FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0393, 955 aa
1>>>pF1KE0393 955 - 955 aa - 955 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7251+/-0.000455; mu= 10.7458+/- 0.028
mean_var=284.5371+/-61.290, 0's: 0 Z-trim(116.5): 351 B-trim: 219 in 1/57
Lambda= 0.076033
statistics sampled from 27337 (27739) to 27337 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16
Scan time: 15.210
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_705691 (OMIM: 609626) MAM domain-containing gly ( 955) 6477 725.7 2.6e-208
XP_016866223 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 961) 6455 723.3 1.4e-207
XP_006715119 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 973) 6276 703.7 1.2e-201
NP_001106970 (OMIM: 611128) MAM domain-containing ( 956) 3509 400.2 2.7e-110
XP_011534821 (OMIM: 611128) PREDICTED: MAM domain- ( 980) 3472 396.1 4.5e-109
NP_878250 (OMIM: 611128) MAM domain-containing gly ( 727) 2441 282.9 4.2e-75
XP_011534824 (OMIM: 611128) PREDICTED: MAM domain- ( 621) 2259 262.8 3.9e-69
XP_016876550 (OMIM: 611128) PREDICTED: MAM domain- ( 526) 1856 218.5 7.2e-56
XP_016876549 (OMIM: 611128) PREDICTED: MAM domain- ( 571) 1844 217.2 1.9e-55
XP_011534827 (OMIM: 611128) PREDICTED: MAM domain- ( 516) 1610 191.5 9.5e-48
NP_002763 (OMIM: 226200,606635) enteropeptidase pr (1019) 340 52.6 1.2e-05
XP_011527961 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1034) 340 52.6 1.2e-05
XP_011527960 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1037) 340 52.6 1.2e-05
XP_011527959 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1049) 340 52.6 1.2e-05
XP_011527958 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1064) 340 52.6 1.3e-05
XP_011527956 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1064) 340 52.6 1.3e-05
XP_011527957 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1064) 340 52.6 1.3e-05
NP_542413 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion pr ( 647) 335 51.8 1.4e-05
XP_016862495 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1379) 340 52.8 1.5e-05
NP_001276968 (OMIM: 602431,610878) roundabout homo (1382) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862494 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1396) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862493 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1398) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862491 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1402) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862490 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1403) 340 52.8 1.5e-05
XP_011532287 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1405) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862488 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1422) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862487 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1424) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862486 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1438) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862485 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1440) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862484 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1442) 340 52.8 1.5e-05
NP_001276969 (OMIM: 602431,610878) roundabout homo (1443) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862483 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1445) 340 52.8 1.5e-05
XP_011532286 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1447) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862481 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1489) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862480 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1496) 340 52.8 1.5e-05
XP_016862479 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1531) 340 52.8 1.6e-05
XP_016862477 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1536) 340 52.8 1.6e-05
XP_011532285 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1538) 340 52.8 1.6e-05
XP_016862476 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1554) 340 52.8 1.6e-05
XP_011532284 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1557) 340 52.8 1.6e-05
XP_016862475 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1576) 340 52.9 1.6e-05
XP_011532283 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1597) 340 52.9 1.6e-05
NP_694999 (OMIM: 612879) MAM domain-containing pro ( 686) 333 51.6 1.6e-05
