Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0836
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0836, 318 aa
1>>>pF1KE0836 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1693+/-0.00108; mu= 16.5060+/- 0.065
mean_var=67.7607+/-14.691, 0's: 0 Z-trim(103.2): 53 B-trim: 951 in 2/45
Lambda= 0.155806
statistics sampled from 7251 (7294) to 7251 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 2153 493.2 1.1e-139
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 801 189.3 3.4e-48
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 559 134.8 7.7e-32
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 500 121.6 8.2e-28
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 478 116.7 2.5e-26
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 458 112.2 5.6e-25
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 449 110.1 2.2e-24
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 444 109.0 5.1e-24
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 441 108.3 7.8e-24
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 428 105.4 6.4e-23
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 400 99.1 4.6e-21
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 374 93.3 2.7e-19
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 371 92.6 4.4e-19
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 364 91.0 1.3e-18
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 358 89.7 3.2e-18
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 341 85.9 4.6e-17
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 337 84.9 8.3e-17
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 334 84.3 1.4e-16
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 317 80.4 1.9e-15
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 317 80.5 2e-15
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 310 78.9 6.1e-15
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 293 75.1 7.9e-14
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 291 74.6 1.1e-13
>>CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 (318 aa)
initn: 2153 init1: 2153 opt: 2153 Z-score: 2620.9 bits: 493.2 E(32554): 1.1e-139
Smith-Waterman score: 2153; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFYCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFYCV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYLRNHLQPWNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYLRNHLQPWNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSGFREPSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TGDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSGFREPSVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAVHPIILLFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAVHPIILLFSN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 CRLRAVLKSRRSSRCGTP
::::::::::::::::::
CCDS58 CRLRAVLKSRRSSRCGTP
310
>>CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 (307 aa)
initn: 813 init1: 473 opt: 801 Z-score: 978.7 bits: 189.3 E(32554): 3.4e-48
Smith-Waterman score: 801; 42.0% identity (71.0% similar) in 293 aa overlap (20-307:9-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV
.: .. :: :..::.::::. .:: ::. ::: : .:.
CCDS43 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFYCV
:::::::::: : ...: . . . . ::. ..: :::.::.: .::::..::
CCDS43 SLGASRFCLQLVGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE0 KIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYL-R----NHL
:::..:: .:.::: .. ::.::.:..:: .: . :.::: :. .::..: : :
CCDS43 KIANITHSTFLWLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QPWNVTGDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSGFR
:: . : .:. ::.. :..: .::.. ..:::.:: :: .. . ...
CCDS43 YKWN-------TRIETYYFPSLKLVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EPSVQAHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAVHPII
.::.::: .:: .:.:: .:. ::::...:: .. . .: :. ..::: .:::.:
CCDS43 DPSTQAHTRALKSLISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFI
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 LLFSNCRLRAVLKSRRSSRCGTP
:.::: .::.:.
CCDS43 LIFSNLKLRSVFSQLLLLARGFWVA
290 300
>>CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 (291 aa)
initn: 537 init1: 231 opt: 559 Z-score: 685.1 bits: 134.8 E(32554): 7.7e-32
Smith-Waterman score: 559; 32.7% identity (64.3% similar) in 294 aa overlap (18-310:8-290)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV
.... : .: :. :. ...:.:.:: ::. : :.: : .:.
CCDS57 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFYCV
::: :::::: . : ... . : : :: :.. :.:.: :.: .. :.::::.
CCDS57 SLGISRFCLQWASMLNNFCSY-----FNLNYVLCNLTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCI
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYLRNHLQPWNV
:...::: .:.::. .. .::.:..:. .. : : :::. . : .:: : :
CCDS57 KVSSFTHHIFLWLRWRILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHL-PRNS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE0 T-GDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSGFREPSV
: :..... . : : . .. ..: .:. :.:..:: :. ..: .::.
CCDS57 TVTDKLENFHQ--YQFQAHTVALVIPFILFLASTIFLMASL---TKQIQHHSTGHCNPSM
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QAHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAVHPIILLFS
.:.. :: .: . ..: ::::..... : . .::::. .: .: :..:
CCDS57 KARFTALRSLAVLFIVFTSYFLTILITIIGTLFDKRCWLWVWEAFVYAFILMHSTSLMLS
220 230 240 250 260 270
300 310
pF1KE0 NCRLRAVLKSRRSSRCGTP
. :. .::..
CCDS57 SPTLKRILKGKC
280 290
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 484 init1: 289 opt: 500 Z-score: 612.8 bits: 121.6 E(32554): 8.2e-28
Smith-Waterman score: 500; 30.7% identity (63.2% similar) in 296 aa overlap (22-308:7-298)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRL----VAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCD
: ::.: . :.: ::.:: . ..:: .: . :
CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASID
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KLLVSLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSV
.:.::. ::.:: :.. . . :.: .. . .... : : . : ..: .: ::.
CCDS86 LILTSLAISRICLLCVILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FYCVKIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILF---FIGNHRMYQNYLRN
.: ::..: ::.:.:.: ... . :.:.. : :: : .. . .. :. . :.
