Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0859
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0859, 329 aa
1>>>pF1KE0859 329 - 329 aa - 329 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6044+/-0.00111; mu= 14.4425+/- 0.065
mean_var=144.4167+/-46.903, 0's: 0 Z-trim(103.6): 372 B-trim: 863 in 2/48
Lambda= 0.106725
statistics sampled from 6999 (7482) to 6999 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 2192 350.0 1.6e-96
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 1260 206.4 2.5e-53
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 1203 197.6 1.1e-50
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 988 164.6 1e-40
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 964 160.9 1.3e-39
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 948 158.4 7e-39
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 939 157.0 1.8e-38
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 929 155.5 5.4e-38
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 919 153.9 1.5e-37
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 918 153.8 1.7e-37
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 916 153.5 2.1e-37
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 907 152.1 5.6e-37
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 886 148.9 5.3e-36
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 872 146.7 2.3e-35
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 844 142.4 4.6e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 843 142.2 5.2e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 835 141.0 1.2e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 832 140.5 1.7e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 831 140.4 1.8e-33
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 831 140.4 1.8e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 831 140.4 1.9e-33
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 824 139.3 4e-33
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 821 138.8 5.4e-33
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 812 137.4 1.4e-32
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 811 137.3 1.6e-32
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 811 137.3 1.6e-32
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 807 136.8 2.6e-32
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 806 136.5 2.7e-32
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 805 136.3 2.9e-32
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 805 136.4 3e-32
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 804 136.2 3.3e-32
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 799 135.5 5.7e-32
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 799 135.5 6e-32
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 797 135.1 7e-32
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 797 135.1 7e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 795 134.8 8.7e-32
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 794 134.7 9.7e-32
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 791 134.2 1.3e-31
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 790 134.1 1.5e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 789 133.9 1.6e-31
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 788 133.8 1.8e-31
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 788 133.8 1.9e-31
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 787 133.6 2e-31
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 787 133.6 2e-31
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 787 133.6 2e-31
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 786 133.5 2.3e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 785 133.3 2.5e-31
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 784 133.1 2.8e-31
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 782 132.9 3.7e-31
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 781 132.7 3.8e-31
>>CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 (329 aa)
initn: 2192 init1: 2192 opt: 2192 Z-score: 1846.4 bits: 350.0 E(32554): 1.6e-96
Smith-Waterman score: 2192; 100.0% identity (100.0% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-329)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTIIRLDHHLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTIIRLDHHLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCATQLFFYLTFGINNCFLLTVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCATQLFFYLTFGINNCFLLTVMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQVTSVFGLPFCDAFVISHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQVTSVFGLPFCDAFVISHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYVLIISTILKIASAEGQKKAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYVLIISTILKIASAEGQKKAFA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYTHHSPTEPCCVQPEEQGGQRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYTHHSPTEPCCVQPEEQGGQRC
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 SAQSRGAKNSVSLMKRGCEGFSFAFINMY
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SAQSRGAKNSVSLMKRGCEGFSFAFINMY
310 320
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1183 init1: 668 opt: 1260 Z-score: 1071.0 bits: 206.4 E(32554): 2.5e-53
Smith-Waterman score: 1260; 68.0% identity (88.7% similar) in 284 aa overlap (1-284:12-293)
10 20 30 40
pF1KE0 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTI
: . : :..:.:.:.:::::..: ....: :::.::.:::.::.::.::