NP_002933 (OMIM: 602431,610878) roundabout homolog (1378) 296 47.9 0.00041
NP_001122401 (OMIM: 602431,610878) roundabout homo (1394) 296 48.0 0.00042
XP_016862492 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1401) 296 48.0 0.00042
XP_016862489 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1420) 296 48.0 0.00042
XP_016862482 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1469) 296 48.0 0.00043
XP_016862478 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1534) 296 48.0 0.00044
XP_011524315 (OMIM: 600389) PREDICTED: meprin A su ( 628) 285 46.3 0.0006
>>NP_705691 (OMIM: 609626) MAM domain-containing glycosy (955 aa)
initn: 6477 init1: 6477 opt: 6477 Z-score: 3860.7 bits: 725.7 E(85289): 2.6e-208
Smith-Waterman score: 6477; 100.0% identity (100.0% similar) in 955 aa overlap (1-955:1-955)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVTCLLLLALIPFHCRGQGVYAPAQAQIVHAGQACVVKEDNISERVYTIREGDTLMLQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 MEVTCLLLLALIPFHCRGQGVYAPAQAQIVHAGQACVVKEDNISERVYTIREGDTLMLQC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LVTGHPRPQVRWTKTAGSASDKFQETSVFNETLRIERIARTQGGRYYCKAENGVGVPAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 LVTGHPRPQVRWTKTAGSASDKFQETSVFNETLRIERIARTQGGRYYCKAENGVGVPAIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SIRVDVQYLDEPMLTVHQTVSDVRGNFYQEKTVFLRCTVNSNPPARFIWKRGSDTLSHSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 SIRVDVQYLDEPMLTVHQTVSDVRGNFYQEKTVFLRCTVNSNPPARFIWKRGSDTLSHSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DNGVDIYEPLYTQGETKVLKLKNLRPQDYASYTCQVSVRNVCGIPDKAITFRLTNTTAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 DNGVDIYEPLYTQGETKVLKLKNLRPQDYASYTCQVSVRNVCGIPDKAITFRLTNTTAPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ALKLSVNETLVVNPGENVTVQCLLTGGDPLPQLQWSHGPGPLPLGALAQGGTLSIPSVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 ALKLSVNETLVVNPGENVTVQCLLTGGDPLPQLQWSHGPGPLPLGALAQGGTLSIPSVQA
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310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RDSGYYNCTATNNVGNPAKKTVNLLVRSMKNATFQITPDVIKESENIQLGQDLKLSCHVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 RDSGYYNCTATNNVGNPAKKTVNLLVRSMKNATFQITPDVIKESENIQLGQDLKLSCHVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 AVPQEKVTYQWFKNGKPARMSKRLLVTRNDPELPAVTSSLELIDLHFSDYGTYLCMASFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 AVPQEKVTYQWFKNGKPARMSKRLLVTRNDPELPAVTSSLELIDLHFSDYGTYLCMASFP
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430 440 450 460 470 480
pF1KE0 GAPVPDLSVEVNISSETVPPTISVPKGRAVVTVREGSPAELQCEVRGKPRPPVLWSRVDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 GAPVPDLSVEVNISSETVPPTISVPKGRAVVTVREGSPAELQCEVRGKPRPPVLWSRVDK
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pF1KE0 EAALLPSGLPLEETPDGKLRLERVSRDMSGTYRCQTARYNGFNVRPREAQVQLNVQFPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 EAALLPSGLPLEETPDGKLRLERVSRDMSGTYRCQTARYNGFNVRPREAQVQLNVQFPPE
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pF1KE0 VEPSSQDVRQALGRPVLLRCSLLRGSPQRIASAVWRFKGQLLPPPPVVPAAAEAPDHAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 VEPSSQDVRQALGRPVLLRCSLLRGSPQRIASAVWRFKGQLLPPPPVVPAAAEAPDHAEL
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610 620 630 640 650 660
pF1KE0 RLDAVTRDSSGSYECSVSNDVGSAACLFQVSAKAYSPEFYFDTPNPTRSHKLSKNYSYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 RLDAVTRDSSGSYECSVSNDVGSAACLFQVSAKAYSPEFYFDTPNPTRSHKLSKNYSYVL
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670 680 690 700 710 720
pF1KE0 QWTQREPDAVDPVLNYRLSIRQLNQHNAVVKAIPVRRVEKGQLLEYILTDLRVPHSYEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 QWTQREPDAVDPVLNYRLSIRQLNQHNAVVKAIPVRRVEKGQLLEYILTDLRVPHSYEVR
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730 740 750 760 770 780
pF1KE0 LTPYTTFGAGDMASRIIHYTEPINSPNLSDNTCHFEDEKICGYTQDLTDNFDWTRQNALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 LTPYTTFGAGDMASRIIHYTEPINSPNLSDNTCHFEDEKICGYTQDLTDNFDWTRQNALT
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790 800 810 820 830 840
pF1KE0 QNPKRSPNTGPPTDISGTPEGYYMFIETSRPRELGDRARLVSPLYNASAKFYCVSFFYHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 QNPKRSPNTGPPTDISGTPEGYYMFIETSRPRELGDRARLVSPLYNASAKFYCVSFFYHM
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pF1KE0 YGKHIGSLNLLVRSRNKGALDTHAWSLSGNKGNVWQQAHVPISPSGPFQIIFEGVRGPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 YGKHIGSLNLLVRSRNKGALDTHAWSLSGNKGNVWQQAHVPISPSGPFQIIFEGVRGPGY
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910 920 930 940 950
