Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0864
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0864, 319 aa
1>>>pF1KE0864 319 - 319 aa - 319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5914+/-0.000968; mu= 13.9384+/- 0.057
mean_var=179.2227+/-61.990, 0's: 0 Z-trim(104.8): 401 B-trim: 464 in 1/49
Lambda= 0.095803
statistics sampled from 7589 (8094) to 7589 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 2.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 2095 302.7 2.6e-82
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 1164 174.0 1.4e-43
CCDS7968.1 OR10W1 gene_id:81341|Hs108|chr11 ( 305) 1077 161.9 5.7e-40
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 1010 152.7 3.6e-37
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 1009 152.6 4.1e-37
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1005 152.0 5.7e-37
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1001 151.4 8.4e-37
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 999 151.1 1e-36
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 981 148.7 5.8e-36
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 960 145.8 4.3e-35
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 955 145.0 6.8e-35
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 952 144.7 9.2e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 952 144.7 9.9e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 944 143.6 2e-34
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 943 143.4 2.2e-34
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 938 142.7 3.5e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 937 142.6 4e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 936 142.5 4.3e-34
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 924 140.8 1.4e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 923 140.7 1.5e-33
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 923 140.7 1.5e-33
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 922 140.5 1.6e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 922 140.5 1.6e-33
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 920 140.2 2e-33
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 919 140.1 2.2e-33
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 919 140.1 2.2e-33
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 917 139.8 2.7e-33
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 916 139.7 2.9e-33
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 915 139.6 3.2e-33
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 909 138.7 5.7e-33
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 907 138.4 6.8e-33
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 906 138.3 7.7e-33
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 905 138.2 8.3e-33
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 905 138.2 8.4e-33
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 903 137.9 1e-32
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 903 138.0 1.1e-32
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 902 137.7 1.1e-32
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 901 137.6 1.2e-32
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 899 137.3 1.5e-32
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 899 137.4 1.6e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 897 137.1 1.8e-32
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 896 136.9 2e-32
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 894 136.6 2.4e-32
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 893 136.6 2.7e-32
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 891 136.2 3.2e-32
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 889 136.0 3.9e-32
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 889 136.0 3.9e-32
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 886 135.5 5.2e-32
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 886 135.6 5.3e-32
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 885 135.4 5.7e-32
>>CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 2095 init1: 2095 opt: 2095 Z-score: 1591.3 bits: 302.7 E(32554): 2.6e-82
Smith-Waterman score: 2095; 99.7% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPVGKLVFNQSDPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVVCTHSTLR
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPVGKLVFNQSEPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVVCTHSTLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQMFFFVTLGSTDCFLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQMFFFVTLGSTDCFLLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 IMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGGALGLALFPSLQLTALIFTLPFCGHHQEIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGGALGLALFPSLQLTALIFTLPFCGHHQEIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAILSIRSAEGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAILSIRSAEGRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVYTFVTPLLNPLLYSLRNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVYTFVTPLLNPLLYSLRNK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 DVKGALRSAIIRKAASDAN
:::::::::::::::::::
CCDS31 DVKGALRSAIIRKAASDAN
310
>>CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1095 init1: 729 opt: 1164 Z-score: 896.0 bits: 174.0 E(32554): 1.4e-43
Smith-Waterman score: 1164; 55.9% identity (81.4% similar) in 306 aa overlap (9-313:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPVGKLVFNQSDPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVVCTHSTLR
:.. .: :: :. : :.:.:..::..:: : ::..: .: . .:.
CCDS31 MEGINKTAKMQFFFRPFSPDPEVQMLIFVVFLMMYLTSLGGNATIAVIVQINHSLH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 TPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQK-PISLAGCGAQMFFFVTLGSTDCFLL
:::::::.::. ::. ::. ..:: :.:.:. : :.:..:::.:::::: ::..:: ::
CCDS31 TPMYFFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGTQMFFFVFLGGADCVLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AIMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGGALGLALFPSLQLTALIFTLPFCGHHQEI
..::::...::::::.: :::. ::...: :.: :... :: :: ::: :::: :..::
CCDS31 VVMAYDQFIAICHPLRYRLIMSWSLCVELLVGSLVLGFLLSLPLTILIFHLPFC-HNDEI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NHFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAILSIRSAEGR
:: ::.: :.:::::: :::...::..:..::.::. :: .:::::. ::: :::::::
CCDS31 YHFYCDMPAVMRLACADTRVHKTALYIISFIVLSIPLSLISISYVFIVVAILRIRSAEGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RRAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVYTFVTPLLNPLLYSLRN
..:.:::: :. :::::::: :..:: : :: : . ....:::.::.::::.:::::
CCDS31 QQAYSTCSSHILVVLLQYGCTSFIYLSPSSSYSPEMGRVVSVAYTFITPILNPLIYSLRN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 KDVKGALRSAIIRKAASDAN
:..: :::.:. ::
CCDS31 KELKDALRKAL-RKF
300
>>CCDS7968.1 OR10W1 gene_id:81341|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 1067 init1: 564 opt: 1077 Z-score: 831.0 bits: 161.9 E(32554): 5.7e-40
Smith-Waterman score: 1077; 53.6% identity (81.1% similar) in 302 aa overlap (15-316:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPVGKLVFNQSDPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVVCTHSTLR
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CCDS79 MEFVFLAYPSCPELHILSFLGVSLVYGLIITGNILIVVSIHTETCLC
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQMFFFVTLGSTDCFLLA
: ::.::..:: .:.:::.:::: .:.: : ..: :.: ::..:: ::..:::.::::::
CCDS79 TSMYYFLGSLSGIEICYTAVVVPHILANTLQSEKTITLLGCATQMAFFIALGSADCFLLA
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130 140 150 160 170 180
pF1KE0 IMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGGALGLALFPSLQLTALIFTLPFCGHHQEIN
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CCDS79 AMAYDRYVAICHPLQYPLLMTLTLCVHLVVASVISGLFLSLQLVAFIFSLPFC-QAQGIE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAILSIRSAEGRR
::.::::::....::. ..:. . :..::....::.:: .::.::. :.:.:.:: ::.
