FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0851, 301 aa
1>>>pF1KE0851 301 - 301 aa - 301 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8399+/-0.00136; mu= 12.4663+/- 0.080
mean_var=187.3783+/-66.637, 0's: 0 Z-trim(101.6): 377 B-trim: 398 in 1/50
Lambda= 0.093695
statistics sampled from 6127 (6583) to 6127 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 955 142.5 3.8e-34
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CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 933 139.6 3e-33
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CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 925 138.5 6.4e-33
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CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 908 136.2 3.1e-32
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 907 136.0 3.4e-32
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 907 136.0 3.4e-32
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CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 901 135.2 6e-32
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 901 135.2 6.1e-32
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 900 135.1 6.6e-32
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 900 135.2 7e-32
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 899 135.0 7.2e-32
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 898 134.8 7.9e-32
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 896 134.6 9.6e-32
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 894 134.3 1.1e-31
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 894 134.3 1.2e-31
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 893 134.1 1.3e-31
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 893 134.2 1.3e-31
>>CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 (301 aa)
initn: 1992 init1: 1992 opt: 1992 Z-score: 1484.2 bits: 282.7 E(32554): 2.4e-76
Smith-Waterman score: 1992; 100.0% identity (100.0% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEFVLLGFSDIPNLHWMLFSIFLLMYLMILMCNGIIILLIKIHPALQTPMYFFLSNFSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEFVLLGFSDIPNLHWMLFSIFLLMYLMILMCNGIIILLIKIHPALQTPMYFFLSNFSLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EICYVTIIIPRMLMDIWTQKGNISLFACATQMCFFLMLGGTECLLLTVMAYDRYVAICKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EICYVTIIIPRMLMDIWTQKGNISLFACATQMCFFLMLGGTECLLLTVMAYDRYVAICKP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LQYPLVMNHKVCIQLIIASWTITIPVVIGETCQIFLLPFCGTNTINHFFCDIPPILKLAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LQYPLVMNHKVCIQLIIASWTITIPVVIGETCQIFLLPFCGTNTINHFFCDIPPILKLAC
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GNIFVNEITVHVVAVVFITVPFLLIVVSYGKIISNILKLSSARGKAKAFSTCSSHLIVVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GNIFVNEITVHVVAVVFITVPFLLIVVSYGKIISNILKLSSARGKAKAFSTCSSHLIVVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LFFGAGTITYLQPKPHQFQRMGKLISLFYTILIPTLNPIIYTLRNKDIMVALRKLLAKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LFFGAGTITYLQPKPHQFQRMGKLISLFYTILIPTLNPIIYTLRNKDIMVALRKLLAKLL
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 T
:
CCDS31 T
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
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Smith-Waterman score: 1028; 47.8% identity (79.5% similar) in 297 aa overlap (2-298:11-307)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEFVLLGFSDIPNLHWMLFSIFLLMYLMILMCNGIIILLIKIHPALQTPMY
::.::::.. :... :: .:: .: . :. : .:. . .. :::::::
CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FFLSNFSLLEICYVTIIIPRMLMDIWTQKGNISLFACATQMCFFLMLGGTECLLLTVMAY
:::.:.::::.:.. ...:.::.:. . . ::. .:.::: ::...:..::.::..:::
CCDS31 FFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DRYVAICKPLQYPLVMNHKVCIQLIIASWTITIPVVIGETCQIFLLPFCGTNTINHFFCD
::.::::.::.: ..::...:. . :.:: .:: . .: .. ::::: :...:::::
CCDS31 DRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IPPILKLACGNIFVNEITVHVVAVVFITVPFLLIVVSYGKIISNILKLSSARGKAKAFST
::.:::. . . :. . . ...:: :: ::.::: .:: .::..::: :. :::::
CCDS31 GPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CSSHLIVVILFFGAGTITYLQPKPHQFQRMGKLISLFYTILIPTLNPIIYTLRNKDIMVA
:::::::: ::.:....:::.:: .: . ::.:: ::.. : :::::: :::... :
CCDS31 CSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 LRKLLAKLLT
... ...
