Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0826
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0826, 251 aa
1>>>pF1KE0826 251 - 251 aa - 251 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0758+/-0.00127; mu= 16.4293+/- 0.075
mean_var=119.1335+/-32.864, 0's: 0 Z-trim(101.5): 381 B-trim: 369 in 1/46
Lambda= 0.117505
statistics sampled from 6124 (6551) to 6124 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 1.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 1258 225.0 5.2e-59
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 992 179.8 1.9e-45
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 935 170.2 1.5e-42
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 905 165.1 5.3e-41
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 904 164.9 5.7e-41
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 899 164.1 1e-40
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 875 160.0 1.7e-39
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 859 157.3 1.1e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 854 156.5 2.1e-38
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 842 154.4 8.4e-38
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 836 153.4 1.7e-37
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 832 152.7 2.7e-37
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 829 152.2 3.8e-37
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 828 152.1 4.4e-37
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 827 151.9 4.9e-37
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 822 151.0 8.8e-37
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 819 150.5 1.3e-36
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 817 150.2 1.6e-36
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 815 149.8 2e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 812 149.3 2.9e-36
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 812 149.3 2.9e-36
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 810 149.0 3.6e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 802 147.7 9.4e-36
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 799 147.1 1.3e-35
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 795 146.5 2.1e-35
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 794 146.3 2.3e-35
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 792 145.9 3e-35
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 784 144.6 7.6e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 784 144.6 7.7e-35
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 782 144.2 9.6e-35
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 779 143.7 1.4e-34
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 778 143.6 1.5e-34
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 778 143.6 1.6e-34
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 775 143.1 2.2e-34
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 774 142.9 2.5e-34
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 774 143.0 2.7e-34
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 773 142.7 2.8e-34
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 773 142.7 2.8e-34
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 773 142.7 2.8e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 771 142.4 3.5e-34
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 770 142.2 3.9e-34
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 770 142.2 3.9e-34
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 768 141.9 5e-34
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 768 141.9 5e-34
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 768 141.9 5e-34
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 768 141.9 5.2e-34
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 767 141.7 5.7e-34
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 765 141.4 7.1e-34
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 763 141.0 9.1e-34
CCDS7968.1 OR10W1 gene_id:81341|Hs108|chr11 ( 305) 761 140.7 1.1e-33
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 1258 init1: 1258 opt: 1258 Z-score: 1173.0 bits: 225.0 E(32554): 5.2e-59
Smith-Waterman score: 1258; 75.9% identity (90.4% similar) in 249 aa overlap (3-251:25-273)
10 20 30
pF1KE0 MANSSSVTEFLVLGFSSLGELQLVLFAVFLCLYLIILS
: . :::::.::::::::.::.::.::: :::.:::
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GNIIIISVIHLDHSLHTPMYFFLGILSISEIFYTTVILPKMLINLFSVFRTLSFVSCATQ
::. ::::::::.:::::::::::::: :: ::: ::::::::::.:: ::.:: :: :
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 MFFFLGFAVTNCLLLGVMGYDCYAAICQPLQYAVLMSWKVCGQLIATCIISGFLISLVGT
::::::::.:::::::::::: :::::.::.: .::::.:::.: :.: :.::: ::. .
CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 TFVFSLPFCGSNKVNHYFCDISPVIRLACADSYISELVIFIFGVLVLVVPLIFICISYGF
..:::::::..::::::::::: :: :::... ..:.:::: ::::::::..:::.::
CCDS30 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYLC
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250
pF1KE0 IVRTILKIPSAEGKQKAFSTCASHLIVVIVHYG
:.:::::::::::..:::::::::: :::::::
CCDS30 ILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYTI
250 260 270 280 290 300
CCDS30 VTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
310 320 330
>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 951 init1: 904 opt: 992 Z-score: 929.6 bits: 179.8 E(32554): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 992; 58.5% identity (87.5% similar) in 248 aa overlap (4-251:7-253)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANSSSVTEFLVLGFSSLGELQLVLFAVFLCLYLIILSGNIIIISVIHLDHSLHTPM
.. ::.:...::::::::::.::..:: ::: :: .:. :..::... .:::::
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLGILSISEIFYTTVILPKMLINLFSVFRTLSFVSCATQMFFFLGFAVTNCLLLGVMG
: :: :::.:: :: ::.:..:..:.: .:.::..::::.::::::: :::::..:::
CCDS30 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDCYAAICQPLQYAVLMSWKVCGQLIATCIISGFLISLVGTTFVFSLPFCGSNKVNHYFC
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CCDS30 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DISPVIRLACADSYISELVIFIFGVLVLVVPLIFICISYGFIVRTILKIPSAEGKQKAFS
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CCDS30 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGK-KAFV
190 200 210 220 230
240 250
