Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0845
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0845, 314 aa
1>>>pF1KE0845 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0211+/-0.00107; mu= 17.4427+/- 0.063
mean_var=149.5711+/-50.407, 0's: 0 Z-trim(104.3): 379 B-trim: 879 in 2/47
Lambda= 0.104870
statistics sampled from 7287 (7809) to 7287 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 2.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 ( 309) 1164 188.6 5.4e-48
CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 ( 321) 1022 167.1 1.6e-41
CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 ( 312) 964 158.3 7e-39
CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 ( 311) 961 157.9 9.6e-39
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 866 143.5 2e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 862 142.9 3.1e-34
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 851 141.2 9.8e-34
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 834 138.7 5.9e-33
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 832 138.3 7.1e-33
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CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 825 137.3 1.5e-32
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 824 137.1 1.7e-32
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 821 136.7 2.3e-32
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 820 136.5 2.5e-32
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 814 135.6 4.8e-32
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 813 135.5 5.3e-32
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 812 135.3 5.8e-32
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 808 134.7 8.9e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 806 134.4 1.1e-31
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 804 134.1 1.4e-31
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 803 134.0 1.5e-31
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 803 134.0 1.5e-31
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 800 133.5 2.1e-31
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CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 791 132.1 5.2e-31
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 791 132.1 5.3e-31
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 791 132.2 5.7e-31
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 789 131.8 6.5e-31
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 787 131.5 8e-31
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 787 131.5 8e-31
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 787 131.6 8.5e-31
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 786 131.4 9e-31
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 786 131.4 9.1e-31
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 784 131.1 1.1e-30
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 783 130.9 1.2e-30
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 782 130.8 1.4e-30
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 782 130.8 1.4e-30
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 782 130.8 1.4e-30
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 781 130.7 1.5e-30
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 780 130.5 1.7e-30
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 780 130.5 1.7e-30
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 778 130.2 2.1e-30
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 778 130.2 2.1e-30
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 778 130.3 2.2e-30
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 777 130.0 2.3e-30
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 777 130.0 2.3e-30
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 777 130.1 2.3e-30
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 777 130.1 2.4e-30
>>CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1182 init1: 966 opt: 1164 Z-score: 975.1 bits: 188.6 E(32554): 5.4e-48
Smith-Waterman score: 1164; 55.9% identity (85.2% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MANVTLVTGFLLMGFSNIQKLRILYGVLFLLIYLAALMSNLLIITLITLDVKLQTPMYFF
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CCDS31 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LKNLSFLDVFLVSVPIPKFIVNNLTHNNSISILGCAFQLLLMTSFSAGEIFILTAMSYDR
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CCDS31 LKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFDR
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pF1KE0 YVAICCPLNYEVVMNTGVCVLMASVSWAIGGLFGTAYTAGTFSMPFCGSSVIPQFFCDVP
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CCDS31 YTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDIP
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SLLRISCSETLMVIYAGIGVGACLSISCFICIVISYIYIFSTVLKIPTTKGQSKAFSTCF
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CCDS31 QLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSICL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PHLTVFTVFIITAYFVYLKPPSNSPSVIDRLLSVIYTVMPPVFNPVTYSLRNNDMKCALI
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CCDS31 PHLLV-VLFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVALG
250 260 270 280 290
310
pF1KE0 RLLQKTYGQEAYFI
:..
CCDS31 MLIKGKLTKK
300
>>CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 1050 init1: 1002 opt: 1022 Z-score: 858.8 bits: 167.1 E(32554): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 1022; 49.5% identity (81.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MANVTLVTGFLLMGFSNIQKLRILYGVLFLLIYLAALMSNLLIITLITLDVKLQTPMYFF
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CCDS34 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LKNLSFLDVFLVSVPIPKFIVNNLTHNNSISILGCAFQLLLMTSFSAGEIFILTAMSYDR
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CCDS34 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
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pF1KE0 YVAICCPLNYEVVMNTGVCVLMASVSWAIGGLFGTAYTAGTFSMPFCGSSVIPQFFCDVP
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CCDS34 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SLLRISCSETLMVIYAGIGVGACLSISCFICIVISYIYIFSTVLKIPTTKGQSKAFSTCF
..:...:: .. : . . .. :.: ::.::: ::::::.::...:..:.::::.
