FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0808, 281 aa
1>>>pF1KE0808 281 - 281 aa - 281 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7911+/-0.00133; mu= 12.1732+/- 0.076
mean_var=150.4671+/-50.232, 0's: 0 Z-trim(102.1): 377 B-trim: 829 in 2/45
Lambda= 0.104557
statistics sampled from 6334 (6793) to 6334 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 2.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1125 182.4 3.7e-46
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1123 182.1 4.5e-46
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1113 180.6 1.3e-45
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1098 178.3 6.4e-45
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1045 170.3 1.6e-42
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1038 169.2 3.2e-42
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1027 167.6 1e-41
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1018 166.2 2.7e-41
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1002 163.8 1.4e-40
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 998 163.2 2.2e-40
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 982 160.8 1.2e-39
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 978 160.2 1.7e-39
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 970 159.0 4.1e-39
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 951 156.1 3e-38
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 941 154.6 8.3e-38
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 931 153.1 2.3e-37
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 924 152.0 4.9e-37
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 908 149.6 2.6e-36
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 894 147.5 1.1e-35
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 888 146.6 2.1e-35
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 886 146.3 2.6e-35
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 865 143.1 2.3e-34
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 849 140.7 1.2e-33
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 844 140.0 2.1e-33
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 840 139.4 3.4e-33
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 830 137.9 9.2e-33
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 822 136.7 2.1e-32
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 821 136.5 2.3e-32
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 808 134.6 9.1e-32
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 807 134.4 1e-31
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 803 133.9 1.6e-31
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 798 133.1 2.6e-31
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 793 132.3 4.3e-31
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 793 132.3 4.3e-31
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 780 130.3 1.7e-30
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 775 129.6 2.9e-30
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 758 127.0 1.7e-29
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 735 123.5 1.9e-28
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 705 119.0 4.3e-27
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 705 119.1 4.7e-27
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 700 118.3 7.8e-27
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 684 115.8 3.9e-26
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 679 115.1 6.5e-26
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 665 113.0 2.9e-25
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 662 112.5 3.8e-25
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 626 107.1 1.7e-23
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 604 103.8 1.7e-22
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 601 103.3 2.3e-22
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 572 98.9 4.7e-21
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 570 98.7 5.9e-21
>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 1014 init1: 541 opt: 1125 Z-score: 942.1 bits: 182.4 E(32554): 3.7e-46
Smith-Waterman score: 1125; 57.6% identity (85.5% similar) in 283 aa overlap (1-281:36-317)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
.::.:: :: .:: .:. ::.:: :.:.::
CCDS53 VTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNSILIVVIVMERNLHVPMYFFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
:::: ..::.....:..:::.:... .:.: .::.: ::.:..::.::::::::::::.
CCDS53 SMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESAILLAMAFDRF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
:::: ::::: .:: .: .:..:...::: : : :::. :: .: ::.:::::::.:
CCDS53 VAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTNIVPHSYCEHIG
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
.:::::..:.::: ::..: .. . ::..:: .::..::.:::.. : :: ::::::::
CCDS53 VARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHKALSTCGS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
:.:::.:::.:.::..:.:.:: ..::.:.:::...::: ::::::::.::::::::..
CCDS53 HLCVILMFYVPSFFTLLTHHFG-RNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVYGVKTKQIREG
250 260 270 280 290 300
270 280
pF1KE0 VILLFSPISV-CC
: : :.. ::
CCDS53 VAHRFFDIKTWCCTSPLGS
310 320
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1136 init1: 745 opt: 1123 Z-score: 940.6 bits: 182.1 E(32554): 4.5e-46
Smith-Waterman score: 1123; 58.5% identity (85.8% similar) in 275 aa overlap (1-274:37-311)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
::.::..:: ::..: . .:: :.::::
CCDS31 SDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALHAPMYLFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
.:. ... :.....:..:::::.:. .::::.:..::: .: :.. ::.::::::::::
CCDS31 CLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLAMAFDRY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
:::: ::::: ::. ... .::.... :: : :::::. :: :::. .. :.::::::
CCDS31 VAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTHTYCEHMG
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
::::::.::.:::.::::::::. ::: .:: ::: .::::::.. : :. ::::::::
CCDS31 IARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHKALSTCGS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
:: .:..:: :::::::.:::: . .:.:.::....:::::::.::::.::..::.:..:
CCDS31 HIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGARTKEIRSR
250 260 270 280 290 300
270 280
pF1KE0 VILLFSPISVCC
.. :.