pF1KE0 TCASHLIVVIVHYG
:::::: ::.::::
CCDS30 TCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVKT
240 250 260 270 280 290
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 935 init1: 935 opt: 935 Z-score: 877.4 bits: 170.2 E(32554): 1.5e-42
Smith-Waterman score: 935; 58.9% identity (82.7% similar) in 248 aa overlap (3-250:5-252)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANSSSVTEFLVLGFSSLGELQLVLFAVFLCLYLIILSGNIIIISVIHLDHSLHTPMY
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CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
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pF1KE0 FFLGILSISEIFYTTVILPKMLINLFSVFRTLSFVSCATQMFFFLGFAVTNCLLLGVMGY
:::.::: ::: :: ::.::::..:.: .:.::..:: ::: :: :. .. .::..:::
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGY
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pF1KE0 DCYAAICQPLQYAVLMSWKVCGQLIATCIISGFLISLVGTTFVFSLPFCGSNKVNHYFCD
: : :::.::.:.:::. :: :.:. :: .::: :..:: ::: .::...:.:::
CCDS30 DRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACGFTVSLVTTSLVFHLPFHSSNQLHHFFCD
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pF1KE0 ISPVIRLACADSYISELVIFIFGVLVLVVPLIFICISYGFIVRTILKIPSAEGKQKAFST
::::..:: : .:.::::..::..::.::..: .:: :. .::::::. :. :.:::
CCDS30 ISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTFST
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240 250
pF1KE0 CASHLIVVIVHYG
:::::::: :::
CCDS30 CASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKEFKSA
250 260 270 280 290 300
>>CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 (329 aa)
initn: 858 init1: 858 opt: 905 Z-score: 849.6 bits: 165.1 E(32554): 5.3e-41
Smith-Waterman score: 905; 53.2% identity (81.6% similar) in 250 aa overlap (3-251:5-254)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANSSSVTEFLVLGFSSLG-ELQLVLFAVFLCLYLIILSGNIIIISVIHLDHSLHTPM
::. ::::: ::::. . .::.:.::: :::. ::::.::...:.::: :::::
CCDS30 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTIIRLDHHLHTPM
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pF1KE0 YFFLGILSISEIFYTTVILPKMLINLFSVFRTLSFVSCATQMFFFLGFAVTNCLLLGVMG
:::: .::::: ::..:.:.:: .:.. . .. :::::.::.: :...::.:: :::
CCDS30 YFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCATQLFFYLTFGINNCFLLTVMG
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDCYAAICQPLQYAVLMSWKVCGQLIATCIISGFLISLVGTTFVFSLPFCGSNKVNHYFC
:: :.:::.::.:.:.:. ..: :: . . :. ...: .: ::.:::: . ..:.::
CCDS30 YDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQVTSVFGLPFCDAFVISHFFC
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 DISPVIRLACADSYISELVIFIFGVLVLVVPLIFICISYGFIVRTILKIPSAEGKQKAFS
:. ...:::.:. ..:.. :. .: :::.:. .. ::: .:. ::::: ::::..:::.
CCDS30 DVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYVLIISTILKIASAEGQKKAFA
190 200 210 220 230 240
240 250
pF1KE0 TCASHLIVVIVHYG
:::::: :::.:::
CCDS30 TCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYTHHSPTEPCCVQPEEQGGQRC
250 260 270 280 290 300
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
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Smith-Waterman score: 904; 54.6% identity (81.9% similar) in 249 aa overlap (3-251:5-253)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANSSSVTEFLVLGFSSLGELQLVLFAVFLCLYLIILSGNIIIISVIHLDHSLHTPMY
: .: .:. ::::: :::::.:::.:: :::. :..:..:: .:.:: ::::::
CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FFLGILSISEIFYTTVILPKMLINLFSVFRTLSFVSCATQMFFFLGFAVTNCLLLGVMGY
.::..::.:: :: :.:.:: .: . ...:.:.::.:::: ..: :::.::..::.
CCDS30 LFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWACTNCFLLAAMGF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DCYAAICQPLQYAVLMSWKVCGQLIATCIISGFLISLVGTTFVFSLPFCGSNKVNHYFCD
: :.::: ::.:: :. .:.::. : ...:.:..: : .: : ::.:....:.:::
CCDS30 DRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMTLVIFHLSFCSSHEIQHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ISPVIRLACADSYISELVIFIFGVLVLVVPLIFICISYGFIVRTILKIPSAEGKQKAFST
::. :::.:. ::: :::...:::.: ..:: :::..:. .::.::::::..:::::
CCDS30 TPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIPSAEGQKKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250
pF1KE0 CASHLIVVIVHYG
::::: :::.:::
CCDS30 CASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIVYSLRNRAIQTA
250 260 270 280 290 300
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 893 init1: 572 opt: 899 Z-score: 844.3 bits: 164.1 E(32554): 1e-40
Smith-Waterman score: 899; 53.8% identity (82.3% similar) in 249 aa overlap (3-250:16-262)
10 20 30 40
pF1KE0 MANSSSVTEFLVLGFSSLGELQLVLFAVFLCLYLIILSGNIIIISVI
: . .:.:. ::::. : :..::.::: ::.. :.:::::...:
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 HLDHSLHTPMYFFLGILSISEIFYTTVILPKMLINLFSVFRTLSFVSCATQMFFFLGFAV
..: :::::::::..:: :: :: ::::.:: .: .. . .:...::::::::. :..
CCDS11 RMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFGI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 TNCLLLGVMGYDCYAAICQPLQYAVLMSWKVCGQLI-ATCIISGFLISLVGTTFVFSLPF
:::.:: .:::: :.:::.::.: :.:. .. ::. ..: : :...... .: :: :::
CCDS11 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSI-GLIVAITQVTSVFRLPF
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 CGSNKVNHYFCDISPVIRLACADSYISELVIFIFGVLVLVVPLIFICISYGFIVRTILKI
: . :: :.:::: ::..:.: :. ..:.. .:..:::::::. .. ::: .:. :::::
CCDS11 C-ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKI
180 190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KE0 PSAEGKQKAFSTCASHLIVVIVHYG
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CCDS46 IPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFST
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pF1KE0 CASHLIVVIVHYG
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CCDS46 CASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKEA
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CCDS12 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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CCDS12 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
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CCDS12 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
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pF1KE0 TCASHLIVVIVHYG
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CCDS12 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]