Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0868
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0868, 305 aa
1>>>pF1KE0868 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4933+/-0.0011; mu= 14.7709+/- 0.065
mean_var=166.0608+/-57.120, 0's: 0 Z-trim(104.1): 381 B-trim: 431 in 1/48
Lambda= 0.099527
statistics sampled from 7291 (7745) to 7291 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7968.1 OR10W1 gene_id:81341|Hs108|chr11 ( 305) 2003 300.4 1.1e-81
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 1078 167.6 1.1e-41
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 998 156.1 3.2e-38
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 943 148.2 7.6e-36
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 922 145.2 6.4e-35
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 905 142.7 3.3e-34
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 903 142.5 4.1e-34
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 890 140.6 1.5e-33
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 890 140.6 1.5e-33
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 876 138.6 5.9e-33
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 876 138.6 5.9e-33
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 867 137.3 1.5e-32
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 865 137.0 1.8e-32
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 865 137.0 1.8e-32
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 864 136.9 2e-32
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 862 136.6 2.4e-32
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 856 135.7 4.4e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 849 134.7 8.9e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 847 134.4 1.1e-31
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 846 134.3 1.2e-31
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 839 133.3 2.4e-31
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 838 133.1 2.6e-31
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 838 133.1 2.6e-31
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 836 132.8 3.2e-31
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 835 132.7 3.5e-31
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 833 132.4 4.4e-31
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 831 132.1 5.2e-31
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 831 132.1 5.3e-31
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 831 132.1 5.3e-31
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 821 130.7 1.4e-30
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 820 130.5 1.6e-30
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 820 130.6 1.7e-30
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 819 130.5 1.9e-30
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 817 130.1 2.1e-30
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 815 129.8 2.6e-30
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 814 129.7 2.9e-30
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 812 129.4 3.5e-30
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 811 129.3 3.9e-30
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 810 129.1 4.3e-30
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 810 129.1 4.3e-30
CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 ( 343) 810 129.2 4.5e-30
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 809 128.9 4.7e-30
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 806 128.5 6.3e-30
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 804 128.3 7.9e-30
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 803 128.1 8.5e-30
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 802 127.9 9.4e-30
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 802 128.0 9.7e-30
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 801 127.8 1e-29
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 801 127.8 1.1e-29
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 800 127.7 1.1e-29
>>CCDS7968.1 OR10W1 gene_id:81341|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 2003 init1: 2003 opt: 2003 Z-score: 1579.7 bits: 300.4 E(32554): 1.1e-81
