Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0885
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0885, 330 aa
1>>>pF1KE0885 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4011+/-0.00112; mu= 15.4419+/- 0.066
mean_var=131.3432+/-41.777, 0's: 0 Z-trim(103.9): 427 B-trim: 850 in 2/47
Lambda= 0.111910
statistics sampled from 7094 (7653) to 7094 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 2069 346.1 2.2e-95
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1719 289.6 2.2e-78
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1114 192.0 5.8e-49
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1066 184.2 1.2e-46
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1063 183.7 1.7e-46
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1059 183.1 2.6e-46
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1049 181.4 8.1e-46
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1045 180.8 1.3e-45
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1045 180.8 1.3e-45
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1041 180.1 2e-45
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1032 178.7 5.4e-45
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1029 178.2 7.7e-45
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1028 178.0 8.4e-45
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1028 178.0 8.5e-45
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1025 177.6 1.2e-44
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1022 177.1 1.8e-44
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1006 174.5 9.9e-44
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 996 172.9 3e-43
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 996 173.0 3.3e-43
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 995 172.7 3.4e-43
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 993 172.4 4.2e-43
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 990 171.9 5.9e-43
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 986 171.3 9.3e-43
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 979 170.1 2e-42
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 974 169.3 3.7e-42
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 972 169.0 4.5e-42
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 966 168.0 8.8e-42
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 964 167.8 1.1e-41
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 959 166.9 2e-41
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 956 166.4 2.7e-41
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 955 166.3 3e-41
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 952 165.8 4.3e-41
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 941 164.0 1.5e-40
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 924 161.3 9.6e-40
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 912 159.3 3.7e-39
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 907 158.5 6.5e-39
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 883 154.6 9.5e-38
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 866 151.9 6.4e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 865 151.7 7e-37
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 854 150.0 2.4e-36
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 853 149.9 2.9e-36
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 852 149.6 3.1e-36
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 851 149.5 3.5e-36
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 850 149.3 3.8e-36
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 850 149.3 3.8e-36
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 846 148.7 5.9e-36
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 845 148.5 6.7e-36
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 842 148.0 9.3e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 841 147.9 1e-35
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 840 147.7 1.2e-35
>>CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 (312 aa)
initn: 2069 init1: 2069 opt: 2069 Z-score: 1826.1 bits: 346.1 E(32554): 2.2e-95
Smith-Waterman score: 2069; 99.4% identity (99.7% similar) in 312 aa overlap (19-330:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRALNKHLLVLMLQKVGGMDGDNQSENSQFLLLGISESPEQQQILFWMFLSMYLVTVLGN
