Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0561
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0561, 333 aa
1>>>pF1KE0561 333 - 333 aa - 333 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3160+/-0.000878; mu= 15.5639+/- 0.053
mean_var=60.4882+/-12.496, 0's: 0 Z-trim(105.4): 16 B-trim: 14 in 1/49
Lambda= 0.164907
statistics sampled from 8415 (8426) to 8415 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35320.1 AWAT2 gene_id:158835|Hs108|chrX ( 333) 2311 558.3 3.1e-159
CCDS14397.1 DGAT2L6 gene_id:347516|Hs108|chrX ( 337) 1252 306.4 2.2e-83
CCDS35321.1 AWAT1 gene_id:158833|Hs108|chrX ( 328) 1222 299.2 3e-81
CCDS31642.1 DGAT2 gene_id:84649|Hs108|chr11 ( 388) 1194 292.6 3.5e-79
CCDS58162.1 DGAT2 gene_id:84649|Hs108|chr11 ( 345) 1149 281.9 5.3e-76
CCDS5714.1 MOGAT3 gene_id:346606|Hs108|chr7 ( 341) 1020 251.2 9.1e-67
CCDS8240.1 MOGAT2 gene_id:80168|Hs108|chr11 ( 334) 956 235.9 3.4e-62
CCDS46524.1 MOGAT1 gene_id:116255|Hs108|chr2 ( 335) 956 235.9 3.4e-62
CCDS75643.1 MOGAT3 gene_id:346606|Hs108|chr7 ( 281) 667 167.1 1.5e-41
>>CCDS35320.1 AWAT2 gene_id:158835|Hs108|chrX (333 aa)
initn: 2311 init1: 2311 opt: 2311 Z-score: 2972.3 bits: 558.3 E(32554): 3.1e-159
Smith-Waterman score: 2311; 100.0% identity (100.0% similar) in 333 aa overlap (1-333:1-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLLPSKKDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIAVNLYLVVFTPYWPVTVLILTWLAFDW
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CCDS35 MLLPSKKDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIAVNLYLVVFTPYWPVTVLILTWLAFDW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KTPQRGGRRFTCVRHWRLWKHYSDYFPLKLLKTHDICPSRNYILVCHPHGLFAHGWFGHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KTPQRGGRRFTCVRHWRLWKHYSDYFPLKLLKTHDICPSRNYILVCHPHGLFAHGWFGHF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ATEASGFSKIFPGITPYILTLGAFFWMPFLREYVMSTGACSVSRSSIDFLLTHKGTGNMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ATEASGFSKIFPGITPYILTLGAFFWMPFLREYVMSTGACSVSRSSIDFLLTHKGTGNMV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IVVIGGLAECRYSLPGSSTLVLKNRSGFVRMALQHGVPLIPAYAFGETDLYDQHIFTPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IVVIGGLAECRYSLPGSSTLVLKNRSGFVRMALQHGVPLIPAYAFGETDLYDQHIFTPGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FVNRFQKWFQSMVHIYPCAFYGRGFTKNSWGLLPYSRPVTTIVGEPLPMPKIENPSQEIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FVNRFQKWFQSMVHIYPCAFYGRGFTKNSWGLLPYSRPVTTIVGEPLPMPKIENPSQEIV
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE0 AKYHTLYIDALRKLFDQHKTKFGISETQELEII
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CCDS35 AKYHTLYIDALRKLFDQHKTKFGISETQELEII
310 320 330
>>CCDS14397.1 DGAT2L6 gene_id:347516|Hs108|chrX (337 aa)
initn: 1275 init1: 884 opt: 1252 Z-score: 1610.5 bits: 306.4 E(32554): 2.2e-83
Smith-Waterman score: 1252; 50.9% identity (81.2% similar) in 336 aa overlap (1-332:1-336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLLPSKKDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIAVNLYLVVFTPYWPVTVLILTWLAFDW
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CCDS14 MAFFSRLNLQEGLQTFFVLQWIPVYIFLGAIPILLIPYFLLFSKFWPLAVLSLAWLTYDW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KTPQRGGRRFTCVRHWRLWKHYSDYFPLKLLKTHDICPSRNYILVCHPHGLFAHGWFGHF
