Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0820
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0820, 194 aa
1>>>pF1KE0820 194 - 194 aa - 194 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2874+/-0.00111; mu= 13.2613+/- 0.066
mean_var=76.3899+/-17.099, 0's: 0 Z-trim(103.1): 351 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.146743
statistics sampled from 6891 (7246) to 6891 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 1.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 690 155.7 2.6e-38
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 690 155.7 2.6e-38
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 685 154.7 5.6e-38
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 682 154.0 8.4e-38
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 663 150.0 1.4e-36
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 661 149.6 1.9e-36
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 657 148.7 3.2e-36
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 655 148.3 4.4e-36
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 651 147.5 8e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 650 147.3 1e-35
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 649 147.0 1.1e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 647 146.6 1.4e-35
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 644 146.0 2.2e-35
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 643 145.8 2.6e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 640 145.2 4.1e-35
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 638 144.7 5.3e-35
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 638 144.7 5.5e-35
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 634 143.9 9.6e-35
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 630 143.0 1.7e-34
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 629 142.8 2e-34
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 626 142.2 3.1e-34
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 626 142.2 3.1e-34
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 626 142.2 3.1e-34
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 623 141.5 4.8e-34
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 623 141.5 4.8e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 623 141.5 4.9e-34
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 622 141.3 5.6e-34
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 611 139.0 2.8e-33
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 608 138.4 4.4e-33
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 608 138.4 4.6e-33
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 607 138.2 5.3e-33
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 605 137.7 6.8e-33
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 602 137.1 1.1e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 600 136.7 1.5e-32
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 598 136.2 1.9e-32
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 596 135.8 2.5e-32
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 594 135.4 3.4e-32
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 594 135.4 3.4e-32
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 592 135.0 4.6e-32
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 582 132.9 2e-31
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 580 132.4 2.7e-31
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 580 132.5 2.9e-31
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 578 132.0 3.7e-31
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 577 131.8 4.3e-31
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 569 130.1 1.3e-30
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 564 129.1 3.1e-30
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 563 128.8 3.2e-30
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 562 128.6 3.7e-30
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 562 128.6 3.7e-30
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 562 128.6 3.8e-30
>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 695 init1: 527 opt: 690 Z-score: 801.2 bits: 155.7 E(32554): 2.6e-38
Smith-Waterman score: 690; 53.2% identity (83.2% similar) in 190 aa overlap (1-190:118-306)
10 20 30
pF1KE0 MPYDRYVAICNPLIYTAIMTQRVCRELVIG
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CCDS31 KKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAYDRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSL
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VYTYGFRNSVIQTALTFQLSFCNSDVIHHFYCADPPLLALSCSDTHNKEKQLMIFSAVNL
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CCDS31 TYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCDIAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TGSLLTIFISYICILFSIIKIQSSEGKCRAFSTRASHLTVVTIFYGTLFFMYLQQPKAGN
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CCDS31 VFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFSTCASHMIAVTVFYGTMLFMYLQ-PQTNH
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KE0 SWKPNKVVSVFYSLVIPMLNPLIYRLRNTEVKDALKKMLEGKEL
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CCDS31 SLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVALKKFMENPCYSFKSM
270 280 290 300 310
>>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 702 init1: 676 opt: 690 Z-score: 801.2 bits: 155.7 E(32554): 2.6e-38
Smith-Waterman score: 690; 53.7% identity (83.7% similar) in 190 aa overlap (1-189:118-306)
10 20 30
pF1KE0 MPYDRYVAICNPLIYTAIMTQRVCRELVIG
: :::::::::::.: .....:.: ::
CCDS31 KKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAYDRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSL
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VYTYGFRNSVIQTALTFQLSFCNSDVIHHFYCADPPLLALSCSDTHNKEKQLMIFSAVNL
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CCDS31 TYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCDNVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNV
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TGSLLTIFISYICILFSIIKIQSSEGKCRAFSTRASHLTVVTIFYGTLFFMYLQQPKAGN
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CCDS31 VGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFSTCASHMMAVTIFYGTLLFMYVQ-PRSNH
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KE0 SWKPN-KVVSVFYSLVIPMLNPLIYRLRNTEVKDALKKMLEGKEL
: . :..::::.::::::::::: ::: .:: ::....
CCDS31 SLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKTALQRFMTNLCYSFKTM
270 280 290 300 310
>>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 526 init1: 526 opt: 685 Z-score: 795.3 bits: 154.7 E(32554): 5.6e-38
Smith-Waterman score: 685; 52.1% identity (84.4% similar) in 192 aa overlap (1-190:118-306)
10 20 30
pF1KE0 MPYDRYVAICNPLIYTAIMTQRVCRELVIG
: ::::.::::::.::..:..::: ...
CCDS31 SRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAYDRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVL
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VYTYGFRNSVIQTALTFQLSFCNSDVIHHFYCADPPLLALSCSDTHNKEKQLMIFSAVNL
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CCDS31 AYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCDIPPLLALSCTDTQIN--QLLLFALCSF
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140
pF1KE0 --TGSLLTIFISYICILFSIIKIQSSEGKCRAFSTRASHLTVVTIFYGTLFFMYLQQPKA
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CCDS31 IQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFSTCASHLIAVTLFYGALLFMYLQ-PTT
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190
pF1KE0 GNSWKPNKVVSVFYSLVIPMLNPLIYRLRNTEVKDALKKMLEGKEL
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CCDS31 SYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
270 280 290 300 310 320
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 684 init1: 520 opt: 682 Z-score: 792.2 bits: 154.0 E(32554): 8.4e-38
Smith-Waterman score: 682; 52.6% identity (82.0% similar) in 194 aa overlap (1-192:118-308)
10 20 30
pF1KE0 MPYDRYVAICNPLIYTAIMTQRVCRELVIG
: :::::::::::.: ..:: .: .::
CCDS41 KQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAYDRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAV
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40 50 60 70 80
pF1KE0 VYTYGFRNSVIQTALTFQLSFCNSDVIHHFYCADPPLLALSCSDTHNKEKQLMIFS--AV
:.:.: ....: :::.::.:.:....:::: : ::: :.:::: . ::: ::. ..
