Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0867
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0867, 309 aa
1>>>pF1KE0867 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7168+/-0.00115; mu= 12.9774+/- 0.068
mean_var=163.6641+/-58.192, 0's: 0 Z-trim(103.4): 392 B-trim: 402 in 1/49
Lambda= 0.100253
statistics sampled from 6904 (7388) to 6904 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 2014 304.2 8.4e-83
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 1165 181.4 7.8e-46
CCDS7968.1 OR10W1 gene_id:81341|Hs108|chr11 ( 305) 1004 158.1 7.8e-39
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 994 156.7 2.2e-38
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 951 150.5 1.6e-36
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 950 150.3 1.8e-36
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 949 150.2 2e-36
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 946 149.7 2.6e-36
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 946 149.7 2.6e-36
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 946 149.7 2.7e-36
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 933 147.9 9.8e-36
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 932 147.7 1.1e-35
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 931 147.6 1.2e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 931 147.6 1.2e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 928 147.1 1.6e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 927 147.0 1.8e-35
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 926 146.8 2e-35
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 923 146.4 2.7e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 918 145.8 4.8e-35
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 911 144.7 8.9e-35
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 910 144.5 1e-34
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 908 144.2 1.2e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 906 144.0 1.5e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 903 143.5 2e-34
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 902 143.4 2.2e-34
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 899 142.9 3e-34
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 898 142.8 3.5e-34
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 897 142.7 3.7e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 896 142.5 4e-34
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 893 142.0 5.3e-34
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 891 141.8 6.6e-34
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 890 141.6 7.2e-34
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 890 141.6 7.3e-34
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 888 141.4 9e-34
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 886 141.1 1.1e-33
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 882 140.6 1.8e-33
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 880 140.2 2e-33
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 879 140.0 2.2e-33
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 879 140.0 2.2e-33
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 878 139.9 2.4e-33
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 878 139.9 2.4e-33
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 877 139.7 2.7e-33
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 876 139.6 3e-33
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 876 139.6 3e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 875 139.5 3.3e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 872 139.0 4.4e-33
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 872 139.0 4.5e-33
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 870 138.7 5.4e-33
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 867 138.3 7.4e-33
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 866 138.2 8.1e-33
>>CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 2014 init1: 2014 opt: 2014 Z-score: 1600.1 bits: 304.2 E(32554): 8.4e-83
Smith-Waterman score: 2014; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGINKTAKMQFFFRPFSPDPEVQMLIFVVFLMMYLTSLGGNATIAVIVQINHSLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEGINKTAKMQFFFRPFSPDPEVQMLIFVVFLMMYLTSLGGNATIAVIVQINHSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGTQMFFFVFLGGADCVLLVVMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGTQMFFFVFLGGADCVLLVVMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDQFIAICHPLRYRLIMSWSLCVELLVGSLVLGFLLSLPLTILIFHLPFCHNDEIYHFYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YDQFIAICHPLRYRLIMSWSLCVELLVGSLVLGFLLSLPLTILIFHLPFCHNDEIYHFYC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DMPAVMRLACADTRVHKTALYIISFIVLSIPLSLISISYVFIVVAILRIRSAEGRQQAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DMPAVMRLACADTRVHKTALYIISFIVLSIPLSLISISYVFIVVAILRIRSAEGRQQAYS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCSSHILVVLLQYGCTSFIYLSPSSSYSPEMGRVVSVAYTFITPILNPLIYSLRNKELKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCSSHILVVLLQYGCTSFIYLSPSSSYSPEMGRVVSVAYTFITPILNPLIYSLRNKELKD
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ALRKALRKF
:::::::::
CCDS31 ALRKALRKF
>>CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 1068 init1: 729 opt: 1165 Z-score: 936.3 bits: 181.4 E(32554): 7.8e-46
Smith-Waterman score: 1165; 55.9% identity (81.4% similar) in 306 aa overlap (5-308:9-313)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEGINKTAKMQFFFRPFSPDPEVQMLIFVVFLMMYLTSLGGNATIAVIVQINHSLH
:.. .: :: :. : :.:.:..::..:: : ::..: .: . .:.
CCDS31 MPVGKLVFNQSEPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVVCTHSTLR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TPMYFFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGTQMFFFVFLGGADCVLL
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CCDS31 TPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQK-PISLAGCGAQMFFFVTLGSTDCFLL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VVMAYDQFIAICHPLRYRLIMSWSLCVELLVGSLVLGFLLSLPLTILIFHLPFC-HNDEI
..::::...::::::.: :::. ::...: :.: :... :: :: ::: :::: :..::
CCDS31 AIMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGGALGLALFPSLQLTALIFTLPFCGHHQEI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YHFYCDMPAVMRLACADTRVHKTALYIISFIVLSIPLSLISISYVFIVVAILRIRSAEGR
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CCDS31 NHFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAILSIRSAEGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QQAYSTCSSHILVVLLQYGCTSFIYLSPSSSYSPEMGRVVSVAYTFITPILNPLIYSLRN
..:.:::: :. :::::::: :..:: : :: : . ....:::.::.::::.:::::
CCDS31 RRAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVYTFVTPLLNPLLYSLRN
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 KELKDALRKAL-RKF
:..: :::.:. ::
CCDS31 KDVKGALRSAIIRKAASDAN
300 310
>>CCDS7968.1 OR10W1 gene_id:81341|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 1001 init1: 842 opt: 1004 Z-score: 810.7 bits: 158.1 E(32554): 7.8e-39
Smith-Waterman score: 1004; 47.8% identity (79.9% similar) in 299 aa overlap (10-308:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGINKTAKMQFFFRPFSPDPEVQMLIFVVFLMMYLTSLGGNATIAVIVQINHSLHTPMY
:.: : . ::...: :. ..: . :: :.: .. . : : ::
CCDS79 MEFVFLAYPSCPELHILSFLGVSLVYGLIITGNILIVVSIHTETCLCTSMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGTQMFFFVFLGGADCVLLVVMA
.::..:. .:: ::. ..: ::: :. :: ... ::.::: ::. ::.::: ::..::
CCDS79 YFLGSLSGIEICYTAVVVPHILANTLQSEKT-ITLLGCATQMAFFIALGSADCFLLAAMA
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130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDQFIAICHPLRYRLIMSWSLCVELLVGSLVLGFLLSLPLTILIFHLPFCHNDEIYHFYC
::...::::::.: :.:. .:::.:.:.:.. :..::: :. .:: ::::. . : ::.:
CCDS79 YDRYVAICHPLQYPLLMTLTLCVHLVVASVISGLFLSLQLVAFIFSLPFCQAQGIEHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DMPAVMRLACADTRVHKTALYIISFIVLSIPLSLISISYVFIVVAILRIRSAEGRQQAYS
:.: ::...::....:. .. . .......:. ::. ::.:::.:.:.:.:: ::..:.:
CCDS79 DVPPVMHVVCAQSHIHEQSVLVAAILAIAVPFFLITTSYTFIVAALLKIHSAAGRHRAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCSSHILVVLLQYGCTSFIYLSPSSSYSPEMGRVVSVAYTFITPILNPLIYSLRNKELKD
:::::. :::::::: .:.:: :::::.:.. : .:..::. ::.::::::.:::.:.:
CCDS79 TCSSHLTVVLLQYGCCAFMYLCPSSSYNPKQDRFISLVYTLGTPLLNPLIYALRNSEMKG
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ALRKALRKF
:. ..: .
CCDS79 AVGRVLTRNCLSQNS
300
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 963 init1: 730 opt: 994 Z-score: 802.4 bits: 156.7 E(32554): 2.2e-38
Smith-Waterman score: 994; 47.4% identity (79.3% similar) in 304 aa overlap (5-308:25-327)
10 20 30 40
pF1KE0 MEGINKTAKMQFFFRPFSPDPEVQMLIFVVFLMMYLTSLG
: : .:.. :: :.:. .:::::..::. :.
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 GNATIAVIVQINHSLHTPMYFFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGT
::.:: ......::::::::::. :.. : ::: : : : ::::...: .:.. :.
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVART-ISFNCCAL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 QMFFFVFLGGADCVLLVVMAYDQFIAICHPLRYRLIMSWSLCVELLVGSLVLGFLLSLPL
:::::. .. ..:.:: ::.::.. ::::::.: .:::..: .: .. . ::: :: .
CCDS30 QMFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 TILIFHLPFCHNDEIYHFYCDMPAVMRLACADTRVHKTALYIISFIVLSIPLSLISISYV
. :.: :::: ... :..::. ::. :::..: :.. ...: . .:: .:. .: .::.
CCDS30 VNLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FIVVAILRIRSAEGRQQAYSTCSSHILVVLLQYGCTSFIYLSPSSSYSPEMGRVVSVAYT
:. .::.: :::::..:.:::.::. ::...:::.::::: :...: . :.:.:.::
CCDS30 CILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYT
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE0 FITPILNPLIYSLRNKELKDALRKALRKF
..::.:::..::::::... :.::.: :
CCDS30 IVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
300 310 320 330
>>CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 965 init1: 707 opt: 951 Z-score: 769.1 bits: 150.5 E(32554): 1.6e-36
Smith-Waterman score: 951; 46.4% identity (76.9% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGINKTAKMQFFFRPFSPDPEVQMLIFVVFLMMYLTSLGGNATIAVIVQINHSLHTPMY
:: .:.:. . .: :: ..:.:.::.::..:: .:: :: : . ....:: :::
CCDS30 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGTQMFFFVFLGGADCVLLVVMA
:::: :. :: :: :.: :..:::. :: .:. ::. ::: :.::: . ::.::.
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKT-ISFLGCAIQMFSFLFLGCSHSFLLAVMG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDQFIAICHPLRYRLIMSWSLCVELLVGSLVLGFLLSLPLTILIFHLPFCHNDEIYHFYC
::..::::.:::: ..:. ..:. :.... . :: .. .: :.::::: .....::.:
CCDS30 YDRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFYSSNQLHHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DMPAVMRLACADTRVHKTALYIISFIVLSIPLSLISISYVFIVVAILRIRSAEGRQQAYS
:. :..:: .. . ..... .::.::: :: .::: :. :::.. :. :: .:.:
CCDS30 DIAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFPSTLGRCKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCSSHILVVLLQYGCTSFIYLSPSSSYSPEMGRVVSVAYTFITPILNPLIYSLRNKELKD
:: ::...: ..:::.::::: :.:.:: . ..::.::.:::..::.::::::::.:.
CCDS30 TCVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMIYSLRNKEFKS
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ALRKALRKF
:: : .:.
CCDS30 ALCKIVRRTISLL
300 310
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 746 init1: 472 opt: 950 Z-score: 768.2 bits: 150.3 E(32554): 1.8e-36
Smith-Waterman score: 950; 45.4% identity (77.5% similar) in 306 aa overlap (1-306:12-315)
10 20 30 40
pF1KE0 MEGINKTAKMQFFFRPFSPDPEVQMLIFVVFLMMYLTSLGGNATIAVIV
:. : : .: :. :: : :. .: ::: .:. .:.:: :..:.
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 QINHSLHTPMYFFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGTQMFFFVFLG
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CCDS11 RMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQ-PISLAGCATQMFFFVTFG
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CCDS56 FFLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAK-PISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMS
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