Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0812
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0812, 312 aa
1>>>pF1KE0812 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2198+/-0.00123; mu= 10.7483+/- 0.071
mean_var=183.4371+/-62.174, 0's: 0 Z-trim(103.7): 393 B-trim: 436 in 1/45
Lambda= 0.094696
statistics sampled from 7060 (7552) to 7060 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 1142 169.2 3.7e-42
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 1130 167.5 1.2e-41
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 1110 164.8 7.7e-41
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 1065 158.7 5.5e-39
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 1059 157.8 9.6e-39
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 1042 155.5 4.9e-38
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 970 145.7 4.4e-35
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 956 143.8 1.7e-34
CCDS31701.1 OR10S1 gene_id:219873|Hs108|chr11 ( 331) 953 143.4 2.3e-34
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 941 141.7 6.9e-34
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 937 141.2 1e-33
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 935 140.9 1.2e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 926 139.7 2.9e-33
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 924 139.4 3.4e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 924 139.4 3.5e-33
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 924 139.4 3.5e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 921 139.0 4.6e-33
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 920 138.9 5.1e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 919 138.7 5.5e-33
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 917 138.5 6.8e-33
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 916 138.3 7.4e-33
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 914 138.1 9.6e-33
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 908 137.2 1.6e-32
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 908 137.3 1.7e-32
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 906 136.9 1.9e-32
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 899 136.0 3.7e-32
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 897 135.7 4.5e-32
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 897 135.8 4.6e-32
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 896 135.6 4.9e-32
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 895 135.4 5.4e-32
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 895 135.4 5.4e-32
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 895 135.4 5.4e-32
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 889 134.6 9.5e-32
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 883 133.9 1.8e-31
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 881 133.5 2e-31
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 879 133.3 2.5e-31
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 877 133.0 3e-31
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 877 133.0 3e-31
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 876 132.8 3.2e-31
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 875 132.7 3.6e-31
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 873 132.4 4.3e-31
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 873 132.4 4.3e-31
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 873 132.4 4.3e-31
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 871 132.1 5.2e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 869 131.9 6.3e-31
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 869 131.9 6.4e-31
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 869 131.9 6.4e-31
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 868 131.7 6.9e-31
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 867 131.6 7.6e-31
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 867 131.6 7.7e-31
>>CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 871 init1: 871 opt: 1142 Z-score: 870.3 bits: 169.2 E(32554): 3.7e-42
Smith-Waterman score: 1142; 55.4% identity (79.2% similar) in 298 aa overlap (3-299:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVKNCCMVTEFILLGIPHTEGLEMTLFVLFLPFYACTLLGNVSILVAVMSSARLHTPMY
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CCDS31 MSNATLLTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 FFLGNLSVFDMGFSSVTCPKMLLYLMGLS-RLISYKDCVCQLFFFHFLGSIECFLFTVMA
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFTAICYPLRYTVIMNPRICVALAVGTWLLGCIHSSILTSLTFTLPYCGPNEVDHFFC
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CCDS31 YDRYLAISYPLRYTNMMTGRSCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFC
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DIPALLPLACADTSLAQRVSFTNVGLISLVCFLLILLSYTRITISILSIRTTEGRRRAFS
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CCDS31 DAPPILKLACADTSANEMVIFVNIGLVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGRHRAFQ
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSAHLIAILCAYGPIITVYLQPTPNPMLGTVVQILMNLVGPMLNPLIYTLRNKEVKTAL
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CCDS31 TCASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRDALHGVVAVFYTTLTPLFNPVVYTLRNKEVKKAL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 KTILHRTGHVPES
CCDS31 LKLKNGSVFAQGE
300 310
>>CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1154 init1: 848 opt: 1130 Z-score: 861.4 bits: 167.5 E(32554): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 1130; 53.1% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (3-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVKNCCMVTEFILLGIPHTEGLEMTLFVLFLPFYACTLLGNVSILVAVMSSARLHTPMY
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CCDS31 MSNASLVTAFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
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pF1KE0 FFLGNLSVFDMGFSSVTCPKMLLYLMGLS-RLISYKDCVCQLFFFHFLGSIECFLFTVMA
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CCDS31 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
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pF1KE0 YDRFTAICYPLRYTVIMNPRICVALAVGTWLLGCIHSSILTSLTFTLPYCGPNEVDHFFC
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CCDS31 YDRYLAISYPLRYTSMMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFC
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pF1KE0 DIPALLPLACADTSLAQRVSFTNVGLISLVCFLLILLSYTRITISILSIRTTEGRRRAFS
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CCDS31 DAPPILKLACADTSANVMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRRAFQ
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSAHLIAILCAYGPIITVYLQPTPNPMLGTVVQILMNLVGPMLNPLIYTLRNKEVKTAL
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CCDS31 TCASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAMDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKAV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 KTILHRTGHVPES
. ...:
CCDS31 LKLRDKVAHPQRK
300 310
>>CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1134 init1: 834 opt: 1110 Z-score: 846.7 bits: 164.8 E(32554): 7.7e-41
Smith-Waterman score: 1110; 53.3% identity (78.8% similar) in 302 aa overlap (8-308:6-307)
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CCDS31 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
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pF1KE0 FFLGNLSVFDMGFSSVTCPKMLLYLMGLS-RLISYKDCVCQLFFFHFLGSIECFLFTVMA
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CCDS31 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
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pF1KE0 YDRFTAICYPLRYTVIMNPRICVALAVGTWLLGCIHSSILTSLTFTLPYCGPNEVDHFFC
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CCDS31 YDRYLAISYPLRYTSMMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYLC
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pF1KE0 DIPALLPLACADTSLAQRVSFTNVGLISLVCFLLILLSYTRITISILSIRTTEGRRRAFS
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CCDS31 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHRAFQ
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pF1KE0 TCSAHLIAILCAYGPIITVYLQPTPNPMLGTVVQILMNLVGPMLNPLIYTLRNKEVKTAL
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CCDS31 TCASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVVDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKAV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 KTILHRTGHVPES
. ...:
CCDS31 LKLRDKVAHSQGE
300 310
>>CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 811 init1: 811 opt: 1065 Z-score: 813.4 bits: 158.7 E(32554): 5.5e-39
Smith-Waterman score: 1065; 50.2% identity (77.5% similar) in 307 aa overlap (3-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVKNCCMVTEFILLGIPHTEGLEMTLFVLFLPFYACTLLGNVSILVAVMSSARLHTPMY
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CCDS31 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTTMY
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pF1KE0 FFLGNLSVFDMGFSSVTCPKMLLYLMGLS-RLISYKDCVCQLFFFHFLGSIECFLFTVMA
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CCDS31 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKLLMTLVFPSGRAISFHSCMAQLYFFHFLGGTECFLYRVMS
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pF1KE0 YDRFTAICYPLRYTVIMNPRICVALAVGTWLLGCIHSSILTSLTFTLPYCGPNEVDHFFC
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CCDS31 CDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQHYLC
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pF1KE0 DIPALLPLACADTSLAQRVSFTNVGLISLVCFLLILLSYTRITISILSIRTTEGRRRAFS
: : .: ::::::: . : :..::... ::.::.:::. :. ::: :::.::..:::.
