Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0860
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0860, 309 aa
1>>>pF1KE0860 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6064+/-0.00143; mu= 13.9959+/- 0.083
mean_var=150.5917+/-49.244, 0's: 0 Z-trim(100.2): 410 B-trim: 663 in 2/45
Lambda= 0.104514
statistics sampled from 5480 (6004) to 5480 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.51), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 2002 314.7 5.6e-86
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 1457 232.6 3.1e-61
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 1203 194.3 1.1e-49
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 1056 172.1 4.9e-43
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1055 171.9 5.5e-43
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1039 169.5 2.9e-42
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 1034 168.8 5.1e-42
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1024 167.3 1.4e-41
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 1003 164.1 1.3e-40
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 997 163.2 2.4e-40
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 978 160.3 1.7e-39
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 956 157.0 1.7e-38
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 933 153.5 1.9e-37
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 933 153.5 1.9e-37
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 933 153.6 1.9e-37
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 932 153.4 2.1e-37
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 931 153.2 2.3e-37
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 927 152.6 3.5e-37
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 927 152.6 3.5e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 925 152.3 4.3e-37
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 921 151.7 6.6e-37
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 920 151.6 7.4e-37
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 920 151.6 7.4e-37
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 918 151.3 9e-37
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 918 151.3 9.1e-37
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 917 151.1 1e-36
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 917 151.1 1e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 917 151.1 1e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 915 150.8 1.2e-36
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 913 150.6 1.6e-36
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 912 150.4 1.7e-36
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 908 149.8 2.6e-36
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 907 149.6 2.9e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 903 149.1 4.7e-36
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 902 148.9 4.8e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 902 148.9 4.8e-36
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 902 148.9 4.8e-36
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 901 148.7 5.4e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 900 148.6 6.1e-36
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 896 147.9 8.9e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 894 147.7 1.1e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 893 147.5 1.2e-35
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 892 147.4 1.4e-35
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 891 147.2 1.5e-35
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 891 147.2 1.5e-35
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 890 147.1 1.7e-35
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 888 146.7 2e-35
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 888 146.8 2.2e-35
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 887 146.6 2.3e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 887 146.7 2.5e-35
>>CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 2002 init1: 2002 opt: 2002 Z-score: 1657.0 bits: 314.7 E(32554): 5.6e-86
Smith-Waterman score: 2002; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPFCGTVVDHFFCDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPFCGTVVDHFFCDI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 YPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFATC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFATC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKDAL
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CRVVGRNIS
:::::::::
CCDS30 CRVVGRNIS
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1477 init1: 1457 opt: 1457 Z-score: 1212.7 bits: 232.6 E(32554): 3.1e-61
Smith-Waterman score: 1457; 71.8% identity (89.3% similar) in 309 aa overlap (1-309:12-320)
10 20 30 40
pF1KE0 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTII
:::.::: ...:.: ::::: ..::::: :::..:::::..::::::::
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 CIDHHLHTPMYFFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILAT
.: :::::::::::::..:::::::::.:::: ::. .:::::::::::::::: ..
CCDS11 RMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFGI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 NNCFLLTAMGYDRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPFC
.::::::::::::::::: :::: :::.: : ::: :. .::: .:. .::..: ::::
CCDS11 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPFC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 GTVVDHFFCDIYPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIAS
. : :::::: :::::::::::.:::.. .: .:. ::.::.::::::.::.::.:::
CCDS11 ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIAS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 AEGRKKTFATCVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVY
.:::::.::::.::::::::: .::::::::::::.. :.: ..:::::.::::::::::
CCDS11 VEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVVY
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE0 SLRNKEVKDALCRVVGRNIS
.::::::::::::.:: ..:
CCDS11 TLRNKEVKDALCRAVGGKFS
310 320
>>CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 (329 aa)
initn: 744 init1: 642 opt: 1203 Z-score: 1005.6 bits: 194.3 E(32554): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 1203; 62.7% identity (85.9% similar) in 284 aa overlap (1-282:1-284)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGK-HQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPM
: . : : :.::.: ::::: . :....::::::.:.::: .:.::.::: .::::::::
CCDS30 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTIIRLDHHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMG
:::: ::. ::: ::..:.:.:: .:. .:::. .::::.::.. .. :::::::.::
CCDS30 YFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCATQLFFYLTFGINNCFLLTVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPFCGT-VVDHFFC
:::::::: ::::.:::.: : ::. ::.:::: ::...::..:.:::: . :..::::
CCDS30 YDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQVTSVFGLPFCDAFVISHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DIYPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFA
:. ..::.: :::.:::::. :: :. .:.::.::::::.::.::.::::::.::.::
CCDS30 DVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYVLIISTILKIASAEGQKKAFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKD
::.:::::::.: ::::: ::::::.::. .: ..::::: .:
CCDS30 TCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYTHHSPTEPCCVQPEEQGGQRC
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 ALCRVVGRNIS
CCDS30 SAQSRGAKNSVSLMKRGCEGFSFAFINMY
310 320
>>CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1058 init1: 573 opt: 1056 Z-score: 886.1 bits: 172.1 E(32554): 4.9e-43
Smith-Waterman score: 1056; 50.6% identity (80.0% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPMY
:.: : : : : :::::::... : :::.:: .:..:: .: ::.. : .:. :: :::
CCDS30 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMGY
:::..:. :: ::..:::.::..:. ... ::. ::: ::: :..:. .. :::..:::
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFLGCSHSFLLAVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 DRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPFCGTV-VDHFFCD
:::.::: ::::.:.:..:.: :: .. . :.:.: . .. .:.::: .. . :::::
CCDS30 DRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFYSSNQLHHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IYPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFAT
: ::.::. . ...:. . . ..:. .:. ::..::: ..:.:::. :. :: :.:.:
CCDS30 IAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFPSTLGRCKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKDA
::::: .: :: ::::. ::.:.:. : .: ..::.:::::::.::..::::::: :.:
CCDS30 CVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMIYSLRNKEFKSA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 LCRVVGRNIS
::..: :.::
CCDS30 LCKIVRRTISLL
310
>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 1031 init1: 799 opt: 1055 Z-score: 885.2 bits: 171.9 E(32554): 5.5e-43
Smith-Waterman score: 1055; 52.3% identity (82.6% similar) in 304 aa overlap (7-309:8-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPM
: :..::..::::.:. :. :::.:: .:. ::::. :...: .. :::::
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMG
: :: .:. ::. ::.::.:..:. :. .. ::. .::::.:::. .: .::.:...::
CCDS30 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPFCG-TVVDHFFC
::::::::.:::::.:..: : .:. : . :. .:.. .. . .. ::: . :.:.::
CCDS30 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DIYPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFA
:. ::.::.: :: ..:. ...: .::.::. ::.::: .....::.: :::: ::.:.
CCDS30 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEG-KKAFV
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKD
::.::::::.:: ::::: ::.:::.:. .:: ...::::..::::::.::::::::::
CCDS30 TCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVKT
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 ALCRVVGRNIS
:: ::.: ..
CCDS30 ALKRVLGMPVATKMS
300 310
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1041 init1: 554 opt: 1039 Z-score: 872.2 bits: 169.5 E(32554): 2.9e-42
Smith-Waterman score: 1039; 51.8% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (1-300:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPMY
: . : : .:.:::::: :. :. ::..::..:..::..:..:. : .: :::::::
CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 FFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMGY
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