Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0856
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0856, 316 aa
1>>>pF1KE0856 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8200+/-0.00122; mu= 13.0822+/- 0.071
mean_var=167.1175+/-55.260, 0's: 0 Z-trim(103.0): 413 B-trim: 387 in 1/48
Lambda= 0.099212
statistics sampled from 6680 (7201) to 6680 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 2101 313.7 1.2e-85
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 1889 283.3 1.7e-76
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 1496 227.1 1.4e-59
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 1480 224.8 7e-59
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 1457 221.5 6.8e-58
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 961 150.5 1.6e-36
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 934 146.6 2.3e-35
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 933 146.5 2.6e-35
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 896 141.3 1.1e-33
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 888 140.1 2.3e-33
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 887 139.9 2.5e-33
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 884 139.5 3.4e-33
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 873 137.9 1e-32
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 868 137.2 1.6e-32
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 868 137.2 1.6e-32
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 855 135.3 5.9e-32
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 849 134.5 1.1e-31
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 840 133.2 2.6e-31
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 840 133.2 2.7e-31
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 833 132.2 5.2e-31
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 831 131.9 6.3e-31
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 830 131.7 7.1e-31
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 826 131.2 1e-30
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 826 131.2 1e-30
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 826 131.2 1e-30
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 826 131.2 1e-30
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 823 130.8 1.4e-30
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 821 130.5 1.7e-30
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 818 130.0 2.3e-30
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 814 129.4 3.4e-30
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 811 129.0 4.7e-30
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 810 128.9 5.1e-30
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 809 128.7 5.7e-30
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 808 128.6 6.3e-30
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 804 128.0 9.5e-30
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 802 127.7 1.1e-29
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 802 127.7 1.1e-29
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 801 127.6 1.3e-29
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 800 127.4 1.4e-29
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 795 126.7 2.3e-29
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 794 126.6 2.5e-29
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 794 126.6 2.5e-29
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 794 126.6 2.6e-29
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 793 126.5 2.8e-29
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 792 126.3 3.1e-29
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 790 126.0 3.8e-29
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 788 125.7 4.5e-29
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 788 125.7 4.6e-29
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 784 125.2 6.7e-29
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 784 125.2 6.8e-29
>>CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 2101 init1: 2101 opt: 2101 Z-score: 1651.0 bits: 313.7 E(32554): 1.2e-85
Smith-Waterman score: 2101; 99.4% identity (99.7% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MPGQNYRTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS12 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
::::::::::::::::
CCDS12 NAINKNFCRRFCPLSS
310
>>CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 1889 init1: 1889 opt: 1889 Z-score: 1487.0 bits: 283.3 E(32554): 1.7e-76
Smith-Waterman score: 1889; 89.9% identity (96.2% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
::.:::: :::: : :::::::.:::.::::::::::::::::::::::.:::.::::::
CCDS32 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
:::::.::.:::::::::::::::::: ::.:::::::: ::::::::::::::::.:::
CCDS32 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
::.::.:::::.::.::::: :::::: ::::::::::::: .:::::::::::::::.:
CCDS32 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
:::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
CCDS32 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
::::::::::: ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
::::::: :.::: ::
CCDS32 NAINKNFYRKFCPPSS
310
>>CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 1515 init1: 1410 opt: 1496 Z-score: 1183.0 bits: 227.1 E(32554): 1.4e-59
Smith-Waterman score: 1496; 72.6% identity (90.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
: : :....::::: ::::::. : .::::.:::.::::::::::::::: :: :::::
CCDS12 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQL-MLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
:::::.::.::::.:::: :::::::: :.:::.:.::: :::::: ::::::::: :::
CCDS12 YLFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
::.::.:::::.::.:::::::: ::. .:::::::::.:: .:.::::::. :.::::
CCDS12 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
:: :::::::... .: .:: :::. ::.::..::.::..::.: ::.:::::::.:.:
CCDS12 HVPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.::: ::..::.:::.::::::: ::. .:.::::::.:.:::::::::::::::::
CCDS12 STCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
:....:
CCDS12 VAMKRTFLSTLYSSGT
300 310
>>CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 (318 aa)
initn: 1507 init1: 1405 opt: 1480 Z-score: 1170.6 bits: 224.8 E(32554): 7e-59
Smith-Waterman score: 1480; 71.2% identity (88.2% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
: :.::...::: :::.::. : .::::.:::.::::::::::::::: :: :::::
CCDS12 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQL-MLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
::::::::.::::.:::: :::::::: :.:::.:.::: :::::: ::::::::: :::
CCDS12 YLFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
::.::.:::::.::.:::::::: ::. .:::: ::::.:: .:::.::: . :::: :
CCDS12 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFAC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
:: :::::::. . : :: :::.:::.::..::.::..::.::::.:::::::.:.:
CCDS12 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.:::::::.::.:::.::::::. .:. .:.::. ::::.:::::::::::::::::
CCDS12 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
:..:.: .. :
CCDS12 VAMKKTFFSKLYPEKNVMM
300 310
>>CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 1462 init1: 1359 opt: 1457 Z-score: 1152.8 bits: 221.5 E(32554): 6.8e-58
Smith-Waterman score: 1457; 70.6% identity (87.2% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
: : :....::::: ::::::. : .::::.:::.::::::::::::::: :: :: ::
CCDS32 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQL-MLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
:::::::::.:::.:::: :::::::: :.:::.:.::: :::::: ::::::::: :::
CCDS32 YLFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
::.::.:::::.::.::: :::. :. .:::: ::::.:: .:::.::: . ::::.:
CCDS32 YDRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
:: :::::::. . : :: :::.:::.::..::.::..::.::::.:::::::.:.:
CCDS32 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.:::::::.::.:::.::::::: .: .:.::. ::::.:::::::::::::::::
CCDS32 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
:..:. .. :
CCDS32 VAMKKTCFTKLFPQNC
300 310
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 554 init1: 554 opt: 961 Z-score: 769.2 bits: 150.5 E(32554): 1.6e-36
Smith-Waterman score: 961; 46.7% identity (79.4% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
: : ... ::.. :::.. . : .::...::..:::: : .:..:. ..: :::::
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLAR-LQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS30 DISPVLKLASQHSGFSQLV-IFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTF
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CCDS30 IQTALRNAFRGRLLGKG
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