CCDS41 PYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCDDMPLLRLTCSDT--RFKQLWIFACAGI
150 160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 NLTGSLLTIFISYICILFSIIKIQSSEGKCRAFSTRASHLTVVTIFYGTLFFMYLQQPKA
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CCDS41 MFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFSTCGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQ-PSS
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190
pF1KE0 GNSWKPNKVVSVFYSLVIPMLNPLIYRLRNTEVKDALKKMLEGKEL
... .:..::::...::::::::: :.: :::.::::.. .:
CCDS41 SHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEALKKIIINKN
270 280 290 300
>>CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 523 init1: 523 opt: 663 Z-score: 770.3 bits: 150.0 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 663; 51.6% identity (80.2% similar) in 192 aa overlap (1-192:118-308)
10 20 30
pF1KE0 MPYDRYVAICNPLIYTAIMTQRVCRELVIG
: :::::::.:: :.. :.. .: ::
CCDS53 EQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMALDRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTV
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VYTYGFRNSVIQTALTFQLSFCNSDVIHHFYCADPPLLALSCSDTHNKEKQLMIFSAVNL
: ::: :.. :: :::.::::.: :.:::::::::. :.::::. :. ... .. .:
CCDS53 PYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCADPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTL
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100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TGSLLTIFISYICILFSIIKIQSSEGKCRAFSTRASHLTVVTIFYGTLFFMYLQQPKAGN
..::. :..::. :. .:..:.:.::. .:::: :::::.::.:::::: ::.. :. .
CCDS53 SSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFSTCASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSE-K
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KE0 SWKPNKVVSVFYSLVIPMLNPLIYRLRNTEVKDALKKMLEGKEL
: . .:...:::... :::::::: ::: .: :...:..::
CCDS53 SVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILAIQQMIRGKSFCKIAV
270 280 290 300 310
>>CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 535 init1: 518 opt: 661 Z-score: 768.0 bits: 149.6 E(32554): 1.9e-36
Smith-Waterman score: 661; 51.6% identity (80.2% similar) in 192 aa overlap (1-192:118-308)
10 20 30
pF1KE0 MPYDRYVAICNPLIYTAIMTQRVCRELVIG
: :::::::.:: :.. :.. .: ::
CCDS53 EQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMALDRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTI
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VYTYGFRNSVIQTALTFQLSFCNSDVIHHFYCADPPLLALSCSDTHNKEKQLMIFSAVNL
: ::: .. :. :::.::::.: :.:::::::::. :.::::. :. ... .. ::
CCDS53 PYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCADPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TGSLLTIFISYICILFSIIKIQSSEGKCRAFSTRASHLTVVTIFYGTLFFMYLQQPKAGN
..::. :..::. :. .:..:.:.::. .:::: :::::.::.:::::: ::.. :. .
CCDS53 SSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFSTCASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSE-K
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KE0 SWKPNKVVSVFYSLVIPMLNPLIYRLRNTEVKDALKKMLEGKEL
: . .:...:::... :::::::: ::::.: :...:..::
CCDS53 SVEESKITAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNTDVILAMQQMIRGKSFHKIAV
270 280 290 300 310
>>CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 654 init1: 520 opt: 657 Z-score: 763.6 bits: 148.7 E(32554): 3.2e-36
Smith-Waterman score: 657; 51.9% identity (81.5% similar) in 189 aa overlap (1-189:117-304)
10 20 30
pF1KE0 MPYDRYVAICNPLIYTAIMTQRVCRELVIG
: ::::::: .:: :.. ..::: :.
CCDS53 SEKTISFAGCFTQCYIFIALLLTEFYMLAAMAYDRYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATF
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VYTYGFRNSVIQTALTFQLSFCNSDVIHHFYCADPPLLALSCSDTHNKEKQLMIFSAVNL
:.::: ....:. :::.:.:: :.::.:::::::::. ::::::. ::. ..: .. ::
CCDS53 PYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCRSSVINHFYCADPPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TGSLLTIFISYICILFSIIKIQSSEGKCRAFSTRASHLTVVTIFYGTLFFMYLQQPKAGN
..:: ...:: :: .:..:.:.::. .:::: .::. .::.:::::: ::.. : . .
CCDS53 SSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFSTCGSHMMAVTLFYGTLFCMYIR-PPTDK
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KE0 SWKPNKVVSVFYSLVIPMLNPLIYRLRNTEVKDALKKMLEGKEL
. . .:...:::..: :.:::::: ::: .::.:::..:
CCDS53 TVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIYSLRNKDVKQALKNVLR
270 280 290 300
>>CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 680 init1: 490 opt: 655 Z-score: 761.3 bits: 148.3 E(32554): 4.4e-36
Smith-Waterman score: 655; 52.1% identity (80.0% similar) in 190 aa overlap (1-190:118-306)
10 20 30
pF1KE0 MPYDRYVAICNPLIYTAIMTQRVCRELVIG
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CCDS31 SVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEALIKELSMKIYFS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]