Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0881
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0881, 309 aa
1>>>pF1KE0881 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5137+/-0.00125; mu= 14.3011+/- 0.074
mean_var=162.3339+/-56.419, 0's: 0 Z-trim(101.9): 444 B-trim: 367 in 1/47
Lambda= 0.100663
statistics sampled from 6166 (6709) to 6166 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16
Scan time: 2.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 1996 302.9 2.1e-82
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1698 259.6 2.2e-69
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1081 170.0 2.1e-42
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1031 162.7 3.3e-40
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1021 161.3 8.9e-40
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1011 159.8 2.4e-39
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1008 159.4 3.3e-39
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1003 158.7 5.5e-39
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1003 158.7 5.6e-39
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 999 158.1 8.1e-39
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 996 157.7 1.1e-38
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 994 157.3 1.3e-38
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 983 155.8 4.1e-38
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 981 155.5 5e-38
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 969 153.7 1.7e-37
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 950 151.0 1.2e-36
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 949 150.8 1.3e-36
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 943 149.9 2.3e-36
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 943 149.9 2.3e-36
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 940 149.6 3.3e-36
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 939 149.4 3.5e-36
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 938 149.2 3.9e-36
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 908 144.9 7.9e-35
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 884 141.4 8.7e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 883 141.2 9.8e-34
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 878 140.5 1.6e-33
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 875 140.2 2.3e-33
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 873 139.8 2.6e-33
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 873 139.8 2.6e-33
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 873 139.8 2.7e-33
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 872 139.7 3.1e-33
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 870 139.3 3.6e-33
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 868 139.1 4.4e-33
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 867 138.9 4.8e-33
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 863 138.3 7.2e-33
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 862 138.2 7.9e-33
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 858 137.6 1.2e-32
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 854 137.1 1.9e-32
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 850 136.5 2.8e-32
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 846 135.9 4e-32
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 840 135.0 7.3e-32
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 835 134.3 1.2e-31
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 835 134.3 1.2e-31
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 834 134.1 1.3e-31
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 834 134.2 1.4e-31
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 829 133.4 2.2e-31
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 829 133.4 2.2e-31
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 827 133.1 2.7e-31
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 827 133.1 2.7e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 826 132.9 3e-31
>>CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 (309 aa)
initn: 1996 init1: 1996 opt: 1996 Z-score: 1592.9 bits: 302.9 E(32554): 2.1e-82
Smith-Waterman score: 1996; 99.4% identity (99.4% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKKENQSFNLDFILLGVTSQQEQNNVFFVIFLCIYPITLTGNLLIILAICADIRLHNPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MKKENQSFNLDFILLGVTSQQEQNNVFFVIFLCIYPITLTGNLLIILAICADIRLHNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIIFSSVTIPKVLANHLLGSKFISFGGCLMQMYFMIALAKADSYTLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLLANLSLVDIIFSSVTIPKVLANHLLGSKFISFGGCLMQMYFMIALAKADSYTLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISCPLHYTTIMSPRSCILLIAGSWVIGNTSALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRAVAISCPLHYTTIMSPRSCILLIAGSWVIGNTSALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IMPLLKLSCSDVHFNVKMMYLGVGVFSLPLLCIIVSYVQVFSTVFQVPSTKSLFKAFCTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IMPLLKLSCSDVHFNVKMMYLGVGVFSLPLLCIIVSYVQVFSTVFQVPSTKSLFKAFCTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GSHLTVVFLYYGTTMCMYFRPLTSYSPKDAVITVMYVAVTPALNPFIYSLRNCDMKAALQ
::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS11 GSHLTVVFLYYGTTMGMYFRPLTSYSPKDAVITVMYVAVTPALNPFIYSLRNWDMKAALQ
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KLFSKRISS
:::::::::
CCDS11 KLFSKRISS
>>CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 (309 aa)
initn: 1698 init1: 1698 opt: 1698 Z-score: 1359.0 bits: 259.6 E(32554): 2.2e-69
Smith-Waterman score: 1698; 83.2% identity (94.5% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKKENQSFNLDFILLGVTSQQEQNNVFFVIFLCIYPITLTGNLLIILAICADIRLHNPMY
:...::: .:.:::::::.::::.. :...:: :::::: :::::.::::.:.:::::::