CCDS86 YYFFKIGNFFHPLFLWMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HLQPWNVTGDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSG
:. .. . :..: .. .: : .. ..::: :: :: .. :...:
CCDS86 TNLTWSCRVNKTQHASTKLFL----NLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FREPSVQAHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIF-PPLDFKFWVWESVIYLCAAVH
:.::..::..:: :..:: .:::.:.::....... : : .. ::. . . :
CCDS86 CRDPSTEAHVRALKAVISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSH
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 PIILLFSNCRLR-AVLKSRRSSRCGTP
.::...: .:: : ::
CCDS86 SFILILGNNKLRHASLKVIWKVMSILKGRKFQQHKQI
290 300 310
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 415 init1: 287 opt: 478 Z-score: 586.2 bits: 116.7 E(32554): 2.5e-26
Smith-Waterman score: 481; 31.5% identity (63.0% similar) in 308 aa overlap (16-315:6-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV
.:: .. : : ..: :::::. . ..:. :: . : .:.
CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELT-IGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFYCV
::. ::.:: :. ....: : .. . ..... : : : ..:: .. ::.:: .
CCDS86 SLAISRICLLCVISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYLRNHLQPWNV
:::...:: ::::: :.. . .:..: .: :. : :. :: ..:
CCDS86 KIANISHPFFFWLKLKINKVMLAILLGSFLIS---LIISVPKNDDMWY-----HL--FKV
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE0 TGDSIRSYCEKFYLFP--LKMITWTMPTAV-FFICMI---LLITSLGRHRKKALLTTSGF
. . .. : .: .:..: .. . : :..:.: ::. :: :: :. : ..::
CCDS86 SHEENITWKFKVSKIPGTFKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGF
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 REPSVQAHIKALLALLSFAMLFISYF-LSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAVHP
:.::..::..:. :.. : .:.: :. . ::.......: . . . . : . . :
CCDS86 RDPSTEAHMRAIKAVIIFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHS
220 230 240 250 260 270
300 310
pF1KE0 IILLFSNCRLR-AVLKSRRSSRCGTP
.::...: .:: : :: : .:
CCDS86 FILIMGNSKLREAFLKMLRFVKCFLRRRKPFVP
280 290 300 310
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 320 init1: 180 opt: 458 Z-score: 561.9 bits: 112.2 E(32554): 5.6e-25
Smith-Waterman score: 458; 30.4% identity (63.4% similar) in 273 aa overlap (35-304:24-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 HMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWV-LRRMLLPCDKLLVSLG
: :: . : : .:: : : ....:.
CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLS-DFIITTLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFYCVKIA
:. : ... .. . . : . . ..:.. .: : : ..: .: :.:.::.:::
CCDS58 LLRIILLCIILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYLRNHLQPWNVTGD
.:.::.:.::: ..: . :::.... :: .: . :.. ..: . .:. ::: .
CCDS58 SFSHPTFLWLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASL-INEFKLY-SVFRGIEATRNVT-E
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVF-FICMILLITSLGRHRKKALLTTSGFREPSVQAH
.:. ..::. . : .: . . . ::: ::::: .. : . .. :.:...::
CCDS58 HFRKKRSEYYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAH
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIF-PPLDFKFWVWESVIYLCAAVHPIILLFSNC
.:. .::: .::. :::...... : : : . . : . .. : : .::...:
CCDS58 KRAIRIILSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNS
230 240 250 260 270 280
310
pF1KE0 RLRAVLKSRRSSRCGTP
.:.
CCDS58 KLKQTFVVMLRCESGHLKPGSKGPIFS
290 300 310
>>CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 (299 aa)
initn: 464 init1: 211 opt: 449 Z-score: 551.3 bits: 110.1 E(32554): 2.2e-24
Smith-Waterman score: 449; 30.2% identity (60.5% similar) in 301 aa overlap (18-315:7-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV
:: . .. :..: ::.:... :.. . .: . : : ::
CCDS38 MLESHLIIYFLLAVIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLS
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 SLGASRFCLQSVVMGKTIYV--FLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFY
:..::. :: .. .. : :.. . : .. . :.: :: .:::.:::
CCDS38 CLAVSRIFLQLFIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILL------FINELELWLATWLGVFY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 CVKIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYLRNHLQPW
:.:.:. ::.:.::: ..: .:::...:. :. .. : .::. ..
CCDS38 CAKVASVRHPLFIWLKMRISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAGFMVPYFLRKFFSQ-
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NVTGDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSGFREPS
:.: .. . ... : . ...: .:.. ..::: ::::: .. :..: : :.
CCDS38 NATIQKEDTLAIQIFSF---VAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTRQMRNTVAGSRVPG
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VQAHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAVHPIILLF
: :.:::..::: .:..:. . :: .. : : : . :: . . : .::..
