FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0854, 332 aa
1>>>pF1KE0854 332 - 332 aa - 332 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5060+/-0.00101; mu= 14.6852+/- 0.059
mean_var=153.2528+/-52.162, 0's: 0 Z-trim(104.4): 384 B-trim: 478 in 1/48
Lambda= 0.103602
statistics sampled from 7387 (7867) to 7387 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 1225 195.7 4.1e-50
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 1198 191.7 6.7e-49
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 1134 182.1 5.1e-46
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 1133 182.0 5.6e-46
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 1120 180.0 2.2e-45
CCDS31701.1 OR10S1 gene_id:219873|Hs108|chr11 ( 331) 1099 176.9 2e-44
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CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 998 161.8 6.7e-40
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CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 966 157.0 1.8e-38
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 952 154.9 7.9e-38
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 951 154.8 8.6e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 947 154.2 1.4e-37
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 944 153.7 1.8e-37
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CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 941 153.3 2.6e-37
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 940 153.1 2.7e-37
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 938 152.9 3.7e-37
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CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 934 152.2 5.1e-37
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CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 925 150.9 1.3e-36
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CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 918 149.8 2.6e-36
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 914 149.2 4e-36
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 914 149.2 4.1e-36
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 912 148.9 4.9e-36
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 910 148.6 6.1e-36
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CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 902 147.4 1.4e-35
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CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 901 147.3 1.6e-35
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 901 147.3 1.6e-35
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 900 147.1 1.7e-35
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 897 146.7 2.4e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 895 146.4 2.9e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 895 146.5 3.1e-35
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 894 146.3 3.2e-35
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 892 146.0 4e-35
>>CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 1242 init1: 1078 opt: 1225 Z-score: 1013.2 bits: 195.7 E(32554): 4.1e-50
Smith-Waterman score: 1225; 60.3% identity (84.1% similar) in 295 aa overlap (30-323:13-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLTV
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CCDS32 MGKTKNTSLDAVVTDFILLGLSHPPNLRSLLFLVFFIIYILTQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRL-HRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGSRIISFGGCV
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CCDS32 LGNLLILLTMWADPKLCARPMYILLGVLSFLDMWLSSVTVPLLILDFTPSIKAIPFGGCV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IQLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLF
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CCDS32 AQLYFFHFLGSTQCFLYTLMAYDRYLAICQPLRYPVLMNGRLCTVLVAGAWVAGSMHGSI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QTSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTFADIGFLALTCFMLILTSY
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CCDS32 QATLTFRLPYCGPNQVDYFICDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDVGVVAASCFMLILLSY
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GYIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPLDGVVAVFYTV
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CCDS32 ANIVNAILKIRTTDGRRRAFSTCGSHLIVVTVYYVPCIFIYLRAGSKDPLDGAAAVFYTV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE0 ITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
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CCDS32 VTPLLNPLIYTLRNQEVKSALKRITAG
290 300 310
>>CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 1223 init1: 1071 opt: 1198 Z-score: 991.4 bits: 191.7 E(32554): 6.7e-49
Smith-Waterman score: 1198; 58.9% identity (82.6% similar) in 299 aa overlap (26-323:5-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLTV
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CCDS32 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQ
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRLH-RPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGSRIISFGGCV
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CCDS32 LGNLLILITVWADPRLHARPMYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IQLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLF
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CCDS32 AQLYFYHFLGSTQCFLYTLMAYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGAL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QTSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTFADIGFLALTCFMLILTSY
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CCDS32 QAILTFRLPYCGPNQVDYFFCDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSY
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GYIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPLDGVVAVFYTV
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CCDS32 IQIIQAILRIHTADGRRRAFSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE0 ITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
:::.:: .:::: :.:.: ::.:.
