FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0814, 256 aa
1>>>pF1KE0814 256 - 256 aa - 256 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1079+/-0.00141; mu= 10.5836+/- 0.083
mean_var=136.9000+/-43.156, 0's: 0 Z-trim(100.8): 371 B-trim: 718 in 2/44
Lambda= 0.109616
statistics sampled from 5779 (6239) to 5779 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 2.000
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 698 122.7 3.1e-28
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 695 122.2 4.4e-28
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CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 686 120.8 1.2e-27
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CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 685 120.6 1.3e-27
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 680 119.8 2.2e-27
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 677 119.3 3.1e-27
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 674 118.9 4.3e-27
>>CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1008; 68.0% identity (87.7% similar) in 228 aa overlap (28-255:1-228)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVLILRYHYSELIPISISLTGIKKHKSMADVNFTLVTEFILLELTDRAELKMVLFVLFLL
::: :::.::::::: :::.:::: ::::.::.
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70 80 90 100 110 120
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::.:.:. :.::..:: .: :::::::..:::::::::::::..::.::.:..: . ::
CCDS31 IYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTPMYFLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATIS
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::::.::.. : ..:::::::..::::::.:::.::::::::. :. :. :: .::.
CCDS31 FSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVMAYDRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGI
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 INSLTHTIGLVKLSFCGPNVISHFFCDLPPLLKLSCSETSMNELLLLIFSGIIATLTFLT
.:.: :::.: .:::: :..::::::.: :::::::.::::::::: :::.:: ::::
CCDS31 VNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSHFFCDIPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLT
160 170 180 190 200 210
250
pF1KE0 VVISYIFIVAAILRIR
:.::::::. : :::
CCDS31 VIISYIFIAFASLRIHSASGRQQAFSTCASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKV
220 230 240 250 260 270
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
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Smith-Waterman score: 825; 52.0% identity (80.2% similar) in 227 aa overlap (30-256:5-231)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVLILRYHYSELIPISISLTGIKKHKSMADVNFTLVTEFILLELTDRAELKMVLFVLFLL
: :.::::::::: . : ::..:::..::
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLT
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IYTISLVGNIGMLFLIYVTPKLHTPMYYFLSCLSFVDACYSSVFAPRMLLNFFVERETIL
.:.: :.::::...:: . :.:.::::.::: ::::: :: : ..:.::.::. : ..:
CCDS79 LYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSIS
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pF1KE0 FSACIVQYFLFVSLLTTEGFLLATMAYDRYMAIVNPLLYTVAMTKIVCIVLAFGSCMGGL
. .: .:...: .. ::.:.::.::::::.:: :::::::.:.. .:. : : .::
CCDS79 YYGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGN
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 INSLTHTIGLVKLSFCGPNVISHFFCDLPPLLKLSCSETSMNELLLLIFSGIIATLTFLT
..::.:: :..: :::.::::::::::::::..:..:: :: ... . . :.
CCDS79 MSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFII
160 170 180 190 200 210
250
pF1KE0 VVISYIFIVAAILRIR
..:::.::. ..:.::
CCDS79 IIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKI
220 230 240 250 260 270
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
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Smith-Waterman score: 823; 52.9% identity (87.1% similar) in 225 aa overlap (32-256:5-229)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 VLILRYHYSELIPISISLTGIKKHKSMADVNFTLVTEFILLELTDRAELKMVLFVLFLLI
:......:.: ::..:::.. ::.::: :
CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YTISLVGNIGMLFLIYVTPKLHTPMYYFLSCLSFVDACYSSVFAPRMLLNFFVERETILF
:....:::.::..:: :.: :::::::::: ::::: :::::..:.::.::. ...:::.
CCDS31 YVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMYYFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILY
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pF1KE0 SACIVQYFLFVSLLTTEGFLLATMAYDRYMAIVNPLLYTVAMTKIVCIVLAFGSCMGGLI
: :.:: :.:: ....::.::..::::::.:: .::::.. :.. :: .:.... . :..
CCDS31 SECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFL
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pF1KE0 NSLTHTIGLVKLSFCGPNVISHFFCDLPPLLKLSCSETSMNELLLLIFSGIIATLTFLTV
..:::: ...::::: ..:.:.:::. :::.::::.: .:::::.:..:. . . :.:
CCDS31 SALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAV
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250
pF1KE0 VISYIFIVAAILRIR
..:: ::. .::.::
CCDS31 AVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVS
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>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 (313 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 VLILRYHYSELIPISISLTGIKKHKSMADVNFTLVTEFILLELTDRAELKMVLFVLFLLI
: .::::::: :::. :... :: :::..