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CCDS14 NTHSQGGRRSAWVRNWTLWKYFRNYFPVKLVKTHDLSPKHNYIIANHPHGILSFGVFINF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ATEASGFSKIFPGITPYILTLGAFFWMPFLREYVMSTGACSVSRSSIDFLLTHKGTGNMV
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CCDS14 ATEATGIARIFPSITPFVGTLERIFWIPIVREYVMSMGVCPVSSSALKYLLTQKGSGNAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IVVIGGLAECRYSLPGSSTLVLKNRSGFVRMALQHGVPLIPAYAFGETDLYDQHIFTPGG
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CCDS14 VIVVGGAAEALLCRPGASTLFLKQRKGFVKMALQTGAYLVPSYSFGENEVFNQETFPEGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 FVNRFQKWFQS----MVHIYPCAFYGRGFTKNSWGLLPYSRPVTTIVGEPLPMPKIENPS
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CCDS14 WLRLFQKTFQDTFKKILGLNFCTFHGRGFTRGSWGFLPFNRPITTVVGEPLPIPRIKRPN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KE0 QEIVAKYHTLYIDALRKLFDQHKTKFGISETQELEII
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CCDS14 QKTVDKYHALYISALRKLFDQHKVEYGLPETQELTIT
310 320 330
>>CCDS35321.1 AWAT1 gene_id:158833|Hs108|chrX (328 aa)
initn: 1202 init1: 643 opt: 1222 Z-score: 1572.1 bits: 299.2 E(32554): 3e-81
Smith-Waterman score: 1222; 54.3% identity (81.5% similar) in 313 aa overlap (18-330:15-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLLPSKKDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIAVNLYLVVFTPYWPVTVLILTWLAFDW
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CCDS35 MAHSKQPSHFQSLMLLQWPLSYLAIFWILQPLFVYLL-FTSLWPLPVLYFAWLFLDW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KTPQRGGRRFTCVRHWRLWKHYSDYFPLKLLKTHDICPSRNYILVCHPHGLFAHGWFGHF
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CCDS35 KTPERGGRRSAWVRNWCVWTHIRDYFPITILKTKDLSPEHNYLMGVHPHGLLTFGAFCNF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ATEASGFSKIFPGITPYILTLGAFFWMPFLREYVMSTGACSVSRSSIDFLLTHKGTGNMV
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CCDS35 CTEATGFSKTFPGITPHLATLSWFFKIPFVREYLMAKGVCSVSQPAINYLLSH-GTGNLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IVVIGGLAECRYSLPGSSTLVLKNRSGFVRMALQHGVPLIPAYAFGETDLYDQHIFTPGG
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CCDS35 GIVVGGVGEALQSVPNTTTLILQKRKGFVRTALQHGAHLVPTFTFGETEVYDQVLFHKDS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FVNRFQKWFQSMVHIYPCAFYGRGFTKNSWGLLPYSRPVTTIVGEPLPMPKIENPSQEIV
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CCDS35 RMYKFQSCFRRIFGFYCCVFYGQSFCQGSTGLLPYSRPIVTVVGEPLPLPQIEKPSQEMV
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE0 AKYHTLYIDALRKLFDQHKTKFGISETQELEII
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CCDS35 DKYHALYMDALHKLFDQHKTHYGCSETQKLFFL
300 310 320
>>CCDS31642.1 DGAT2 gene_id:84649|Hs108|chr11 (388 aa)
initn: 1113 init1: 828 opt: 1194 Z-score: 1535.0 bits: 292.6 E(32554): 3.5e-79
Smith-Waterman score: 1194; 48.9% identity (79.9% similar) in 329 aa overlap (5-332:60-387)
10 20 30
pF1KE0 MLLPSKKDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIA
... .. :.:..:.:: .: :.. .. :
CCDS31 PALSREGSGRWGTGSSILSALQDLFSVTWLNRSKVEKQLQVISVLQWVLSFLVLGVACSA
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VNLYLVVFTPYWPVTVLILTWLAFDWKTPQRGGRRFTCVRHWRLWKHYSDYFPLKLLKTH
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CCDS31 ILMY-IFCTDCWLIAVLYFTWLVFDWNTPKKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTH
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 DICPSRNYILVCHPHGLFAHGWFGHFATEASGFSKIFPGITPYILTLGAFFWMPFLREYV
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CCDS31 NLLTTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIRPYLATLAGNFRMPVLREYL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 MSTGACSVSRSSIDFLLTHKGTGNMVIVVIGGLAECRYSLPGSSTLVLKNRSGFVRMALQ
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CCDS31 MSGGICPVSRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALR
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 HGVPLIPAYAFGETDLYDQHIFTPGGFVNRFQKWFQSMVHIYPCAFYGRG-FTKNSWGLL
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CCDS31 HGADLVPIYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLV
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 PYSRPVTTIVGEPLPMPKIENPSQEIVAKYHTLYIDALRKLFDQHKTKFGISETQELEII
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CCDS31 PYSKPITTVVGEPITIPKLEHPTQQDIDLYHTMYMEALVKLFDKHKTKFGLPETEVLEVN
330 340 350 360 370 380
>>CCDS58162.1 DGAT2 gene_id:84649|Hs108|chr11 (345 aa)
initn: 1113 init1: 828 opt: 1149 Z-score: 1477.9 bits: 281.9 E(32554): 5.3e-76
Smith-Waterman score: 1149; 51.5% identity (80.8% similar) in 297 aa overlap (37-332:48-344)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 KDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIAVNLYLVVFTPYWPVTVLILTWLAFDWKTPQRG
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CCDS58 AEADRSQRSHGGPALSREGSGRWGVACSAILMYIFCTDCWLIAVLYFTWLVFDWNTPKKG
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GRRFTCVRHWRLWKHYSDYFPLKLLKTHDICPSRNYILVCHPHGLFAHGWFGHFATEASG
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CCDS58 GRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTHNLLTTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATE
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FSKIFPGITPYILTLGAFFWMPFLREYVMSTGACSVSRSSIDFLLTHKGTGNMVIVVIGG
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CCDS58 VSKKFPGIRPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVSRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGG
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LAECRYSLPGSSTLVLKNRSGFVRMALQHGVPLIPAYAFGETDLYDQHIFTPGGFVNRFQ
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CCDS58 AAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPIYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQ
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KWFQSMVHIYPCAFYGRG-FTKNSWGLLPYSRPVTTIVGEPLPMPKIENPSQEIVAKYHT
: ::... . :: :.::: :....:::.:::.:.::.::::. .::.:.:.:. . :::
CCDS58 KKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEHPTQQDIDLYHT
260 270 280 290 300 310
310 320 330
pF1KE0 LYIDALRKLFDQHKTKFGISETQELEII
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CCDS58 MYMEALVKLFDKHKTKFGLPETEVLEVN
320 330 340
>>CCDS5714.1 MOGAT3 gene_id:346606|Hs108|chr7 (341 aa)
initn: 988 init1: 771 opt: 1020 Z-score: 1312.2 bits: 251.2 E(32554): 9.1e-67
Smith-Waterman score: 1020; 40.9% identity (75.8% similar) in 330 aa overlap (5-333:13-341)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLLPSKKDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIAVNLYLVVFTPYWPVTVLI
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CCDS57 MGVATTLQPPTTSKTLQKQHLEAVGAYQYVLTFLFMGP-FFSLLVFVLLFTSLWPFSVFY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LTWLAFDWKTPQRGGRRFTCVRHWRLWKHYSDYFPLKLLKTHDICPSRNYILVCHPHGLF
