Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0562
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0562, 328 aa
1>>>pF1KE0562 328 - 328 aa - 328 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0255+/-0.000841; mu= 17.7929+/- 0.051
mean_var=64.5901+/-13.052, 0's: 0 Z-trim(107.2): 21 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.159585
statistics sampled from 9422 (9435) to 9422 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 1.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35321.1 AWAT1 gene_id:158833|Hs108|chrX ( 328) 2313 541.1 4.7e-154
CCDS14397.1 DGAT2L6 gene_id:347516|Hs108|chrX ( 337) 1231 292.0 4.7e-79
CCDS35320.1 AWAT2 gene_id:158835|Hs108|chrX ( 333) 1222 289.9 1.9e-78
CCDS31642.1 DGAT2 gene_id:84649|Hs108|chr11 ( 388) 1188 282.1 5e-76
CCDS58162.1 DGAT2 gene_id:84649|Hs108|chr11 ( 345) 1137 270.3 1.6e-72
CCDS5714.1 MOGAT3 gene_id:346606|Hs108|chr7 ( 341) 1070 254.9 6.8e-68
CCDS8240.1 MOGAT2 gene_id:80168|Hs108|chr11 ( 334) 996 237.9 8.9e-63
CCDS46524.1 MOGAT1 gene_id:116255|Hs108|chr2 ( 335) 953 228.0 8.6e-60
CCDS75643.1 MOGAT3 gene_id:346606|Hs108|chr7 ( 281) 731 176.8 1.8e-44
>>CCDS35321.1 AWAT1 gene_id:158833|Hs108|chrX (328 aa)
initn: 2313 init1: 2313 opt: 2313 Z-score: 2879.3 bits: 541.1 E(32554): 4.7e-154
Smith-Waterman score: 2313; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:1-328)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQPLFVYLLFTSLWPLPVLYFAWLFLDWKTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQPLFVYLLFTSLWPLPVLYFAWLFLDWKTPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLTFGAFCNFCTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLTFGAFCNFCTEA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKGVCSVSQPAINYLLSHGTGNLVGIVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKGVCSVSQPAINYLLSHGTGNLVGIVVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQVLFHKDSRMYKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQVLFHKDSRMYKF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QSCFRRIFGFYCCVFYGQSFCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQIEKPSQEMVDKYHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QSCFRRIFGFYCCVFYGQSFCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQIEKPSQEMVDKYHA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 LYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
310 320
>>CCDS14397.1 DGAT2L6 gene_id:347516|Hs108|chrX (337 aa)
initn: 1216 init1: 602 opt: 1231 Z-score: 1532.8 bits: 292.0 E(32554): 4.7e-79
Smith-Waterman score: 1231; 54.6% identity (82.7% similar) in 324 aa overlap (10-325:13-334)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYL---AIFWILQPLFVYLLFTSLWPLPVLYFAWLFL
.:....::: :. :: .: : : :::...::: :: .:::
CCDS14 MAFFSRLNLQEGLQTFFVLQWIPVYIFLGAIPILLIPYF--LLFSKFWPLAVLSLAWLTY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 DWKTPERGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLTFGAFC
::.: .::::::::::: .: ..:.:::. ..::.::::.:::... ::::.:.::.:
CCDS14 DWNTHSQGGRRSAWVRNWTLWKYFRNYFPVKLVKTHDLSPKHNYIIANHPHGILSFGVFI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 NFCTEATGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKGVCSVSQPAINYLLSH-GTGN
:: :::::... ::.::: ..:: .: ::.::::.:. ::: ::. :..:::.. :.::
CCDS14 NFATEATGIARIFPSITPFVGTLERIFWIPIVREYVMSMGVCPVSSSALKYLLTQKGSGN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LVGIVVGGVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQVLFHK
: :::::..::: :...::.:..:::::. ::: ::.:::...:::.::..: : .
CCDS14 AVVIVVGGAAEALLCRPGASTLFLKQRKGFVKMALQTGAYLVPSYSFGENEVFNQETFPE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE0 DS--RMYK--FQSCFRRIFGFYCCVFYGQSFCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQIEK
. :... ::. :..:.:. :.:.:..: .:: :.::..:::.::::::::.:.:..