pF1KE0 LGDIAIDDVTLKKGECPRKQTDPNKVVVMPGSGAPCQSSPQLWGPMAIFLLALQR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_705 LGDIAIDDVTLKKGECPRKQTDPNKVVVMPGSGAPCQSSPQLWGPMAIFLLALQR
910 920 930 940 950
>>XP_016866223 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain-cont (961 aa)
initn: 6463 init1: 6265 opt: 6455 Z-score: 3847.7 bits: 723.3 E(85289): 1.4e-207
Smith-Waterman score: 6455; 99.4% identity (99.4% similar) in 961 aa overlap (1-955:1-961)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVTCLLLLALIPFHCRGQGVYAPAQAQIVHAGQACVVKEDNISERVYTIREGDTLMLQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEVTCLLLLALIPFHCRGQGVYAPAQAQIVHAGQACVVKEDNISERVYTIREGDTLMLQC
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 LVTGHPRPQVRWTKTAGSASDKFQETSVFNETLRIERIARTQGGRYYCKAENGVGVPAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVTGHPRPQVRWTKTAGSASDKFQETSVFNETLRIERIARTQGGRYYCKAENGVGVPAIK
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 SIRVDVQYLDEPMLTVHQTVSDVRGNFYQEKTVFLRCTVNSNPPARFIWKRGSDTLSHSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SIRVDVQYLDEPMLTVHQTVSDVRGNFYQEKTVFLRCTVNSNPPARFIWKRGSDTLSHSQ
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pF1KE0 DNGVDIYEPLYTQGETKVLKLKNLRPQDYASYTCQVSVRNVCGIPDKAITFRLTNTTAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DNGVDIYEPLYTQGETKVLKLKNLRPQDYASYTCQVSVRNVCGIPDKAITFRLTNTTAPP
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pF1KE0 ALKLSVNETLVVNPGENVTVQCLLTGGDPLPQLQWSHGPGPLPLGALAQGGTLSIPSVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALKLSVNETLVVNPGENVTVQCLLTGGDPLPQLQWSHGPGPLPLGALAQGGTLSIPSVQA
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pF1KE0 RDSGYYNCTATNNVGNPAKKTVNLLVRSMKNATFQITPDVIKESENIQLGQDLKLSCHVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDSGYYNCTATNNVGNPAKKTVNLLVRSMKNATFQITPDVIKESENIQLGQDLKLSCHVD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVPQEKVTYQWFKNGKPARMSKRLLVTRNDPELPAVTSSLELIDLHFSDYGTYLCMASFP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAALLPSGLPLEETPDGKLRLERVSRDMSGTYRCQTARYNGFNVRPREAQVQLNVQFPPE
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pF1KE0 VEPSSQDVRQALGRPVLLRCSLLRGSPQRIASAVWRFKGQLLPPPPVVPAAAEAPDHAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VEPSSQDVRQALGRPVLLRCSLLRGSPQRIASAVWRFKGQLLPPPPVVPAAAEAPDHAEL
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pF1KE0 RLDAVTRDSSGSYECSVSNDVGSAACLFQVSAKAYSPEFYFDTPNPTRSHKLSKNYSYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLDAVTRDSSGSYECSVSNDVGSAACLFQVSAKAYSPEFYFDTPNPTRSHKLSKNYSYVL
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pF1KE0 QWTQREPDAVDPVLNYRLSIRQLNQHNAVVKAIPVRRVEKGQLLEYILTDLRVPHSYEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QWTQREPDAVDPVLNYRLSIRQLNQHNAVVKAIPVRRVEKGQLLEYILTDLRVPHSYEVR
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pF1KE0 LTPYTTFGAGDMASRIIHYTEPINSPNLSDNTCHFEDEKICGYTQDLTDNFDWTRQNALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTPYTTFGAGDMASRIIHYTEPINSPNLSDNTCHFEDEKICGYTQDLTDNFDWTRQNALT
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pF1KE0 QNPKRSPNTGPPTDISGTPEGYYMFIETSRPRELGDRARLVSPLYNASAKFYCVSFFYHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNPKRSPNTGPPTDISGTPEGYYMFIETSRPRELGDRARLVSPLYNASAKFYCVSFFYHM
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pF1KE0 YGKHIGSLNLLVRSRNKGALDTHAWSLSGNKGNVWQQAHVPISPSGPFQIIFEGVRGPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YGKHIGSLNLLVRSRNKGALDTHAWSLSGNKGNVWQQAHVPISPSGPFQIIFEGVRGPGY
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910 920 930 940 950
pF1KE0 LGDIAIDDVTLKKGECPRKQTDPNK------VVVMPGSGAPCQSSPQLWGPMAIFLLALQ
::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGDIAIDDVTLKKGECPRKQTDPNKGARREGVVVMPGSGAPCQSSPQLWGPMAIFLLALQ
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 R
:
XP_016 R
>>XP_006715119 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain-cont (973 aa)
initn: 6265 init1: 6265 opt: 6276 Z-score: 3741.5 bits: 703.7 E(85289): 1.2e-201
Smith-Waterman score: 6276; 98.4% identity (99.0% similar) in 943 aa overlap (1-943:1-943)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVTCLLLLALIPFHCRGQGVYAPAQAQIVHAGQACVVKEDNISERVYTIREGDTLMLQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LVTGHPRPQVRWTKTAGSASDKFQETSVFNETLRIERIARTQGGRYYCKAENGVGVPAIK
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XP_006 DNGVDIYEPLYTQGETKVLKLKNLRPQDYASYTCQVSVRNVCGIPDKAITFRLTNTTAPP
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::... ::::::: ..:::.: :: ..:. ::::::::::.:: :
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:::::::: :::.:..::::...... .:: :.::::::..:::::.:. :.::...: .