CCDS79 HFFCDVPPVMHVVCAQSHIHEQSVLVAAILAIAVPFFLITTSYTFIVAALLKIHSAAGRH
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVYTFVTPLLNPLLYSLRNK
::::::: ::::::::::::...:: : :: . .: :.::::. :::::::.:.:::.
CCDS79 RAFSTCSSHLTVVLLQYGCCAFMYLCPSSSYNPKQDRFISLVYTLGTPLLNPLIYALRNS
230 240 250 260 270 280
310
pF1KE0 DVKGALRSAIIRKAASDAN
..:::. .. :. :
CCDS79 EMKGAVGRVLTRNCLSQNS
290 300
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1006 init1: 546 opt: 1010 Z-score: 780.8 bits: 152.7 E(32554): 3.6e-37
Smith-Waterman score: 1010; 48.5% identity (80.1% similar) in 297 aa overlap (14-310:21-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MPVGKLVFNQSDPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVV
:.:::..:.. : :. :: .:: ::.. : :: :. ..
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 CTHSTLRTPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQMFFFVTLGS
:.:::::::: :: : :: :..: :::...: ..:::::::..:::::::.:
CCDS11 RMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFGI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TDCFLLAIMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGGALGLALFPSLQLTALIFTLPFC
:.::::. :.::::::::.::.: .::...: :.. :: ...:. .. .. .: ::::
CCDS11 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GHHQEINHFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAILSI
. ... ::.::. ::..:.: : :.. . ..:.:::..:. :. .:::.: .::.:
CCDS11 A--RKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKI
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RSAEGRRRAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVYTFVTPLLNPL
:.:::..::.::. :::::...:.: :..::.:.: .....:. :...:: .::::::.
CCDS11 ASVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 LYSLRNKDVKGALRSAIIRKAASDAN
.:.::::.:: :: :.
CCDS11 VYTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
300 310 320
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 1014 init1: 505 opt: 1009 Z-score: 779.8 bits: 152.6 E(32554): 4.1e-37
Smith-Waterman score: 1009; 47.0% identity (80.0% similar) in 315 aa overlap (2-315:18-330)
10 20 30 40
pF1KE0 MPVGKLVFNQSDPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILC
:. :. : . :::.. .:.. :.:. ::..::.:::.::
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 GNTAIIWVVCTHSTLRTPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQ
::..:: :. ..:.:::::::. :: : :: :..: :: :.:.. . ::. :. :
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 MFFFVTLGSTDCFLLAIMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGG-ALGLALFPSLQL
::::. .. :.:.::..:.::::.:::::::: .:. ..: .. .. :.: ... :: .
CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIG-GFLASLTV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 TALIFTLPFCGHHQEINHFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSY
. :.:.::::. .. .::..::. :. :::.. :.. :... ..:::..:::.:::::
CCDS30 VNLVFSLPFCSANK-VNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VFITCAILSIRSAEGRRRAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVY
. : .::.: ::::::.:::::. ::.::...::: :..:::: .. ..: ....:
CCDS30 LCILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTY
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE0 TFVTPLLNPLLYSLRNKDVKGALRSAIIRKAASDAN
:.:::::::..::::::::. :.:... .:..
CCDS30 TIVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
300 310 320 330
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1031 init1: 510 opt: 1005 Z-score: 777.1 bits: 152.0 E(32554): 5.7e-37
Smith-Waterman score: 1005; 50.8% identity (77.7% similar) in 301 aa overlap (9-309:5-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPVGKLVFNQSDPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVVCTHSTLR
: .. .::: .:... :.:.::: ::: :::. : .:. :: .. : :.
CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS30 KEVKDALCRVVGRNIS
300
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