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS58 MDGDNQSENSQFLLLGISESPEQQRILFWMFLSMYLVTVLGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VLIILAISSDSHLHTPMYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNFQSQNKAISYAGCLTQLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLIILAISSDSHLHTPMYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNFQSQNKAISYAGCLTQLY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLVSLVTLDNLILAVMAYDRYVATCCPLHYVTAMSPGLCVLLLSLCWGLSVLYGLLLTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FLVSLVTLDNLILAVMAYDRYVATCCPLHYVTAMSPGLCVLLLSLCWGLSVLYGLLLTFL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTRVTFCGPREIHYLFCDMYILLWLACSNTHIIHTALIATGCFIFLTPLGFMTTSYVRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LTRVTFCGPREIHYLFCDMYILLWLACSNTHIIHTALIATGCFIFLTPLGFMTTSYVRIV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RTILQMPSASKKYKTFSTCASHLGVVSLFYGTLAMVYLQPLHTYSMKDSVATVMYAVLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RTILQMPSASKKYKTFSTCASHLGVVSLFYGTLAMVYLQPLHTYSMKDSVATVMYAVLTP
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 MMNPFIYSLRNKDMHGAPGRVLWRPFQRPK
::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS58 MMNPFIYRLRNKDMHGAPGRVLWRPFQRPK
290 300 310
>>CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 (312 aa)
initn: 1732 init1: 1706 opt: 1719 Z-score: 1520.7 bits: 289.6 E(32554): 2.2e-78
Smith-Waterman score: 1719; 82.6% identity (94.5% similar) in 310 aa overlap (19-328:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRALNKHLLVLMLQKVGGMDGDNQSENSQFLLLGISESPEQQQILFWMFLSMYLVTVLGN
::: ::::.:.:::::.:::::::.::::::::::::::.::
CCDS11 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VLIILAISSDSHLHTPMYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNFQSQNKAISYAGCLTQLY
:::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::
CCDS11 VLIILAISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLVSLVTLDNLILAVMAYDRYVATCCPLHYVTAMSPGLCVLLLSLCWGLSVLYGLLLTFL
::::::.:::::::::::::::: ::::::.::::: ::.::::::: :::::::. :.:
CCDS11 FLVSLVALDNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTRVTFCGPREIHYLFCDMYILLWLACSNTHIIHTALIATGCFIFLTPLGFMTTSYVRIV
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CCDS11 MTRVTFCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLII
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RTILQMPSASKKYKTFSTCASHLGVVSLFYGTLAMVYLQPLHTYSMKDSVATVMYAVLTP
:.::..::.:::::.:::::::::.:::::::: ::::.::::::.:::::::::::.::
CCDS11 RAILRIPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDSVATVMYAVVTP
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 MMNPFIYSLRNKDMHGAPGRVLWRPFQRPK
::::::::::::::::: ::.: . :.:
CCDS11 MMNPFIYSLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
290 300 310
>>CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 (330 aa)
initn: 1068 init1: 991 opt: 1114 Z-score: 992.5 bits: 192.0 E(32554): 5.8e-49
Smith-Waterman score: 1114; 55.3% identity (79.1% similar) in 311 aa overlap (13-322:12-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRALNKHLLVLMLQKVGGMDGDNQSENSQFLLLGISESPEQQQILFWMFLSMYLVTVLGN
:: .: ::. :.:::::.:: ::.: .:: .::.:::::..::
CCDS35 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VLIILAISSDSHLHTPMYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNFQSQNKAISYAGCLTQLY
.::::::::: ::::::::::::::.:: :.. .:::::.:...:.. :::.:::.:::
CCDS35 LLIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLVSLVTLDNLILAVMAYDRYVATCCPLHYVTAMSPGLCVLLLSLCWGLSVLYGLLLTFL
::. . ::: .::::::::::: : :::: :.::: ::.:.:..:: :. .:. :.:
CCDS35 FLLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTRVTFCGPREIHYLFCDMYILLWLACSNTHIIHTALIATGCFIFLTPLGFMTTSYVRIV
::::.::. . : ...:: :: ::::.::. . .:. : ... .:: ... :::::
CCDS35 LTRVAFCAQKAIPHFYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE0 RTILQMPSASKKYKTFSTCASHLGVVSLFYGTLAMVYLQPLHTYSM-KDSVATVMYAVLT
... . : . ..:.::::.::: :: ::::.: ::: : ::: ..: :.:.: :.
CCDS35 WAVFVISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVII
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE0 PMMNPFIYSLRNKDMHGAPGRVLWRPFQRPK
: .:::::::::.::. : :...
CCDS35 PTLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
300 310 320 330
>>CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 (320 aa)
initn: 1043 init1: 900 opt: 1066 Z-score: 950.8 bits: 184.2 E(32554): 1.2e-46
Smith-Waterman score: 1066; 55.5% identity (79.9% similar) in 308 aa overlap (19-324:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRALNKHLLVLMLQKVGGMDGDNQSENSQFLLLGISESPEQQQILFWMFLSMYLVTVLGN
:. ::.. ..:::::.: . : : ::: .:::::::: ::
CCDS12 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VLIILAISSDSHLHTPMYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNFQSQNKAISYAGCLTQLY
.:::::: :::::::::::::.::::.:: :...:.::::.:. .::: :.:::::.:..
CCDS12 LLIILAICSDSHLHTPMYFFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLVSLVTLDNLILAVMAYDRYVATCCPLHYVTAMSPGLCVLLLSLCWGLSVLYGLLLTFL
:..:. ::::.:.::::::.::.: ::::.. :.: :: ::. : .::. .:: :.