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQ-QITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 IRLDHHLHTPMYFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCATQLFFYLTFG
::.: :::::::::: ::: ::: ::..:.:.:::.:.. :::. .::::.::..:::
CCDS11 IRMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 INNCFLLTVMGYDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQVTSVFGLPF
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CCDS11 ITNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 CDAFVISHFFCDVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYVLIISTILKI
: : . :::::.: ..::.: :::::::.....:: :::.:::::::::::::::::::
CCDS11 C-ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ASAEGQKKAFATCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYTHHSPTEPCC
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CCDS11 ASVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE0 VQPEEQGGQRCSAQSRGAKNSVSLMKRGCEGFSFAFINMY
CCDS11 VYTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
300 310 320
>>CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 744 init1: 642 opt: 1203 Z-score: 1023.8 bits: 197.6 E(32554): 1.1e-50
Smith-Waterman score: 1203; 62.7% identity (85.9% similar) in 284 aa overlap (1-284:1-282)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTIIRLDHHLHTPM
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CCDS30 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGK-HQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCATQLFFYLTFGINNCFLLTVMG
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CCDS30 YFFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQVTSVFGLPFCDAFVISHFFC
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CCDS30 YDRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPFCGT-VVDHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYVLIISTILKIASAEGQKKAFA
:. ..::.: :::.:::::. :: :. .:.::.::::::.::.::.::::::.::.::
CCDS30 DIYPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYTHHSPTEPCCVQPEEQGGQRC
::.:::::::.: ::::: ::::::.::. .: ..::::: .:
CCDS30 TCVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKD
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE0 SAQSRGAKNSVSLMKRGCEGFSFAFINMY
CCDS30 ALCRVVGRNIS
300
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 933 init1: 933 opt: 988 Z-score: 844.5 bits: 164.6 E(32554): 1e-40
Smith-Waterman score: 988; 50.3% identity (78.1% similar) in 310 aa overlap (5-313:25-333)
10 20 30 40
pF1KE0 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTL
: :.:::::. ::::. . .:..::::: :::. :
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLG-EIQLALFVVFLFLYLVIL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SGNVIIMTIIRLDHHLHTPMYFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCAT
:::: :...:.::. ::::::::: .:: ::: :: .:.:.:: .::. . :. . ::
CCDS30 SGNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCAL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 QLFFYLTFGINNCFLLTVMGYDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQ
:.::.: :.:.::.:: :::::::.:::.::.: ..:. ..: .::.. :. ...
CCDS30 QMFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 VTSVFGLPFCDAFVISHFFCDVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYV
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CCDS30 VNLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LIISTILKIASAEGQKKAFATCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYT
:. ::::: ::::..:::.::::::.:::.::::::.:::.: .. ..:::..::::
CCDS30 CILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE0 HHSPT-EPCCVQPEEQGGQRCSAQSRGAKNSVSLMKRGCEGFSFAFINMY
.: .: . ... : . : :.:..:
CCDS30 IVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
300 310 320 330
>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 769 init1: 703 opt: 964 Z-score: 824.8 bits: 160.9 E(32554): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 964; 53.0% identity (80.6% similar) in 279 aa overlap (6-284:7-283)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTIIRLDHHLHTP
.: ::.:.. ::::. . .:..::.:: ::: : .:: ::..::.. ::::
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLG-ELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MYFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCATQLFFYLTFGINNCFLLTVM
:: :: .::.::.::: .:::..: ::. . :. ..:::::::.: :. .::.:..::
CCDS30 MYGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GYDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQVTSVFGLPFCDAFVISHFF
:::::::::.::::..:..:: ..: : : . :. .:.: .. . . :: ..:.:
CCDS30 GYDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CDVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYVLIISTILKIASAEGQKKAF
::. ..::::::: :.:. : .:. :...:. :..::: .:..::::: :::: ::::
CCDS30 CDMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEG-KKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ATCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYTHHSPTEPCCVQPEEQGGQR
.:::::::::..::::::::::.:::.:. .:.:..:::: .:
CCDS30 VTCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 CSAQSRGAKNSVSLMKRGCEGFSFAFINMY
CCDS30 TALKRVLGMPVATKMS
300 310
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 906 init1: 906 opt: 948 Z-score: 811.5 bits: 158.4 E(32554): 7e-39
Smith-Waterman score: 948; 52.6% identity (78.2% similar) in 289 aa overlap (1-284:1-283)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTIIRLDHHLHTPM
: . : : .:.: :::: . .:..:..::.:::.::..::.:. :::: ::::::
CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSS-SGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPM
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