CCDS31 LLKLLHLGKTSI
310
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 777 init1: 602 opt: 1113 Z-score: 932.5 bits: 180.6 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 1113; 59.1% identity (86.2% similar) in 276 aa overlap (1-274:40-312)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
.:.::. :: :.:.:.::.:::::.: ::
CCDS31 HTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQSLHEPMYYFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
.:: : .. :..:. :..:.:.::.. .::::.:.:.::::::. . :: .:.:::::::
CCDS31 AMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIVLVAMAFDRY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
.::: ::::: ::::. . :. ::.::... :..::. :: .::. ::::.::::::
CCDS31 IAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTYCEHMG
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGL-TVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCG
::::::..:.::: .:: ...:: ::..:::.::. ::.::: . :: ::.:::.:::
CCDS31 IARLACASIKVNIRFGLGNISLLL--LDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARLKALNTCG
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SHICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKD
::: ::. :.::::::::.:::: ..::..:::....:::.::: :::.::::.::::..
CCDS31 SHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFG-HNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQIRE
250 260 270 280 290 300
270 280
pF1KE0 RVILLFSPISVCC
::. .:
CCDS31 RVLRIFLKTNH
310
>>CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 (335 aa)
initn: 1118 init1: 967 opt: 1098 Z-score: 920.0 bits: 178.3 E(32554): 6.4e-45
Smith-Waterman score: 1098; 59.1% identity (84.2% similar) in 279 aa overlap (1-278:54-331)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
:::.:. :: .:: .:... ::::.:.::
CCDS41 NSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALEGNGILICVILSQAILHEPMYIFL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
::::::. ::.... :..:: ::. ::: .:..:::::::.:. .::.:::::::::
CCDS41 SMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQMFFIHFLFI-HSAVLLAMAFDRY
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRY-TILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
:::: :::: :::::... :: ::. .::.: : :::. .: :: ::: :..:::::
CCDS41 VAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSIFLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMG
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
::.:.:..:..:. :::..:::::::::.:: .:: ::.:::.. : :: ::::::::
CCDS41 IAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIHILQAVFRLLSQDARSKALSTCGS
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
:::::..::.::.:: .:.::::...: ..:::..::::..::::::.::::.:: : .
CCDS41 HICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSVPCYVHILLASLYVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEG
270 280 290 300 310 320
270 280
pF1KE0 VILLFSPISVCC
. .:: ..
CCDS41 AKQMFSNLAKGSK
330
>>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 477 init1: 477 opt: 1045 Z-score: 877.0 bits: 170.3 E(32554): 1.6e-42
Smith-Waterman score: 1045; 54.3% identity (84.1% similar) in 276 aa overlap (1-275:42-316)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
.:::::.:: .:..::..:.:::::...::
CCDS31 LSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVEHSLHEPMFFFL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
:::: ....:..:..:..:.:.:. . .:.: .:..::::.:. :: .::::.:::::.:
CCDS31 SMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDSAILMAMAFDHY
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
:::: ::::: ::: ... : ... ::: : : .::. : .: ::::.::::.:
CCDS31 VAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTRIIPHTYCEHIG
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
.:.:::..:..:. ::. : .... :..:: .::. :: ::: . : : :::.::::
CCDS31 VAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFGLPSQDACQKALGTCGS
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
:.:::.:::::::::.:::::: ... . .::. ..::...:: :::..::::::::.:.
CCDS31 HVCVILMFYTPAFFSILAHRFG-HNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMVYGVKTKQIRDK
260 270 280 290 300 310
270 280
pF1KE0 VILLFSPISVCC
::::::
CCDS31 VILLFSKGTG
320
>>CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 699 init1: 539 opt: 1038 Z-score: 871.4 bits: 169.2 E(32554): 3.2e-42
Smith-Waterman score: 1038; 56.2% identity (83.3% similar) in 276 aa overlap (1-274:36-308)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
.:..:. :: ..:.:.::.:::::.: :
CCDS53 DTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEPMYYCL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
.:: : .. :..:. :..:.:.::. .::::. .::::::::. : :: .:.:::::::
CCDS53 AMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAMAFDRY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
.::: :: :: ::::. . :. ::.::... :..::. :: .::. ::::.::::::
CCDS53 IAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTYCEHMG
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGL-TVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCG
::::::..:.:::..:: ...:: ::..:::.:. ::.::: . :: ::.:::.:::
CCDS53 IARLACASIKVNIMFGLGSISLLL--LDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKALNTCG
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SHICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKD
::: ::. : :::::::..: :: . ::..:::....:::.::: :::.::::.::.:..
