Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0817
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0817, 254 aa
1>>>pF1KE0817 254 - 254 aa - 254 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3200+/-0.00119; mu= 14.5087+/- 0.070
mean_var=120.1829+/-38.238, 0's: 0 Z-trim(101.6): 379 B-trim: 744 in 2/47
Lambda= 0.116991
statistics sampled from 6122 (6589) to 6122 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 2.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 1291 229.7 1.9e-60
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 810 148.5 5.1e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 781 143.6 1.5e-34
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 780 143.5 1.7e-34
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CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 774 142.5 3.5e-34
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 772 142.1 4.3e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 768 141.4 6.9e-34
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 767 141.3 7.7e-34
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 767 141.3 7.7e-34
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 766 141.1 8.7e-34
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 765 140.9 9.8e-34
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 764 140.8 1.1e-33
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 762 140.4 1.4e-33
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 757 139.6 2.5e-33
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 757 139.6 2.5e-33
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 755 139.2 3.2e-33
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 755 139.3 3.2e-33
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 753 138.9 4e-33
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 753 138.9 4e-33
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 747 137.9 8e-33
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CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 742 137.0 1.4e-32
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 742 137.1 1.5e-32
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 740 136.7 1.9e-32
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 739 136.6 2.1e-32
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 737 136.2 2.6e-32
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 733 135.5 4.1e-32
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 732 135.3 4.6e-32
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 732 135.4 4.6e-32
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 732 135.4 4.6e-32
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 732 135.4 4.7e-32
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 729 134.8 6.5e-32
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 729 134.8 6.6e-32
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 726 134.3 9.3e-32
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 726 134.3 9.3e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 726 134.3 9.4e-32
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 724 134.0 1.2e-31
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 724 134.0 1.2e-31
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 724 134.0 1.2e-31
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 722 133.7 1.6e-31
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 721 133.5 1.7e-31
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 721 133.5 1.8e-31
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 720 133.3 1.9e-31
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 719 133.2 2.1e-31
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 717 132.8 2.7e-31
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 716 132.6 3e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 716 132.7 3e-31
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 716 132.7 3e-31
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 715 132.5 3.4e-31
>>CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 (335 aa)
initn: 1347 init1: 1291 opt: 1291 Z-score: 1198.6 bits: 229.7 E(32554): 1.9e-60
Smith-Waterman score: 1291; 74.0% identity (93.7% similar) in 254 aa overlap (1-254:23-276)
10 20 30
pF1KE0 MGDKGTGNHSDVTDFILEGFRVRPEFYILLFFLFLLIY
:::.::.:::..::::: :::::::..::::.:::..:
CCDS31 MLGSKPRVHLYILPCASQQVSTMGDRGTSNHSEMTDFILAGFRVRPELHILLFLLFLFVY
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMVLLGNISVMTIIVTDSQLNTPMYFFLGNLSFIDVSYSTVIAPKAMAHFLSEKKTVSFA
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CCDS31 AMILLGNVGMMTIIMTDPRLNTPMYFFLGNLSFIDLFYSSVIEPKAMINFWSENKSISFA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 GCVAQLFLFALFIVTEGFVLAAMAYDRFSAICNPLLHSVHMSRRLCTQLVAGSYFCGWAS
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CCDS31 GCVAQLFLFALLIVTEGFLLAAMAYDRFIAICNPLLYSVQMSTRLCTQLVAGSYFCGCIS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 SILQVSVTFSVSFCASRVIAHFYCDSYQIEKISCSNLFVNKMVSLSLSVIIILPTIVVII
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CCDS31 SVIQTSMTFTLSFCASRAVDHFYCDSRPLQRLSCSDLFIHRMISFSLSCIIILPTIIVII
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250
pF1KE0 VSYLYIVSSVLKIPSSEGRKKDFSTCSSHLGVVSLL
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CCDS31 VSYMYIVSTVLKIHSTEGHKKAFSTCSSHLGVVSVLYGAVFFMYLTPDRFPELSKVASLC
250 260 270 280 290 300
CCDS31 YSLVTPMLNPLIYSLRNKDVQEALKKFLEKKNIIL
310 320 330
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 803 init1: 803 opt: 810 Z-score: 760.2 bits: 148.5 E(32554): 5.1e-36
Smith-Waterman score: 810; 47.6% identity (78.0% similar) in 246 aa overlap (8-253:7-252)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGDKGTGNHSDVTDFILEGFRVRPEFYILLFFLFLLIYSMVLLGNISVMTIIVTDSQLNT
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CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PMYFFLGNLSFIDVSYSTVIAPKAMAHFLSEKKTVSFAGCVAQLFLFALFIVTEGFVLAA
::::::.::::.:. : . :.:: ...::::.:..:. ::. :...: : ::.:.:::
CCDS79 PMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAA
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pF1KE0 MAYDRFSAICNPLLHSVHMSRRLCTQLVAGSYFCGWASSILQVSVTFSVSFCASRVIAHF
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CCDS79 MAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 YCDSYQIEKISCSNLFVNKMVSLSLSVIIILPTIVVIIVSYLYIVSSVLKIPSSEGRKKD
.:: . :.::.. .:. . . . . . ...::.::..:. ::::: : ::::
CCDS79 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
180 190 200 210 220 230
250
pF1KE0 FSTCSSHLGVVSLL
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CCDS79 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
240 250 260 270 280 290
>>CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 (310 aa)
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Smith-Waterman score: 781; 45.9% identity (80.9% similar) in 246 aa overlap (9-254:5-250)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGDKGTGNHSDVTDFILEGFRVRPEFYILLFFLFLLIYSMVLLGNISVMTIIVTDSQLNT
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CCDS31 MAAKNSSVTEFILEGLTHQPGLRIPLFFLFLGFYTVTVVGNLGLITLIGLNSHLHT
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pF1KE0 PMYFFLGNLSFIDVSYSTVIAPKAMAHFLSEKKTVSFAGCVAQLFLFALFIVTEGFVLAA
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CCDS31 PMYFFLFNLSLIDFCFSTTITPKMLMSFVSRKNIISFTGCMTQLFFFCFFVVSESFILSA
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pF1KE0 MAYDRFSAICNPLLHSVHMSRRLCTQLVAGSYFCGWASSILQVSVTFSVSFCASRVIAHF
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CCDS31 MAYDRYVAICNPLLYTVTMSCQVCLLLLLGAYGMGFAGAMAHTGSIMNLTFCADNLVNHF
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pF1KE0 YCDSYQIEKISCSNLFVNKMVSLSLSVIIILPTIVVIIVSYLYIVSSVLKIPSSEGRKKD
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CCDS31 MCDILPLLELSCNSSYMNELVVFIVVAVDVGMPIVTVFISYALILSSILHNSSTEGRSKA
180 190 200 210 220 230
250
pF1KE0 FSTCSSHLGVVSLL
:::::::. ::::.
