Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0838
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0838, 309 aa
1>>>pF1KE0838 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3370+/-0.00136; mu= 15.5543+/- 0.081
mean_var=79.0717+/-19.136, 0's: 0 Z-trim(99.6): 75 B-trim: 759 in 2/46
Lambda= 0.144233
statistics sampled from 5722 (5789) to 5722 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.491), E-opt: 0.2 (0.178), width: 16
Scan time: 2.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 2019 430.4 8.6e-121
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 989 216.1 2.9e-56
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 924 202.5 3.4e-52
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 809 178.6 5.4e-45
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 704 156.8 2e-38
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 642 143.9 1.6e-34
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 631 141.6 7.4e-34
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 630 141.4 8.7e-34
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 623 139.9 2.3e-33
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 618 138.9 4.9e-33
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 607 136.6 2.5e-32
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 600 135.1 6.4e-32
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 596 134.3 1.2e-31
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 578 130.5 1.6e-30
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 556 126.0 3.8e-29
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 501 114.5 1.1e-25
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 492 112.6 3.8e-25
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 487 111.6 8.2e-25
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 480 110.1 2.1e-24
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 441 102.0 6.1e-22
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 426 98.9 5.5e-21
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 408 95.2 6.8e-20
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 375 88.3 7.8e-18
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 264 65.2 7.2e-11
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2019 Z-score: 2282.1 bits: 430.4 E(32554): 8.6e-121
Smith-Waterman score: 2019; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCRKIACMI
:::::::::
CCDS86 TCRKIACMI
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 1006 init1: 980 opt: 989 Z-score: 1123.6 bits: 216.1 E(32554): 2.9e-56
Smith-Waterman score: 989; 47.7% identity (81.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
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CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
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CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
..:: ...:: : :.:::::. :: :: ....: ::: ::::::.::::.:.. ::
CCDS86 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
...:. ::.: .. : ::.: . .::: ::: :..:: .::.:::. :::::.. ....
CCDS86 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCRKIACMI
CCDS86 WKVMSILKGRKFQQHKQI
310
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 897 init1: 476 opt: 924 Z-score: 1050.6 bits: 202.5 E(32554): 3.4e-52
Smith-Waterman score: 924; 48.2% identity (77.8% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
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CCDS86 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAI-AKHKRNITEMFHVSKIP-
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CCDS86 WLKLKINKVMLAILLGSF----LISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMT
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CCDS86 TFKQLTL-NLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVR
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CCDS86 IFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLK
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 MLTCRKIACMI
:: : . :..
CCDS86 ML--RFVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 840 init1: 410 opt: 809 Z-score: 921.2 bits: 178.6 E(32554): 5.4e-45
Smith-Waterman score: 809; 41.0% identity (75.1% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
........: ..:... .. . .: . :::.:.:..:..:::.:.: ::::: ::: ::
CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKH---KRNITEMFHVSKI
::::... :. :.::: .::.: .. : ....... . ::.:: :. ..
CCDS58 WLKWRVSRVMVWMLLG----ALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRS
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PYFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTM
:. .: .:. . :.:::: :. ::. :: :::.:. .:.::::.::.: :::. .
CCDS58 EYYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRII
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFV
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CCDS58 LSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFV
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 RMLTCRKIACMI
:: :
CCDS58 VMLRCESGHLKPGSKGPIFS
300 310
>>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa)
initn: 637 init1: 328 opt: 704 Z-score: 803.3 bits: 156.8 E(32554): 2e-38
Smith-Waterman score: 704; 38.4% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW
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pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
.....:.. ...:..:.... : ::...: .::..: :..:::::::. :. .::
CCDS86 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
::: . .::. .... . ::: : .:. :: : : . . ... : ::
CCDS86 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILN-DY------KTKNDTVWDLNMYKSEYF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
:.:: .: : .:::. ..:. :::::..:.. .:: :: .::.::.:.:.. ::
CCDS86 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
:..:.::.:. . . . . :: . :: .. .:: :::.:::. :.::.:. .:.:
CCDS86 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCRKIACMI
... :
CCDS86 --QQLKCCEKRKNLRVT
300
>>CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 (314 aa)
initn: 667 init1: 362 opt: 642 Z-score: 733.4 bits: 143.9 E(32554): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 642; 37.4% identity (69.5% similar) in 305 aa overlap (1-300:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
: . :.::.:: .:::...::: .:.::: . ::..:. ..:.::: :.:. : .
CCDS31 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
:.. ..... : .:: . ... .: ..:.:. :..:::..:::.::: : :::
CCDS31 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 WLKWKID-MVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPY
::.:... :.: ..:. : . .. ::. : . : .. : : :.: .. :: :
CCDS31 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLL-IFDSLVLEIFI--DISLNII--DKSNLTLYLDESKTLY
130 140 150 160 170
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pF1KE0 FEPL----TLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIK
. : ::..: ...:: . : :...: :: :::...:: . :::: :::.: ::.:
CCDS31 -DKLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQT
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CCDS31 MVMSFLFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQT
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 FVRMLTCRKIACMI
::.:
CCDS31 AVRLLWHLRNYTKTPNPLPL
300 310
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 577 init1: 366 opt: 631 Z-score: 721.3 bits: 141.6 E(32554): 7.4e-34
Smith-Waterman score: 631; 35.3% identity (69.3% similar) in 300 aa overlap (1-297:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
: : .:: ..: .:::.: :.::.:.:.: :::..:...:.:: .: :.:.:: ::
CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQ-QIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLF
..:. .. . ..... .:.::. : .:..:.:..: ...::.::::: : : :
CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF
70 80 90 100 110
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pF1KE0 LWLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPY
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CCDS86 LYLKWRVNKVILMILLGTL-VFLFLNLIQINMHIKDW----LDRYERNTTWNFSMSDFET
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FEPLTLFNL--FAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTM
: . :.. :...:: :..:::.::. :: .: ....: : ::: :.::. :.: .
CCDS86 FSVSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFV
::..:. ... .:... . . . . : ... : .::..::. : ::::.:.
CCDS86 ISFLLFYASFFLC-VLISWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFL
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 RMLTCRKIACMI
CCDS86 LVAAKVWAKR
300
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 628 init1: 300 opt: 630 Z-score: 720.0 bits: 141.4 E(32554): 8.7e-34
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CCDS53 WHVRYWVKGEKPSSS
300
>>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa)
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CCDS86 HLKKRIKSVVLVILLG--PLVFLICNLAVITM--DERVWT-KEYEGNVTWKIKLRNAIHL
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CCDS86 LMLFAIYFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVL
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CCDS86 WQMTR
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
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CCDS86 VILLHWYSTVLNP---TSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLI
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CCDS86 FHHLKRKAKSVVLVIVLG----SLFF-LVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAM
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CCDS86 HLSNLTVAMLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVT
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pF1KE0 ML---TCRKIACMI
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CCDS86 VLWQVTCWAKGQNQSTP
300
309 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 03:30:52 2016 done: Sat Nov 5 03:30:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]