Result of FASTA (omim) for
pF1KE0858
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0858, 315 aa
1>>>pF1KE0858 315 - 315 aa - 315 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1942+/-0.000412; mu= 16.7873+/- 0.025
mean_var=108.4945+/-29.349, 0's: 0 Z-trim(111.1): 353 B-trim: 1080 in 1/50
Lambda= 0.123132
statistics sampled from 19104 (19633) to 19104 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 6.280
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 948 179.7 7e-45
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 866 165.1 1.7e-40
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 866 165.1 1.7e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 866 165.1 1.7e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 853 162.8 8.4e-40
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 852 162.6 9.3e-40
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 834 159.4 8.9e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 831 158.9 1.2e-38
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 830 158.7 1.4e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 807 154.6 2.4e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 807 154.6 2.4e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 807 154.6 2.4e-37
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 805 154.3 3.1e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 802 153.7 4.5e-37
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 801 153.5 4.9e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 787 151.1 2.8e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 786 150.9 3.2e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 781 150.0 5.9e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 763 146.8 5.4e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 722 139.5 8.4e-33
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 566 111.8 1.9e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 564 111.5 2.4e-24
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 201 47.0 6.6e-05
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 201 47.0 6.8e-05
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 201 47.0 6.8e-05
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 201 47.0 6.8e-05
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 201 47.0 6.8e-05
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 201 47.1 7e-05
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 201 47.1 7e-05
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 201 47.1 7e-05
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 201 47.1 7.2e-05
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 199 46.6 7.6e-05
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 199 46.6 7.6e-05
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 199 46.6 7.6e-05
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 196 46.2 0.00013
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 196 46.2 0.00013
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 194 45.7 0.00015
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 194 45.8 0.00016
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 193 45.6 0.00017
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 193 45.6 0.00017
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 192 45.4 0.00019
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 192 45.4 0.00019
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 190 45.0 0.00024
XP_016881180 (OMIM: 600377) PREDICTED: galanin rec ( 269) 186 44.2 0.00035
NP_000789 (OMIM: 126453,143465,606798) D(1B) dopam ( 477) 188 44.9 0.0004
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 185 44.2 0.0005
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 185 44.2 0.0005
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 185 44.3 0.00055
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 183 43.9 0.00063
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 182 43.6 0.00065
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 968 init1: 539 opt: 948 Z-score: 926.8 bits: 179.7 E(85289): 7e-45
Smith-Waterman score: 948; 48.2% identity (76.7% similar) in 313 aa overlap (5-315:5-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFP-HLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE0 YDRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTI-LVVMIPC-LLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA
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pF1KE0 FSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKEL
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NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV
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300 310
pF1KE0 KVAMKKTCFTKLFPQNC
: :...: : .::
NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 835 init1: 539 opt: 866 Z-score: 848.1 bits: 165.1 E(85289): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 866; 45.1% identity (73.7% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE0 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE0 VPPLLKLACGD----DVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRN
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGA-LVMITP----FLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRW
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pF1KE0 KAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNK
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XP_011 KAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNR
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300 310
pF1KE0 ELKVAMKKTCFTKLFPQNC
:: :.::
XP_011 YLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 835 init1: 539 opt: 866 Z-score: 848.1 bits: 165.1 E(85289): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 866; 45.1% identity (73.7% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE0 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE0 VPPLLKLACGD----DVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRN
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGA-LVMITP----FLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRW
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pF1KE0 KAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNK
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NP_036 KAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNR
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300 310
pF1KE0 ELKVAMKKTCFTKLFPQNC
:: :.::
NP_036 YLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 835 init1: 539 opt: 866 Z-score: 847.9 bits: 165.1 E(85289): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 866; 45.1% identity (73.7% similar) in 308 aa overlap (1-304:11-313)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVW
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE0 SERSLHMPMYLFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE0 HSFLLTVMGYDRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE0 HKEIHHFFCHVPPLLKLACGD----DVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAI
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGA-LVMITP----FLCILASYMHITCTV
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pF1KE0 LKIPSAEGRNKAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFL
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XP_011 LKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPML
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pF1KE0 SPIIFSLRNKELKVAMKKTCFTKLFPQNC
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XP_011 NPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 870 init1: 555 opt: 853 Z-score: 835.6 bits: 162.8 E(85289): 8.4e-40
Smith-Waterman score: 853; 43.6% identity (73.3% similar) in 307 aa overlap (5-310:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE0 MYLFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVM
::.:: ::.... : :.:.::...:: ..::.. .:: :..: .:. :.::.:..:
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE0 GYDRYVAICHPLRYNVLMSLRG-CTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMS-RGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHF
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pF1KE0 FCHVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNK
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NP_006 FCDLPPLLKLSC-TDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
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pF1KE0 AFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKE
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 LKVAMKKTCFTKLFPQNC
.: : .:. .:.
NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 852; 42.3% identity (76.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
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NP_003 APALLILA-STDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFS
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
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NP_003 TCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKS--VSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 AMKKTCFTKLFPQNC
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NP_003 ALRKVA-TRNFP
300
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 773 init1: 288 opt: 834 Z-score: 817.1 bits: 159.4 E(85289): 8.9e-39
Smith-Waterman score: 834; 42.9% identity (73.8% similar) in 317 aa overlap (1-311:1-313)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MQGLNHTS-VSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRS----IAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TVMGYDRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIH
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HFFCHVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLV-CITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEG
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTD--MSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAG
190 200 210 220 230
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pF1KE0 RNKAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLR
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NP_003 RYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 NKELKVAMKKTCFTKLFPQNC
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NP_003 NQEVKRAL--CCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 815 init1: 534 opt: 831 Z-score: 814.6 bits: 158.9 E(85289): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 831; 41.1% identity (77.8% similar) in 302 aa overlap (4-304:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
10 20 30 40 50
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pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMF-FSFSFGFTHSFLLTVMG
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLG-AEMVLFTTMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFC
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NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC
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pF1KE0 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
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NP_001 EIPPLLALSCSP-VRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAF
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pF1KE0 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
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NP_001 STCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 VAMKKTCFTKLFPQNC
....:
NP_001 AGIRKVFAFLKH
300
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 832 init1: 557 opt: 830 Z-score: 813.5 bits: 158.7 E(85289): 1.4e-38
Smith-Waterman score: 830; 42.3% identity (76.2% similar) in 298 aa overlap (5-302:5-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE0 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVN-IVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
190 200 210 220 230
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pF1KE0 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 AMKKTCFTKLFPQNC
:.
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 809 init1: 507 opt: 807 Z-score: 791.4 bits: 154.6 E(85289): 2.4e-37
Smith-Waterman score: 807; 43.1% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (5-304:5-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 VPPLLKLACGD----DVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRN
. ...::: : .: ...... : :. : :.:::: :...:::: : :::.
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVL-----LMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]