Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0884
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0884, 312 aa
1>>>pF1KE0884 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8342+/-0.00135; mu= 12.8726+/- 0.078
mean_var=207.3294+/-81.331, 0's: 0 Z-trim(102.0): 446 B-trim: 388 in 1/46
Lambda= 0.089073
statistics sampled from 6177 (6746) to 6177 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 2.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 2045 276.5 1.8e-74
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1719 234.6 7.5e-62
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1145 160.9 1.2e-39
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1102 155.3 5.5e-38
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1102 155.3 5.6e-38
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1093 154.2 1.2e-37
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1087 153.4 2.1e-37
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1080 152.5 3.9e-37
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1077 152.1 5.1e-37
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1069 151.1 1e-36
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1061 150.1 2.2e-36
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1059 149.8 2.5e-36
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1054 149.2 4e-36
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1053 149.0 4.4e-36
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1052 148.9 4.8e-36
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1046 148.1 8.2e-36
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1045 148.0 8.9e-36
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1041 147.5 1.3e-35
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1037 147.0 1.8e-35
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1032 146.3 2.8e-35
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 1031 146.2 3.1e-35
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1031 146.2 3.2e-35
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1024 145.3 5.7e-35
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1022 145.0 6.8e-35
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1022 145.1 7.3e-35
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1014 144.1 1.5e-34
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1007 143.1 2.6e-34
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 1004 142.7 3.4e-34
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 995 141.7 8.2e-34
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 986 140.4 1.7e-33
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 983 140.1 2.3e-33
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 978 139.4 3.5e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 966 137.9 1e-32
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 953 136.2 3.2e-32
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 941 134.6 9.4e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 932 133.5 2.1e-31
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 918 131.7 7.3e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 901 129.5 3.3e-30
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 901 129.5 3.3e-30
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 897 129.0 4.7e-30
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 893 128.5 6.7e-30
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 883 127.2 1.6e-29
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 879 126.7 2.3e-29
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 879 126.7 2.3e-29
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 879 126.7 2.3e-29
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 878 126.5 2.6e-29
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 878 126.5 2.6e-29
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 877 126.4 2.8e-29
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 876 126.3 3.2e-29
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 875 126.2 3.4e-29
>>CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 (312 aa)
initn: 2045 init1: 2045 opt: 2045 Z-score: 1450.3 bits: 276.5 E(32554): 1.8e-74
Smith-Waterman score: 2045; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 GRLLDKHFKRLT
::::::::::::
CCDS11 GRLLDKHFKRLT
310
>>CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 (312 aa)
initn: 1732 init1: 1706 opt: 1719 Z-score: 1223.9 bits: 234.6 E(32554): 7.5e-62
Smith-Waterman score: 1719; 82.6% identity (94.2% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
::: ::::.:.:::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::.:
CCDS58 MDGDNQSENSQFLLLGISESPEQQRILFWMFLSMYLVTVLGNVLIILAISSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS58 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNFQSQNKAISYAGCLTQLYFLVSLVTLDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
::::: ::::::.::::: ::.::::::: :::::::. :.:.::::::: :.:::.::.
CCDS58 DRYVATCCPLHYVTAMSPGLCVLLLSLCWGLSVLYGLLLTFLLTRVTFCGPREIHYLFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
::.:: .:::: .: ::.:::::::::: :.::. ::: :.:.::..::.:::::.:::
CCDS58 MYILLWLACSNTHIIHTALIATGCFIFLTPLGFMTTSYVRIVRTILQMPSASKKYKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGAL
::::::.:::::::: ::::.::::::.:::::::::::.::::::::: :::::::::
CCDS58 CASHLGVVSLFYGTLAMVYLQPLHTYSMKDSVATVMYAVLTPMMNPFIYRLRNKDMHGAP
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 GRLLDKHFKRLT
::.: . :.:
CCDS58 GRVLWRPFQRPK
310
>>CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 (330 aa)
initn: 1120 init1: 1007 opt: 1145 Z-score: 825.0 bits: 160.9 E(32554): 1.2e-39
Smith-Waterman score: 1145; 56.1% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (5-304:22-322)
10 20 30 40
pF1KE0 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNV
::. :.:::::.:: ::.: .:: .::.:::::.:::.