CCDS34 QMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PHLTVFTVFIITAYFVYLKPPSNSPSVIDRLLSVIYTVMPPVFNPVTYSLRNNDMKCALI
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CCDS34 PHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAALR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 RLLQKTYGQEAYFI
..:.:
CCDS34 KMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
310 320
>>CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 950 init1: 921 opt: 964 Z-score: 811.5 bits: 158.3 E(32554): 7e-39
Smith-Waterman score: 964; 45.2% identity (76.1% similar) in 314 aa overlap (1-310:1-310)
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pF1KE0 MANVTLVTGFLLMGFSNIQKLRILYGVLFLLIYLAALMSNLLIITLITLDVKLQTPMYFF
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CCDS31 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMYFF
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pF1KE0 LKNLSFLDVFLVSVPIPKFIVNNLTHNNSISILGCAFQLLLMTSFSAGEIFILTAMSYDR
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CCDS31 LRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAHDR
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pF1KE0 YVAICCPLNYEVVMNTGVCVLMASVSWAIGGLFGTAYTAGTFSMPFCGSSVIPQFFCDVP
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CCDS31 YVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCDIP
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pF1KE0 SLLRISCSETL----MVIYAGIGVGACLSISCFICIVISYIYIFSTVLKIPTTKGQSKAF
:::..:::.:. :.. ...:::. .::: :. :::.:::::: .: ..:::
CCDS31 SLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGG----GCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAF
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pF1KE0 STCFPHLTVFTVFIITAYFVYLKPPSNSPSVIDRLLSVIYTVMPPVFNPVTYSLRNNDMK
:::.::. : .::. . :::.::. .. : .:: .:..:::.:::. :::::...:
CCDS31 STCIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIK
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300 310
pF1KE0 CALIRLLQKTYGQEAYFI
:. ..... . .:
CCDS31 VAIKKIMKRIFYSENV
300 310
>>CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 967 init1: 946 opt: 961 Z-score: 809.1 bits: 157.9 E(32554): 9.6e-39
Smith-Waterman score: 961; 48.9% identity (78.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MANVTLVTGFLLMGFSNIQKLRILYGVLFLLIYLAALMSNLLIITLITLDVKLQTPMYFF
: :.: :: :::: ::.: .:..:.. ::::::::.:..:::::..:::: .:.::::::
CCDS31 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAVLVGNLLIIAVITLDQHLHTPMYFF
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pF1KE0 LKNLSFLDVFLVSVPIPKFIVNNLTHNNSISILGCAFQLLLMTSFSAGEIFILTAMSYDR
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CCDS31 LKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSYDR
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pF1KE0 YVAICCPLNYEVVMNTGVCVLMASVSWAIGGLFGTAYTAGTFSMPFCGSSVIPQFFCDVP
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CCDS31 YVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSSVIHQFFRDIP
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pF1KE0 SLLRISCSETLMVIYAGIGVGACLSISCFICIVISYIYIFSTVLKIPTTKGQSKAFSTCF
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CCDS31 HVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PHLTVFTVFIITAYFVYLKPPSNSPSVIDRLLSVIYTVMPPVFNPVTYSLRNNDMKCALI
:.: :. .:. :. :. : : ... :. : .... :::.:: .::. :::::...: :.
CCDS31 PQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTAMW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 RLLQKTYGQEAYFI
::. : :
CCDS31 RLFVKIYFLQK
310
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 883 init1: 854 opt: 866 Z-score: 731.4 bits: 143.5 E(32554): 2e-34
Smith-Waterman score: 866; 44.6% identity (73.9% similar) in 303 aa overlap (3-304:7-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANVTLVTGFLLMGFSNIQKLRILYGVLFLLIYLAALMSNLLIITLITLDVKLQTP
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CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 MYFFLKNLSFLDVFLVSVPIPKFIVNNLTHNNSISILGCAFQLLLMTSFSAGEIFILTAM
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CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 SYDRYVAICCPLNYEVVMNTGVCVLMASVSWAIGGLFGTAYTAGTFSMPFCGSSVIPQFF
.:::::::: :: : :::. :.:. . .:. :.. . ..:. .: . .: ..:: .::
CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE0 CDVPSLLRISCSETLMVIYAGIGVGACLSISCFICIVISYIYIFSTVLKIPTTKGQSKAF
::.: ::..::..: . . :. . : ::: :.:::..:. .:::: . .:..:.:
CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 STCFPHLTVFTVFIITAYFVYLKPPS-NSPSVIDRLLSVIYTVMPPVFNPVTYSLRNNDM
::: ::: :.. : :.: .: ::.. :...::.::.. ::.::. :::::.:.
CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNT-DKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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300 310
pF1KE0 KCALIRLLQKTYGQEAYFI
: : ..:.
CCDS79 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 871 init1: 834 opt: 862 Z-score: 728.0 bits: 142.9 E(32554): 3.1e-34
Smith-Waterman score: 862; 42.4% identity (76.1% similar) in 297 aa overlap (3-299:5-301)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANVTLVTGFLLMGFSNIQKLRILYGVLFLLIYLAALMSNLLIITLITLDVKLQTPMY
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300 310
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.
CCDS46 VKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
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CCDS34 KRTIQKTVPMEI
310
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CCDS31 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
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CCDS31 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
310 320
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CCDS31 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPMYF
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CCDS31 LSRTVSKALALRNCIP
290 300
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]