CCDS31 DAPPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGKHRAFQ
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pF1KE0 TCSAHLIAILCAYGPIITVYLQPTPNPMLGTVVQILMNLVGPMLNPLIYTLRNKEVKTAL
::..: :..:: .:: . .::.: . :: ...... :.:::..::::::::: ::
CCDS31 TCASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRKAVDGVVAVFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKAL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 KTILHRTGHVPES
. ...:
CCDS31 LKLKDKVAHSQSK
300 310
>>CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 (310 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MEVKNCCMVTEFILLGIPHTEGLEMTLFVLFLPFYACTLLGNVSILVAVMSSARLH
.::.:::::. : .:. ::..:. .: : :::. ::... .. .:
CCDS32 MGKTKNTSLDAVVTDFILLGLSHPPNLRSLLFLVFFIIYILTQLGNLLILLTMWADPKLC
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pF1KE0 T-PMYFFLGNLSVFDMGFSSVTCPKMLLYLMGLSRLISYKDCVCQLFFFHFLGSIECFLF
. :::..:: :: .:: .:::: : ..: . . : . :: ::.::::::: .:::.
CCDS32 ARPMYILLGVLSFLDMWLSSVTVPLLILDFTPSIKAIPFGGCVAQLYFFHFLGSTQCFLY
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pF1KE0 TVMAYDRFTAICYPLRYTVIMNPRICVALAVGTWLLGCIHSSILTSLTFTLPYCGPNEVD
:.:::::. ::: :::: :.:: :.:..:..:.:. : .:.:: ..::: :::::::.::
CCDS32 TLMAYDRYLAICQPLRYPVLMNGRLCTVLVAGAWVAGSMHGSIQATLTFRLPYCGPNQVD
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pF1KE0 HFFCDIPALLPLACADTSLAQRVSFTNVGLISLVCFLLILLSYTRITISILSIRTTEGRR
.:.:::::.: ::::::.. . :.:..::... ::.::::::. :. .::.::::.:::
CCDS32 YFICDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDVGVVAASCFMLILLSYANIVNAILKIRTTDGRR
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pF1KE0 RAFSTCSAHLIAILCAYGPIITVYLQP-TPNPMLGTVVQILMNLVGPMLNPLIYTLRNKE
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CCDS32 RAFSTCGSHLIVVTVYYVPCIFIYLRAGSKDPLDGAAA-VFYTVVTPLLNPLIYTLRNQE
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 VKTALKTILHRTGHVPES
::.::: :
CCDS32 VKSALKRITAG
300 310
>>CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 1065 init1: 902 opt: 1042 Z-score: 796.4 bits: 155.5 E(32554): 4.9e-38
Smith-Waterman score: 1042; 49.7% identity (76.0% similar) in 312 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEVKNCCMVTEFILLGIPHTEGLEMTLFVLFLPFYACTLLGNVSILVAVMSSARLHT-PM
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CCDS32 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
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pF1KE0 YFFLGNLSVFDMGFSSVTCPKMLL-YLMGLSRLISYKDCVCQLFFFHFLGSIECFLFTVM
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CCDS32 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGV-KPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLM
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pF1KE0 AYDRFTAICYPLRYTVIMNPRICVALAVGTWLLGCIHSSILTSLTFTLPYCGPNEVDHFF
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CCDS32 AYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFF
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pF1KE0 CDIPALLPLACADTSLAQRVSFTNVGLISLVCFLLILLSYTRITISILSIRTTEGRRRAF
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CCDS32 CDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAF
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240 250 260 270 280 290
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CCDS32 STCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLA
240 250 260 270 280 290
300 310
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CCDS32 LKRML-RSPRTPSEV
300 310
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CCDS41 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIMAY
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CCDS41 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVS-LRKHSAEGRRKALST
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CCDS41 CSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSAMK
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310
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. .:
CCDS41 QLRQRQVFFTKSYT
300 310
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CCDS32 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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CCDS32 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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CCDS32 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
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CCDS32 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIRE-HSSEGKSKAIST
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CCDS32 CTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMR
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.:
CCDS32 KLLSQHMFC
300
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