FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0862, 313 aa
1>>>pF1KE0862 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6556+/-0.00124; mu= 14.1406+/- 0.073
mean_var=186.1446+/-69.150, 0's: 0 Z-trim(101.5): 390 B-trim: 401 in 1/47
Lambda= 0.094005
statistics sampled from 6066 (6529) to 6066 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 2.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 2019 287.2 1.1e-77
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CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 1170 172.1 5.2e-43
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1086 160.7 1.4e-39
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CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1000 149.0 4.4e-36
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 1000 149.0 4.4e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 999 148.9 4.8e-36
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CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 968 144.7 9e-35
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CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 949 142.1 5.3e-34
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 948 142.0 5.8e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 944 141.5 8.6e-34
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CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 921 138.3 7.4e-33
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CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 920 138.2 8.2e-33
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 919 138.0 8.9e-33
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 916 137.7 1.2e-32
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 914 137.3 1.4e-32
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 912 137.1 1.7e-32
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 911 137.0 1.9e-32
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 907 136.4 2.7e-32
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 907 136.4 2.7e-32
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 902 135.7 4.4e-32
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 900 135.5 5.3e-32
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 898 135.2 6.4e-32
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 894 134.7 9.4e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 887 133.7 1.8e-31
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 884 133.3 2.4e-31
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 883 133.1 2.6e-31
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 881 132.9 3.2e-31
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 880 132.7 3.5e-31
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 880 132.8 3.5e-31
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 880 132.8 3.5e-31
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 880 132.8 3.5e-31
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 879 132.6 3.8e-31
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2019 Z-score: 1508.2 bits: 287.2 E(32554): 1.1e-77
Smith-Waterman score: 2019; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACGFTVSLVTTSLVFHLPFHSSNQLHHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACGFTVSLVTTSLVFHLPFHSSNQLHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKEFKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKEFKSA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LRRTIGQTFYPLS
:::::::::::::
CCDS30 LRRTIGQTFYPLS
310
>>CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1768 init1: 1723 opt: 1724 Z-score: 1292.0 bits: 247.2 E(32554): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 1724; 84.5% identity (95.8% similar) in 309 aa overlap (1-305:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
::.::.::::: . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS30 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGY
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: :::::::.:::
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFLGCSHSFLLAVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACGFTVSLVTTSLVFHLPFHSSNQLHHFFCD
:::.::::::::::::::::::::.::::::::::. . :::::::::.:::::::::::
CCDS30 DRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFYSSNQLHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTFST
:.:::::::.:. :::.::::: ...:.::::::::::..:.::::..::..:: :.:::
CCDS30 IAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFPSTLGRCKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKEFKSA
:.::::.:::::.:::::::::..::.::::.::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS30 CVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMIYSLRNKEFKSA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 L----RRTIGQTFYPLS
: ::::
CCDS30 LCKIVRRTISLL
310
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 1188 init1: 1144 opt: 1170 Z-score: 885.6 bits: 172.1 E(32554): 5.2e-43
Smith-Waterman score: 1170; 59.2% identity (83.9% similar) in 304 aa overlap (5-307:25-327)
10 20 30 40
pF1KE0 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLG
: :.: ::..::::::...: :::.::.::: :.
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TNAIIISTIVLDRALHTPMYFFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQ
:. :::.: ::..:::::::::.::: :: :::::.::::..::: .:::: ::.:
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
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110 120 130 140 150
pF1KE0 MFSFLFFGSSHSFLLAAMGYDRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACG-FTVSLVT
:: :: :. .. .::..:::::: :::.::.: .::. :: : .::::: : : .::..
CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVC-GKLAAACAIGGFLASLTV
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160 170 180 190 200 210
pF1KE0 TSLVFHLPFHSSNQLHHFFCDISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYI
..::: ::: :.:...:.::::: :. :: .. ...:::. ::..::.:.:.: :::.
CCDS30 VNLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 RIISAILKIPSSVGRYKTFSTCASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYT
:. .::::::. :: :.:::::::: :: :::.::::::::: .::.:..: :..:.::
CCDS30 CILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310
pF1KE0 ILTPLFNPMIYSLRNKEFKSALRRTIGQTFYPLS
:.:::.:::.::::::. . :.:...:.
CCDS30 IVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
300 310 320 330
>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MEQVNKT-VVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPM
:. ::: :: .:...:::::..:: ::::::::::: : .:. :...: .. .:::::
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMG
: :: ::: :: ::::::.:..:: :::. :::::..:: :.: :: :. .. .:.:.::
CCDS30 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACGFTVSLVTTSLVFHLPFHSSNQLHHFFC
::::.:::.::::...... . . :.. . : :: ..::.:.:. . : . :...:.::
CCDS30 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTFS
:..::.::: . ..:..: :.......:.::::.:: :...::::::. :. :.:
CCDS30 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGK-KAFV
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKEFKS
:::::: :: :::.:::.::::::.. .:..: :..:.::..:::.::..::::::: :.
CCDS30 TCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVKT
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALRRTIGQTFYPLS
::.:..:
CCDS30 ALKRVLGMPVATKMS
300 310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 1098 init1: 1047 opt: 1063 Z-score: 807.4 bits: 157.6 E(32554): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 1063; 52.2% identity (79.8% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
::. :.:.. ::..::::.: .:: :::.::.: :. ::: : .:: : : : ::::::
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGY
.::. :. .:::: ::.:.: :::.::.::..::..:.:.:.:: .:. .:::::.:
CCDS46 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAAC-ACGFTVSLVTTSLVFHLPFHSSNQLHHFFC
:::.::::::::::.... .: . .::.: : :: :.: : :.: ::: ..::...:::
CCDS46 DRYIAICNPLRYSVILSKVLC-NQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFC
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTFS
:: :.: :. ... ..:... ::: :.: :..::: :::.::.: :: :: :.::
CCDS46 DIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKEFKS
:::::: .: . :. : : :.:: ..:. ..: :.:: :...::..::.::.::::..:
CCDS46 TCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALRRTIGQTFYPLS
:.. :::. . :
CCDS46 AVK-TIGSKWQPPISSLDSKLTY
300 310 320
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1074 init1: 557 opt: 1054 Z-score: 800.8 bits: 156.4 E(32554): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 1054; 51.1% identity (79.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:12-319)
10 20 30 40
pF1KE0 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTI
:.. : :.. .:: ::::. . : :: .:: ::..::. : ::.. :
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 VLDRALHTPMYFFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGS
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CCDS11 RMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFGI
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110 120 130 140 150 160
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CCDS11 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPF-
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SSNQLHHFFCDISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIP
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CCDS11 CARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIA
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230 240 250 260 270 280
pF1KE0 SSVGRYKTFSTCASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMI
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CCDS11 SVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVV
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE0 YSLRNKEFKSALRRTIGQTFYPLS
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CCDS11 YTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
300 310 320
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CCDS12 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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CCDS12 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
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CCDS12 AFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKE
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300 310
pF1KE0 FKSALRRTIGQTFYPLS
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CCDS12 LKVAMKKTFFSKLYPEKNVMM
300 310
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10 20 30 40 50 60
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CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPMY
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CCDS30 TPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIPSAEGQKKAFST
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CCDS30 CASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIVYSLRNRAIQTA
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310
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::
CCDS30 LRNAFRGRLLGKG
310
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CCDS30 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPMY
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CCDS30 FFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMGY
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CCDS30 IYPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFAT
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CCDS30 CVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKDA
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CCDS30 LCRVVGRNIS
300
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CCDS32 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
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CCDS32 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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CCDS32 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]