Result of FASTA (omim) for
pF1KE0873
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0873, 322 aa
1>>>pF1KE0873 322 - 322 aa - 322 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8455+/-0.00046; mu= 19.0714+/- 0.028
mean_var=132.7753+/-33.966, 0's: 0 Z-trim(111.0): 347 B-trim: 1188 in 1/51
Lambda= 0.111305
statistics sampled from 18969 (19511) to 18969 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 4.570
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 956 165.6 1.2e-40
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 930 161.4 2.3e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 896 155.9 1e-37
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 892 155.3 1.5e-37
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 892 155.3 1.5e-37
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 892 155.3 1.6e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 882 153.7 4.7e-37
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 872 152.1 1.4e-36
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 868 151.4 2.2e-36
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 865 151.0 3.1e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 861 150.3 4.9e-36
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 861 150.3 4.9e-36
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 861 150.3 4.9e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 859 150.0 6.1e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 856 149.5 8.4e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 826 144.7 2.4e-34
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 825 144.5 2.7e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 800 140.5 4.2e-33
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 798 140.2 5.4e-33
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 771 135.8 1.1e-31
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 546 99.7 8.3e-21
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 501 92.5 1.2e-18
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 238 50.3 6.6e-06
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 234 49.7 1e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 229 48.8 1.7e-05
NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic ( 477) 220 47.7 5.9e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 216 46.9 8.7e-05
NP_001042 (OMIM: 182453) somatostatin receptor typ ( 418) 213 46.4 0.00012
XP_011528651 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 213 46.4 0.00012
XP_005261778 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 213 46.4 0.00012
XP_016884412 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 213 46.4 0.00012
XP_016884413 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 213 46.4 0.00012
XP_006724374 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 213 46.4 0.00012
NP_001265616 (OMIM: 182453) somatostatin receptor ( 418) 213 46.4 0.00012
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 211 46.0 0.00014
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 209 45.7 0.00018
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 208 45.5 0.00019
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 208 45.5 0.00019
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 206 45.3 0.00025
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 206 45.3 0.00025
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 197 43.0 0.00036
NP_005277 (OMIM: 600731) neuropeptides B/W recepto ( 333) 202 44.5 0.00036
XP_011531037 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 198 44.1 0.00065
XP_011531038 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 198 44.1 0.00065
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 197 43.9 0.00072
XP_011531036 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 618) 198 44.3 0.00079
NP_852111 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 669) 198 44.3 0.00082
NP_000136 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 695) 198 44.4 0.00084
XP_011531035 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 729) 198 44.4 0.00086
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 193 43.1 0.001
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 974 init1: 949 opt: 956 Z-score: 850.4 bits: 165.6 E(85289): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 956; 47.5% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (4-308:6-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MYMFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE0 AYDRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFF
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pF1KE0 CDLPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310 320
pF1KE0 EAVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
.:..::.: :
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 967 init1: 716 opt: 930 Z-score: 827.7 bits: 161.4 E(85289): 2.3e-39
Smith-Waterman score: 930; 46.4% identity (76.5% similar) in 306 aa overlap (1-301:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPQNTS-TVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
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pF1KE0 YMFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLS----WGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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pF1KE0 ALMAYDRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQIN
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
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pF1KE0 HFFCDLPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRR
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KTFSTCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNK
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 DFKEAVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
. :.:.
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 884 init1: 859 opt: 896 Z-score: 798.3 bits: 155.9 E(85289): 1e-37
Smith-Waterman score: 896; 44.2% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNL-LEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPM
: : . ...: :..:..: : :.:::. :: :: .:. :: .:: :. :::::
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pF1KE0 YMFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMA
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pF1KE0 YDRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFC
::::.::::::.:: .:.. ..:...:: : .. . . . . ::: :..:::::
NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE0 DLPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFS
: ::...: :. . . :. .. .: :. : .: : :. :...::.:::..:..:.::
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE0 TCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKE
::.::: ::.:.: . : :. . :: .:..:. ::::::.:::.::::::.. :.
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310 320
pF1KE0 AVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
:. .....
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 906 init1: 863 opt: 892 Z-score: 794.9 bits: 155.3 E(85289): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 892; 45.3% identity (73.3% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
: : :.:..: :::.. . : ::::.:: .: :..::..:: :: ::.:::
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pF1KE0 MFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMAY
.::..:::... .. :::: .::: . :.::: .:..:.:: .. . ::::.:::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE0 DRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFCD
:...:.: ::.: : . ::. ::. : .. . .: .:... :.::. : :.:::::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE0 LPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFST
. ::..:::: ....:: :. . :. :. :. :. :. ..:..:::.:: :.:::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE0 CGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKEA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KE0 VRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
..::. :
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 892; 45.3% identity (73.3% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
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pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
: : :.:..: :::.. . : ::::.:: .: :..::..:: :: ::.:::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE0 MFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE0 DRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFCD
:...:.: ::.: : . ::. ::. : .. . .: .:... :.::. : :.:::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE0 LPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE0 CGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKEA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 VRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
..::. :
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 906 init1: 863 opt: 892 Z-score: 794.8 bits: 155.3 E(85289): 1.6e-37
Smith-Waterman score: 892; 45.3% identity (73.3% similar) in 307 aa overlap (1-307:11-317)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVS
: : :.:..: :::.. . : ::::.:: .: :..::..:: ::
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 QGLRLHSPMYMFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSAT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ECFLLALMAYDRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PNQINHFFCDLPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TSGRRKTFSTCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 SLRNKDFKEAVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 867 init1: 721 opt: 882 Z-score: 786.3 bits: 153.7 E(85289): 4.7e-37
Smith-Waterman score: 882; 43.3% identity (73.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 LPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 CGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKEA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQE--KSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
310 320
pF1KE0 VRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
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NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 872 init1: 872 opt: 872 Z-score: 777.5 bits: 152.1 E(85289): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 872; 43.2% identity (74.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 MFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKEA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 VRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
. .:. ::
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 872 init1: 846 opt: 868 Z-score: 774.1 bits: 151.4 E(85289): 2.2e-36
Smith-Waterman score: 868; 43.9% identity (73.9% similar) in 303 aa overlap (5-305:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHS
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 PMYMFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWG--QAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLL
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNL--WGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ALMAYDRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQIN
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NP_001 VVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVD
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 HFFCDLPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRR
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NP_001 HFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQ
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 KTFSTCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNK
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NP_001 KVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNK
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 DFKEAVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
. ::...:
NP_001 VVRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 871 init1: 851 opt: 865 Z-score: 771.5 bits: 151.0 E(85289): 3.1e-36
Smith-Waterman score: 865; 42.3% identity (74.4% similar) in 312 aa overlap (1-310:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
:. : :: :.: ::::.. . . .:::..:. : ::..::..:: : .::.:::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMAY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFCD
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 LPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFST
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
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. ... .:. :
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start: Sat Nov 5 03:48:01 2016 done: Sat Nov 5 03:48:02 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]