CCDS14 GTWLRLFQKTFQDTFKKILGLNFCTFHGRGFTRGSWGFLPFNRPITTVVGEPLPIPRIKR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE0 PSQEMVDKYHALYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
:.:. ::::::::..::.:::::::..:: :::.:
CCDS14 PNQKTVDKYHALYISALRKLFDQHKVEYGLPETQELTIT
300 310 320 330
>>CCDS35320.1 AWAT2 gene_id:158835|Hs108|chrX (333 aa)
initn: 1202 init1: 643 opt: 1222 Z-score: 1521.7 bits: 289.9 E(32554): 1.9e-78
Smith-Waterman score: 1222; 54.3% identity (81.5% similar) in 313 aa overlap (15-325:18-330)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQPLFVYLL-FTSLWPLPVLYFAWLFLDW
..:: .: : : . . .::. :: ::. :: ..:: .::
CCDS35 MLLPSKKDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIAVNLYLVVFTPYWPVTVLILTWLAFDW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KTPERGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLTFGAFCNF
:::.::::: . ::.: .: : ::::. .:::.:. : .::.. :::::.. : : .:
CCDS35 KTPQRGGRRFTCVRHWRLWKHYSDYFPLKLLKTHDICPSRNYILVCHPHGLFAHGWFGHF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 CTEATGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKGVCSVSQPAINYLLSH-GTGNLV
:::.:::: ::::::.. ::. :: .::.:::.:. :.::::. .:..::.: ::::.:
CCDS35 ATEASGFSKIFPGITPYILTLGAFFWMPFLREYVMSTGACSVSRSSIDFLLTHKGTGNMV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GIVVGGVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQVLFHKDS
.:.::..: :.:...::.:..:.:::: :::::. :.:...::::..::: .: .
CCDS35 IVVIGGLAECRYSLPGSSTLVLKNRSGFVRMALQHGVPLIPAYAFGETDLYDQHIFTPGG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RMYKFQSCFRRIFGFYCCVFYGQSFCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQIEKPSQEMV
. .::. :. . .: :.:::..: ..: ::::::::..:.::::::.:.::.::::.:
CCDS35 FVNRFQKWFQSMVHIYPCAFYGRGFTKNSWGLLPYSRPVTTIVGEPLPMPKIENPSQEIV
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 DKYHALYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
:::.::.:::.::::::::..: ::::.:
CCDS35 AKYHTLYIDALRKLFDQHKTKFGISETQELEII
310 320 330
>>CCDS31642.1 DGAT2 gene_id:84649|Hs108|chr11 (388 aa)
initn: 894 init1: 647 opt: 1188 Z-score: 1478.4 bits: 282.1 E(32554): 5e-76
Smith-Waterman score: 1188; 50.8% identity (79.8% similar) in 327 aa overlap (1-325:59-385)
10 20 30
pF1KE0 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQ
. .:: ...: . .::: ::.:.. .
CCDS31 GPALSREGSGRWGTGSSILSALQDLFSVTWLNRSKVEKQLQVISVLQWVLSFLVLGVACS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 PLFVYLLFTSLWPLPVLYFAWLFLDWKTPERGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTK
...:.. :. : . ::::.:: .::.::..::::: ::::: :: ..:::::: ..::.
CCDS31 AILMYIFCTDCWLIAVLYFTWLVFDWNTPKKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTH
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 DLSPEHNYLMGVHPHGLLTFGAFCNFCTEATGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYL
.: .::..: ::::.. .:::::: :::: :: :::: :.::::. :..: .::::
CCDS31 NLLTTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIRPYLATLAGNFRMPVLREYL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KE0 MAKGVCSVSQPAINYLLS-HGTGNLVGIVVGGVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQ
:. :.: ::. .:.:::: .:.:: . :::::..:.:.:.:. ... :..:::::. ::.
CCDS31 MSGGICPVSRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALR
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HGAHLVPTFTFGETEVYDQVLFHKDSRMYKFQSCFRRIFGFYCCVFYGQS-FCQGSTGLL
::: ::: ..:::.::: ::.:.. : :. :.. .:: :.:.:.. : . . ::.
CCDS31 HGADLVPIYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLV
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 PYSRPIVTVVGEPLPLPQIEKPSQEMVDKYHALYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
:::.::.::::::. .:..:.:.:. .: ::..::.:: ::::.:::..: ::. :
CCDS31 PYSKPITTVVGEPITIPKLEHPTQQDIDLYHTMYMEALVKLFDKHKTKFGLPETEVLEVN
330 340 350 360 370 380
>>CCDS58162.1 DGAT2 gene_id:84649|Hs108|chr11 (345 aa)
initn: 843 init1: 596 opt: 1137 Z-score: 1415.7 bits: 270.3 E(32554): 1.6e-72
Smith-Waterman score: 1137; 53.0% identity (81.4% similar) in 296 aa overlap (32-325:47-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 AHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQPLFVYLLFTSLWPLPVLYFAWLFLDWKTPER
...:.. :. : . ::::.:: .::.::..