CCDS12 FFTSFGCLDNLLLTVMAYDRFVAVCHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE0 LTRVTFCGPREIHYLFCDMYILLWLACSNTHIIHTAL-IATGCFIFLTPLGFMTTSYVRI
. :..:: :: ..:::. .: ::::.: : .... .::: . .. :.. :: .:
CCDS12 VLRLSFCTEMEIPHFFCDLLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFF-SYYKI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VRTILQMPSASKKYKTFSTCASHLGVVSLFYGTLAMVYLQPLHTYSMKDS-VATVMYAVL
: .::.. ::..:.:.::::.:::.::.::::: :::. : : . : ::.:::...
CCDS12 VFSILRISSAGRKHKAFSTCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE0 TPMMNPFIYSLRNKDMHGAPGRVLWRPFQRPK
:::.::::::::: ::. : ::.: :
CCDS12 TPMLNPFIYSLRNTDMKRALGRLLSRATFFNGDITAGLS
290 300 310 320
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1110 init1: 903 opt: 1063 Z-score: 948.3 bits: 183.7 E(32554): 1.7e-46
Smith-Waterman score: 1063; 51.5% identity (82.4% similar) in 307 aa overlap (19-324:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRALNKHLLVLMLQKVGGMDGDNQSENSQFLLLGISESPEQQQILFWMFLSMYLVTVLGN
:.: ::: :.:::::.:..:.::..:: .::::::.:::::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VLIILAISSDSHLHTPMYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNFQSQNKAISYAGCLTQLY
.::::..: :: :::::::::.::::.:. : .:.::::.: ....::. :::::.:
CCDS10 LLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLVSLVTLDNLILAVMAYDRYVATCCPLHYVTAMSPGLCVLLLSLCWGLSVLYGLLLTFL
:. .: .::..:::::::..::.: ::::.. :. ::.::.. : .. : :: :.:
CCDS10 FVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTRVTFCGPREIHYLFCDMYILLWLACSNTHIIHTALIATGCFIFLTPLGFMTTSYVRIV
.. ..::. : ..:::. :: :.::.::. .. ... : ....::. . .::..:.
CCDS10 MAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHIT
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE0 RTILQMPSASKKYKTFSTCASHLGVVSLFYGTLAMVYLQPLHTYSM-KDSVATVMYAVLT
:.:..::.. ..:.::::.:::.:: :::.:. ::..:: ..: ::..:::.:.:.:
CCDS10 CTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE0 PMMNPFIYSLRNKDMHGAPGRVLWRPFQRPK
::.:::::::::. ..:: .:. :
CCDS10 PMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1048 init1: 903 opt: 1059 Z-score: 944.8 bits: 183.1 E(32554): 2.6e-46
Smith-Waterman score: 1059; 53.7% identity (79.8% similar) in 307 aa overlap (19-324:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRALNKHLLVLMLQKVGGMDGDNQSENSQFLLLGISESPEQQQILFWMFLSMYLVTVLGN
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CCDS68 PAILRVRTRGGVGKAFSTCSSHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVT
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CCDS68 PMLNPFIYSLRNKDMKGALKRLFSHRSIVSS
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CCDS35 FFLAFGNTDSYLLAAMAIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIPHFHSLLHILL
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CCDS35 MLNPFIYSLRNKDMKQGLAKLMHRMKCQ
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CCDS12 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGN
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CCDS12 LLIILATISDSHLHTPMYFFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMY
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CCDS12 FFILFAGFENFLLSVMAYDRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILM
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CCDS12 VVRLSFCTALEIPHFFCELNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKII
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CCDS12 SSIHAISSAQGKYKAFSTCASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVT
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CCDS12 PMLNPFIYSLRNKDIKRALGIHLLWGTMKGQFFKKCP
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CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGN
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CCDS11 LLIIVLIRLDSHLHTPMYLFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMY
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CCDS11 FFLLFGDLESFLLVAMAYDRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLL
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CCDS11 MARLCFCADNVIPHFFCDMSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIV
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