FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0887, 351 aa
1>>>pF1KE0887 351 - 351 aa - 351 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6674+/-0.00125; mu= 14.6867+/- 0.073
mean_var=196.0260+/-66.229, 0's: 0 Z-trim(102.3): 411 B-trim: 406 in 1/49
Lambda= 0.091605
statistics sampled from 6368 (6873) to 6368 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 2058 285.6 3.9e-77
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CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1174 168.7 5.8e-42
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1163 167.3 1.6e-41
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CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1119 161.5 9e-40
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1110 160.3 2e-39
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1110 160.3 2e-39
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1102 159.3 4.3e-39
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1098 158.7 6.1e-39
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1098 158.7 6.2e-39
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1095 158.4 8.5e-39
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CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1072 155.3 6.6e-38
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CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1063 154.1 1.5e-37
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1054 152.9 3.4e-37
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CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1020 148.4 7.7e-36
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 1009 146.9 2.1e-35
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 1004 146.3 3.4e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 998 145.5 5.9e-35
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 974 142.3 5.3e-34
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 969 141.6 8.2e-34
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 962 140.7 1.6e-33
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 950 139.2 5.1e-33
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CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 938 137.5 1.4e-32
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 933 136.9 2.2e-32
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 924 135.7 5.1e-32
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CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 916 134.6 1.1e-31
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CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 912 134.1 1.5e-31
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 909 133.7 2e-31
>>CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 (313 aa)
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Smith-Waterman score: 2058; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (39-351:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 STLEYCIIFRVHNPGLTNVTQLTQLSSYRQMEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMYFFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMYFFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQ
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130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAYDCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWI
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCDINPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTGLIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCDINPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTGLIC
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFSTCSSHLSVVSLFFGTSFCVDFSSPSTHSAQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFSTCSSHLSVVSLFFGTSFCVDFSSPSTHSAQK
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE0 DTVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNQEIKSSLRKLIWVRKIHSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DTVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNQEIKSSLRKLIWVRKIHSP
280 290 300 310
>>CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 (319 aa)
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Smith-Waterman score: 1184; 59.3% identity (83.1% similar) in 307 aa overlap (39-344:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 STLEYCIIFRVHNPGLTNVTQLTQLSSYRQMEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGS
:: : :.::: .:::::.. : :::
CCDS12 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMYFFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQ
:: :::::: :::::::. :.:..:::::::::.:::.:: : .:::.:::: ::: :..
CCDS12 FLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMYFFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNK
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pF1KE0 AISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAYDCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWI
.:.: .::.:.:::.::. .: :::.::::: .:::::::::..::.: :: .:: :::
CCDS12 VITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAYDRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWT
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCDINPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTGLIC
:.::.:::. :.. ::::. :::::::..: ...:.:.: : :..::..: .: :
CCDS12 MSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCELNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGP
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFSTCSSHLSVVSLFFGTSFCVDFSSPSTHSAQK
. .. ::....:.: : ::::: ::::::.:::::::::.:. . : .:: .:.....
CCDS12 LTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFSTCASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHS
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310 320 330 340 350
pF1KE0 DTVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNQEIKSSLR-KLIWVRKIHSP
...:::::::::::::::::::::..:: .: .:.:
CCDS12 SATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRALGIHLLWGTMKGQFFKKCP
280 290 300 310
>>CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 1177; 58.9% identity (83.4% similar) in 302 aa overlap (39-340:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 STLEYCIIFRVHNPGLTNVTQLTQLSSYRQMEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGS
:.. : : : : .:::.::. : : :::
CCDS32 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGL
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pF1KE0 FLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMYFFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQ
:: :::::: :::::::. :.:..:::::::::.:::..: :::::::::::.::: ...
CCDS32 FLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNK
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pF1KE0 AISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAYDCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWI
.:.:.::. :. ::.::: :. :::.::::: .:::::::::..::.: :: .:: ::::
CCDS32 VITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAYDRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWI
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pF1KE0 MNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCDINPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTGLIC
:..:.:.:..:.. : ::.. :::::::.:: .. :.:.: : :..:.... .: :
CCDS32 MSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCEINQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGP
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pF1KE0 VLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFSTCSSHLSVVSLFFGTSFCVDFSSPSTHSAQK
. .. ::... :.: : ::::: ::::::.:::::::::.:: . : .:: .::...
CCDS32 LTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFSTCASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHT
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pF1KE0 DTVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNQEIKSSLRKLIWVRKIHSP
..:::::::::::::::::::::..::....
