Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0849
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0849, 316 aa
1>>>pF1KE0849 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1042+/-0.00127; mu= 11.2304+/- 0.074
mean_var=151.7627+/-51.171, 0's: 0 Z-trim(102.3): 388 B-trim: 837 in 2/47
Lambda= 0.104110
statistics sampled from 6378 (6868) to 6378 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 2077 324.7 5.9e-89
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 1278 204.7 7.9e-53
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 1262 202.3 4.2e-52
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 1227 197.0 1.6e-50
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 1225 196.7 2e-50
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 1117 180.5 1.5e-45
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1091 176.7 2.4e-44
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1056 171.3 8.6e-43
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1046 169.9 2.5e-42
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 1037 168.5 6.1e-42
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 1028 167.1 1.5e-41
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1024 166.5 2.4e-41
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1023 166.4 2.7e-41
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1011 164.6 9.2e-41
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 1008 164.2 1.4e-40
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 1006 163.8 1.6e-40
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1000 162.9 2.9e-40
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 997 162.5 4e-40
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 996 162.3 4.4e-40
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 994 162.0 5.4e-40
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 991 161.6 7.5e-40
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 989 161.3 9.2e-40
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 989 161.3 9.2e-40
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 983 160.4 1.7e-39
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 982 160.2 1.9e-39
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 980 159.9 2.4e-39
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 979 159.8 2.6e-39
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 978 159.6 2.9e-39
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 977 159.5 3.2e-39
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 977 159.5 3.2e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 977 159.5 3.2e-39
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 977 159.5 3.2e-39
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 976 159.3 3.6e-39
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 974 159.0 4.4e-39
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 974 159.0 4.4e-39
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 974 159.1 4.7e-39
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 973 158.9 4.8e-39
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 973 158.9 4.9e-39
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 972 158.7 5.4e-39
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 972 158.7 5.5e-39
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 971 158.6 6e-39
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 967 158.0 9e-39
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 967 158.0 9.1e-39
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 966 157.8 1e-38
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 961 157.1 1.7e-38
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 960 157.0 2.1e-38
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 958 156.6 2.3e-38
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 958 156.6 2.4e-38
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 957 156.5 2.6e-38
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 953 155.8 3.9e-38
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 2077 init1: 2077 opt: 2077 Z-score: 1710.5 bits: 324.7 E(32554): 5.9e-89
Smith-Waterman score: 2077; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 VKRTITQKVLQKLDVF
::::::::::::::::
CCDS31 VKRTITQKVLQKLDVF
310
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1281 init1: 1220 opt: 1278 Z-score: 1061.9 bits: 204.7 E(32554): 7.9e-53
Smith-Waterman score: 1278; 61.0% identity (84.4% similar) in 315 aa overlap (1-313:1-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MICENHTRVTEFILLGFTN-NPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPM
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CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMA
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CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFC
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CCDS77 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DGPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFS
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CCDS77 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKG
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CCDS77 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 AVKRTITQKV-LQKLDVF
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CCDS77 ALKRLIHRTLGSQKL
310
>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1199 init1: 1199 opt: 1262 Z-score: 1048.9 bits: 202.3 E(32554): 4.2e-52
Smith-Waterman score: 1262; 61.4% identity (83.9% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MICENHTRVTEFILLGFTNNP-EMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPM
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CCDS77 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMA
::::.:::.::. :.::.::::: :.. :::.::.:::::::::: .:::::. ::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFC
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CCDS77 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DGPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFS
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CCDS77 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKG
::::::.:::::: ..::::. ::::.:::::::.::::::.:::::::::.:::.:::.
CCDS77 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 AVKRTITQKVLQKLDVF
:..::. .:::
CCDS77 ALSRTF-HKVLALRNCIP
310
>>CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 (303 aa)
initn: 1272 init1: 1209 opt: 1227 Z-score: 1020.7 bits: 197.0 E(32554): 1.6e-50
Smith-Waterman score: 1227; 61.2% identity (85.0% similar) in 294 aa overlap (15-307:1-294)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MICENHTRVTEFILLGFTNNP-EMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPM
..:.. : :.: ::. ::.:: :::.:: ::. :: .: :..::
CCDS31 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMA
::::.:::.::. :.::.::::: :.. :::.::.:::::::::: .:::::. ::
CCDS31 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFC
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CCDS31 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DGPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFS
:.::::.:: .::...:. :...:.: .:.: ::: :::.: .::.. :: :..::::
CCDS31 DSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKG
::::::.:::::: . ::::.:::::.:::.:::.::::::.:::::::::.:::::::.
CCDS31 TCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKN
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 AVKRTITQKVLQKLDVF
:..::...
CCDS31 ALSRTVSKALALRNCIP
290 300
>>CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1248 init1: 1212 opt: 1225 Z-score: 1018.9 bits: 196.7 E(32554): 2e-50
Smith-Waterman score: 1225; 56.0% identity (87.3% similar) in 307 aa overlap (4-310:4-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
.:.. :.:::::::.: ::.::.:: ::.::.:::.:: .:... :.. .:..:::
CCDS31 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMAY
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CCDS31 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFCD
:::.:::.::.: :::::.. . ..: ::.::. :. .::.:....:::::: ..:.::.
CCDS31 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFST
::::.:: .:: ..:. :...:.:..: :: :::.:: :....::.: :.:::::::::
CCDS31 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKGA
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CCDS31 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 VKRTITQKVLQKLDVF
. . .::.
CCDS31 LIKLWRRKVILHTF
310
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1176 init1: 1112 opt: 1117 Z-score: 931.3 bits: 180.5 E(32554): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 1117; 54.4% identity (81.3% similar) in 305 aa overlap (5-309:4-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
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CCDS34 FFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAY
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CCDS34 DRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCE
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CCDS34 IQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFST
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CCDS34 CSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKAA
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310
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.:::: . :
CCDS34 LKRTIQKTVPMEI
300 310
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310
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CCDS46 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
310 320 330 340 350
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CCDS46 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
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CCDS46 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
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CCDS46 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
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CCDS46 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
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pF1KE0 VKRTITQKVLQKLDVF
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CCDS46 FKRLVARVFLIKK
310
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CCDS31 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNLSFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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CCDS31 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSWASGALVSLVDTSFTF
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CCDS31 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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CCDS31 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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CCDS31 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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CCDS31 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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CCDS31 LRKVATRNFP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]