CCDS58 QAEADRSQRSHGGPALSREGSGRWGVACSAILMYIFCTDCWLIAVLYFTWLVFDWNTPKK
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLTFGAFCNFCTEAT
::::: ::::: :: ..:::::: ..::..: .::..: ::::.. .:::::: ::::
CCDS58 GGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTHNLLTTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEAT
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKGVCSVSQPAINYLLS-HGTGNLVGIVVG
:: :::: :.::::. :..: .:::::. :.: ::. .:.:::: .:.:: . ::::
CCDS58 EVSKKFPGIRPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVSRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVG
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQVLFHKDSRMYKF
:..:.:.:.:. ... :..:::::. ::.::: ::: ..:::.::: ::.:.. :
CCDS58 GAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPIYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWV
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290
pF1KE0 QSCFRRIFGFYCCVFYGQS-FCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQIEKPSQEMVDKYH
:. :.. .:: :.:.:.. : . . ::.:::.::.::::::. .:..:.:.:. .: ::
CCDS58 QKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEHPTQQDIDLYH
260 270 280 290 300 310
300 310 320
pF1KE0 ALYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
..::.:: ::::.:::..: ::. :
CCDS58 TMYMEALVKLFDKHKTKFGLPETEVLEVN
320 330 340
>>CCDS5714.1 MOGAT3 gene_id:346606|Hs108|chr7 (341 aa)
initn: 1001 init1: 565 opt: 1070 Z-score: 1332.4 bits: 254.9 E(32554): 6.8e-68
Smith-Waterman score: 1070; 45.8% identity (75.1% similar) in 325 aa overlap (6-328:17-341)
10 20 30 40
pF1KE0 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQPLFVYLLFTSLWPLPVLYF
: .:.... :. :..: . ... : ::::::::. :.:.
CCDS57 MGVATTLQPPTTSKTLQKQHLEAVGAYQYVLTFLFMGPFFSLLVFVLLFTSLWPFSVFYL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 AWLFLDWKTPERGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLT
.::..:: ::..::::: :.:: .: ..:::.:. ..:: .: :..::..:.::::..
CCDS57 VWLYVDWDTPNQGGRRSEWIRNRAIWRQLRDYYPVKLVKTAELPPDRNYVLGAHPHGIMC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FGAFCNFCTEATGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKGVCSVSQPAINYLLSH
: .::: ::..:::. :::. : ::.:. .: .: :.:.:. :.: ::. .....::.
CCDS57 TGFLCNFSTESNGFSQLFPGLRPWLAVLAGLFYLPVYRDYIMSFGLCPVSRQSLDFILSQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 GT-GNLVGIVVGGVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQ
:. : :.:::. ::: :::. : ::::::::: ::.::: :::...:::....
CCDS57 PQLGQAVVIMVGGAHEALYSVPGEHCLTLQKRKGFVRLALRHGASLVPVYSFGENDIFRL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VLFHKDSRMYKFQSCFRRIFGFYCCVFYGQS-FCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQI
: : .. : :....:: :.:.:.. : : ::::.. ::.::::.:.:.::
CCDS57 KAFATGSWQHWCQLTFKKLMGFSPCIFWGRGLFSATSWGLLPFAVPITTVVGRPIPVPQR
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320
pF1KE0 EKPSQEMVDKYHALYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
.:..: :..:::::: ::..::..:: : . : :.
CCDS57 LHPTEEEVNHYHALYMTALEQLFEEHKESCGVPASTCLTFI
310 320 330 340
>>CCDS8240.1 MOGAT2 gene_id:80168|Hs108|chr11 (334 aa)
initn: 1018 init1: 536 opt: 996 Z-score: 1240.5 bits: 237.9 E(32554): 8.9e-63
Smith-Waterman score: 996; 45.8% identity (72.7% similar) in 319 aa overlap (10-327:15-333)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQPLFVYLLFTSLWPLPVLYFAWLFLD
.:.: .::. .:.::. : :. :::: .: : ::: :: .::
CCDS82 MVEFAPLFMPWERRLQTLAVLQFVFSFLALAEICTVGFIALLFTRFWLLTVLYAAWWYLD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 WKTPERGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLTFGAFCN
:..:::. .: : .: ...:::::...:: .:.: .::. : ::::.:. ::: :
CCDS82 RDKPRQGGRHIQAIRCWTIWKYMKDYFPISLVKTAELDPSRNYIAGFHPHGVLAVGAFAN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FCTEATGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKG-VCSVSQPAINYLLSHGTGNL
.:::.::::. :::: ::: :. .:. :: :.:.:. : : : .. : . : .: :::
CCDS82 LCTESTGFSSIFPGIRPHLMMLTLWFRAPFFRDYIMSAGLVTSEKESAAHILNRKGGGNL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VGIVVGGVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQVLFHKD
.::.:::. :::.. :.. ::.:..:::::: :: ::: ::: :.:::....::. .