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..:.::.::::..::::::.::::::::::::.:.: .::::::.:::: ..:::.: ::
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:..:: :.. .:::::: .:. :. :::.: :.: : .. : :: .. .::::.::..
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. :.: :.: :.:::::::::..:..::..:.. : :::: ....:::.:...:.::.
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:.:::.:..:..:::::.: : :.:...:..::.. :..:..:::.:.:.::: :.::
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. :. . :.:..::::: ::::...::. .. ...:::. ::::.: :::.: .::::.
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:::.:. :.: :. :: ::. :::.::: :::::..::::::.:::: ::: ::.:
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: :::. ..::. : : . : .::. : :. . ::. ..:: . .. ...
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: . ... .. : :.::. :..:.. : : :..:::.::::.:: ::. ... . :::
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::::: .::::: .. :::.::: .:. . : . ..::.:. : ::.: :..:
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.::::.:::: ::::::::.. .::: ..
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:.: :::::::::: :::.:..::::...... .:: :.::::::..:::::.:. :.::
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...: ...:.::.::::..::::::.::::::::::::.:.: .::::::.:::: ..::
XP_011 QEVLLQGSDKGVEIYEPFFTQGETKILKLKNLRPQDYANYSCIASVRNVCNIPDKMVSFR
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:.: :: :..:: :.. .:::::: .:. :. :::.: :.: : .. : :: .. .:::
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:.::.. . :.: :.: :.:::::::::..:..::..:.. : :::: ....:::.:..
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.:.::.:.:::.:..:..:::::.: : :.:...:..::.. :..:..:::.:.:.::
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: :.::. :. . :.:..::::: ::::...::. .. ...:::. ::::.: :::.:
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: ::.:: :::. ..::. : : . : .::. : :. . ::. ..:: .
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.. ...: . ... .. : :.::. :..:.. : : :..:::.::::.:: ::. ...
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. ::: ::::: .::::: .. :::.::: .:. . : . ..::.:. : ::.:
XP_011 HRVYSYSLQWTQMNPDAVDRIVAYRLGIRQAGQQRWWEQEIKINGNIQKGELITYNLTEL
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:..::::::: : :: :: . :.:.:. :.: :.: . : ::: .:: .::: ::::
XP_011 IKPEAYEVRLTPLTKFGEGDSTIRVIKYSAPVN-PHLREFHCGFEDGNICLFTQDDTDNF
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pF1KE0 DWTRQNALTQNPKRSPNTGPPTDISGTPEGYYMFIETSRPRELGDRARLVSPLYNASAK-
:::.:.. :.: : .::::: .: ::. ::.::.::::::: :..:::.::... . :
XP_011 DWTKQSTATRNTKYTPNTGPNADRSGSKEGFYMYIETSRPRLEGEKARLLSPVFSIAPKN
800 810 820 830 840 850
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pF1KE0 -------FYCVSFFYHMYGKHIGSLNLLVRSRNKGALDTHAWSLSGNKGNVWQQAHVPIS
:: ::::::::.::: ::. .: ... .... :: :::::. :..::: :
XP_011 PYGPTNTAYCFSFFYHMYGQHIGVLNVYLRLKGQTTIENPLWSSSGNKGQRWNEAHVNIY
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pF1KE0 PSGPFQIIFEGVRGPGYLGDIAIDDVTLKKGECPRKQTDPNKVVVMPGSGAPCQSSPQLW
: ::.::::.:::: ::::::::.. .::: ..