CCDS31 FSTCSSHIIVVSLFFGSGAFMYLKPLSILPLEQGKVSSLFYTIIVPVLNPLIYSLRNKDV
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>>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa)
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Smith-Waterman score: 780; 47.4% identity (78.1% similar) in 247 aa overlap (8-254:5-251)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGDKGTGNHSDVTDFILEGFRVRPEFYILLFFLFLLIYSMVLLGNISVMTIIVTDSQLNT
: . ::.::: : ::. : ::..::..:.... ::....:. .::.:.:
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQT
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pF1KE0 PMYFFLGNLSFIDVSYSTVIAPKAMAHFLSEKKTVSFAGCVAQLFLFALFIVTEGFVLAA
:::::: .:..:... ::::::: . .:: .:::.:: :..:: : .:::.: ..::
CCDS31 PMYFFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLAL
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pF1KE0 MAYDRFSAICNPLLHSVHMSRRLCTQLVAGSYFCGWASSILQVSVTFSVSFCASRVIAHF
:::::. :::::::. : .::::: ::. .:. :....:. : .::::.:.: .: ::
CCDS31 MAYDRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 YCDSYQIEKISCSNLFVNKMVSLSLSVIIILPTIVVIIVSYLYIVSSVLKIPSSEGRKKD
:::. . .:::. .. . : . .. .. ......:::. :: :.::: :::::::
CCDS31 YCDNVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKA
180 190 200 210 220 230
250
pF1KE0 FSTCSSHLGVVSLL
::::.::. .:...
CCDS31 FSTCASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKD
240 250 260 270 280 290
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
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Smith-Waterman score: 780; 46.6% identity (77.3% similar) in 247 aa overlap (8-254:5-251)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGDKGTGNHSDVTDFILEGFRVRPEFYILLFFLFLLIYSMVLLGNISVMTIIVTDSQLNT
:.. .:.::. :: :. .::: .:.: : .: ::: .. ::: .:.:
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PMYFFLGNLSFIDVSYSTVIAPKAMAHFLSEKKTVSFAGCVAQLFLFALFIVTEGFVLAA
:::.:::::.:::. :.: .:. :.:.::.::..:..:::.::: :..:. .: ..:::
CCDS46 PMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 MAYDRFSAICNPLLHSVHMSRRLCTQLVAGSYFCGWASSILQVSVTFSVSFCASRVIAHF
:::::. :::::: .:: .:. ::.::.:. . :. .:.... .:: . ::.. : .:
CCDS46 MAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 YCDSYQIEKISCSNLFVNKMVSLSLSVIIILPTIVVIIVSYLYIVSSVLKIPSSEGRKKD
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CCDS46 FCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKA
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250
pF1KE0 FSTCSSHLGVVSLL
::::.:::..: :.
CCDS46 FSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDI
240 250 260 270 280 290
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 794 init1: 768 opt: 774 Z-score: 727.2 bits: 142.5 E(32554): 3.5e-34
Smith-Waterman score: 774; 44.9% identity (79.4% similar) in 247 aa overlap (8-254:6-252)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGDKGTGNHSDVTDFILEGFRVRPEFYILLFFLFLLIYSMVLLGNISVMTIIVTDSQLNT
:.. :: ::: :. .:.. :.::.::: .: ..: :.:....: ::.:.
CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHM
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pF1KE0 PMYFFLGNLSFIDVSYSTVIAPKAMAHFLSEKKTVSFAGCVAQLFLFALFIVTEGFVLAA
::::::.::::.:. : . ::: .. ...:.::.::.::..: :.: . .:: :.:::
CCDS31 PMYFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MAYDRFSAICNPLLHSVHMSRRLCTQLVAGSYFCGWASSILQVSVTFSVSFCASRVIAHF
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CCDS31 MAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 YCDSYQIEKISCSNLFVNKMVSLSLSVIIILPTIVVIIVSYLYIVSSVLKIPSSEGRKKD
.:: . .:::. :....:.. .::.. . ...:...:: :::..:.:: :. :: :
CCDS31 FCDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKA
180 190 200 210 220 230
250
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]