Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0829
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0829, 276 aa
1>>>pF1KE0829 276 - 276 aa - 276 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3621+/-0.0011; mu= 14.7640+/- 0.065
mean_var=131.0279+/-38.878, 0's: 0 Z-trim(104.1): 356 B-trim: 476 in 1/46
Lambda= 0.112045
statistics sampled from 7345 (7756) to 7345 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 1.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 997 173.1 2.2e-43
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CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 803 141.8 6.2e-34
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CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 794 140.3 1.7e-33
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CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 774 137.0 1.6e-32
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 771 136.6 2.2e-32
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CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 769 136.2 2.7e-32
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CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 756 134.1 1.2e-31
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 754 133.8 1.5e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 753 133.6 1.6e-31
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 751 133.3 2e-31
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 748 132.8 2.9e-31
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 747 132.7 3.2e-31
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 745 132.4 4e-31
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 743 132.1 5.1e-31
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 742 131.9 5.6e-31
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 739 131.4 7.9e-31
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 739 131.4 8e-31
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 738 131.2 8.8e-31
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 737 131.1 9.7e-31
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 736 130.9 1.1e-30
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 735 130.7 1.2e-30
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 735 130.8 1.2e-30
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 734 130.6 1.4e-30
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 732 130.3 1.7e-30
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 731 130.1 1.9e-30
>>CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1031 init1: 988 opt: 997 Z-score: 892.3 bits: 173.1 E(32554): 2.2e-43
Smith-Waterman score: 997; 55.6% identity (82.8% similar) in 268 aa overlap (6-273:2-269)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAPSRSMEVSGNHTSVAMFVLLGLSDEKELQLILFPVFLVIYLVTLIWNMGLIILIRIDS
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CCDS31 MSITKAWNSSSVTMFILLGFTDHPELQALLFVTFLGIYLTTLAWNLALIFLIRGDT
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CCDS31 HLHTPMYFFLSNLSFIDICYSSAVAPNMLTDFFWEQKTISFVGCAAQFFFFVGMGLSECL
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CCDS31 INHFFCDLPPVLALSCSDTFLSQVVNFLVVVTVGGTSFLQLLISYGYIVSAVLKIPSAEG
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250 260 270
pF1KE0 CAKAFNTCASHLAAVALFYGTALSVYMHPSSSHSMK
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CCDS31 RWKACNTCASHLMVVTLLFGTALFVYLRPSSSYLLGRDKVVSVFYSLVIPMLNPLIYSLR
240 250 260 270 280 290
CCDS31 NKEIKDALWKVLERKKVFS
300 310
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
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Smith-Waterman score: 983; 52.8% identity (82.5% similar) in 269 aa overlap (7-275:1-269)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAPSRSMEVSGNHTSVAMFVLLGLSDEKELQLILFPVFLVIYLVTLIWNMGLIILIRIDS
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CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDS
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CCDS31 HLHMPMYFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECF
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CCDS31 LLAAMAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYM
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pF1KE0 IQHFFCNTLQIISLSCSNPFISQMILFLEAIFVGLGSLLVILLSYGFIVASILKISSTKC
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CCDS31 INHFFCDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATG
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pF1KE0 CAKAFNTCASHLAAVALFYGTALSVYMHPSSSHSMK
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CCDS31 RTKAFSTCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFR
240 250 260 270 280 290
CCDS31 NKEIKNAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
300 310 320
>>CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 915; 49.6% identity (78.7% similar) in 268 aa overlap (7-274:1-268)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAPSRSMEVSGNHTSVAMFVLLGLSDEKELQLILFPVFLVIYLVTLIWNMGLIILIRIDS
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pF1KE0 IQHFFCNTLQIISLSCSNPFISQMILFLEAIFVGLGSLLVILLSYGFIVASILKISSTKC