XP_011 PITSFQLIFEGIRGPGIEGDIAIDDVSIAEGECAKQDLATKNSVDGAVGILVHIWLFPII
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950
pF1KE0 GPMAIFLLALQR
XP_011 VLISILSPRR
980
>>NP_878250 (OMIM: 611128) MAM domain-containing glycosy (727 aa)
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pF1KE0 LKLKNLRPQDYASYTCQVSVRNVCGIPDKAITFRLTNTTAPPALKLSVNETLVVNPGENV
..:::.: :: :..:: :.. .:::::: .
NP_878 MVSFRLSNKTASPSIKLLVDDPIVVNPGEAI
10 20 30
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pF1KE0 TVQCLLTGGDPLPQLQWSHGPGPLPLGALAQGGTLSIPSVQARDSGYYNCTATNNVGNPA
:. :. :::.: :.: : .. : :: .. .::::.::.. . :.: :.: :.:::::::
NP_878 TLVCVTTGGEPAPSLTWVRSFGTLPEKTVLNGGTLTIPAITSDDAGTYSCIANNNVGNPA
40 50 60 70 80 90
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pF1KE0 KKTVNLLVRSMKNATFQITPDVIKESENIQLGQDLKLSCHVDAVPQEKVTYQWFKNGKPA
::..:..::..:.. : :::: ....:::.:...:.::.:.:::.:..:..:::::.:
NP_878 KKSTNIIVRALKKGRFWITPDPYHKDDNIQIGREVKISCQVEAVPSEELTFSWFKNGRPL
100 110 120 130 140 150
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pF1KE0 RMSKRLLVTRNDPELPAVTSSLELIDLHFSDYGTYLCMASFPGAPVPDLSVEVNISSETV
: :.:...:..::.. :..:..:::.:.:.::: :.::. :. . :.:..::::: ::
NP_878 RSSERMVITQTDPDVSPGTTNLDIIDLKFTDFGTYTCVASLKGGGISDISIDVNISSSTV
160 170 180 190 200 210
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pF1KE0 PPTISVPKGRAVVTVREGSPAELQCEVRGKPRPPVLWSRVDKEAALLPSGLPLEETPDGK
::...::. .. ...:::. ::::.: :::.: .::::.:::.:. :.: :. ::
NP_878 PPNLTVPQEKSPLVTREGDTIELQCQVTGKPKPIILWSRADKEVAM-PDGSMQMESYDGT
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 LRLERVSRDMSGTYRCQTARYNGFNVRPREAQVQLNVQFPPEVEPSSQDVRQALGRPVLL
::. :::.::: :::::..::::::.:::: ::: ::.:: :::. ..::. : : .
NP_878 LRIVNVSREMSGMYRCQTSQYNGFNVKPREALVQLIVQYPPAVEPAFLEIRQGQDRSVTM
280 290 300 310 320 330
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pF1KE0 RCSLLRGSPQRIASAVWRFKGQLLPPPPVVPAAAEAPDHAELRLDAVTRDSSGSYECSVS
: .::. : :. . ::. ..:: . .. ...: . ... .. : :.::.
NP_878 SCRVLRAYPIRVLTYEWRLGNKLLR-----TGQFDSQEYTEYAVKSLSNENYGVYNCSII
340 350 360 370 380
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pF1KE0 NDVGSAACLFQVSAKAYSPEFYFDTPNPTRSHKLSKNYSYVLQWTQREPDAVDPVLNYRL
:..:.. : : :..:::.::::.:: ::. ... . ::: ::::: .::::: .. :::
NP_878 NEAGAGRCSFLVTGKAYAPEFYYDTYNPVWQNR-HRVYSYSLQWTQMNPDAVDRIVAYRL
390 400 410 420 430 440
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pF1KE0 SIRQLNQHNAVVKAIPVR-RVEKGQLLEYILTDLRVPHSYEVRLTPYTTFGAGDMASRII
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NP_878 GIRQAGQQRWWEQEIKINGNIQKGELITYNLTELIKPEAYEVRLTPLTKFGEGDSTIRVI
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pF1KE0 HYTEPINSPNLSDNTCHFEDEKICGYTQDLTDNFDWTRQNALTQNPKRSPNTGPPTDISG
.:. :.: :.: . : ::: .:: .::: :::::::.:.. :.: : .::::: .: ::
NP_878 KYSAPVN-PHLREFHCGFEDGNICLFTQDDTDNFDWTKQSTATRNTKYTPNTGPNADRSG
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NP_878 SKEGFYMYIETSRPRLEGEKARLLSPVFSIAPKNPYGPTNTAYCFSFFYHMYGQHIGVLN
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.. .::: ..