Smith-Waterman score: 2003; 99.7% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEFVFLAYPSCPELHILSFLGVSLVYGLIITGNILIVVSIHTETCLCTSMYYFLGSLSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MEFVFLAYPSCPELHILSFLGVSLVYGLIITGNILIVVSIHTETCLCTSMYYFLGSLSGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EICYTAVVVPHILANTLQSEKTITLLGCATQMAFFIALGSADCFLLAAMAYDRYVAICHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 EICYTAVVVPHILANTLQSEKTITLLGCATQMAFFIALGSADCFLLAAMAYDRYVAICHP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LQYPLLMTLTLCVHLVVASVISGLFLSLQLVAFIFSLPFCQAQGIEHFFCDVPPVMHVVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LQYPLLMTLTLCVHLVVASVISGLFLSLQLVAFIFSLPFCQAQGIEHFFCDVPPVMHVVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AQSHIHEQSVLVAAILAIAVPFFLITTSYTFIVAALLKIHSAAGRHRAFSTCSSHLTVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 AQSHIHEQSVLVAAILAIAVPFFLITTSYTFIVAALLKIHSAAGRHRAFSTCSSHLTVVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LQYGCCAFMYLCPSSSYNPKQDQFISLVYTLGTPLLNPLIYALRNSEMKGAVGRVLTRNC
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LQYGCCAFMYLCPSSSYNPKQDRFISLVYTLGTPLLNPLIYALRNSEMKGAVGRVLTRNC
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LSQNS
:::::
CCDS79 LSQNS
>>CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 1068 init1: 564 opt: 1078 Z-score: 861.7 bits: 167.6 E(32554): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 1078; 53.6% identity (81.5% similar) in 302 aa overlap (2-302:15-316)
10 20 30 40
pF1KE0 MEFVFLAYPSCPELHILSFLGVSLVYGLIITGNILIVVSIHTETCLC
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CCDS31 MPVGKLVFNQSEPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVVCTHSTLR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TSMYYFLGSLSGIEICYTAVVVPHILANTLQSEKTITLLGCATQMAFFIALGSADCFLLA
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CCDS31 TPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQMFFFVTLGSTDCFLLA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 AMAYDRYVAICHPLQYPLLMTLTLCVHLVVASVISGLFLSLQLVAFIFSLPFC-QAQGIE
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CCDS31 IMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGGALGLALFPSLQLTALIFTLPFCGHHQEIN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 HFFCDVPPVMHVVCAQSHIHEQSVLVAAILAIAVPFFLITTSYTFIVAALLKIHSAAGRH
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CCDS31 HFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAILSIRSAEGRR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 RAFSTCSSHLTVVLLQYGCCAFMYLCPSSSYNPKQDQFISLVYTLGTPLLNPLIYALRNS
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CCDS31 RAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVYTFVTPLLNPLLYSLRNK
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE0 EMKGAVGRVLTRNCLSQNS
..:::. .. :. :
CCDS31 DVKGALRSAIIRKAASDAN
310
>>CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 996 init1: 836 opt: 998 Z-score: 799.7 bits: 156.1 E(32554): 3.2e-38
Smith-Waterman score: 998; 47.5% identity (79.9% similar) in 299 aa overlap (1-298:10-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEFVFLAYPSCPELHILSFLGVSLVYGLIITGNILIVVSIHTETCLCTSMY
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CCDS31 MEGINKTAKMQFFFRPFSPDPEVQMLIFVVFLMMYLTSLGGNATIAVIVQINHSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFLGSLSGIEICYTAVVVPHILANTLQSEKT-ITLLGCATQMAFFIALGSADCFLLAAMA
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CCDS31 FFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGTQMFFFVFLGGADCVLLVVMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICHPLQYPLLMTLTLCVHLVVASVISGLFLSLQLVAFIFSLPFCQAQGIEHFFC
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CCDS31 YDQFIAICHPLRYRLIMSWSLCVELLVGSLVLGFLLSLPLTILIFHLPFCHNDEIYHFYC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DVPPVMHVVCAQSHIHEQSVLVAAILAIAVPFFLITTSYTFIVAALLKIHSAAGRHRAFS
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CCDS31 DMPAVMRLACADTRVHKTALYIISFIVLSIPLSLISISYVFIVVAILRIRSAEGRQQAYS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSSHLTVVLLQYGCCAFMYLCPSSSYNPKQDQFISLVYTLGTPLLNPLIYALRNSEMKG
:::::. :::::::: .:.:: :::::.:.. . .:..::. ::.::::::.:::.:.:
CCDS31 TCSSHILVVLLQYGCTSFIYLSPSSSYSPEMGRVVSVAYTFITPILNPLIYSLRNKELKD
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 AVGRVLTRNCLSQNS
:. ..: .
