRTHTKENIYECSKCGKSFRGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EHGKASDEKPSPTKHWRTHTKENIYECSKCGKSFRGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 KSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KE1 IVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
550 560 570 580
>>CCDS55406.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX (575 aa)
initn: 4134 init1: 3520 opt: 4037 Z-score: 2412.8 bits: 456.4 E(32554): 4.5e-128
Smith-Waterman score: 4037; 99.0% identity (99.0% similar) in 581 aa overlap (1-581:1-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAMSQESLTFKDVFVDFTLEEWQQLDSAQKNLYRDVMLENYSHLVSVGHLVGKPDVIFRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAMSQESLTFKDVFVDFTLEEWQQLDSAQKNLYRDVMLENYSHLVSVGHLVGKPDVIFRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GPGDESWMADGGTPVRTCAGEDRPEVWEVDEQIDHYKESQDKFLWQAAFIGKETLKDESG
::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GPGDESWMADGGTPVRTCA------VWEVDEQIDHYKESQDKFLWQAAFIGKETLKDESG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QECKICRKIIYLNTDFVSVKQRLPKYYSWERCSKHHLNFLGQNRSYVRKKDDGCKAYWKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QECKICRKIIYLNTDFVSVKQRLPKYYSWERCSKHHLNFLGQNRSYVRKKDDGCKAYWKV
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190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CLHYNLHKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQTGEKLYKCTECGKVFIQKANLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CLHYNLHKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQTGEKLYKCTECGKVFIQKANLV
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250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 THTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAFYKGIKCTTSSLIYQRIHTSEKPQCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 THTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAFYKGIKCTTSSLIYQRIHTSEKPQCS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 EHGKASDEKPSPTKHWRTHTKENIYECSKCGKSFRGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EHGKASDEKPSPTKHWRTHTKENIYECSKCGKSFRGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGK
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 KSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580
pF1KE1 IVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
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>>CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX (620 aa)
initn: 8802 init1: 1061 opt: 1668 Z-score: 1012.7 bits: 197.4 E(32554): 4.4e-50
Smith-Waterman score: 2003; 51.1% identity (71.6% similar) in 616 aa overlap (1-579:1-605)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAMSQESLTFKDVFVDFTLEEWQQLDSAQKNLYRDVMLENYSHLVSVGHLVGKPDVIFRL
:: : .::.:: :::: :::: :. :..::::::::.::.:: ::. : ::..:..:
CCDS35 MAKPQGLVTFEDVAVDFTQEEWQYLNPPQRTLYRDVMLETYSNLVFVGQQVTKPNLILKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE1 GPGDESWMADGGTPVRTCAGEDRPEVWEVDEQID-HYKESQDK-FLWQAAFIGKETLKDE
: :.: : . ::: .:::::. .....::: .: :..: :.:. .
CCDS35 EV--EECPAEGKIPFW-----NFPEVCQVDEQIERQHQDDQDKCLLMQVGFSDKKTIITK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SGQECKICRKIIYLNTDFVSVKQRLPKYYSWERCSKHHLNFLGQNRSYVRKKDDGCKAYW
:...:. .:..:.:..:. :: :. :. .:...... : : :.::
CCDS35 SARDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDLFSRS-SAENKYDNGCA---
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KVCLHYNLHKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQTGEKLYKCTECGKVFIQKAN
:. .: . .:..:. . . .. ::.:..:..: :: ..::: ..:: : :.: .:..
CCDS35 KLFFHTEYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFECTACRKTFSKKSH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LVVHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKH
:.:: ::::::::. : ::.::::::: :: : ::::::.:.:: ::::.: .:::.: :
CCDS35 LIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFREKSTVIIH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE1 QRTHTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAFYKGIKC-----------------
::::::::. :..: ::: .. .:: :.::: . :. ::
CCDS35 YRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLDLIIHHSTH
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380
pF1KE1 -----------------TTSSLIYQRIHTSEKP-QCSEHGKASDEKPSPTKHWRTHTKEN
.. .:.:: ::.::: .:.: ::. .:: . : :::: :.
CCDS35 TGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFNEKSTLIVHQRTHTGEK
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 IYECSKCGKSFRGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGKTFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYEC
:::. :::.: ::.:.:::: :.::::.::. : :.:: ::.: .:.: :::::::::
CCDS35 PYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQKSYLMLHQRGHTGEKPYEC
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 RRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSEKSPLIKHQRIHTGERPYECTDCK
.: :::..:: ::.::: :: ::::::::::::: ::: :: ::::::::.:::: :
CCDS35 NECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIHQRIHTGEKPYECPVCW
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 KAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTLIVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFS
::::.:: :: ::: ::::::: :.:::::: :::. ::.:::::::::.: .:::::.