NP_878 SIAEGECAKQDLATKNSVDGAVGILVHIWLFPIIVLISILSPRR
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10 20 30
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..:. ::::::::::.:: : ::::::::::.:::::::::::.::..:::::::::
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: : ::::::::::::.: :::::::::: :::.:..::::...... .:: :.::::::
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..:::::.:. :.::...: ...:.::.::::..::::::.::::::::::::.:.: .:
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:::::.:::: ..:::.: :: :..:: :.. .:::::: .:. :. :::.: :.: : .
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::::.: :::.: .::::.:::.:. :.: :. :: ::. :::.::: :::::.
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10 20 30
pF1KE0 MEVTCLLLLALIPFHCRGQGVYAPAQAQIVHAGQACV
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pF1KE0 VKEDNISERVYTIREGDTLMLQCLVTGHPRPQVRWTKTAGSASDKFQETSVFNETLRIER
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100 110 120 130 140 150
pF1KE0 IARTQGGRYYCKAENGVGVPAIKSIRVDVQYLDEPMLTVHQTVSDVRGNFYQEKTVFLRC
: : ::::::::::::.: :::::::::: :::.:..::::...... .:: :.::::::
XP_016 IQRHQGGRYYCKAENGLGSPAIKSIRVDVYYLDDPVVTVHQSIGEAKEQFYYERTVFLRC
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 TVNSNPPARFIWKRGSDTLSHSQDNGVDIYEPLYTQGETKVLKLKNLRPQDYASYTCQVS
..:::::.:. :.::...: ...:.::.::::..::::::.::::::::::::.:.: .:
XP_016 VANSNPPVRYSWRRGQEVLLQGSDKGVEIYEPFFTQGETKILKLKNLRPQDYANYSCIAS
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220 230 240 250 260 270
pF1KE0 VRNVCGIPDKAITFRLTNTTAPPALKLSVNETLVVNPGENVTVQCLLTGGDPLPQLQWSH
:::::.:::: ..:::.: :: :..:: :.. .:::::: .:. :. :::.: :.: : .
XP_016 VRNVCNIPDKMVSFRLSNKTASPSIKLLVDDPIVVNPGEAITLVCVTTGGEPAPSLTWVR
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280 290 300 310 320 330
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. : :: .. .::::.::.. . :.: :.: :.:::::::::..:..::..:.. : ::
XP_016 SFGTLPEKTVLNGGTLTIPAITSDDAGTYSCIANNNVGNPAKKSTNIIVRALKKGRFWIT
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340 350 360 370 380 390
pF1KE0 PDVIKESENIQLGQDLKLSCHVDAVPQEKVTYQWFKNGKPARMSKRLLVTRNDPELPAVT
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XP_016 PDPYHKDDNIQIGREVKISCQVEAVPSEELTFSWFKNGRPLRSSERMVITQTDPDVSPGT
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..:..:::.:.:.::: :.::. :. . :.:..::::: :
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XP_016 SQEYTEYAVKSLSNENYGVYNCSIINEAGAGRCSFLVTGKAYAPEFYYDTYNPVWQNR-H
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pF1KE0 KNYSYVLQWTQREPDAVDPVLNYRLSIRQLNQHNAVVKAIPVR-RVEKGQLLEYILTDLR
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pF1KE0 YVLQWTQREPDAVDPVLNYRLSIRQLNQHNAVVKAIPVR-RVEKGQLLEYILTDLRVPHS
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XP_011 YSLQWTQMNPDAVDRIVAYRLGIRQAGQQRWWEQEIKINGNIQKGELITYNLTELIKPEA
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pF1KE0 NALTQNPKRSPNTGPPTDISGTPEGYYMFIETSRPRELGDRARLVSPLYNASAK------
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XP_011 NTAYCFSFFYHMYGQHIGVLNVYLRLKGQTTIENPLWSSSGNKGQRWNEAHVNIYPITSF
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pF1KE0 FLLALQR
XP_011 LSPRR
955 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Thu Nov 3 12:34:35 2016 done: Thu Nov 3 12:34:38 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]