CCDS31 ALRKALRKF
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 943 init1: 943 opt: 943 Z-score: 757.0 bits: 148.2 E(32554): 7.6e-36
Smith-Waterman score: 943; 44.0% identity (80.1% similar) in 302 aa overlap (2-303:11-312)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEFVFLAYPSCPELHILSFLGVSLVYGLIITGNILIVVSIHTETCLCTSMY
::..:.. . ::... :. .: . . ::.:::. .. : : ::
CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFLGSLSGIEICYTAVVVPHILANTLQSEKTITLLGCATQMAFFIALGSADCFLLAAMAY
.:: .:: .:.:.: :.::..:.. .. .: :...::.::: ::. .::..::::. :::
CCDS31 FFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DRYVAICHPLQYPLLMTLTLCVHLVVASVISGLFLSLQLVAFIFSLPFCQAQGIEHFFCD
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CCDS31 DRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VPPVMHVVCAQSHIHEQSVLVAAILAIAVPFFLITTSYTFIVAALLKIHSAAGRHRAFST
:::...: ... ..:...:....: : :: :: .::: :. ..:.. ::.::..::::
CCDS31 GPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CSSHLTVVLLQYGCCAFMYLCPSSSYNPKQDQFISLVYTLGTPLLNPLIYALRNSEMKGA
::::: :: : :: .. :: :.:. .:.. ...:: ::. ::.:::.::.:::.:.:::
CCDS31 CSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 VGRVLTRNCLSQNS
: :..:.. :..
CCDS31 VKRTITQKVLQKLDVF
310
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 967 init1: 922 opt: 922 Z-score: 740.4 bits: 145.2 E(32554): 6.4e-35
Smith-Waterman score: 922; 42.8% identity (79.1% similar) in 297 aa overlap (2-298:31-327)
10 20 30
pF1KE0 MEFVFLAYPSCPELHILSFLGVSLVYGLIIT
::..:.. : :... :. ..: .:..
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GNILIVVSIHTETCLCTSMYYFLGSLSGIEICYTAVVVPHILANTLQSEKTITLLGCATQ
::. :. :: . : : ::.::: :: : :: :..:..: : :. .::.. :: :
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 MAFFIALGSADCFLLAAMAYDRYVAICHPLQYPLLMTLTLCVHLVVASVISGLFLSLQLV
: ::.... ..:.::..:.::::.::::::.:: ::. .: .:..: .:.:.. :: .:
CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AFIFSLPFCQAQGIEHFFCDVPPVMHVVCAQSHIHEQSVLVAAILAIAVPFFLITTSYTF
..::::::.:. ..:.:::. :. ..:... ..: ... ..:...:::..: .::
CCDS30 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYLC
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 IVAALLKIHSAAGRHRAFSTCSSHLTVVLLQYGCCAFMYLCPSSSYNPKQDQFISLVYTL
:. ..::: :: ::..:::::.:::.::...::: .:.:: :...: ..:......::.
CCDS30 ILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYTI
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE0 GTPLLNPLIYALRNSEMKGAVGRVLTRNCLSQNS
::::::..:.:::.... :. .:: .
CCDS30 VTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
310 320 330
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 948 init1: 901 opt: 905 Z-score: 727.5 bits: 142.7 E(32554): 3.3e-34
Smith-Waterman score: 905; 43.7% identity (77.2% similar) in 302 aa overlap (2-298:11-312)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEFVFLAYPSCPELHILSFLGVSLVYGLIITGNILIVVSIHTETCLCTSMY
.::::.. : ::..: : .: . .:.:..:...:. .. : : ::
CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFLGSLSGIEICYTAVVVPHILANTLQSEKTITLLGCATQMAFFIALGSADCFLLAAMAY
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CCDS30 LFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWACTNCFLLAAMGF
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CCDS30 DRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMTLVIFHLSFCSSHEIQHFFCD
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CCDS30 TPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIPSAEGQKKAFST
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CCDS30 CASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIVYSLRNRAIQTA
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300
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310
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CCDS77 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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CCDS77 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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CCDS77 ALSRTFHKVLALRNCIP
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CCDS34 FLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAYD
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CCDS34 RYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCEI
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CCDS34 QPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFSTC
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CCDS31 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLF-GVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPM
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CCDS31 AYDRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLF
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CCDS31 CETPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAF
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.. .. :. .
CCDS31 RTLIKLWRRKVILHTF
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CCDS31 T
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]