CCDS53 SHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFG-HDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKHIRE
250 260 270 280 290 300
270 280
pF1KE0 RVILLFSPISVCC
:. .:
CCDS53 TVLRIFFKTDH
310
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 723 init1: 541 opt: 1027 Z-score: 862.4 bits: 167.6 E(32554): 1e-41
Smith-Waterman score: 1027; 50.9% identity (85.1% similar) in 275 aa overlap (1-274:36-308)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
.:..:..::. ..:.: ::.:::.:.. ::
CCDS31 DTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQPMFYFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
.::. .. :.... :..:.:.::. ..::::.:. ::::::.. :...:..::.::.
CCDS31 AMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVMAYDRF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
:::: ::.:: :::.... .. ..: :.. . ::.::. :: .::.::.::.:::: :
CCDS31 VAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTYCEHRG
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
.: :::. :..:::::: : . .:..:: ::..::.:::.. : .:.::..::::
CCDS31 LAGLACAPIKINIIYGLMV-ISYIIVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAFNTCGS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
:.::.. :::::::::..:::: ..:::.::::...:::.::: :::.::::.::::...
CCDS31 HVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFG-QNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQIREQ
250 260 270 280 290 300
270 280
pF1KE0 VILLFSPISVCC
.. .:
CCDS31 IVKIFVQKE
310
>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1025 init1: 668 opt: 1018 Z-score: 854.9 bits: 166.2 E(32554): 2.7e-41
Smith-Waterman score: 1018; 53.6% identity (79.3% similar) in 276 aa overlap (1-275:36-311)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
::.::..:: :..:: : .::.:.: ::
CCDS44 KTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKPMYYFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
.::. ..... ... :..: :.::: ::.: :. :::: : . ::..:. ::.:::
CCDS44 AMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLMALDRY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRY-TILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
::::::::: ::::. .. :.: :. .:. .. :: ::. : :: ::.::.::.::.
CCDS44 VAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLLPYCRGNILPHTYCDHMS
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
.:.:.:::..:: :::: :::: :.::. : ::::::.:: ..:: :: ::..:: .
CCDS44 VAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKAFNTCTA
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
:::.: . ::::::::..:::: . :: ::.:...:.:.:: .:::.::::::::.:
CCDS44 HICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTKQIRDC
250 260 270 280 290 300
270 280
pF1KE0 VILLFSPISVCC
:: ..:
CCDS44 VIRILSGSKDTKSYSM
310 320
>>CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 1032 init1: 685 opt: 1002 Z-score: 841.9 bits: 163.8 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1002; 50.9% identity (82.2% similar) in 275 aa overlap (1-274:36-310)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
:: .:..::. :..::. ...::.:.:.::
CCDS31 GTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRPMYVFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
..:. .. :. ... :..: ::::. .:.: .:..::::.: . ::..:. ::.:.
CCDS31 ALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLMALDHC
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRY-TILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
::::.:::: ::::.:.. : :. . .:. .. : ::. :: :: :.:::.::.::.
CCDS31 VAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKRLPYCKGNVIPHTYCDHMS
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
.:...:::. :: :::: :::: :.::. : :::::::.:: ..:: :: ::.::: .
CCDS31 VAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKAFSTCTA
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
:.:.: . :.::::.:..:.:::.::: ::::....::.:.:: .:::.:::::.:...
CCDS31 HFCAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKTRQVRES
250 260 270 280 290 300
270 280
pF1KE0 VILLFSPISVCC
:: .:
CCDS31 VIRFFLKGKDNSHNF
310 320
>>CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 655 init1: 655 opt: 998 Z-score: 838.6 bits: 163.2 E(32554): 2.2e-40
Smith-Waterman score: 998; 53.3% identity (81.6% similar) in 272 aa overlap (1-271:36-307)
10 20 30
pF1KE0 MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
:::.::.:: :: :: :..::.:.: ::
CCDS31 SSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRPMYYFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
..:. .. : .. .:..: :.::. .:.:..:..::::.:.. ::..:. ::.:::
CCDS31 ALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLMALDRY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE0 VAICYPLRY-TILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
::::::::: ::::. .. : :.:. .:. .. :: .:. :: :: :.:::.::.::.
CCDS31 VAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRGNFIPHTYCDHMS
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
.:...:::..:: :::: :::: .:: : .::::::.::...:: :: ::.::: :
CCDS31 VAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAFSTCTS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
:.: : . :. :::.:..::: :..::.::::.:..::.:.:: .:::.::::::::..
CCDS31 HMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKTKQIQEG
250 260 270 280 290 300
270 280
pF1KE0 VILLFSPISVCC
::
CCDS31 VIKFLLGDKVSFTYDK
310 320
281 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 03:16:03 2016 done: Sat Nov 5 03:16:04 2016
Total Scan time: 2.150 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]