CCDS35 KAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTHTGEKPYKCTECGKAFT
530 540 550 560 570 580
570 580
pF1KE1 GKSTLIKHQRSHTGDKNL
::.:: :::.:.: :
CCDS35 QKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
590 600 610 620
>>CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 (738 aa)
initn: 9172 init1: 1083 opt: 1669 Z-score: 1012.6 bits: 197.7 E(32554): 4.4e-50
Smith-Waterman score: 1716; 50.9% identity (72.4% similar) in 515 aa overlap (81-579:171-681)
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 VGKPDVIFRLGPGDESWMADGGTPVRTCAGEDRPEVWEVDEQIDHYKESQDKFLWQAAFI
:: ..: . :.:::: : : .
CCDS31 LDLLIPKGDYGKAESDDFNVFDNFFLHSKPEDT-DTWLKYYDCDKYKESYKKS--QIIIY
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120 130 140 150 160
pF1KE1 GKETLKDESGQECKICRKIIYLNTDFVSVKQRLPKYYSWE--RCSK---HHLNFLGQNRS
.. : :. ::. ::: . . .... ..: . .. :.: .. .:. ..:.
CCDS31 HRNRL-GEKLYECSECRKRFSKKPSLIKHQSRHIRDIAFGCGNCGKTFPQKSQFITHHRT
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 YVRKKDDGC----KAYWKVCLHYNLHKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQTGE
.. .: .: ::. . . .... .:. .. .. :::. .:. : . :..:::
CCDS31 HTGEKPYNCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHTGEKPYECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGE
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 KLYKCTECGKVFIQKANLVVHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKPYE
: : :.:::..: .:.::. ::: ::::::.:: ::.::::.:: :..:.::::: ::.
CCDS31 KPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFG
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 CSECGKTFIQKSTLIKHQRTHTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAFYKGIKC
::.: :.:..:: ::.:: ::::::. :..: :::. :: :..:: . . :.:
CCDS31 CSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQC
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390
pF1KE1 -----TTSSLI-YQRIHTSEKP-QCSEHGKASDEKPSPTKHWRTHTKENIYECSKCGKSF
: :: .: ::.::: ::. ::: ..: . ..: :::: :. ::::.:::.:
CCDS31 GKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAF
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 RGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGKTFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKS
: :. ::::::::::: :: :::.: :::: :.::::::::::: .:::::::::
CCDS31 SEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKS
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460 470 480 490 500 510
pF1KE1 TLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSEKSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIK
.: .::: :::::::.: .: ::::.:: : ::::::::.::::. :.::: .:: ::.
CCDS31 SLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIR
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pF1KE1 HQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTLIVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRS
: : :::::::.:.:: ::: ::.:: :.: ::::::.:: .:::::: :: :: :::.
CCDS31 HLRTHTGEKPYECNECRKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQRT
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580
pF1KE1 HTGDKNL
:::.:
CCDS31 HTGEKPYGCSECRKAFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYRCIECGKAFSQKSQLINHQRTHTVK
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10 20 30 40
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: .::.:: :::: :::: :. :..::::::::.:
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CCDS35 SNLVFVGQQVTKPNLILKLEV--EECPAEGKIPFW-----NFPEVCQVDEQIERQHQDDQ
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pF1KE1 DK-FLWQAAFIGKETLKDESGQECKICRKIIYLNTDFVSVKQRLPKYYSWERCSKHHLNF
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CCDS35 DKCLLMQVGFSDKKTIITKSARDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDL
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160 170 180 190 200 210
pF1KE1 LGQNRSYVRKKDDGCKAYWKVCLHYNLHKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQT
.... : : :.:: :. .: . .:..:. . . .. ::.:..:..: :: ..
CCDS35 FSRS-SAENKYDNGCA---KLFFHTEYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKN
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pF1KE1 GEKLYKCTECGKVFIQKANLVVHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKP
::: ..:: : :.: .:..:.:: ::::::::. : ::.::::::: :: : ::::::.:
CCDS35 GEKPFECTACRKTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERP
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pF1KE1 YECSECGKTFIQKSTLIKHQRTHTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAFYKGI
.:: ::::.: .:::.: : ::::::::. :..: ::: .. .:: :.::: . :.
CCDS35 FECPECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECT
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pF1KE1 KC----------------------------------TTSSLIYQRIHTSEKP-QCSEHGK
:: .. .:.:: ::.::: .:.: ::
CCDS35 KCGESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGK
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370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ASDEKPSPTKHWRTHTKENIYECSKCGKSFRGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGKTFSG
. .:: . : :::: :. :::. :::.: ::.:.:::: :.::::.::. : :.::
CCDS35 SFNEKSTLIVHQRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQ
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pF1KE1 KSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSEKSPL
::.: .:.: ::::::::: .: :::..:: ::.::: :: ::::::::::::: ::: :
CCDS35 KSYLMLHQRGHTGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKL
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pF1KE1 IKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTLIVHH
: ::::::::.:::: : ::::.:: :: ::: ::::::: :.:::::: :::. ::.
