FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0846, 314 aa
1>>>pF1KE0846 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1177+/-0.000564; mu= 17.3728+/- 0.035
mean_var=143.2383+/-41.168, 0's: 0 Z-trim(106.8): 273 B-trim: 903 in 1/49
Lambda= 0.107163
statistics sampled from 14495 (14929) to 14495 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16
Scan time: 6.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 1214 200.4 4e-51
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 962 161.4 2.1e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 951 159.7 6.9e-39
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 940 158.0 2.3e-38
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 940 158.0 2.3e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 938 157.7 2.8e-38
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 896 151.2 2.5e-36
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 889 150.2 5.4e-36
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NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 858 145.3 1.5e-34
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 854 144.8 2.3e-34
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 841 142.7 9e-34
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 839 142.4 1.1e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 837 142.1 1.4e-33
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 811 138.1 2.3e-32
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 789 134.7 2.4e-31
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 590 103.9 4.4e-22
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 560 99.3 1.1e-20
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 238 49.5 1.1e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 218 46.6 0.00011
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 212 45.5 0.00018
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NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 205 44.4 0.00037
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XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 202 44.1 0.00059
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 202 44.1 0.00059
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 202 44.1 0.00059
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 194 42.7 0.0012
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NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 195 43.0 0.0012
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 195 43.0 0.0012
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 195 43.0 0.0012
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 194 42.8 0.0013
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 193 42.6 0.0013
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 193 42.6 0.0013
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 191 42.2 0.0016
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 189 42.1 0.0023
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NP_114142 (OMIM: 606916) probable G-protein couple ( 451) 184 41.4 0.0042
XP_006712545 (OMIM: 601122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 456) 184 41.4 0.0042
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 182 40.8 0.0043
NP_000858 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine recep ( 481) 184 41.4 0.0044
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1214; 58.1% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (5-311:5-312)
10 20 30 40 50
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240 250 260 270 280 290
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE0 TLIKLWRRKVILHTF
.: . ... . :
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 962; 48.9% identity (78.6% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-308)
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: :.: . ..::.:::... :::. :: :::::..:..:: . ..: ....::.:::
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGT-LLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
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pF1KE0 TCASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
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300 310
pF1KE0 TLIKLWRRKVILHTF
.: .. ::
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVP
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pF1KE0 RTLIKLWRRKVILHTF
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KE0 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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310
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:: :.
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
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Smith-Waterman score: 940; 47.6% identity (78.5% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
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pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
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pF1KE0 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE0 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
:..:.:.:: :. ....:...:.:: :.:::::... .:::. : ::.::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE0 LIKL-WRRKVILHTF
:: :.
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 940; 47.6% identity (78.5% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
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pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE0 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LIKL-WRRKVILHTF
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 938 init1: 820 opt: 938 Z-score: 808.3 bits: 157.7 E(85289): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 938; 46.3% identity (77.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE0 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE0 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
310
pF1KE0 LIKLWRRKVILHTF
: :. :
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 917 init1: 891 opt: 896 Z-score: 773.2 bits: 151.2 E(85289): 2.5e-36
Smith-Waterman score: 896; 43.9% identity (74.6% similar) in 303 aa overlap (5-305:8-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHV
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE0 PMYLFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE0 MAYDRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHL
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE0 FCETPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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pF1KE0 FSTCASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEM
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300 310
pF1KE0 KRTLIKL--WRRKVILHTF
. .. .: :
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 922 init1: 883 opt: 889 Z-score: 767.3 bits: 150.1 E(85289): 5.3e-36
Smith-Waterman score: 889; 44.0% identity (71.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE0 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LIKLWRRKVILHTF
: :. : :
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 922 init1: 883 opt: 889 Z-score: 767.3 bits: 150.1 E(85289): 5.3e-36
Smith-Waterman score: 889; 44.0% identity (71.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
:. ::: : ::.:::.: :. : :: :: .:..:..:: .: . .:... ::.:::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE0 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
:.:::. : :::.: .:..: :..: : . .. ::..::.:::.:::::: .: .
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
314 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 03:34:59 2016 done: Sat Nov 5 03:35:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]