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CCDS31 IRHFFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKG
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pF1KE0 CAKAFNTCASHLAAVALFYGTALSVYMHPSSSHSMK
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CCDS31 RSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLR
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CCDS31 NKEIKDALKRLQKRKCC
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>>CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 (314 aa)
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Smith-Waterman score: 849; 47.3% identity (77.3% similar) in 264 aa overlap (12-275:5-268)
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pF1KE0 MAPSRSMEVSGNHTSVAMFVLLGLSDEKELQLILFPVFLVIYLVTLIWNMGLIILIRIDS
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CCDS31 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNR
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pF1KE0 HLNTPMYFFLSFLSFTDICYSSTISPRMLSDFLKDKKTISFLACATQYFLGAWMSLAECC
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CCDS31 QLHTPMYYFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECY
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pF1KE0 LLVIMACDRYVAIGSPLQYSAIMVPSICWKMVAGVCGGGFLSSLVHTVPCFNLYYCGPNI
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CCDS31 MLAAMACDRYVAICSPLLYRVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNI
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pF1KE0 IQHFFCNTLQIISLSCSNPFISQMILFLEAIFVGLGSLLVILLSYGFIVASILKISSTKC
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CCDS31 IKHYFCDIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKG
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pF1KE0 CAKAFNTCASHLAAVALFYGTALSVYMHPSSSHSMK
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CCDS31 RCKAFSTCSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVILMLNPLIYSLR
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CCDS31 NNEVRNALMKLLRRKISLSPG
300 310
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 859 init1: 808 opt: 841 Z-score: 756.1 bits: 147.9 E(32554): 8.5e-36
Smith-Waterman score: 841; 47.7% identity (78.9% similar) in 266 aa overlap (12-275:5-268)
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pF1KE0 MAPSRSMEVSGNHTSVAMFVLLGLSDEKELQLILFPVFLVIYLVTLIWNMGLIILIRIDS
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CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADT
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pF1KE0 HLNTPMYFFLSFLSFTDICYSSTISPRMLSDFLKDKKTISFLACATQYFLGAWMS--LAE
:::::::::: :.:.:.::::.:.:.::..:: ...::: ::::: :: ... ..:
CCDS41 SLNTPMYFFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQ--LGCFLTFMISE
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pF1KE0 CCLLVIMACDRYVAIGSPLQYSAIMVPSICWKMVAGVCGGGFLSSLVHTVPCFNLYYCGP
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CCDS41 SLLLASMAYDRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHS
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pF1KE0 NIIQHFFCNTLQIISLSCSNPFISQMILFLEAIFVGLGSLLVILLSYGFIVASILKISST
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CCDS41 NIVNHFYCDDMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSA
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pF1KE0 KCCAKAFNTCASHLAAVALFYGTALSVYMHPSSSHSMK
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CCDS41 EGRQKAFSTCGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYS
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CCDS41 LQNKEVKEALKKIIINKN
300
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 861 init1: 816 opt: 825 Z-score: 742.1 bits: 145.3 E(32554): 5.2e-35
Smith-Waterman score: 825; 48.5% identity (78.4% similar) in 264 aa overlap (12-275:5-268)
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pF1KE0 MAPSRSMEVSGNHTSVAMFVLLGLSDEKELQLILFPVFLVIYLVTLIWNMGLIILIRIDS
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pF1KE0 HLNTPMYFFLSFLSFTDICYSSTISPRMLSDFLKDKKTISFLACATQYFLGAWMSLAECC
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CCDS31 QLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECI
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pF1KE0 LLVIMACDRYVAIGSPLQYSAIMVPSICWKMVAGVCGGGFLSSLVHTVPCFNLYYCGPNI
:. .:: :::.:: :: :: :: .. ::.::. ..:.:. .:.: .: .: :.
CCDS31 LFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNV
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CCDS31 SKEVKKALANVISRKRTSSFL
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CCDS31 NVVEHFFCDAPPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSP
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CCDS31 EGRQKAFSTCASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYS
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CCDS31 LRNKEVKSAFKKTVGKAKASIGFIF
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CCDS53 NTDVILAMQQMIRGKSFHKIAV
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CCDS53 QLQTPMYFFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFY
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CCDS53 FLASMALDRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]