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550 560 570 580
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CCDS35 RTHTGEKPYKCTECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
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... :..: :. :. : . :... .:: .. .. :......::
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: :: .:::: ::::.::..: : : :. ::::::::::::: ::.:.:: .:.. :.
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. :. .: . :: .:: ::.::: .:.: ::: ... :.: : :: :.
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CCDS74 YGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECN
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pF1KE1 RCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSEKSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKK
:::::...:.: :::.:::::::.::.::.:::. .:::.::::::::.::::..: .
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.. : .:.: :::.:
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: . : ::.: ..:.:.. ..:::.. . . .: :. :
CCDS74 PQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRG--EDTEGHWEWSC
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pF1KE1 RKIIYLNTD--FVSVK-------QR------------LPKY-YSWERCSKHHLNFLGQ--
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CCDS74 ESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKRE
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pF1KE1 -------NRSYVRKKDDGCKAYWKVCLHYNL----HKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQAL
... :..: :. :. : . :... .:: .. .. :......::
CCDS74 KPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSAL
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pF1KE1 RKSQRSQTGEKLYKCTECGKVFIQKANLVVHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQ
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CCDS74 TKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHE
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CCDS74 RTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHT
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pF1KE1 RQAFYKGIKC-----TTSSLI-YQRIHTSEKP-QCSEHGKASDEKPSPTKHWRTHTKENI
. :. .: . :: .:: ::.::: .:.: ::: ... :.: : :: :.
CCDS74 GEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKP
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pF1KE1 YECSKCGKSFRGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGKTFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECR
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CCDS74 YGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECN
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pF1KE1 RCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSEKSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKK
:::::...:.: :::.:::::::.::.::.:::. .:::.::::::::.::::..: .
CCDS74 DCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGR
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pF1KE1 AFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTLIVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSG
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CCDS74 AFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQ
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570 580
pF1KE1 KSTLIKHQRSHTGDKNL
.. : .:.: :::.:
CCDS74 STHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KE1 DVMLENYSHLVSVGHLVGKPDVIFRLGPGDESWMADGGTPVRTCAGEDRPEVWEVDEQID
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CCDS12 LSDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDG---LWYCRGEDTEGHWEWS----
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pF1KE1 HYKESQDKFLWQAAFIGKETLKDESGQECKICRKIIYLNTDF----VSVKQRLPKYYSWE
:: ... .:: .: :. :. . ..: :: :. .. ... : ..:
CCDS12 --CESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENI-SLNPDLPHQPMTPERQSP--HTWG
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pF1KE1 RCSKHH---LNFLGQNRSYVRKKDDGCKAYWKVCLHYNL----HKAQPAERFFDPNQRGK
.:.. :: : ... :..: :. :. : . :... .:: .. .. :
CCDS12 TRGKREKPDLNVL--QKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLK
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pF1KE1 ALHQKQALRKSQRSQTGEKLYKCTECGKVFIQKANLVVHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQ
......:: : :: .:::: ::::.::..: : : :. ::::::::::::: ::.:.::
CCDS12 GFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSF
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 KSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQRTHTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHL
.:.. :.::::::::::::::::.: :. : .: : ::::::. : .: :::. : :
CCDS12 RSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSL
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pF1KE1 IRHEKTHIRQAFYKGIKC-----TTSSLI-YQRIHTSEKP-QCSEHGKASDEKPSPTKHW
.:.. : . :. .: . :: .:: ::.::: .:.: ::: ... :.:
CCDS12 TKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHR
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pF1KE1 RTHTKENIYECSKCGKSFRGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGKTFSGKSHLSVHHRTHT
: :: :. : :..:::.: .: :: :.: :::::::::: :::.: ..::. :.: ::
CCDS12 RIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHT
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pF1KE1 GEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSEKSPLIKHQRIHTGERP
::::::: :::::...:.: :::.:::::::.::.::.:::. .:::.::::::::.:
CCDS12 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
510 520 530 540 550 560
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pF1KE1 YECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTLIVHHRTHTGEKPYECR
:::..: .:::..: ::.:::::: :::: :.::::.:: .:.: :.:::::::::::.
CCDS12 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
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pF1KE1 DCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
::::.: .. : .:.: :::.:
CCDS12 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
630 640 650 660 670
>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (682 aa)
initn: 7901 init1: 1036 opt: 1617 Z-score: 982.2 bits: 191.9 E(32554): 2.2e-48
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40 50 60 70 80 90
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]