Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0882
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0882, 318 aa
1>>>pF1KE0882 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4827+/-0.000958; mu= 14.5062+/- 0.057
mean_var=133.1271+/-43.808, 0's: 0 Z-trim(105.2): 397 B-trim: 958 in 2/50
Lambda= 0.111158
statistics sampled from 7767 (8295) to 7767 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 927 160.7 1.4e-39
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 917 159.1 4.2e-39
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 913 158.4 6.5e-39
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 906 157.3 1.4e-38
CCDS11026.1 OR1E2 gene_id:8388|Hs108|chr17 ( 323) 897 155.9 3.9e-38
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 884 153.8 1.7e-37
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 874 152.2 5e-37
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 870 151.5 7.7e-37
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 869 151.4 8.7e-37
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 867 151.1 1.1e-36
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 863 150.4 1.7e-36
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 863 150.4 1.7e-36
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 862 150.3 1.9e-36
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 859 149.8 2.6e-36
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 852 148.7 5.7e-36
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 852 148.7 6e-36
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 850 148.3 7.1e-36
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 844 147.4 1.4e-35
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 842 147.1 1.8e-35
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 839 146.6 2.4e-35
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 834 145.8 4.6e-35
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 832 145.4 5.3e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 829 145.0 7.4e-35
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 827 144.7 9.5e-35
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 819 143.4 2.2e-34
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 818 143.2 2.5e-34
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 815 142.7 3.5e-34
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 815 142.7 3.5e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 812 142.2 4.9e-34
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 809 141.8 6.8e-34
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 803 140.8 1.3e-33
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 800 140.3 1.9e-33
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 799 140.2 2.1e-33
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 794 139.4 3.6e-33
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 792 139.0 4.5e-33
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 790 138.7 5.6e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 789 138.6 6.5e-33
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 787 138.3 8.5e-33
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 786 138.1 8.8e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 784 137.7 1.1e-32
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 780 137.1 1.7e-32
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 779 137.0 1.9e-32
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 778 136.8 2.1e-32
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 778 136.8 2.1e-32
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 776 136.5 2.7e-32
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX ( 308) 772 135.8 4.1e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 772 135.8 4.2e-32
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 771 135.7 4.6e-32
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 770 135.5 5.2e-32
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 768 135.2 6.5e-32
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 927 init1: 504 opt: 927 Z-score: 824.2 bits: 160.7 E(32554): 1.4e-39
Smith-Waterman score: 927; 46.7% identity (76.2% similar) in 302 aa overlap (14-315:12-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMSFAPNASHSPVFLLLGFSRANISYTLLFFLFLAIYLTTILGNVTLVLLISWDSRLHSP
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CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MYYLLRGLSVIDMGLSTVTLPQLLAHLVSHYPTIPAARCLAQFFFFYAFGVTDTLVIAVM
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CCDS11 MYLFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAM
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CCDS11 AYDRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCAD---NV-I
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PHFFCDHRPLLRASCSDIHSNELAIFFEGGFLMLGPCALIVLSYVRIGAAILRLPSAAGR
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CCDS11 PHFFCDMSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGI
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RRAVSTCGSHLTMVGFLYGTIICVYFQPPFQNSQYQDMVASVMYTAITPLANPFVYSLHN
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CCDS11 CKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 KDVKGALCRLLEWVKVDP
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CCDS11 RDMKGALSRVIHQKKTFFSL
300 310
>>CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 (316 aa)
initn: 931 init1: 503 opt: 917 Z-score: 815.5 bits: 159.1 E(32554): 4.2e-39
Smith-Waterman score: 917; 47.1% identity (73.4% similar) in 312 aa overlap (2-311:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMSFAPNASHSPVFLLLGFSRANISYTLLFFLFLAIYLTTILGNVTLVLLISWDSRLHSP
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CCDS35 MEAANESSEGISFVLLGLTTSPGQQRPLFVLFLLLYVASLLGNGLIVAAIQASPALHAP
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pF1KE0 MYYLLRGLSVIDMGLSTVTLPQLLAHLVSHYPTIPAARCLAQFFFFYAFGVTDTLVIAVM
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CCDS35 MYFLLAHLSFADLCFASVTVPKMLANLLAHDHSISLAGCLTQMYFFFALGVTDSCLLAAM
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pF1KE0 ALDRYVAICDPLHYALVMNHQRCACLLALSWVVSILHTMLRVGLV--LPLCWTGDAGGNV
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CCDS35 AYDCYVAIRHPLPYATRMSRAMCAALVGMAWLVSHVHSLLYILLMARLSFC------ASH
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pF1KE0 NLPHFFCDHRPLLRASCSDIHSNELAIFFEGGFLMLGPCALIVLSYVRIGAAILRLPSAA
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CCDS35 QVPHFFCDHQPLLRLSCSDTHHIQLLIFTEGAAVVVTPFLLILASYGAIAAAVLQLPSAS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GRRRAVSTCGSHLTMVGFLYGTIICVYFQPPFQNSQYQDMVASVMYTAITPLANPFVYSL
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CCDS35 GRLRAVSTCGSHLAVVSLFYGTVIAVYFQATSRREAEWGRVATVMYTVVTPMLNPIIYSL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 HNKDVKGALCRLLEWVKVDP
:.::.::: ::
CCDS35 WNRDVQGALRALLIGRRISASDS
300 310
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 913 init1: 475 opt: 913 Z-score: 812.1 bits: 158.4 E(32554): 6.5e-39
Smith-Waterman score: 913; 45.6% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (7-311:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMSFAPNASHSPVFLLLGFSRANISYTLLFFLFLAIYLTTILGNVTLVLLISWDSRLHSP
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pF1KE0 MYYLLRGLSVIDMGLSTVTLPQLLAHLVSHYPTIPAARCLAQFFFFYAFGVTDTLVIAVM
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CCDS10 MYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVM
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pF1KE0 ALDRYVAICDPLHYALVMNHQRCACLLALSWVVSILHTMLRVGLVLPLCWTGDAGGNVNL
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CCDS10 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNA----I
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pF1KE0 PHFFCDHRPLLRASCSDIHSNELAIFFEGGFLMLGPCALIVLSYVRIGAAILRLPSAAGR
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CCDS10 THFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGR
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pF1KE0 RRAVSTCGSHLTMVGFLYGTIICVYFQPPFQNSQYQDMVASVMYTAITPLANPFVYSLHN
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CCDS10 WKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRN
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310
pF1KE0 KDVKGALCRLLEWVKVDP
. .:::: ...
