Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0883
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0883, 314 aa
1>>>pF1KE0883 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7655+/-0.00114; mu= 13.5654+/- 0.067
mean_var=188.4603+/-63.834, 0's: 0 Z-trim(103.8): 442 B-trim: 422 in 1/48
Lambda= 0.093425
statistics sampled from 7039 (7590) to 7039 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 2066 291.7 5e-79
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1252 182.0 5.3e-46
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1147 167.8 9.7e-42
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1126 165.0 6.9e-41
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1116 163.7 1.8e-40
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1113 163.2 2.3e-40
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1111 163.0 2.8e-40
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1110 162.8 3.1e-40
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1108 162.6 3.7e-40
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1093 160.6 1.5e-39
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1082 159.1 4.2e-39
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1074 158.0 8.8e-39
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1057 155.7 4.3e-38
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 1055 155.4 5.3e-38
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1053 155.1 6.3e-38
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1052 155.0 6.9e-38
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1052 155.0 6.9e-38
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1050 154.7 8.3e-38
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1046 154.2 1.2e-37
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1045 154.1 1.3e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1045 154.1 1.3e-37
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1043 153.8 1.6e-37
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1041 153.5 2e-37
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1024 151.2 9.4e-37
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1024 151.3 1e-36
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 1019 150.6 1.5e-36
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1018 150.4 1.7e-36
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1011 149.5 3.3e-36
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1007 148.9 4.6e-36
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 1005 148.7 5.5e-36
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 998 147.8 1.1e-35
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 978 145.1 7.3e-35
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 974 144.5 1e-34
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 972 144.2 1.2e-34
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 967 143.6 1.9e-34
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 952 141.5 7.9e-34
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 946 140.7 1.4e-33
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 932 138.8 5.1e-33
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 930 138.6 6.2e-33
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 929 138.4 6.8e-33
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 928 138.3 7.4e-33
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 926 138.0 9e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 924 137.8 1.1e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 923 137.6 1.2e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 923 137.7 1.2e-32
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 919 137.1 1.7e-32
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 915 136.5 2.5e-32
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 915 136.5 2.5e-32
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 915 136.6 2.6e-32
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 915 136.6 2.7e-32
>>CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 2066 init1: 2066 opt: 2066 Z-score: 1532.3 bits: 291.7 E(32554): 5e-79
Smith-Waterman score: 2066; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
::::::::::::::
CCDS41 LQKMLLKCTVFQQQ
310
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1240 init1: 1240 opt: 1252 Z-score: 939.4 bits: 182.0 E(32554): 5.3e-46
Smith-Waterman score: 1252; 60.0% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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CCDS10 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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CCDS10 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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CCDS10 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
:.:..
CCDS10 LKKVVGRVVFSV
310
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1149 init1: 1127 opt: 1147 Z-score: 862.9 bits: 167.8 E(32554): 9.7e-42
Smith-Waterman score: 1147; 53.4% identity (80.8% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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CCDS35 MKRENQSSVSEFLLLDLPIWPEQQAVFFTLFLGMYLITVLGNLLIILLIRLDSHLHTPMF
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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CCDS35 FFLSHLALTDISLSSVTVPKMLLSMQTQDQSILYAGCVTQMYFFIFFTDLDNFLLTSMAY
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pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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CCDS35 DRYVAICHPLRYTTIMKEGLCNLLVTVSWILSCTNALSHTLLLAQLSFCADNTIPHFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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CCDS35 LVALLKLSCSDISLNELVIFTVGQAVITLPLICILISYGHIGVTILKAPSTKGIFKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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CCDS35 CGSHLSVVSLYYGTIIGLYFLPSSSASSDKDVIASVMYTVITPLLNPFIYSLRNRDIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
:.... . ::..:
CCDS35 LERLFNRATVLSQ
310
>>CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 (313 aa)
initn: 1126 init1: 1126 opt: 1126 Z-score: 847.6 bits: 165.0 E(32554): 6.9e-41
Smith-Waterman score: 1126; 53.8% identity (80.7% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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CCDS11 MEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGSFLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
:::.::...: ::.:::::.:..:: ...::..::: ::.::. :: ....:: ::::
CCDS11 FFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQAISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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CCDS11 DCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWIMNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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CCDS11 INPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTGLICVLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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CCDS11 CSSHLSVVSLFFGTSFCVDFSSPSTHSAQKDTVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNQEIKSS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
:.:..
CCDS11 LRKLIWVRKIHSP
310
>>CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 (322 aa)
initn: 1138 init1: 1102 opt: 1116 Z-score: 840.2 bits: 163.7 E(32554): 1.8e-40
Smith-Waterman score: 1116; 53.1% identity (80.7% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
: .: . : ::.::::: ::: .. .::: :::.:.:::.::. : .:::::.:::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
::::.::..:: :.:.:::.:..:. : .. . ::..: .::. :...::.:. :::
CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
::::::::::::.. :. ::.:::: :... :::::.:.:::::::..:: :.:::
CCDS35 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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CCDS35 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
:. :::::...: : :..:: : : . ... .....:. :.::::::::.:::.:.: .
CCDS35 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
:.:.:
CCDS35 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
310 320
>>CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 (313 aa)
initn: 1134 init1: 1113 opt: 1113 Z-score: 838.1 bits: 163.2 E(32554): 2.3e-40
Smith-Waterman score: 1113; 51.8% identity (81.6% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
:: :: : . .:.:::: . ::. :: ::.::::. ..::.::: .:..:::::.:::
CCDS32 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS32 LRKLVNRKITSSS
310
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CCDS11 LSRVIHQKKTFFSL
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CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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CCDS35 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
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CCDS35 LGKLFSRATFFSW
310
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CCDS12 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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CCDS12 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
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CCDS12 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFST
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310 320
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]