FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0838, 309 aa
1>>>pF1KE0838 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2667+/-0.000597; mu= 15.6651+/- 0.037
mean_var=72.7125+/-15.924, 0's: 0 Z-trim(105.4): 94 B-trim: 1741 in 2/47
Lambda= 0.150408
statistics sampled from 13534 (13618) to 13534 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.465), E-opt: 0.2 (0.16), width: 16
Scan time: 6.390
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 2019 448.2 9.9e-126
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 989 224.7 1.9e-58
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 924 210.6 3.4e-54
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 809 185.6 1.1e-46
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 704 162.8 7.8e-40
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 642 149.4 8.9e-36
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 631 147.0 4.5e-35
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 630 146.8 5.3e-35
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 623 145.2 1.5e-34
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 618 144.2 3.2e-34
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 607 141.8 1.7e-33
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 600 140.3 4.7e-33
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 596 139.4 8.9e-33
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 588 137.7 2.9e-32
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XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 588 137.7 2.9e-32
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 578 135.5 1.4e-31
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 556 130.7 3.6e-30
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 492 116.8 5.5e-26
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 487 115.8 1.2e-25
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 480 114.2 3.3e-25
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 441 105.8 1.2e-22
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 423 101.9 1.9e-21
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 408 98.6 1.6e-20
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 375 91.4 2.3e-18
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 264 67.3 4.2e-11
>>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2019 Z-score: 2378.3 bits: 448.2 E(85289): 9.9e-126
Smith-Waterman score: 2019; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCRKIACMI
:::::::::
NP_076 TCRKIACMI
>>NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 member (318 aa)
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Smith-Waterman score: 989; 47.7% identity (81.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
:.... ...:: ::::. .:.. .: :::..:.:..:..:::...::.::.. :::::
NP_076 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
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NP_076 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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pF1KE0 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
..:: ...:: : :.:::::. :: :: ....: ::: ::::::.::::.:.. ::
NP_076 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
...:. ::.: .. : ::.: . .::: ::: :..:: .::.:::. :::::.. ....
NP_076 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCRKIACMI
NP_076 WKVMSILKGRKFQQHKQI
310
>>NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 member (312 aa)
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Smith-Waterman score: 924; 48.2% identity (77.8% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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NP_076 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
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pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
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NP_076 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
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pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAI-AKHKRNITEMFHVSKIP-
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NP_076 WLKLKINKVMLAILLGSF----LISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPG
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pF1KE0 YFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMT
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NP_076 TFKQLTL-NLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVI
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pF1KE0 SFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVR
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NP_076 IFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLK
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 MLTCRKIACMI
:: : . :..
NP_076 ML--RFVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 member (316 aa)
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Smith-Waterman score: 809; 41.0% identity (75.1% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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NP_058 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
........: ..:... .. . .: . :::.:.:..:..:::.:.: ::::: ::: ::
NP_058 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKH---KRNITEMFHVSKI
::::... :. :.::: .::.: .. : ....... . ::.:: :. ..
NP_058 WLKWRVSRVMVWMLLG----ALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRS
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pF1KE0 PYFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTM
:. .: .:. . :.:::: :. ::. :: :::.:. .:.::::.::.: :::. .
NP_058 EYYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRII
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pF1KE0 TSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFV
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NP_058 LSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFV
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300
pF1KE0 RMLTCRKIACMI
:: :
NP_058 VMLRCESGHLKPGSKGPIFS
300 310
>>NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 member (307 aa)
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pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
:. ...:::.....: ..:.::::.:.::: :: :.:.::. .:::.:.:.:: ::
NP_076 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW
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pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
.....:.. ...:..:.... : ::...: .::..: :..:::::::. :. .::
NP_076 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
::: . .::. .... . ::: : .:. :: : : . . ... : ::
NP_076 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILN-DY------KTKNDTVWDLNMYKSEYF
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pF1KE0 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
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NP_076 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
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pF1KE0 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
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NP_076 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
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pF1KE0 TCRKIACMI
... :
NP_076 --QQLKCCEKRKNLRVT
300
>>NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 member (314 aa)
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Smith-Waterman score: 642; 37.4% identity (69.5% similar) in 305 aa overlap (1-300:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
: . :.::.:: .:::...::: .:.::: . ::..:. ..:.::: :.:. : .
NP_852 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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:.. ..... : .:: . ... .: ..:.:. :..:::..:::.::: : :::
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NP_852 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLL-IFDSLVLEIFI--DISLNII--DKSNLTLYLDESKTLY
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pF1KE0 FEPL----TLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIK
. : ::..: ...:: . : :...: :: :::...:: . :::: :::.: ::.:
NP_852 -DKLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMK
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pF1KE0 TMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQT
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NP_852 MVMSFLFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQT
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 FVRMLTCRKIACMI
::.:
NP_852 AVRLLWHLRNYTKTPNPLPL
300 310
>>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa)
initn: 577 init1: 366 opt: 631 Z-score: 750.6 bits: 147.0 E(85289): 4.5e-35
Smith-Waterman score: 631; 35.3% identity (69.3% similar) in 300 aa overlap (1-297:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQ-QIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLF
..:. .. . ..... .:.::. : .:..:.:..: ...::.::::: : : :
NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF
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pF1KE0 LWLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPY
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NP_076 LYLKWRVNKVILMILLGTL-VFLFLNLIQINMHIKDW----LDRYERNTTWNFSMSDFET
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 FEPLTLFNL--FAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTM
: . :.. :...:: :..:::.::. :: .: ....: : ::: :.::. :.: .
NP_076 FSVSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIV
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 TSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFV
::..:. ... .:... . . . . : ... : .::..::. : ::::.:.
NP_076 ISFLLFYASFFLC-VLISWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFL
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 RMLTCRKIACMI
NP_076 LVAAKVWAKR
300
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 628 init1: 300 opt: 630 Z-score: 749.3 bits: 146.8 E(85289): 5.3e-35
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
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NP_795 VLVLNWYATELNP-AFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
70 80 90 100 110
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:: .. :: :::: . .:: . .: .. .. ... :.: ... . :.
NP_795 HLKRRVKSVVLVILLG--PLLFLVCHLFVINMN---QIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYL
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... .:..: :. ..:. . : . : : :. :: : .::: :.::.:::. .:
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pF1KE0 TCRKIACMI
NP_795 WHVRYWVKGEKPSSS
300
>>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa)
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10 20 30 40 50 60
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NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
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NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGL-EVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISL
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pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
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NP_795 HLKKRIKSVVLVILLG--PLVFLICNLAVITM--DERVWT-KEYEGNVTWKIKLRNAIHL
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pF1KE0 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
::. .: ..:: .::: :.::. :: .: :...:.. ::.::::.::..:..:.:::
NP_795 SSLTVTTLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSF
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...: .:.. : :.. . ::.. . . .::.:: ::.:::. . ::.:::. .:
NP_795 LMLFAIYFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVL
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pF1KE0 TCRKIACMI
NP_795 WQMTR
>>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa)
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10 20 30 40 50 60
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:.: .: ::.. :::: ..::.:::.:.: :.:..:::..: :.. :...:. :.
NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIF--TFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPL
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NP_795 VILLHWYSTVLNP---TSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLI
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NP_795 FHHLKRKAKSVVLVIVLG----SLFF-LVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAM
120 130 140 150 160 170
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NP_795 HLSNLTVAMLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVT
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NP_795 VLWQVTCWAKGQNQSTP
300
309 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 03:30:52 2016 done: Sat Nov 5 03:30:53 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]