CCDS10 RYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 (310 aa)
initn: 871 init1: 432 opt: 906 Z-score: 806.1 bits: 157.3 E(32554): 1.4e-38
Smith-Waterman score: 906; 43.4% identity (75.9% similar) in 311 aa overlap (7-315:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMSFAPNASHSPVFLLLGFSRANISYTLLFFLFLAIYLTTILGNVTLVLLISWDSRLHSP
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CCDS35 MGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAVFLPIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTP
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pF1KE0 MYYLLRGLSVIDMGLSTVTLPQLLAHLVSHYPTIPAARCLAQFFFFYAFGVTDTLVIAVM
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CCDS35 MYFFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETKTISYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAM
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pF1KE0 ALDRYVAICDPLHYALVMNHQRCACLLALSWVVSILHTMLRVGLV--LPLCWTGDAGGNV
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CCDS35 AIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIPHFHSLLHILLTNQLIFC-----ASNV
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pF1KE0 NLPHFFCDHRPLLRASCSDIHSNELAIFFEGGFLMLGPCALIVLSYVRIGAAILRLPSAA
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CCDS35 -IHHFFCDDQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTPFSCIIISYLRILITVLKIPSAA
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pF1KE0 GRRRAVSTCGSHLTMVGFLYGTIICVYFQPPFQNSQYQDMVASVMYTAITPLANPFVYSL
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CCDS35 GKRKAFSTCGSHLTVVTLFYGSISYLYFQP-LSNYTVKDQIATIIYTVLTPMLNPFIYSL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 HNKDVKGALCRLLEWVKVDP
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CCDS35 RNKDMKQGLAKLMHRMKCQ
300 310
>>CCDS11026.1 OR1E2 gene_id:8388|Hs108|chr17 (323 aa)
initn: 825 init1: 452 opt: 897 Z-score: 798.1 bits: 155.9 E(32554): 3.9e-38
Smith-Waterman score: 897; 45.0% identity (74.9% similar) in 307 aa overlap (14-311:12-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMSFAPNASHSPVFLLLGFSRANISYTLLFFLFLAIYLTTILGNVTLVLLISWDSRLHSP
:::::. . .: . ::::.::::.:::. ...:: ::.::.:
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTP
10 20 30 40 50
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pF1KE0 MYYLLRGLSVIDMGLSTVTLPQLLAHLVSHYPTIPAARCLAQFFFFYAFGVTDTLVIAVM
.: .: .:: :. .:.::.:.:: .. .. :.:: : ::.:..:: :. .......:
CCDS11 VYLFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAM
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pF1KE0 ALDRYVAICDP---------LHYALVMNHQRCACLLALSWVVSILHTMLRVGLVLPLCWT
: ::::::: : :::. .:. . : ..:::::.. .:.::.. :. ::.
CCDS11 AYDRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFC
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pF1KE0 GDAGGNVNLPHFFCDHRPLLRASCSDIHSNELAIFFEGGFLMLGPCALIVLSYVRIGAAI
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CCDS11 AD---NV-IPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSI
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pF1KE0 LRLPSAAGRRRAVSTCGSHLTMVGFLYGTIICVYFQPPFQNSQYQDMVASVMYTAITPLA
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CCDS11 LKVPSSKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPML
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pF1KE0 NPFVYSLHNKDVKGALCRLLEWVKVDP
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CCDS11 TPFIYSLRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
300 310 320
>>CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 (322 aa)
initn: 877 init1: 457 opt: 884 Z-score: 786.8 bits: 153.8 E(32554): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 884; 44.6% identity (75.1% similar) in 305 aa overlap (7-311:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMSFAPNASHSPVFLLLGFSRANISYTLLFFLFLAIYLTTILGNVTLVLLISWDSRLHSP
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CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTP
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CCDS11 HYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]