CCDS32 ITPFLNPLIYTLRNQEVKLALKRMLRSPRTPSEV
280 290 300 310
>>CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 (311 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTS-VSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLT
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CCDS31 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLT
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60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VSGNGLIILTVLVDIRLHRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGS-RIISFGGC
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CCDS31 VLGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSC
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pF1KE0 VIQLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSL
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CCDS31 VAQLYFFHFLGSTECFLYTVMSYDRYLAISYPLRYTSMMSGSRCALLATSTWLSGSLHSA
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pF1KE0 FQTSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTFADIGFLALTCFMLILTS
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CCDS31 VQTILTFHLPYCGPNQIQHYLCDAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLS
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pF1KE0 YGYIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPLDGVVAVFYT
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CCDS31 YVSIVCSILRIHTSEGRHRAFQTCASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVVDGVVAIFYT
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300 310 320 330
pF1KE0 VITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
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CCDS31 VLTPLLNPVVYTLRNKEVKKAVLKLRDKVAHSQGE
280 290 300 310
>>CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1150 init1: 881 opt: 1133 Z-score: 938.9 bits: 182.0 E(32554): 5.6e-46
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLTV
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CCDS31 MSNASLVTAFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTV
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70 80 90 100 110
pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRLHRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGS-RIISFGGCV
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CCDS31 LGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCV
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pF1KE0 IQLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLF
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CCDS31 AQLYFFHFLGSTECFLYTVMSYDRYLAISYPLRYTSMMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAV
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QTSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTFADIGFLALTCFMLILTSY
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CCDS31 QTILTFHLPYCGPNQIQHYFCDAPPILKLACADTSANVMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSY
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GYIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPLDGVVAVFYTV
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CCDS31 VSIVCSILRIRTSDGRRRAFQTCASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAMDGVVAIFYTV
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300 310 320 330
pF1KE0 ITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
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CCDS31 LTPLLNPVVYTLRNKEVKKAVLKLRDKVAHPQRK
280 290 300 310
>>CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1137 init1: 855 opt: 1120 Z-score: 928.4 bits: 180.0 E(32554): 2.2e-45
Smith-Waterman score: 1120; 56.5% identity (77.9% similar) in 299 aa overlap (26-323:3-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLTV
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CCDS31 MSNATLLTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTV
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70 80 90 100 110
pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRLHRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGS-RIISFGGCV
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CCDS31 LGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCV
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pF1KE0 IQLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLF
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CCDS31 AQLYFFHFLGSTECFLYTVMSYDRYLAISYPLRYTNMMTGRSCALLATGTWLSGSLHSAV
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pF1KE0 QTSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTFADIGFLALTCFMLILTSY
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CCDS31 QTILTFHLPYCGPNQIQHYFCDAPPILKLACADTSANEMVIFVNIGLVASGCFVLIVLSY
160 170 180 190 200 210
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pF1KE0 GYIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPLDGVVAVFYTV
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CCDS31 VSIVCSILRIRTSEGRHRAFQTCASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRDALHGVVAVFYTT
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE0 ITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
.:::.: ..::: :::.: :: .:
CCDS31 LTPLFNPVVYTLRNKEVKKALLKLKNGSVFAQGE
280 290 300 310
>>CCDS31701.1 OR10S1 gene_id:219873|Hs108|chr11 (331 aa)
initn: 1096 init1: 858 opt: 1099 Z-score: 911.2 bits: 176.9 E(32554): 2e-44
Smith-Waterman score: 1099; 56.0% identity (80.1% similar) in 302 aa overlap (23-323:15-316)
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITV
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70 80 90 100 110
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CCDS31 AGNLLILLTVGSDSHLSLPMYHFLGHLSFLDACLSTVTVPKVMAGLLTLDGKVISFEGCA
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CCDS31 VQLYCFHFLASTECFLYTVMAYDRYLAICQPLHYPVAMNRRMCAEMAGITWAIGATHAAI
120 130 140 150 160 170
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CCDS31 HTSLTFRLLYCGPCHIAYFFCDIPPVLKLACTDTTINELVMLASIGIVAAGCLILIVISY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
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CCDS31 IFIVAAVLRIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQPRSSEAGAGAPAVFYTI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
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CCDS31 VTPMLNPFIYTLRNKEVKHALQRLLCSSFRESTAGSPPP
300 310 320 330
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTV
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CCDS31 LGNLLILLVIRVDSHLHTTMYYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKLLMTLVFPSGRAISFHSCM
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CCDS31 AQLYFFHFLGGTECFLYRVMSCDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAV
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CCDS31 QAILTFHLPYCGPNWIQHYLCDAPPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSY
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CCDS31 VSIVCSILRIRTSEGKHRAFQTCASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRKAVDGVVAVFYTV
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pF1KE0 ITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
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CCDS31 LTPLLNPVVYTLRNKEVKKALLKLKDKVAHSQSK
280 290 300 310
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CCDS41 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTL
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CCDS41 SGNILIIIATVFTPSLHTPMYFFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCIT
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CCDS41 QLFFLHLFACAEIFLLIIMAYDRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQ
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CCDS41 TFLTIRLPYCGPNIIDSYFCDVPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSY-
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... . :: ::.:::.:.:::.::. :: ... :: ::: :: .. .: ::.:::::.
CCDS41 MVILVSLRKHSAEGRRKALSTCSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYTVV
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CCDS41 TPLLNPFIYTLRNEEVKSAMKQLRQRQVFFTKSYT
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CCDS31 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIIL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRLHRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGSRIISFGGCVI
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CCDS31 LGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFFLSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCML
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CCDS31 QLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDRYVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQ
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CCDS31 VALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVHPVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYS
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CCDS31 IILVS-LRKQSAEGRRKALSTCGSHIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTII
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CCDS30 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTV
10 20 30
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CCDS30 LGNLLIFLVVCLDSRLHTPMYHFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLL
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CCDS30 QIYFFHSLGATECYLLTAMAYDRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVE
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