CCDS35 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 LIILAISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYF
::::::::: .::::.::::::::.:: :.. .:::::.:...... :::.:::.::::
CCDS35 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LVSLVALDNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLM
:. . .::: .::::::::::::: ::::.:.:::.:: :.:..::::. .:.::::.
CCDS35 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 TRVTFCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIR
:::.::... : ...:. .::..:::. ..:. ..:. : ... .:. ....::: :.
CCDS35 TRVAFCAQKAIPHFYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 AILRIPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSV-KDSVATVMYAVVTP
:.. : : . ..::::::.::: .: ::::.: ::: : :::. ..: :.:.: :. :
CCDS35 AVFVISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE0 MMNPFIYSLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
.:::::::::.::. :::.:.
CCDS35 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
310 320 330
>>CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1083 init1: 929 opt: 1102 Z-score: 795.4 bits: 155.3 E(32554): 5.5e-38
Smith-Waterman score: 1102; 54.7% identity (82.1% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
:.. : .: :.:::::.:..:: : .:: .:::::::::.::.:::::.::::.::::.:
CCDS32 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
:::.::::.:. :...:.:::::..:...: ::: :::::.:::. ....:...::::::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
::.:::: :::::. :.: :: ::. : . ..:.: ::: :.:: . .: ..:::
CCDS32 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
.:..:::: .:. :: .. .. ..: . ...:: :. ... . :.. :::::::
CCDS32 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDS-VATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGA
:.::: .::::::: :::. :.: ..: .:.::::.::::.:::::::::::..::
CCDS32 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 LGRLLDKHFKRLT
: :::..
CCDS32 LERLLSRADSCP
310
>>CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 (320 aa)
initn: 1090 init1: 930 opt: 1102 Z-score: 795.3 bits: 155.3 E(32554): 5.6e-38
Smith-Waterman score: 1102; 55.8% identity (82.5% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
:. :::....::::::.: . : : ::: .:::::::: .::.:::::: :::.::::.:
CCDS12 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
:::.::::.:: :...:.::::.:. ..:: :.:::::.:..:..:. ::::.:.::::
CCDS12 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
::.::.: :::::. :.:.:: ::. : .::. .:..:: . :..:: .: ..::.
CCDS12 DRFVAVCHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTEMEIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE0 MYVLLRMACSNIQINHTVL-IATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFS
. .:..:::. ::..:. .::: . .: : ...:: :. .:::: :...:.::::
CCDS12 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGV-LGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDS-VATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHG
::.:::..:.::::: :::. : : . : ::.:::..::::.::::::::: ::.
CCDS12 TCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALGRLLDKHFKRLT
::::::..
CCDS12 ALGRLLSRATFFNGDITAGLS
300 310 320
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1107 init1: 931 opt: 1093 Z-score: 789.1 bits: 154.2 E(32554): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 1093; 51.1% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
:.: ::: :::::::.:..:.::..:: .::::::.::.::.::::..: :: ::::.:
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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310
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: ::.
CCDS68 LKRLFSHRSIVSS
300 310
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CCDS32 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
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CCDS32 DRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCD
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CCDS32 LTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFST
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CCDS32 LRKLVNRKITSSS
310
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CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
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CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
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CCDS11 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
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CCDS11 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
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CCDS11 LSRVIHQKKTFFSL
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>>CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 (310 aa)
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CCDS35 MGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAVFLPIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMY
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CCDS35 FFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETKTISYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAI
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CCDS35 DRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIPHFHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCD
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CCDS35 DQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTPFSCIIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFST
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]