Result of FASTA (omim) for
pF1KE0877
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0877, 319 aa
1>>>pF1KE0877 319 - 319 aa - 319 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0286+/-0.000657; mu= 17.7184+/- 0.040
mean_var=107.9831+/-27.530, 0's: 0 Z-trim(105.4): 321 B-trim: 879 in 1/47
Lambda= 0.123423
statistics sampled from 13156 (13586) to 13156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.477), E-opt: 0.2 (0.159), width: 16
Scan time: 5.120
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 978 185.9 9e-47
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 932 177.7 2.6e-44
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 922 176.0 9.2e-44
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 917 175.1 1.7e-43
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 917 175.1 1.7e-43
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 917 175.1 1.7e-43
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 917 175.1 1.7e-43
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 912 174.2 3.1e-43
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 895 171.2 2.5e-42
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 895 171.2 2.6e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 885 169.4 8.8e-42
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XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 864 165.6 1.2e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 864 165.7 1.2e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 853 163.7 4.6e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 840 161.4 2.3e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 817 157.3 3.9e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 784 151.4 2.2e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 768 148.5 1.6e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 765 148.0 2.4e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 548 109.4 1e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 510 102.6 1.1e-21
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 247 55.8 1.4e-07
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 219 50.8 4.4e-06
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 212 49.6 1.1e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 207 48.8 2.2e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 207 48.8 2.3e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 200 47.4 4.8e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 199 47.2 5.3e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 196 46.7 7.8e-05
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 194 46.6 0.00012
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 192 46.1 0.00014
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 192 46.1 0.00014
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 189 45.6 0.00021
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 187 45.1 0.00024
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 186 45.0 0.00029
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 186 45.0 0.00029
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 186 45.0 0.00029
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 186 45.0 0.00029
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 186 45.0 0.00029
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 186 45.0 0.00029
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 186 45.0 0.00029
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 186 45.0 0.0003
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 183 44.5 0.00045
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 180 44.0 0.00067
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 180 44.1 0.00069
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 180 44.1 0.00069
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 178 43.5 0.00073
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 176 43.2 0.00098
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 174 42.8 0.0011
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 986 init1: 963 opt: 978 Z-score: 960.7 bits: 185.9 E(85289): 9e-47
Smith-Waterman score: 978; 46.5% identity (79.4% similar) in 301 aa overlap (5-305:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE0 PMYLFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPM
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 MAYDRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 TCEILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FSTCTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 KVALKKLLIRNHFNTAFISILK
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NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 924 init1: 924 opt: 932 Z-score: 916.4 bits: 177.7 E(85289): 2.6e-44
Smith-Waterman score: 932; 45.2% identity (77.4% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
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pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
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pF1KE0 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
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310
pF1KE0 LKKLLIRNHFNTAFISILK
...::
NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 895 init1: 849 opt: 922 Z-score: 906.7 bits: 176.0 E(85289): 9.2e-44
Smith-Waterman score: 922; 46.7% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (1-303:1-304)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYP-KVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPM
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pF1KE0 EILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE0 TCTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKV
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE0 ALKKLLIRNHFNTAFISILK
::..
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 917; 45.5% identity (77.3% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
: : :.: :..::.: :... ..: : : .::.:.:::..:::.. .::.::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE0 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQE--KSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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310
pF1KE0 LKKLLIRNHFNTAFISILK
:.:. ::
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 917 init1: 917 opt: 917 Z-score: 901.9 bits: 175.1 E(85289): 1.7e-43
Smith-Waterman score: 917; 45.8% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE0 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE0 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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310
pF1KE0 LKKLLIRNHFNTAFISILK
.:::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 917 init1: 917 opt: 917 Z-score: 901.9 bits: 175.1 E(85289): 1.7e-43
Smith-Waterman score: 917; 45.8% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE0 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LKKLLIRNHFNTAFISILK
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NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 917 init1: 917 opt: 917 Z-score: 901.9 bits: 175.1 E(85289): 1.7e-43
Smith-Waterman score: 917; 45.8% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LKKLLIRNHFNTAFISILK
.:::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 894 init1: 894 opt: 912 Z-score: 897.3 bits: 174.2 E(85289): 3.1e-43
Smith-Waterman score: 912; 45.2% identity (77.2% similar) in 294 aa overlap (5-298:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAY
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XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
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XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 LKKLLIRNHFNTAFISILK
XP_011 GS
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 943 init1: 874 opt: 895 Z-score: 880.8 bits: 171.2 E(85289): 2.5e-42
Smith-Waterman score: 895; 43.9% identity (73.9% similar) in 303 aa overlap (5-307:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 EILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFS
.. .: : :.:: .::.. ...... :.: :::..: ::..:.:..::::::.
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKV
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 ALKKLLIRNHFNTAFISILK
:::.: :
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 900 init1: 694 opt: 895 Z-score: 880.5 bits: 171.2 E(85289): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 895; 45.1% identity (74.4% similar) in 297 aa overlap (9-301:10-306)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNT----ISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 PMMAYDRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIIN
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 HFTCEILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRS
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KAFSTCTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNK
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
250 260 270 280 290 300
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::: ::
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310 320
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]