CCDS82 LGIIVGGAQEALDARPGSFTLLLRNRKGFVRLALTHGAPLVPIFSFGENDLFDQIPNSSG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SRMYKFQSCFRRIFGFYCCVFYGQSFCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQIEKPSQEM
: . .:. ...:.:. .:.:.. : : ::.:: :::.::::.:. . . .::.:
CCDS82 SWLRYIQNRLQKIMGISLPLFHGRGVFQYSFGLIPYRRPITTVVGKPIEVQKTLHPSEEE
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 VDKYHALYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
:.. : :. : .::. :: ... :.: :
CCDS82 VNQLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPADQHLEFC
310 320 330
>>CCDS46524.1 MOGAT1 gene_id:116255|Hs108|chr2 (335 aa)
initn: 970 init1: 537 opt: 953 Z-score: 1187.0 bits: 228.0 E(32554): 8.6e-60
Smith-Waterman score: 953; 42.6% identity (73.5% similar) in 317 aa overlap (10-325:16-332)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQPLFVYLLFTSLWPLPVLYFAWLFL
.:.. .::: :.:: . . . :.:.. . : . :. ::..
CCDS46 MKVEFAPLNIQLARRLQTVAVLQWVLKYLLLGPMSIGITVMLIIHNYLFLYIPYLMWLYF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 DWKTPERGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLTFGAFC
::.:::::::::.:..:: .: :..::::: ..::.::.: :::..: ::::... :::
CCDS46 DWHTPERGGRRSSWIKNWTLWKHFKDYFPIHLIKTQDLDPSHNYIFGFHPHGIMAVGAFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 NFCTEATGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKGVCSVSQPAINYLLSH-GTGN
:: .. . :. :::.: .: .: .: : :::.:. :. :::. ...:..:. : ::
CCDS46 NFSVNYSDFKDLFPGFTSYLHVLPLWFWCPVFREYVMSVGLVSVSKKSVSYMVSKEGGGN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LVGIVVGGVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQVLFHK
. ::.::. :.:.. :. ::....:::::. :: ::: :::. .:::.:.. :. .
CCDS46 ISVIVLGGAKESLDAHPGKFTLFIRQRKGFVKIALTHGASLVPVVSFGENELFKQTDNPE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DSRMYKFQSCFRRIFGFYCCVFYGQSFCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQIEKPSQE
: . :. ...:.:: .:.... : . ::. : . : ::::.:.:. : .:.::
CCDS46 GSWIRTVQNKLQKIMGFALPLFHARGVFQYNFGLMTYRKAIHTVVGRPIPVRQTLNPTQE
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 MVDKYHALYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
.... : ::. :.:::..:: .:: : . :
CCDS46 QIEELHQTYMEELRKLFEEHKGKYGIPEHETLVLK
310 320 330
>>CCDS75643.1 MOGAT3 gene_id:346606|Hs108|chr7 (281 aa)
initn: 705 init1: 565 opt: 731 Z-score: 911.8 bits: 176.8 E(32554): 1.8e-44
Smith-Waterman score: 731; 47.8% identity (77.3% similar) in 207 aa overlap (6-211:17-223)
10 20 30 40
pF1KE0 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQPLFVYLLFTSLWPLPVLYF
: .:.... :. :..: . ... : ::::::::. :.:.
CCDS75 MGVATTLQPPTTSKTLQKQHLEAVGAYQYVLTFLFMGPFFSLLVFVLLFTSLWPFSVFYL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 AWLFLDWKTPERGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLT
.::..:: ::..::::: :.:: .: ..:::.:. ..:: .: :..::..:.::::..
CCDS75 VWLYVDWDTPNQGGRRSEWIRNRAIWRQLRDYYPVKLVKTAELPPDRNYVLGAHPHGIMC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FGAFCNFCTEATGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKGVCSVSQPAINYLLSH
: .::: ::..:::. :::. : ::.:. .: .: :.:.:. :.: ::. .....::.
CCDS75 TGFLCNFSTESNGFSQLFPGLRPWLAVLAGLFYLPVYRDYIMSFGLCPVSRQSLDFILSQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 GT-GNLVGIVVGGVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQ
:. : :.:::. ::: :::. : ::::::::: ::.::
CCDS75 PQLGQAVVIMVGGAHEALYSVPGEHCLTLQKRKGFVRLALRHGGPPHPRPPAPPPHRGGS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VLFHKDSRMYKFQSCFRRIFGFYCCVFYGQSFCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQIE
CCDS75 QSLSRPLHDGPGAALRGAQGKLWGPRFHLPHLHLGLAAAFR
250 260 270 280
328 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:20:09 2016 done: Wed Nov 2 23:20:09 2016
Total Scan time: 1.840 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]