CCDS38 RGAPISALLSILSFLILYFSHCMIKVFLSSLKFHIRRFIFLFFILVIGIYPSGHSLILIL
220 230 240 250 260 270
300 310
pF1KE0 SNCRLRAVLKSRR-SSRCGTP
.: .:. :. :.:
CCDS38 GNPKLKQNAKKFLLHSKCCQ
280 290
>>CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 (323 aa)
initn: 452 init1: 311 opt: 444 Z-score: 544.7 bits: 109.0 E(32554): 5.1e-24
Smith-Waterman score: 444; 31.0% identity (62.0% similar) in 313 aa overlap (8-308:4-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNGDHMVLGSSVTDKK-AIILVTILLLLR----LVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPC
.....::: . . ::. :.. ...: :.::::: :.::. . :
CCDS43 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 DKLLVSLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLS
:.... :. ::. :: .: ..:. .: ... : : .. ::: ..:: ..::.
CCDS43 DRIMLMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITVFLNHSNLWFAAWLK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VFYCVKIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLS-SFTTILFFIGNHRMYQNYLRNH
::::..::.:.::.:: .:.:. .::.: :: .: ::. : .. ... :. .
CCDS43 VFYCLRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVLVSLSFS----FPLSRDVFNVYVNSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LQPWNVTGDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTM----PTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLT
. : .... ..: . . : .. ..: : .:.. ::: :: :: . .
CCDS43 I-PIPSSNSTEKKYFSETNMVNL-VFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE0 TSGFREPSVQAHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCA-
..: :.::..::: :. : : .:.: ..: .:...:: .. : : . :
CCDS43 ATGSRDPSMKAHIGAIKATSYFLILYIFNAIALFLSTSNIFD--TYSSWNILCKIIMAAY
240 250 260 270 280
290 300 310
pF1KE0 -AVHPIILLFSNCRLRAVLKSRRSSRCGTP
: : . :...: :: . :
CCDS43 PAGHSVQLILGNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
290 300 310 320
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 398 init1: 274 opt: 441 Z-score: 541.3 bits: 108.3 E(32554): 7.8e-24
Smith-Waterman score: 441; 31.0% identity (61.7% similar) in 303 aa overlap (11-304:3-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV
: .:. :::.: ..: .: :::.:. . ..:. .. . : .:.
CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFIL---GILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILT
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 SLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQ-WDFLNAATLWSSTWLSVFYC
.: .:.:: ::.. . : . :.: .. : :.. : : : : ..: .: :.:::
CCDS86 NLVIARICLISVMVVNGIVIVLNPDVYTKNK-QQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VKIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFI---GNHRMYQ--NYLRNH
.:::. .::.:.::: :.. . :.:.. ..: ..... : ..:.. .. ::
CCDS86 LKIASSSHPLFLWLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LQPWNVTGDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSGF
. ..: : : : . :: : : .: : .: ..::. :: :: :. : ..:
CCDS86 TEMFHV---SKIPYFEPLTLFNLFAI---VPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 REPSVQAHIKALLALLSFAMLFISYFLS---LVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAV
:.::...:..:. .. :: ..:. :..: ..:: : .: ...: .
CCDS86 RDPSTEVHVRAIKTMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLG--
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 HPIILLFSNCRLRAVLKSRRSSRCGTP
: .::. : .::
CCDS86 HSLILIVLNNKLRQTFVRMLTCRKIACMI
290 300
>>CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 (338 aa)
initn: 382 init1: 284 opt: 428 Z-score: 525.0 bits: 105.4 E(32554): 6.4e-23
Smith-Waterman score: 432; 32.0% identity (61.4% similar) in 306 aa overlap (19-308:36-323)
10 20 30 40
pF1KE0 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVL
.....:: :..: .:::: : ..:::
CCDS47 FPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHAAEWVQ
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RRMLLPCDKLLVSLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDF--LNAA
. . ..:: :..::. :::..: . : . ..: :. . ::. .: ::
CCDS47 NKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLE-ITISSTSLSF-YSEDAVYYAFKISFIFLNFC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 TLWSSTWLSVFYCVKIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRM
.:: ..::: :: ::::.:..:.:. :. ...: .::.:. :: . ::. .: :. .
CCDS47 SLWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSV-FISFSHSMFCINICTV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 YQNYLRNHLQPWNVTGDSIRSYCEKF------YLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSL
: : : . : . .... ..: .. ..: : ..: : .:.. ::: ::
CCDS47 YCN---NSF-PIHSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGIVT---PLIMFILTATLLILSL
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE0 GRHRKKALLTTSGFREPSVQAHIKALLALLSFAMLFISYFLSL-VFSAAGIFPPLDFKFW
:: . ...: .::..::. :. : ::::: : .:.:...: :. :
CCDS47 KRHTLHMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKA--------ISYFLILYIFNAVALFIYLSNMFD
240 250 260 270 280
280 290 300 310
pF1KE0 V---WESVIYLCAAVHP----IILLFSNCRLRAVLKSRRSSRCGTP
. :... . :..: :.:. .: :: . :
CCDS47 INSLWNNLCQIIMAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL
290 300 310 320 330
318 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 03:25:47 2016 done: Sat Nov 5 03:25:47 2016
Total Scan time: 2.480 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]