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFQQPLFFLFLVV
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pF1KE0 YTISLVGNIGMLFLIYVTPKLHTPMYYFLSCLSFVDACYSSVFAPRMLLNFFVERETILF
: ...:::.:...:. .. .::::::::: :::.: ::::::.:.::.:: ... : .
CCDS31 YIVTMVGNLGLIILFGLNSHLHTPMYYFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISY
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pF1KE0 SACIVQYFLFVSLLTTEGFLLATMAYDRYMAIVNPLLYTVAMTKIVCIVLAFGSCMGGLI
.:..: :.:. .. .: ..:..::::::.:: ::::: :.:.. :: .:.:.. . ::
CCDS31 VGCMTQLFFFLFFVISECYMLTSMAYDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLA
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pF1KE0 NSLTHTIGLVKLSFCGPNVISHFFCDLPPLLKLSCSETSMNELLLLIFSGIIATLTFLTV
.. .:: ...:.::. :.:.:..::. :::.:::. : .::...:: :: . :.
CCDS31 GATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLCDILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGINIMVPSCTI
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250
pF1KE0 VISYIFIVAAILRIR
.:::.:::..::.:.
CCDS31 LISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFSTCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSSGSMEQGKVSS
220 230 240 250 260 270
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
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Smith-Waterman score: 753; 49.8% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (32-256:3-227)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 VLILRYHYSELIPISISLTGIKKHKSMADVNFTLVTEFILLELTDRAELKMVLFVLFLLI
: : ::::::. ::: ::.. ::..::.:
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YTISLVGNIGMLFLIYVTPKLHTPMYYFLSCLSFVDACYSSVFAPRMLLNFFVERETILF
: :.::::.::. :: . ::::::.::: ::.:: :::. .:.....:.. . ::.
CCDS31 YLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILY
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.:: .:.:.::...:.:.::::.:::::: :. .:: ::..:: :: ::.:: . :..
CCDS31 NACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYDRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFL
100 110 120 130 140 150
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pF1KE0 NSLTHTIGLVKLSFCGPNVISHFFCDLPPLLKLSCSETSMNELLLLIFSGIIATLTFLTV
:. :: . .:::: ::. ::::: :::: ::::.. ..:..... :. ...:..
CCDS31 NASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDAPPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVI
160 170 180 190 200 210
250
pF1KE0 VISYIFIVAAILRIR
.:::.:: .:...:
CCDS31 LISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTCASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMA
220 230 240 250 260 270
>>CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 (320 aa)
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Smith-Waterman score: 751; 49.8% identity (81.3% similar) in 219 aa overlap (38-256:15-233)
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pF1KE0 HYSELIPISISLTGIKKHKSMADVNFTLVTEFILLELTDRAELKMVLFVLFLLIYTISLV
::.:: .:.: .:...::. : .: .::.
CCDS35 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GNIGMLFLIYVTPKLHTPMYYFLSCLSFVDACYSSVFAPRMLLNFFVERETILFSACIVQ
::.:: .:: . .::::::.::. ::..::::::...:.::..... : :: ..:: .:
CCDS35 GNMGMALLIRMDARLHTPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YFLFVSLLTTEGFLLATMAYDRYMAIVNPLLYTVAMTKIVCIVLAFGSCMGGLINSLTHT
.:.:..: :: :::.::::::.:: ::::::.::.. .:..: .: .:: .....::
CCDS35 MFVFAGLADTECCLLAAMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IGLVKLSFCGPNVISHFFCDLPPLLKLSCSETSMNELLLLIFSGIIATLTFLTVVISYIF
.:::: :. ::::.:::: .:::.::.:::::. . :.: : : :....:: :
CCDS35 TLTFRLSFCRSRKINSFFCDIPPLLAISCSDTSLNELLLFAICGFIQTATVLAITVSYGF
170 180 190 200 210 220
250
pF1KE0 IVAAILRIR
:..:....:
CCDS35 IAGAVIHMRSVEGSRRAASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTL
230 240 250 260 270 280
>>CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 (313 aa)
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Smith-Waterman score: 747; 50.2% identity (79.0% similar) in 229 aa overlap (28-256:3-230)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVLILRYHYSELIPISISLTGIKKHKSMADVNFTLVTEFILLELTDRAELKMVLFVLFLL
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CCDS31 VLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAFSTCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKV
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CCDS31 LISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFSTCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSSGSMEQGKVSS
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CCDS41 IYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMYFFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVIS
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CCDS41 FDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAYDRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSF
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CCDS41 LMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCDDMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLI
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CCDS41 VFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFSTCGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKM
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CCDS31 IYMANMVGNLGMIVLIKIDLCLHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAIS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]