CCDS32 GAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGAMKTFFRGKQ
280 290 300
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1174; 56.7% identity (80.3% similar) in 305 aa overlap (39-343:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 STLEYCIIFRVHNPGLTNVTQLTQLSSYRQMEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGS
: : : .:.:: .:::.:.: ..:. ::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVF
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pF1KE0 FLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMYFFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQ
:: :::.:: ::::::: . :. :::::::::.:::..: :: ::::::::: ...:
CCDS10 FLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQ
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pF1KE0 AISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAYDCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWI
.::. ::: :.:: ..:: .. ::::::::: .::.:::::: :. :: .::.. :.
CCDS10 TISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWV
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pF1KE0 MNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCDINPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTGLIC
. :. ::::::: :::::.. : :::::..:::.:::.: ::..:. :.:. .
CCDS10 VANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITP
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pF1KE0 VLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFSTCSSHLSVVSLFFGTSFCVDFSSPSTHSAQK
::.. :: .. :.::.::..:. ::::::.:::.:: ::..: . : :. :.:::.:
CCDS10 FLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEK
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 DTVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNQEIKSSLRKLIWVRKIHSP
::.:.:.:::::::::::::::::. .:..:.:..
CCDS10 DTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
280 290 300 310
>>CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1184 init1: 1156 opt: 1163 Z-score: 859.1 bits: 167.3 E(32554): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 1163; 58.7% identity (82.3% similar) in 305 aa overlap (39-340:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 STLEYCIIFRVHNPGLTNVTQLTQLSSYRQMEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGS
:: .: :.::: :::.::. : : :::
CCDS12 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGL
10 20 30
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pF1KE0 FLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMYFFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQ
:: :::::: :::::::. :.:..:::::::::.:::.:: ::.:::.:::: ::: ::.
CCDS12 FLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMYFFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSR
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pF1KE0 AISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAYDCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWI
.:.:.::. :. ::.:: :...:::::::: .::::::::: .::.: :: .:: :::.
CCDS12 VITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWM
100 110 120 130 140 150
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pF1KE0 MNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCDINPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTG---
. ::.:: ..:.. ::::.. :::::::..: .. :.:.: : :.. .....:: .
CCDS12 IAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCELNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGP
160 170 180 190 200 210
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pF1KE0 LICVLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFSTCSSHLSVVSLFFGTSFCVDFSSPSTHS
:. .:: ::... :.: : ::::: ::::::.::::::::: :.. : ..: .::.
CCDS12 LVGILC---SYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFSTCASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHN
220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE0 AQKDTVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNQEIKSSLRKLIWVRKIHSP
.. ...:::::::.:::::::::::::..:: .:.
CCDS12 SHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRALKMSFRGKQ
270 280 290 300
>>CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1148; 55.4% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (39-343:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 STLEYCIIFRVHNPGLTNVTQLTQLSSYRQMEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGS
::..::: .:. .:::.:.. : : :::
CCDS32 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGL
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CCDS32 FLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 AISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAYDCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWI
::: ::: :.::.:.:. ...::::::::: .::::::::: .::.: :: .:: :::.
CCDS32 DISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWF
100 110 120 130 140 150
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CCDS32 IIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFP
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: ...::... :... . :..:: ::::::.::: :::::.::.. : .:: :::.:.
CCDS32 VAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQS
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310 320 330 340 350
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...:::::..::::::::::::::...:..:..:.
CCDS32 SSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP
280 290 300 310
>>CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1147; 56.7% identity (81.6% similar) in 305 aa overlap (39-343:1-305)
10 20 30 40 50 60
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CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGL
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CCDS32 FLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMYFFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENK
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:::: :: :.:: :.: .:...::.::::: .::.::::::..::.: :: .:: ..:.
CCDS32 AISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAYDRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWL
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.... :::: :: : :: . :::::::... .:.:.:.: : : .:.. :. :..
CCDS32 IGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCELTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFP
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CCDS32 LLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALSTCGSHLSVVSLFYGTGIGVHFTSAVTHSSQK
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CCDS32 ISVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDVKGALGSLLSRAASCL
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Smith-Waterman score: 1140; 56.3% identity (80.3% similar) in 309 aa overlap (39-347:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 STLEYCIIFRVHNPGLTNVTQLTQLSSYRQMEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGS
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CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYAL
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CCDS11 FLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMYLFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDP
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CCDS11 SIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAYDRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWV
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CCDS11 LTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCDMSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIP
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CCDS11 FLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLK
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CCDS11 DTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGALSRVIHQKKTFFSL
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>>CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 (313 aa)
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CCDS32 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSL
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CCDS32 FFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMYFFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSK
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CCDS32 AISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAYDRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWA
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CCDS32 FSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCDLTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATP
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CCDS32 FVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFSTCSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVK
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CCDS32 EKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGALRKLV-NRKITSSS
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CCDS41 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVL
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CCDS41 FLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMYFFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTK
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CCDS41 TISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAYDRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWL
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CCDS41 VTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCDLNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTP
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CCDS41 LVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVSTCSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPES
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]