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CCDS57 LVWLYVDWDTPNQGGRRSEWIRNRAIWRQLRDYYPVKLVKTAELPPDRNYVLGAHPHGIM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AHGWFGHFATEASGFSKIFPGITPYILTLGAFFWMPFLREYVMSTGACSVSRSSIDFLLT
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CCDS57 CTGFLCNFSTESNGFSQLFPGLRPWLAVLAGLFYLPVYRDYIMSFGLCPVSRQSLDFILS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HKGTGNMVIVVIGGLAECRYSLPGSSTLVLKNRSGFVRMALQHGVPLIPAYAFGETDLYD
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CCDS57 QPQLGQAVVIMVGGAHEALYSVPGEHCLTLQKRKGFVRLALRHGASLVPVYSFGENDIFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QHIFTPGGFVNRFQKWFQSMVHIYPCAFYGRG-FTKNSWGLLPYSRPVTTIVGEPLPMPK
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CCDS57 LKAFATGSWQHWCQLTFKKLMGFSPCIFWGRGLFSATSWGLLPFAVPITTVVGRPIPVPQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE0 IENPSQEIVAKYHTLYIDALRKLFDQHKTKFGISETQELEII
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CCDS57 RLHPTEEEVNHYHALYMTALEQLFEEHKESCGVPASTCLTFI
300 310 320 330 340
>>CCDS8240.1 MOGAT2 gene_id:80168|Hs108|chr11 (334 aa)
initn: 929 init1: 929 opt: 956 Z-score: 1230.0 bits: 235.9 E(32554): 3.4e-62
Smith-Waterman score: 956; 42.3% identity (71.9% similar) in 331 aa overlap (1-331:7-332)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLLPSKKDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIAVNLYLVVFTPYWPVTVLILT
...: .. :.: .::.:. :: .: . . .:.. ..:: .: .::: .
CCDS82 MVEFAPLFMPWERRLQT----LAVLQFVFS-FLALAEICTVGFIALLFTRFWLLTVLYAA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 WLAFDWKTPQRGGRRFTCVRHWRLWKHYSDYFPLKLLKTHDICPSRNYILVCHPHGLFAH
: .: :..:::.. .: : .::...::::..:.:: .. :::::: ::::..:
CCDS82 WWYLDRDKPRQGGRHIQAIRCWTIWKYMKDYFPISLVKTAELDPSRNYIAGFHPHGVLAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GWFGHFATEASGFSKIFPGITPYILTLGAFFWMPFLREYVMSTGACSVSRSSIDFLLTHK
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CCDS82 GAFANLCTESTGFSSIFPGIRPHLMMLTLWFRAPFFRDYIMSAGLVTSEKESAAHILNRK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GTGNMVIVVIGGLAECRYSLPGSSTLVLKNRSGFVRMALQHGVPLIPAYAFGETDLYDQH
: ::.. ...:: : . ::: ::.:.::.::::.:: ::.::.: ..:::.::.::
CCDS82 GGGNLLGIIVGGAQEALDARPGSFTLLLRNRKGFVRLALTHGAPLVPIFSFGENDLFDQI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 IFTPGGFVNRFQKWFQSMVHIYPCAFYGRGFTKNSWGLLPYSRPVTTIVGEPLPMPKIEN
. :... .:. .:... : :.::: . :.::.:: ::.::.::.:. . : .
CCDS82 PNSSGSWLRYIQNRLQKIMGISLPLFHGRGVFQYSFGLIPYRRPITTVVGKPIEVQKTLH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE0 PSQEIVAKYHTLYIDALRKLFDQHKTKFGISETQELEII
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CCDS82 PSEEEVNQLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPADQHLEFC
300 310 320 330
>>CCDS46524.1 MOGAT1 gene_id:116255|Hs108|chr2 (335 aa)
initn: 973 init1: 897 opt: 956 Z-score: 1230.0 bits: 235.9 E(32554): 3.4e-62
Smith-Waterman score: 956; 40.4% identity (73.1% similar) in 327 aa overlap (4-330:7-332)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLLPSKKDLKTALDVFAVFQWSFSALLITTTVIAVNLYLVVFTPYWPVTVLILTWLA
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CCDS46 MKVEFAPLNIQLARRLQTVAVLQWVLKYLLLGPMSIGITVMLIIHN-YLFLYIPYLMWLY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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