CCDS11 MRENNQSSTLEFILLGVTGQQEQEDFFYILFLFIYPITLIGNLLIVLAICSDVRLHNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIIFSSVTIPKVLANHLLGSKFISFGGCLMQMYFMIALAKADSYTLAAMAY
:::::::::::.::::::::.::::::::: ::::::: ::::::::...::: ::::::
CCDS11 FLLANLSLVDIFFSSVTIPKMLANHLLGSKSISFGGCLTQMYFMIALGNTDSYILAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISCPLHYTTIMSPRSCILLIAGSWVIGNTSALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
::::::: :::::::::::::: ::::::::::..:::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRAVAISRPLHYTTIMSPRSCIWLIAGSWVIGNANALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IMPLLKLSCSDVHFNVKMMYLGVGVFSLPLLCIIVSYVQVFSTVFQVPSTKSLFKAFCTC
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CCDS11 ITPLLKLSCSDIHFHVKMMYLGVGIFSVPLLCIIVSYIRVFSTVFQVPSTKGVLKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GSHLTVVFLYYGTTMCMYFRPLTSYSPKDAVITVMYVAVTPALNPFIYSLRNCDMKAALQ
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CCDS11 GSHLTVVSLYYGTVMGTYFRPLTNYSLKDAVITVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDMKAALR
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KLFSKRISS
:::.:::::
CCDS11 KLFNKRISS
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1099 init1: 712 opt: 1081 Z-score: 874.7 bits: 170.0 E(32554): 2.1e-42
Smith-Waterman score: 1081; 52.4% identity (80.1% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKKENQSFNLDFILLGVTSQQEQNNVFFVIFLCIYPITLTGNLLIILAICADIRLHNPMY
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CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIIFSSVTIPKVLANHLLGSKFISFGGCLMQMYFMIALAKADSYTLAAMAY
:.:.:::.::: :: .:.::.::::.: .. ::: ::: ::::.. .. :.. ::.:::
CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISCPLHYTTIMSPRSCILLIAGSWVIGNTSALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
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CCDS10 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE0 IMPLLKLSCSDVHFN-VKMMYLGVGVFSLPLLCIIVSYVQVFSTVFQVPSTKSLFKAFCT
. :::::::::.:.: : .. :. :. :.:::..::... ::..:::::. .::: :
CCDS10 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGSHLTVVFLYYGTTMCMYFRPLTSYSP-KDAVITVMYVAVTPALNPFIYSLRNCDMKAA
:::::.::.:.:.: . .:: ::.:.: ::.. ::.:..::: :::::::::: .:.:
CCDS10 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 LQKLFSKRISS
:.:. .. . :
CCDS10 LKKVVGRVVFSV
310
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1048 init1: 642 opt: 1031 Z-score: 835.4 bits: 162.7 E(32554): 3.3e-40
Smith-Waterman score: 1031; 51.1% identity (79.5% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKKENQSFNLDFILLGVTSQQEQNNVFFVIFLCIYPITLTGNLLIILAICADIRLHNPMY
::.:::: .:.:: . ::. :::..:: .: ::. ::::::: : : .::.::.
CCDS35 MKRENQSSVSEFLLLDLPIWPEQQAVFFTLFLGMYLITVLGNLLIILLIRLDSHLHTPMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIIFSSVTIPKVLANHLLGSKFISFGGCLMQMYFMIALAKADSYTLAAMAY
:.:..:.:.:: .::::.::.: . .. : ..::. ::::.: .. :.. :..:::
CCDS35 FFLSHLALTDISLSSVTVPKMLLSMQTQDQSILYAGCVTQMYFFIFFTDLDNFLLTSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISCPLHYTTIMSPRSCILLIAGSWVIGNTSALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
:: ::: ::.:::::. : ::.. ::... :.:: :::: :.::::... . .:.::
CCDS35 DRYVAICHPLRYTTIMKEGLCNLLVTVSWILSCTNALSHTLLLAQLSFCADNTIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE0 IMPLLKLSCSDVHFNVKMMY-LGVGVFSLPLLCIIVSYVQVFSTVFQVPSTKSLFKAFCT
.. ::::::::. .: ... .: .:..:::.::..:: .. :....::::..:::. :
CCDS35 LVALLKLSCSDISLNELVIFTVGQAVITLPLICILISYGHIGVTILKAPSTKGIFKALST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGSHLTVVFLYYGTTMCMYFRPLTSYSP-KDAVITVMYVAVTPALNPFIYSLRNCDMKAA
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CCDS35 CGSHLSVVSLYYGTIIGLYFLPSSSASSDKDVIASVMYTVITPLLNPFIYSLRNRDIKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 LQKLFSKRISS
:..::..
CCDS35 LERLFNRATVLSQ
310
>>CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1021 init1: 705 opt: 1021 Z-score: 827.6 bits: 161.3 E(32554): 8.9e-40
Smith-Waterman score: 1021; 52.1% identity (76.4% similar) in 305 aa overlap (4-306:2-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKKENQSFNLDFILLGVTSQQEQNNVFFVIFLCIYPITLTGNLLIILAICADIRLHNPMY
:::: .:.: :... ::.. .: ::::.: .:::::::::::: .:..::.:::
CCDS68 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIIFSSVTIPKVLANHLLGSKFISFGGCLMQMYFMIALAKADSYTLAAMAY
:.:::::.::. ..: :. :.:.: . ::. ::: ::::.. .. ::. ::::::
CCDS68 FFLANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYFFLMFGDLDSFFLAAMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISCPLHYTTIMSPRSCILLIAGSWVIGNTSALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
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CCDS68 DRYVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLMARLSFCVTGEIAHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 IMPLLKLSCSDVHFNVKMMY-LGVGVFSLPLLCIIVSYVQVFSTVFQVPSTKSLFKAFCT
: :.:::::::.:.: :.. :: :. .:.:::..::... ....: . .. ::: :
CCDS68 ITPVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVPAILRVRTRGGVGKAFST
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGSHLTVVFLYYGTTMCMYFRPLTSYSP-KDAVITVMYVAVTPALNPFIYSLRNCDMKAA
:.::: :: ..::: . :. : . : :: . ..::. ::: :::::::::: :::.:
CCDS68 CSSHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTPMLNPFIYSLRNKDMKGA
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 LQKLFSKRISS
:..:::.:
CCDS68 LKRLFSHRSIVSS
300 310
>>CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1006 init1: 620 opt: 1011 Z-score: 819.7 bits: 159.8 E(32554): 2.4e-39
Smith-Waterman score: 1011; 51.1% identity (76.9% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKKENQSFNLDFILLGVTSQQEQNNVFFVIFLCIYPITLTGNLLIILAICADIRLHNPMY
:. :::: .:.:::. . ::. :::..:: .: :. :::::.: : : .::.:::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIIFSSVTIPKVLANHLLGSKFISFGGCLMQMYFMIALAKADSYTLAAMAY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]