FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0893, 347 aa
1>>>pF1KE0893 347 - 347 aa - 347 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6010+/-0.00116; mu= 14.4075+/- 0.069
mean_var=128.0301+/-41.513, 0's: 0 Z-trim(102.1): 387 B-trim: 816 in 2/45
Lambda= 0.113349
statistics sampled from 6287 (6789) to 6287 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1387 239.0 3.9e-63
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 1324 228.7 5.1e-60
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1227 212.8 2.9e-55
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1147 199.8 2.6e-51
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1093 190.9 1.2e-48
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CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 1087 190.0 2.3e-48
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1077 188.4 7.4e-48
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CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1059 185.4 5.5e-47
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1055 184.7 8.7e-47
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1046 183.2 2.4e-46
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1045 183.1 2.7e-46
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1042 182.6 3.8e-46
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1042 182.6 3.9e-46
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1029 180.5 1.7e-45
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CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1013 177.9 1e-44
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1006 176.7 2.3e-44
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1002 176.1 3.5e-44
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CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1000 175.7 4.4e-44
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CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 984 173.1 2.7e-43
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 980 172.5 4.5e-43
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CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 973 171.3 9.5e-43
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CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 963 169.7 2.9e-42
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 961 169.3 3.7e-42
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CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 960 169.2 4.2e-42
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 959 169.0 4.6e-42
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 959 169.0 4.8e-42
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 956 168.6 6.9e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 952 167.9 1e-41
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 950 167.6 1.3e-41
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 948 167.2 1.6e-41
>>CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1987 init1: 1987 opt: 1987 Z-score: 1777.1 bits: 337.1 E(32554): 1.1e-92
Smith-Waterman score: 1987; 98.1% identity (99.0% similar) in 311 aa overlap (37-347:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LKLMKEAVLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFA
::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS35 MEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPQLQKPLFA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSET
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130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSC
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVV
:::: :::::.:.:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PFLCIIFSYLRIMVTVLRIPSAAGKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE0 RDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR
280 290 300 310
>>CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1914 init1: 1914 opt: 1914 Z-score: 1712.6 bits: 325.2 E(32554): 4.5e-89
Smith-Waterman score: 1914; 94.8% identity (97.4% similar) in 310 aa overlap (37-346:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LKLMKEAVLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFA
:: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 METKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSET
::::::::.:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IFLIMYLLTAVGNVLIILAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSET
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSY
:.::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS35 KIISYVGCLIQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPWHCLLMLLGSC
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVV
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::.:.:::::.:::::::::::::.
CCDS35 PFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAAGKWKAFSTCGSHLTVVVLFYGSVIYVYFRPLSMYSVM
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE0 RDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR
. :::::::::::::::::::::::::::::::::. :::
CCDS35 KGRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLRHRIYS
280 290 300 310
>>CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 (310 aa)
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Smith-Waterman score: 1387; 68.0% identity (87.9% similar) in 306 aa overlap (40-345:3-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKEAVLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFL
.: . : :::::::: :. ::::::.::
CCDS35 MGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAVFL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVI
.::....::.::: :: :: ::.:::::::: :::.:::..:::.::::::::::::.:
CCDS35 PIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMYFFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETKTI
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pF1KE0 SYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSYSIS
:: ::.:::::.:::::::::::.::::: ::::::.:: ..:. : :.:.:. :. :
CCDS35 SYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFL
:.:::...:: ..: ::::..:.::::: :::::::::. ....:::: ::::.:::
CCDS35 HFHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCDDQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTPFS
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pF1KE0 CTIFSYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDR
: :.:::.:..:::.::::: : :::::::::::.:.:::::: :.::.::: :.: .:.
CCDS35 CIIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFSTCGSHLTVVTLFYGSISYLYFQPLSNYTV-KDQ
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 VATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR
.::..:::.:::::::::::::::::.:: ::. :.
CCDS35 IATIIYTVLTPMLNPFIYSLRNKDMKQGLAKLMHRMKCQ
280 290 300 310
>>CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 (324 aa)
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Smith-Waterman score: 1324; 66.9% identity (89.0% similar) in 299 aa overlap (47-345:10-307)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 KLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYLLAA
: :::::::: . :.::::.:::.::..
CCDS35 MGMSNLTRLSEFILLGLSSRSEDQRPLFALFLIIYLVTL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 VGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVGCLA
.::.::: ::.:::::..::::::: ::: :::.::::::::::::::: :.:::. :::
CCDS35 MGNLLIILAIHSDPRLQNPMYFFLSILSFADICYTTVIVPKMLVNFLSEKKTISYAECLA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 QMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSYSISHLHSLFR
:::::..::: ::::::.:::.: ::::::.:: .::. : :.:.: ..:..:::..