CCDS31 VKRTITQKVLQKLDVF
310
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 992; 47.8% identity (77.1% similar) in 297 aa overlap (2-298:10-306)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEFVLLGFSDIPNLHWMLFSIFLLMYLMILMCNGIIILLIKIHPALQTPMYF
::.::::: . .:. .:::.:: .::. . : .:..:.. :::.::::
CCDS34 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMYF
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pF1KE0 FLSNFSLLEICYVTIIIPRMLMDIWTQKGNISLFACATQMCFFLMLGGTECLLLTVMAYD
:: ..: ::: :... .: .: . : . .:: .:: :: :::..:.::: ::..::::
CCDS34 FLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAYD
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pF1KE0 RYVAICKPLQYPLVMNHKVCIQLIIASWTITIPVVIGETCQIFLLPFCGTNTINHFFCDI
::.:::.::.:::...:.::.:: ..:. . : .:.: :: ::::: ::: .:::.:
CCDS34 RYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCEI
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pF1KE0 PPILKLACGNIFVNEITVHVVAVVFITVPFLLIVVSYGKIISNILKLSSARGKAKAFSTC
:.:.:.::. .::. . ......: :: ::. :::.:. .:... :. :. ::::::
CCDS34 QPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFSTC
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pF1KE0 SSHLIVVILFFGAGTITYLQPKPHQFQRMGKLISLFYTILIPTLNPIIYTLRNKDIMVAL
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CCDS34 SSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKAAL
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300
pF1KE0 RKLLAKLLT
.. . :
CCDS34 KRTIQKTVPMEI
310
>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 984 init1: 947 opt: 988 Z-score: 750.6 bits: 147.0 E(32554): 1.7e-35
Smith-Waterman score: 988; 48.7% identity (77.0% similar) in 300 aa overlap (2-300:11-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEFVLLGFSDIPN-LHWMLFSIFLLMYLMILMCNGIIILLIKIHPALQTPM
::.:..::..:. .. .:: :: .::. : :..:::. : :..::
CCDS77 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE0 YFFLSNFSLLEICYVTIIIPRMLMDIWTQKGNISLFACATQMCFFLMLGGTECLLLTVMA
:::: :.:.::: . .:.:.:: . .: .::...::::: ::...: .::.::..::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE0 YDRYVAICKPLQYPLVMNHKVCIQLIIASWTITIPVVIGETCQIFLLPFCGTNTINHFFC
::::::::.::.::..::... .: ::: .::. .: .: .:::::: .:::::
CCDS77 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE0 DIPPILKLACGNIFVNEITVHVVAVVFITVPFLLIVVSYGKIISNILKLSSARGKAKAFS
: ::.:::.:.. . :: . : ... . .: :::. :: .: . :::. ::.:: ::::
CCDS77 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE0 TCSSHLIVVILFFGAGTITYLQPKPHQFQRMGKLISLFYTILIPTLNPIIYTLRNKDIMV
::::::.:: ::. ....::. :: .. . ::.:: ::.. : ::::::.:::...
CCDS77 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300
pF1KE0 ALRKLLAKLLT
:: . . :.:
CCDS77 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 985 init1: 985 opt: 985 Z-score: 748.4 bits: 146.6 E(32554): 2.3e-35
Smith-Waterman score: 985; 48.1% identity (79.7% similar) in 295 aa overlap (1-295:10-304)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEFVLLGFSDIPNLHWMLFSIFLLMYLMILMCNGIIILLIKIHPALQTPMY
.::.:::::..:.:. .::..::..:.. :: :.:: ..:... .:..:::
CCDS31 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 FFLSNFSLLEICYVTIIIPRMLMDIWTQKGNISLFACATQMCFFLMLGGTECLLLTVMAY
.:: :.:..:. . ..: :.::. . :.: ::. .: .:: :.:..:::::.:: .:::
CCDS31 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DRYVAICKPLQYPLVMNHKVCIQLIIASWTITIPVVIGETCQIFLLPFCGTNTINHFFCD
::..:::.::.::..::. : ..:.: :: : :. .: .: .:::: : :::.::.
CCDS31 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IPPILKLACGNIFVNEITVHVVAVVFITVPFLLIVVSYGKIISNILKLSSARGKAKAFST
::.:.:.:.. :. :: . . ..... ::::::..:: ... :::. :. :. :::::
CCDS31 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CSSHLIVVILFFGAGTITYLQPKPHQFQRMGKLISLFYTILIPTLNPIIYTLRNKDIMVA
:.::: : ::.:....:::::: . ::::: ::.: : :::.::.:::... .
CCDS31 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
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300
pF1KE0 LRKLLAKLLT
: ::
CCDS31 LIKLWRRKVILHTF
310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1045 init1: 960 opt: 981 Z-score: 745.5 bits: 146.0 E(32554): 3.3e-35
Smith-Waterman score: 981; 48.8% identity (76.8% similar) in 297 aa overlap (1-297:10-306)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEFVLLGFSDIPNLHWMLFSIFLLMYLMILMCNGIIILLIKIHPALQTPMY
:.:.:::::: : :. .:: . :..::. :. : ::.. . : :.::::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 FFLSNFSLLEICYVTIIIPRMLMDIWTQKGNISLFACATQMCFFLMLGGTECLLLTVMAY
:::::.:::.::..: . :. :... : .:. .:..:. . : ::.:::.::. ::
CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DRYVAICKPLQYPLVMNHKVCIQLIIASWTITIPVVIGETCQIFLLPFCGTNTINHFFCD
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CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
130 140 150 160 170 180
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CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
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240 250 260 270 280 290
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CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
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300
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CCDS31 LRKLLSGKL
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CCDS77 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
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300
pF1KE0 ALRKLLAKLLT
::..:. . :
CCDS77 ALKRLIHRTLGSQKL
310
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10 20 30 40 50
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CCDS31 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPMYFFLRNLSF
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CCDS31 LEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMAYDRYVAICS
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CCDS31 PLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFCDSPPVLRLV
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CCDS31 CADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFSTCSSHLLVV
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pF1KE0 ILFFGAGTITYLQPKPHQFQRMGKLISLFYTILIPTLNPIIYTLRNKDIMVALRKLLAKL
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CCDS31 SLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKNALSRTVSKA
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300
pF1KE0 LT
:
CCDS31 LALRNCIP
300
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CCDS34 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
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CCDS34 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
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CCDS34 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
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CCDS34 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
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CCDS34 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFR
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.::.:
CCDS34 RLLGKEMGLTQS
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]