CCDS35 QMYFFLVFGNIDSYLLAAMAINRCVAICNPFHYVTVMNRRCCVLLLAFPITFSYFHSLLH
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 VLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCTIFSYL
:::..::.::.:..:.:::::..::::::::.: ...:.::: :: ...::.: :.:::
CCDS35 VLLVNRLTFCTSNVIHHFFCDVNPVLKLSCSSTFVNEIVAMTEGLASVMAPFVCIIISYL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 QIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATVMYT
.:...::.::::: : ::::::.::::.: :::::: :::..::: :.: .::.::. ::
CCDS35 RILIAVLKIPSAAGKHKAFSTCSSHLTVVILFYGSISYVYLQPLSSYTV-KDRIATINYT
220 230 240 250 260 270
320 330 340
pF1KE0 VVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR
:.: .:::::::::::::::::.:: ..:
CCDS35 VLTSVLNPFIYSLRNKDMKRGLQKLINKIKSQMSRFSTKTNKICGP
280 290 300 310 320
>>CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 (309 aa)
initn: 1300 init1: 1060 opt: 1227 Z-score: 1105.5 bits: 212.8 E(32554): 2.9e-55
Smith-Waterman score: 1227; 60.7% identity (86.4% similar) in 308 aa overlap (37-344:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LKLMKEAVLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFA
:: :..::.: :::::::: :. :: ::.
CCDS35 MERINHTSSVSEFILLGLSSRPEDQKTLFV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSET
.:::.::.. .::.::: :: .:.:.:::::::: ::. :::::: .:::::.:::::
CCDS35 LFLIVYLVTITGNLLIILAIRFNPHLQTPMYFFLSFLSLTDICFTTSVVPKMLMNFLSEK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSY
:.:::.:::.::::..:.::.:: ::: ::.:: ::.:.:.:: ..:. .::.:.. :
CCDS35 KTISYAGCLTQMYFLYALGNSDSCLLAVMAFDRYVAVCDPFHYVTTMSHHHCVLLVAFSC
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVT
:. :::::...::..::.:: :..:.::.:: .::::::::. ...: :::. :.::
CCDS35 SFPHLHSLLHTLLLNRLTFCDSNVIHHFLCDLSPVLKLSCSSIFVNEIVQMTEAPIVLVT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVV
::: :::..:..:::.:::.. : ::::::: .::.:.::::::. ::..: : :.:
CCDS35 RFLCIAFSYIRILTTVLKIPSTSGKRKAFSTCGFYLTVVTLFYGSIFCVYLQPPSTYAV-
220 230 240 250 260
310 320 330 340
pF1KE0 RDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR
.:.:::..:::.. :::::::::::::.:.::.::...
CCDS35 KDHVATIVYTVLSSMLNPFIYSLRNKDLKQGLRKLMSKRS
270 280 290 300
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1168 init1: 1147 opt: 1147 Z-score: 1034.8 bits: 199.8 E(32554): 2.6e-51
Smith-Waterman score: 1147; 55.6% identity (81.1% similar) in 302 aa overlap (44-345:7-308)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 VLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYL
::.: :.::::: .:. :. ::..:: :::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYL
10 20 30
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CCDS10 ATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCG
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CCDS10 CLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV
100 110 120 130 140 150
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CCDS10 LLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA
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pF1KE0 SYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATV
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CCDS10 SYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATV
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320 330 340
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CCDS10 LYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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.:. :::. .:::.::: :: : .:::::::::.:::..:.:..: .:::::.. . .
CCDS32 LFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMYFFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGS
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CCDS32 KAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAYDRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALW
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CCDS32 AFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCDLTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIAT
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CCDS32 PFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFSTCSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTV
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CCDS32 KEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGALRKLVNRKITSSS
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CCDS35 MEAANESSEGISFVLLGLTTSPGQQRPLFV
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CCDS35 LFLLLYVASLLGNGLIVAAIQASPALHAPMYFLLAHLSFADLCFASVTVPKMLANLLAHD
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CCDS35 HSISLAGCLTQMYFFFALGVTDSCLLAAMAYDCYVAIRHPLPYATRMSRAMCAALVGMAW
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CCDS35 LVSHVHSLLYILLMARLSFCASHQVPHFFCDHQPLLRLSCSDTHHIQLLIFTEGAAVVVT
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CCDS35 PFLLILASYGAIAAAVLQLPSASGRLRAVSTCGSHLAVVSLFYGTVIAVYFQATSRREAE
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CCDS35 WGRVATVMYTVVTPMLNPIIYSLWNRDVQGALRALLIGRRISASDS
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CCDS35 MDNSNWTS-VSHFVLLGISTHPEEQIPLFL
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CCDS35 VFSLMYAINISGNLAIITLILSAPRLHIPMYIFLSNLALTDICFTSTTVPKMLQIIFSPT
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CCDS35 KVISYTGCLAQTYFFICFAVMENFILAVMAYDRYIAICHPFHYTMILTRMLCVKMVVMCH
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CCDS35 ALSHLHAMLHTFLIGQLIFCADNRIPHFFCDLYALMKISCTSTYLNTLMIHTEG-AVVIS
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CCDS35 GALAFITASYACIILVVLRIPSAKGRWKTFSTCGSHLTVVAIFYGTLSWVYFRPLSSYSV
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CCDS35 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYL
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CCDS35 VTMVGNLLIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSG
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CCDS35 CLAQLYFLLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPA
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